Ll_transcript_55493

• Id Trinity: FTRINITY_DN57209_c3_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_55493
• Sequence: GAAAAATGATATATCCTTATATCAATTTAGTAGAATGATTTAATAAGAAGATGTAGTAGAAGAATATAACAACGATGAGAATAATGATTTTTCGGGATTA TAGTAATGGAGGATAATGGTGGTAGGGTTGGGATGAGTGGAAGGAGTAGGTATCTTTGTCTCTAACTTTCATCTCCACTTCAACCCTTCACCTTCTCCAC AACTACTCAACCCTAACCCACCGTTTCCGTTTCTTTCCTCACCCATGGAATCATCATCGAACTTCACCCCCTTCCTTCTCTTCCTCTCCGCAACCCTCAC CGTTCTCTCCTCCGTCTCCGCCAACTCCGAAGGCGACGCTCTCTACGCTCTCAAACGGAGCTTCTCCGACCCCGATAACGTCCTCCAGAGCTGGGATCCC ACTCTCGTTAGTCCCTGTACTTGGTTCCATGTCACTTGTAATCAGAATAACCGTGTCACTCGATTAGATCTTGGAAACTCTAACTTATCGGGACATTTGG TACCTGAACTTGAGAAACTGGAACATCTACAATATCTGTATGTTATCACCTAGCATAGTTTATTATTCACTGTTCAATTTTGTTTTTATTTCAATTTTCA AGTATGTTACTGTGGTTTTTCTCTTTTTTTTGTTGATGTAGTGAACTATACAAAAATAATATTCAAGGAGTTATTCCTCCAGAGCTTGGAAACTTGAAGA ATCTTGTGAGTTTGGACTTGTATAATAACAACATATCGGGAATTATCCCTCCTTCGTTGGGGAATCTGAAGAATCTTGTGTTTTTGATTTTGATCCGGGG TGTTCGTGGTTCACATCAGTACTGAAAACCAAACTGAAACAAGTTCAAGTTTTAGATTTGGTTCACTAAACTCATTTAGATTTGGCTTTGGATTAGAGGA AGTAGTTAAAATCTTTCTGTGACAAGTATTGTAGAACTTGTTTGGGTCATATCTGGATGCATGGTTTACTGAGAAGATTTGAAGAACTAAATATTATTGA AAACTCAGATTCTTTATTTTTAAGCCGAATCTGAAAATTCAATTTTATATATGTATGCAAAAGGCTATTAATACTTACTAATTCTGATTGGAAAAAGGTT GAATGCCTGAATCATGACTCATTCTGATTAAATTGAGTTCCATAAAATCACAACATTTGTTAATGTTATTCAATCGAAGCAAACTACAGAGCTTAGAAGT TCCTGTTATAATATAAAGCTTTTCGATCTATTAATTCCAAGGACTATAACTGTGTGCAACCCAAGATCCTTCATTATCAACATGGATTATACTACTAAGC TAGTTAGCGAATGACCTACCTAAAACCATATACATATTTTTGGAGTCAAATTCTTTGACTTGGCCTTTTAGCTTTATCAGAGGCTGAAATTCATTTCACT GACTCTGGGAAGACAAGTCAAATTAGTCACTCAATTGAGGTAGGAAAGAAATTGAGTTATTAATCCCATTCTTAACTGCTGGAAAGCTGCCAGTCTTTCA GCTTGACATGCCAGACATGGCATAACTTGCCACGCTGCTGACAAGACTTTATTTCTTCATTGTAATTGTTTTGTGGCATAGACCATATATTATTATGCAG TTTGCATGTTTCTTATCAGTTTTTCTTTGCAGACGACTTAACGACAACCGGTTAACTGGCCCAATCCCTAAGGAACTCGTTGGTCCTCCAAACCTTAAAG TTGTGTAAGTCATTTTCTTGCCTTTTAAGTTGATAAAACTGTATAGTTATATCATGAAGATGTGTGCTTACGAAGAGCCTAATGATTCACTTTATGTTCA GGGATGTCTCCAACAATGACTTATGTGGAACAATTCCTACCACTGGGCCATTTGAGCATATTCCGTTGAATAACTTTGAGAACAACCCTCGTTTGGAAGG TCCAGAGTTGTTGGGACTTGTACCCTATGCCACAAACTGCTCGTGAATAATATGATGCTCCAGTATCTTTCCATGTGGGTTCAATTATATATATGTATGC TAAAATCTAAGTTTATTACCTCATAGTGTAATGGGCAGTGGTAAAATCTAATTCCTCATATATGTAAATCTTACATACATATTGTGATCTTCCAACAGTG TTTTGAGATCATGAATATCTATTGATGCAATACTAGAAATGAATGGACGTGGTTAGCTATAAAAGATATGTGAAGCTTGACCGTTTCTTATGTCGAATAC TGTTTCTTGTCTTATTAGAGTGCTATTTCCTTCAAATACCCAACTCTTGCTGGTTTTTGTTTGGTATTGAACAGGTTGAAGCTTCAAGGGCTAAGCCTAA AATGAGTGTTGTGTGCCATGGCTAAGTTTAGTATTTAAAATTCT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_66757;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_55493

FPKM

• FPAB: 12.4
• FPNAB: 15
• LF1: 13.4
• LF2: 10.1
• LF3: 13.5
• LF4: 13.7
• UF1: 15.1
• UF2: 11.2
• UF3: 14.9
• UF4: 18.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_55493

• Blastp: -
• Blastx: Leucine-rich repeat protein 1 from Arabidopsis with 87.5% of identity
• Eggnog: leucine Rich Repeat(COG4886)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G21090)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019434355.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;