Ll_transcript_54874

Id TrinityFTRINITY_DN57253_c0_g2_i1
Name TranscriptLl_transcript_54874
SequenceCACGAACTCAAAGAACACATAGCATCAACATCAACATCATCATCATCATCATCTTCTTCAGACGGCGACGCTTTGGTGGTTCGGTTCCGAACCGTTCTCC CGAACCTCCTCCACACCTATATCCACCCTTCCTCCGCCAACGAGAGAGAAGTTATCGCCGTGCTGAAACTCATATCTCACACCGCCACCAATTTCCCTCG TGTTTTCTACCATTCCACCGCTTCTTCTATTTTACCTATTATTGCTCACATTTTCCCTTTCTTTCTTACCCCTCCTTTTCGTTCTCGTCATCCTCTTTTC TTTCAAACTCTCTCTTCTCTTCTTTCTTTGCTTCGATCCCTCTCTCGTGATTCTTACATTCACTTCTTCCTTGATTCCGTGTTACTCATTCAAGATATTT TACATGTGGCTTCACTGCCTTTACACAACGCGGGTGAGAATGGATCATCTAGGGTGACATTGAAGTGCTTTTGTCGGTTATTCTCTGGGGTGGAAGATAT CCCGTTGGCTAATAAACCTGGGGATGGATGTGGTTTATTGGTTGATCTTACTGGCGAAAGCCGATGGCAACCTTTCGCTACTTGGATTTTAAGGCTTATT AGTAAATGCATAACGGAAGGGACACTGAGTGTCAAAGGGTTGATCAATGCGTCGTTTGTTCATGCTGCGTGTTCTCTTTTATGCTATGGTGATGCTGATT TGCAAATGGCATGCTTTGACTTTGTATACATTCTCGGAACGGTGACAGACTATGATATCATTCCGTATCACAATTTAATCCTAACAATATCTACTATCTT GAATCTGGACAAGGAGGGGTTTCCTGTCTTCAGAAACCTGGCATATGATTCATCAATGGGTATTTGCCTCAATTTGCTTTACTCTAACTGTACAGAAGAT GTTGTCAAGTTAACTGCTGCTGATTTAGTCAGTGTATTCCTCCAATCAACATGGAGAACCAAAAGCCAGGAACTTAAGGTTGCACTATTCAGTGCCTATG CTAGGATTGCTCAAGTTTGCCCCCCTCATATCTGGAAGCCAGAATATCTCATTTCTGTACTCTATCATCCAGAACCATTATTGCCTGCCCTAATAGACTG CTTTCAAGTAGCTCTATCTACTCTCGGTCCGAGTCTTGTTGGGGGAGTCCACAAAAACAAGTTGTTGACCATGTCATCTGAAGATAAGTCAATTGAAAGC AGGACACTTGGCCAAAAGAGACCCGTCCAGGATATGGATAATTTAAAGATCAAGCGACAAAAAATAAATGAAGAAATTATTGTTGCAGATGCAAGTGTTG AGGTGGAATGCAAATATACTCATTTAGTTACTCTTCAATTGGTGAAAGATTATGCTAACCATATGAATAAATCTCTTCTTGCATCTGTTCAATCATTAAA TGCTCCTACTGTCGAACATAGTTCTTTGAAACCAGCTAATGCATTGTCTGCACTTAGCAAGCTATGCATTGCCTTCTCTAGTTATCCAGAGACACATCTG TCACTCAAAATTTTCCAGCAGATGCTTGCATGGCTTCCCTGGATAGTTGAGCAGGCAAAACAAGGGAATTCGATCACGGTTGATATCTCCACCTACCTGG AAGGACTTCACAGTGTATTGCTATCACAGGGTGCCTCTTTCATTGAGAACAACCTATTACAATATCAAAATAACTGTGCAGACCTTACACATGTAGTGCT TAAACTTCCCTGGACTCATATGCTTCTTGCTGCTGATAGCAGTTGTCAATGGAAAACAAAATGCCTTTCTCTTCAAGTAGCATCCAAGCTAGGCCCATGC TTGAACATTGAAATTGTTCTTGAAATTTTGGATTTGGGTCTTCATGATGAAGCTGAAGAAGTCAGAATTGAAGCTGTCATTTCCATGCCAGTGCTGCTTT TGTGGTCTGCTCACGATGTATCACCTATCTTTAAAACACTGGAGTACTTAAAGAGAGATGATGAGAAGGTTAAAAAAATTGTTCCCATATCTCTTGGCCT ATTGTCATGCCTTTATGGATGCAGAAGATCTGGAGCAGGTTTACATGTAAATGAATGCAAATTATTTCTAAACATGAACAGTGGTAAACCATGTTGGACG ATAGATCAATTACTTCAAGGTTTCAACTGTTCTAAATGTGACCAACAAGTTATATACAATCATGATAAGCAACATCCTCAAATCACTCATCGACCTGATA TGCATGGAGCAGATGCAGATCTTAGTTTGGACTGTAATTTCATCCAACTACAGACTTTATTTTTTGAACTTCTTTTTGATGAGTCATCAGAAAATGTCCA GATTTCCTGTGTGAGAGTTATTCATCGGATTCTTGCACATGCAGCTGCTGATATTCTGCTCAAAACGAGATTTGAGTGGATAAAATGCGTAGAATTTTTT CTGATTAGTAGAAGCAAGGAATTAAGAGAAGCATTTTGCAGTCAGATCAGTTCCTTTGTTGATAACCATATTTTGAGTCTAATTTTTTCTGGAGGCACTG ACAAAGGTAAAGAACAAAAATTCTTGGATGCAATTAAATATGCTGTGGCAGTGGCTGAAAGTCCACAAATATTAGAGACACTACTGGAATGTACTGCAGA AATAATGGTTGCTGTTGATATAGATAGTAAATTGTTCCTGTCTTCTCTTATATTGTTAGTTGATCAGCTTGACAGTGTACATGTGACTGTAAGAGTCAAT GCATCAAGGTTAATACAGAAATCTTCCTGTTCCCATCTTAAAGGAGGACTTGAGTTAATTCTTGCTAAAGATGTTCATATTCGTATAGAACTGTATGATT ATCTCTCTGAGAGACTCGCCAGCCGCCCAATCTTAGTGAGGGAATTTGCAGAAGCTGTTTTAGGCGTTGAGACTGAAGAGCTTGTCAAGAAAATGGTTCC TTTTGTTCTCCCAAAGCTTGTGGTGTCTCAGCAGGATAGTTCTCAAACCCTTGACACCTTATATGAGTTGGCCAAGTGTTTGAATACAGATATGGGGTCT CTGATAGTTGATTGGCTGCCAAAAGTACTTGCTTTTGCTCTACATCAAGCAGATGACCAGATGTTACTTTCTGCCGTGCAGTTTTACCATGAACAGATTG GTTCTGACAAGCAGAAAATATTTGCGGCTGCATTACCGGCTCTTCTAGATGAACTTGTTTGCTTCACAGACGTTGGTGATTCAGATGAGATAAGTAGAAG ATTAGCCAGAGTGCCTGAGATGATTAAGGGAATAGCTAAAGTTCTAACAGGTGGGGAAGATCTTGCAGGGTTTTTGAGAAATCATTTTGTTGGCCTTCTG AATGGTATAGACAGAAAGATGCTCCATGCTGATGATTTTGTGCTTCGGAGACAAGCGTTGAAGCGTATTAAGATGCTGATTAGAATGATGGGTTCTCATC TGAATACTTATGTGCCAAAGTTGATGGTTCTTCTCATGCATGCTATAGATAAAGAACCACTACAAAAGGAAGGTCTCTCTGTCTTGCATTTTTTCATAAA GCAATTGGCTAAAGTATCGCCATCTAGCATTAAGCATATAATTTCTCAAGTTTTTGCTTCCCTTCTTCCCTTCTTGGAGAGAGACAAAGAAAATCCTTCG ATGCATTTGGACAAAGTGGTAAAAATTCTAGAAGAACTTGTTTTAAACAACCGGATTATCCTAAAACAGCATATATCTGAGTTCCCTCCATTGCCGAGCG TTCTTGCTTTGGCGGAAGTAAACAAAGCAATTGAGGATGCACGTGGGTCAATGACTTTGAAGGATCAATTACGAGATGTAGTTGACGGTTTAAATCACGA GAACTTAAATGTGCGGTACATGGTAGTGTGTGAGCTTCGCAAGCTTCTGAACATTAAATGGAAGGATGTTACAGCTCTAATAACTGCTGAAGCTGGTTCA GATTTGGATGTCTTAAGTTCTTTGATCACATCATTATTCAGAGGATGTGCAGAAGAATCAAGGAACACAGTTGGGCAGCGATTGAAGTTAGTTTGTGCTG ATTGTCTTGGAGCCCTTGGTGCTGTTGACCCTGCTAAAGTAAAAGGTTTTTCATGTCAACGTTTCAAAATTCAATGCTCTGATGATGACCTTATATTTGA GCTGATCCACAAACATCTAGCTCGGGCATTTAGATCGGCACCCGATACTCTTATTCAAGATTCTGCTGCATTAGCTATACAGGAGCTTCTAAAATTTGCT GGCTGTGAGGCATCACTTGATGAGAATGCATCAACTTATACATCACAGGCACAAAAGGATGGGGATGATAGATGTGGTGTTGCATCTAAGATTAAGAGTA CTAATGGGATGAATAATAGGGGTCAGAGATTATGGGATCGTTTCTCTAATTATGTGAAAGAGATAATAGCCCCATGTTTAACATCTAGGTTTCAGCTCCC TAAAGTATCCGATTCAACATCTGCTGGCCCGATATACCGCCCATCTATGTCATTTAGAAGTTGGATATTCTTTTGGATAAGAAAACTGACTGTTCATGCT ACTGGATCTCGTGCAAGCATCTTTAATGCTTGTCGTGGAATTGTGCGCCATGATATGCAAACAGCAACATATTTACTTCCATACTTAGTTCTTAACGCTG TTTGTCATGGTACTCAGGAGGCACGTCACAGCATAACCGAAGAAATCCTATCTGTTCTTGATGCAGCTGCATCAGAGAACAGTGGTGCTTCAGTTCATGG ATTCAATGGTGGTCAAAGTGAAGTTTGTATTCAAGCCGTGTTTAATCTTCTTGATAATCTTGGACAATGGATGGATGATGTTGAACAAGACCTTGCCCTT TCCCTTTCTCAGTCATTGGTTTCTAAGCAACAAAAGTCAAAAGATCAAAGTTCAAATTCCTTGACAGATCAGGAACAGCTCCTTGTACAGTGTAAATATG TTTCAGAGCTTCTATCTGCGGTTCCAAAGGTGACTCTTGCTAGGGCTTCCTTTAGGTGTCAGGCATATGCAAGGTCCTTCATGTACTTTGAGTCTCATGT AAGGGGAAAGTCAGGTGCTTTCAACCCTGCTGCTGAGAGGAGTGGCGTCTTTGAGGAAGAAGATGTTTCACATCTTATGGAAATATACAGCTGTTTAGAT GAGCCAGATGGACTGTCTGGTTTGTCATGTTTAAGTAAATCTTTGAGGTTACAGGATCAGCTATTGATAAACAAAAAGGCTGGGAACTGGGCTGATGTTT TAACTTTCTGTGAACAGTCTTTGCAGATGGAGCCAACTTCAGTTCAAAGGCATTCTGATGTCCTTAAATGTTTACTAAATATGTGCCACCTTCAGGCTAT GGTCACTCATGTTGATGGTTTAATTTCTAGGATTCCTAGGTACAAGAAGGAGTGGTGCATGCAAGGTGTGCAGGCAGCCTGGAGGCTTGGCAGGTGGGAT TTGATGGATGAGTACCTTAGTGGGGCAGAAGAAGAAGGTTTAGTTTGTAGCAGCTCTGAAAGTAATGCTTCATTTGACTTGGATGTTGCAAAGATTCTCC AGGCAATGATGAAGAAGGACCACTTCTCAGTTGAAGAGAGGATAGCATTATCCAAGCAGTCACTAATTGCCCCCCTTGCTGCCGCAGGCATGGACTCTTA CATGCGTGCGTACCCATTTGTGGTAAAACTTCACTTCCTACGAGAGCTGGAGGAATTCCATTCTCTTCTGGGTGATGACTCCTTTTTAGAGAAACCATTT CGTGTAGGTGATTTAGGGTTTGCTAAATTGGTGGATAACTGGGACAATCGACTCCGATTTACACAGTCATCACTTTGGGCTAGGGAGCCTCTCTTGGCTT TCAGGAGGCTGGTTTTTGGTGCAAGTGGTCTTGACGCTCAAGTCGGCAATTATTGGCTTCAGTATTCAAAGCTATGTCGCTCGGCTGGGCATTATGAAAC AGCCAACAGGGCAATATTGGAAGCCCAGGCGTCTGGTGCACCTAATGTCCACATTGAAAAGGCGAAACTTCTTTGGAGCACACGACGGTCTGATGGTGCC ATTTCTGTCTTGCAACAATCTCTCTTGAACATGCCTGTTGAGATTTTAGGCTCTGCTGCAATAACATCAATTACTAGCCTTTCCCTCTTGCCACTTAACC CCCCACCTATTGTCTCTGAAAGTCAAACTGTAAATGAGAACATAGATATTGCAAAGACTCTTCTTCTGTACTCAAGGTGGACGCATTACACTGGGCAAAA ACAGAAGGAAGAAGTAATAAGTCTTTATACCAGGGTGAGGGAACTGCAGCCAAAATGGGAGAAGGGATACTTCTATGTGGCTAAGTATTGTGATGAATTG CTTGGGGATGCCAGGAAACGCCAGGAGGAGAATTTTGAGCTCGGTCCTAGATCAGTTTCTTCAGCAATTGCTGCTGCTGGCTCTTCAAACTTGAATGGTG AGAGGCGTTGGTGGTCCTATGTTCCCGATGTGCTGTTATTCTATGCAAAAGGACTTCACAGGGGACACAAGAATCTATTTCAGGCACTTCCAAGGTTATT AACCCTGTGGTTTGATTTTGGTAGCATTTATCAAACAAGTGGTTCATCCAACAAAGATTTAAAGAATGTGCATGTGAAGGTAATGAGTATTATAAGAGGC TGTTTGAAGGATTTACCAACATACCATTGGTTGACGGTGCTTCCTCAATTGGTTTCAAGAATTTGCCACCAGAATGAAGAAATTGTTCGAGTGGTCAAGC TCATCATTACCTCTGTTCTCCGCCAGTATCCACAACAGAGCCTATGGATTATGGCGGCAGTTTCAAAATCCACTGTTCGTTCTAGGCGGGAAGCAGCAGC TGAAATCATACAAGCTGCACGCAAAGGTTTCAGCCCGCGCACTGATGAGAACAGCTTGTTTGTTCAATTTGCTAGCCTTATTGACCATCTGATCAAATTA TGCTTCCATGCTGGCCAGTCAAGATCGAAGACAATTAATCTCTCAACTGAATTTAGTGCTCTAAAGAGGATGATGCCCCTGGGAATTATTATGCCAATTC AGCAATCTCTTACTGTTAATCTACCGACATATGATGGAAATCCGGGCGATTCACCTATGTCTAATATCTTTTCTGCCACAGATCTTCCTACTATATTAGG CATTGCTGACGAGGCTGAAATTCTTTCATCTCTACAGCGACCTAAGAAAGTCATTCTACTAGGCAGTGATGGCCACGAACACCCATTTTTATGCAAACCC AAGGATGATCTCCGCAAAGATGCCCGCATGATGGAGTTTAATGCAATGATTAACAGGTTGCTATCAAAATATCCTGAAAGTCGTCGAAGGAAGCTATATA TTCGCACATTTGCTGTGGTTCCTCTGACGGAGGACTGTGGTATGGTAGAGTGGGTACCCCATACTCGTGGACTTAGACAAATTCTTCAAGACATCTATAT TACCTGTGGAAAGTTTGATAGGCAGAAAACAAATCCTCAAATTAAACGAATTTATGATCAATGCCAAGGGCCCGCGTTGCTTATGCTCACACAACTGCAG TTTGGTCAATGGTTGGTCACATTGTGGGGCTGGGTGATCGGCACGGTGAAAACATTCTTTTTGATTCTACCAGTGGTGATTGTGTTCATGTTGATTTCAG TTGCTTATTTGACAAAGGCTTGCAGTTGGAGAAGCCCGAGCTTGTTCCTTTTAGGCTAACACAGAACATGATCGATGGCTTAGGCATCACTGGATATGAG GGTATCTTCTTGAGGGTTTGTGAAATTACACTTTCAGTTCTGAGGACACACAGGGAGACTCTCATGAGCGTGCTTGAAACTTTCATTCACGATCCTCTTG TCGAGTGGACAAAATCACACAAGTCTAGTGGAGTAGAAGTTCAGAATCCACATGCACAGCGCGCTATTAGTAATATTGAGGCAAGGTTACAAGGAGTGGT TGTTGGTGTTGGGGCTGCACCATCATTGCCTCTTGCTGTAGAAGGTCAAGCTCGTAGACTAATTGCTGAAGCAGTCTCTCACAAAAATCTTGGAAAGATG TACATCTGGTGGATGCCTTGGTTTTGAAGAATTCGATGAATCGATAAGATCTTCTCATAACAATTCAGTTAGGTATGACATCATTAGTTTCACATCCTCA ATGCATGGCGTCTATATACAGAATGGAAGTAATCTAGAGATTGAACCAGCAAGCAGAGGAAGGAAATAGGAATGGTTCAATATGATCTTTTTGGGCAAAG GTAACCTTTGACTATGGGGATATCATAAAAGAATGTACAAAGTAGATTTTTGGTGCTGCTACAGAATGTATTTGGACCTGAATAGGCAAAACTTGGTGAC ACAAAAGATTGAACTTCAACATGACTGACAGAAATTCATCCCATAGAGTTGTATATATAATGGTTGTATTCCCTTGTAAATGATGAATGTATAAAATGCC ATTACTCCTTCCATATGATATAGTCCAATGCATATAAATCTAACGTAGTTTTATCTTTCTCTCTTGTCCTGTCATAGTTTCATTTTTAAAAGTAACACCT TCTGAATTGAACTTATTATTCACAAAAAGAAAAGCTTGAATTGTTTGATTGTTTTAATGTATTTAGCTTCTAGTTTCTATTCAACCCAGATGTAATTCCC TTTCAATGTTCAGTCCTGCGTACTTTAAGAAACTCATGGTTCTTAATGTTATTGATTTGTTCAATGTATTTAGTAAGTTTAAATGCAAAAAAAAA BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_67145; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_54874

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_54874

BlastpSerine/threonine-protein kinase ATR from Arabidopsis with 62.67% of identity
BlastxSerine/threonine-protein kinase ATR from Arabidopsis with 61.16% of identity
Eggnogphosphatidylinositol kinase activity(COG5032)
KeggLink to kegg annotations (AT5G40820)
CantataDBLink to cantataDB annotations (CNT0002379)
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019441707.1)
PfamUME (NUC010) domain (PF08064.12)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;