| Id Trinity | FTRINITY_DN57062_c2_g1_i4 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_171351 |
| Sequence | ATTCTATTGAACGTGTATAAATTTTATATAGATATTATTTACACTAAATTATGTAATATAACGACATTTTTTATTTATATGATATTGTTCTCTCTTTCCT CATTCCTCTTCCAAAACCTTCAGATCACTTGCGAGGATGGGGTGGGAAAACATTTTCAGAAGGCGTGTTAGAGTATTCACAATGGCCATAGTAATATACC TCGATTATAAGGCTGTACAACAGCGGGAGAAATGGACTAGCAAATCTGGACAAGCTGCATTGTGGGAGAAGGCTCATGAGCGTAATGCTAAGCGTGTTCT AAATTTGATATTAGAGATGGAAGGCTTGTGGGTGAAACTTGGACAATATATGTCAACACGTGCAGATGTGCTTCCCCCAGCTTATACACGTCTTTTGAAG CTTTTACAGGACTCCCTTCCTCCTCGCCCTCTGGAAGAGGTTTATGGAACAATACAGAAAGAATTGGGGAAGTCAATGGACGAGATATTTTCTGATTTTG TCAATGAACCTTTAGCAACAGCATCGATAGCGCAAGTCCATCGTGCAACTTTGCTCAATGGGCAGGAAGTGGTTGTTAAAGTTCAACATGATGGTATCAA GGCAGTCATACTAGAGGACTTAAAAAATGCTAAGTCAATTGTTGACTGGATAGCATGGGCCGAGCCGCAATATAACTTTAATCCTATGATTGATGAATGG TGCAAAGAAGCTCCTAAAGAACTTGACTTCAACCATGAAGCTGAAAACACTAGAACTGTGGCTAAAAATCTTGGCTGCAGAAACCAATCAGATAGAAATA TGAATGCCAATCGAGTGGATGTCTTGATCCCAGATGTAATTCAGTCTACAGAAAAAGTTCTTGTTTTAGAGTACATGGATGGCATTCGGTTGAATGATTT AGAATCACTAGAAGCTTTTGGAGTTGATAAACAAAAGATTGTTGAGGAGATTACTCGTGCTTATGCTCACCAAATATATGTTGATGGGTTTTTCAATGGT GATCCTCATCCAGGAAATTTTCTTGTGAGCAAGGAATTTCCTCATCGTCCCATTTTACTTGACTTTGGGCTTACAAAGAAAGTATCAAGCACCTTTAAGC AAGCACTTGCAAAGATGTTTTTGTCTTCTGTTGAGGTTGGTGCTGGCTTTTGTGCCTTTTCATGTTTATATAGGTACTAACCAAATTATAATATTATATA CATGGTTAACTTGGGTGTTATGATAATTGTTGTTATCTAGAGTCTAAGATCATAAAATTTGAAGGGTAGTTATTATGCTCTGGCTTGAGCAGCAAGCCCA TCCTAGCCTTTTTACGAAGATTTGGGTTTTAAATTGAGTCTCATTTCTCAGGCAAATGTTTTGATGAGGTTGTGTACTAAAAGGTAGTCGTCTCGTTTTA ATCATTTTGTTAAAGTATTGAAGTCACATATAAGACAAGAACCATTTATAATAATTTGGAAAATCGTCCTCCCATGATTACATTTTAAGTGGAGTTGGAC CCAGTTATTCTAACATGGTATTTGATTCAGAGCTTACCCCGAAGTTGGGTTACTTGCAGATGTTCCTTCTTGCAAAATTTCATGCTCAGAGGGGTCATTC CTGGGTGTGAGGGGTGTTAAAGTATTGAAGTCCCATACGGTTGATAATATAAGTCAAGAGTCATTTATAATGACTTGGATGATCCTTCTTTTATGAGCTA GCTTTTGGGGTGGAGTTAGGCCCATTTATTCCAACACATTAAGCGATAATATTTTCAGATGTATTTATTTGGCATTCACCTATTAGTTATACCTTAGGAT TAACTCTAACATGCTGTTGAGCCACTCTTTCACAATTTAGGCTGCGCTTTGATCTTGACGACCTTCTTTTCCATTCTTTTCTTGAGAAAGTGAGCAGGAC AAGGTGATTGATGTTAATCTGGATTTTTTCCTCCAAAAAGTGTGGTTCTAGGGGAAGATGCAAATGCCATTTTCCTACATCACTTGATAGATTAAGTTTT TAGTTGGGTGCTTTTGTTACACTAACACAGTCATGGTTAAAACTTAAAAGTTCAGTCTTATTCAGGAACAAACCGTCATTGTAAAATATTTTTATTATTA GTGCAAGTTTCCCTTATTGGTTTCTCCAAATGATCTTTGTAGTTGATGACCTAGTATGTAAGTTTTTTTGTTATAGGGGGATTTCGTGGCCCTTCTGTCT GCGTTAGCAGAAATGGGGCTCAAGTTGCGTGTAGACTTACCAGAGCAGACAATGGAGGTAGTAACTGTATTCTTTCGTGCTACAACACAAGCAAATGAAT CCTATAAAACAAGGAAGTCTTTGGCCGATCAACGAACCAAAAATATGAAGGCTATACAGGAGAAAATGAATCTCGACCAAAAAGAAATGAAACGTTTTAA TCCTGTTGATGCTTTTCCTGGTGATATTGTAATATTTGGAAGGGTTCTTAATCTTCTAAGAGGGCTTTCTGCTACCATGAATGTGCACATAGTATATATG GACATAATGAGGCCATTTGCAGAATCAGTTTTGAGGGGGTACATTGACAAAGGGCCATCAGTAAATGATAGATGGATTTTTGATTCACCAGTCCATTCTG ATGTAGAAGCCAAGCTTAGGCAACTTTTGATTGAGCTGGGAAATAATGATAAAGTACTTGGAATCCAGGTGCATGCTGTTGCTATTTGATAATTAGTACA CTGGTATACTGAAGCTTGAGATTGTTTGTGTTTATGATTATTTCCTTAAGGCATATATACTTCTTAACAAGAGTCTTGATTAGGTAGAAATTACTGAATA CATGTTCTGATAGCATATCTTTATGTGATTGATGATAAGGATTATACATGTTATAATAATTTACGTTAAAAATTAATCATTAGTGAATGTTAGAGACACA AAATACAATCTTGGGCTTTTAACTAACAGCTTCAGCTTTTGGGATAATTGTGCCCTCCATTGATTTGTTGAGCTAAGTATTTCGTCTTTTTAATAGATAA TTAGTAGTTCACCCAAGAGATGTTATTCTTTATTATTGTTGCTGTTGTTGCATTTGATTTGAAGAGTAAATCAAATAGCTCAAGCATGTGTTGATTTATT TTAAAAAATTCTGTATAATCTCTTAAGGTATGTGCCTACAAAGATGGAGAGGTCATTATTGACACTGCTGCTGGAGTGCTTGGTAAATATGATCCTCGTC CGGTCAAGCCTGATAGCCTTTTCCCAGTGTTCTCTGTTACAAAGGGTATCACTTCAGGAATGATGCATTGGTTGGTGGATAATGGAAAACTAAATCTTGC GGAGAATGTTGCAAATATTTGGCCGGGATTTGGGTCGAACGGGAAGGATTTCATAAAGGTTCATCATGTGCTCAACCATACATCTGGTTTGCACAATGCA ATGACAGACATAACTCGAGAAAACCCTCTACTTATGTCTGATTGGGATGAATGTTTAAATCACATTTGTAAGTCAGTACCTGAGACAGAACCAGGCAAGG AGCAGTTTTATCATTATTTGTCATTTGGCTGGTTGTGCGGTGGAATCATTGAGCATGCATCTGGAAAGAAATTTCAGGAGATCCTTGAAGAAGCGATAGT CCGCCCTCTCCATATTGAAGGAGAGATGTATGTAGGGATTCCCCCAGGGGTGGAATCACGCCTTGCAGCTCTAACTGTAGATACAGATGATTTAAGGAAG CTTGCGGGGCTCACCGGTCGTCCTGACCTTCCCTCCTCCTTTCAGCCACAGCAAATTGCTCAACTTGCAACCACACTGCCCCCTCTTTTCAATACATTGC ATGCTCGCCGTGCCATCATACCAGCTGCTAATGGACATTTATCTGCCAGGGCACTTGCGCGCTACTATGCAGCCCTAGCCGATGGCGGCAAGATACCTCC ACCTCATTCTTCTGCTTCAGAGCCGGTACTTGGAAGTCATCCCCACATCCCCAAACTATTTTCTTCTCAAAAAGCCCCCAAAAATAGGAAATGTTTTGGA CGGAAAGAGGTAATCTTGCCTTCAATAGATAATAACCCTACAGGTTATGAAAAAGTCTCTAGCGTCGAAGATTTCCAGGATAATAGTGAAGGCTCCAGTA CCAGCAAAGATAGTAATCCTCGAACCCGTGCTGAGGGCAAGTTCTTTAAGAATCCTAAGGTTATCGACGAATTCTTGGGTGTCGGAGAGTATGAGAATTT AACATTGCCAAATGGGGGTTTCGGGCTAGGGTTTAAGAGGTTTAGTTCTAAGGATGGATCATCCATTGCCTTTGGTCATTCTGGAATGGGTGGATCTACT GGGTTTTGTGATGTCACACACAAGTTTTCTATTGCTATAACACTGAACAAGATGTCCTTTGGAGGTGTTACTGGAAAAATTGTTCAACTTGTTTGTTCAG AGTTGAATATTCCTGTGCCAGATGATTTCCTAAGATTTGCAAATGAGCAGAGTGGATCTGATGAGCAATTAAATATGGCTAGGCCTCTGATTAATTAAGA AATGATCACTCCTTTTATAATTATAGATACAATAATTTATTATATTGGTTTGGTGTTGATTGGTGAGCCTCAACGTAATGATAATGTTGTTGCTTAGTAA CCAAGAGGTAATGAGTTTAAATTCCGAAAATAGTATAGGGTAAGATTATGTTCATTCACGTTCCACTAGGTAGGAGTCTTGTACATTGAACCACTGGTTT TGTTGTGGATCTCTTTTATCTCAAATCTTAGCATTACATGAATTTGCTTCCTTCTGTATAATGTATTCAATTATGTACACAAAGTTGAACTTTAACCATT GAAATCTTGGTCCTTATCTAATTTCAGGTTCCACCATTTTATTTTCATCAAAAAA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_65483; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_171351
| Blastp | Uncharacterized aarF domain-containing protein kinase 1 from Xenopus with 32.81% of identity |
|---|---|
| Blastx | Protein ACTIVITY OF BC1 COMPLEX KINASE 8, chloroplastic from Arabidopsis with 33.23% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | Link to kegg annotations (443831) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019458336.1) |
| Pfam | ABC1 family (PF03109.15) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |