Ll_transcript_55080

• Id Trinity: FTRINITY_DN57266_c2_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_55080
• Sequence: GTTTGCCAGCTAATAATGTATGTAAGAAATATATAAAAAGGAAGATAAGCTTGAGATCCGGAATGAACAGCAATTTATGTTGAATTGAATTGAAAAGGAA AAAGAAAAGAAAAAGGATGAATGGAGATGAAGAATACGATTACCTGTTCAAGGTGGTTCTAATCGGAGATTCAGGTGTTGGCAAATCCAATTTGCTTTCT CGATTCACTCGCAATGAGTTCTGTTTGGAGTCCAAGTCCACCATTGGAGTTGAATTTGCCACCCGCACCCTTCAGGTATCTCGCTCTTTCTTCCATCGTA TCTATGTTATTTATGGAGTGAGGGTCCTAAAATATATTAGTTTGTTATACAAAAGAGTGAGGGTATTTACTTTGTAATTATAGAACTGTGTGTGGTGTGC AGGTTGAGGGAAGAACAATAAAAGCTCAGATATGGGACACAGCTGGGCAAGAACGATACAGAGCAATAACAAGTGCTTACTATCGTGGTGCCCTCGGTGC TCTACTTGTCTACGATACAACTAAACCAATCACTTTTGATAATGTTGCGCGTTGGCTCAAGGAACTTAGGGATCATGCTGATGCTAACATTGTTATCATG TTGATTGGTAACAAAACTGATCTCAAACATCTCCGTGCTGTTGCCACTGAAGATGCTCAAACTTATGCTGAGAAAGAAGGTCTTTCTTTCATTGAGACTT CTGCTCTTGAATCAACTAATGTGGACAAGGCTTTCCAAACAACACTTGCACATATATACCACATCATTAGTAAGAAATCACTCTCTTCCAATCATCCTGC TGCTGCAGCTTATGGTATTAAAGAAGGTAGCACTATCGCTGTCGATGGATCCCAACCTGTTTCCAAGAACTCTTGCTGTACATCTTGATCGCTTCTATAT GTGCACTTCTCTCTGCTTTTTTTCCAACTGCACTTTGGTATGTTATCAGGATTATGCTTGTGTATGCATGCTGAGTAATGTGAATTATCTCTTTTAATGG CTATTATTCAAGTGTAATAGGTTTGTTCCGTTTGGATATTTAATGTTTGATGAAATAGAATGTAAAAGATTAGATTTATCCCGTTAATCGAATGGTACAC TCCACTATCCACAATTGACTACTACCAAGCATTTCATTATTACACTTGCTCATCTAACCAAACCTTAGTAATACCATGGCACTGGTTTTCATTCTAACAA TAAGCGATTATAAATCCTTCATTATTAATCTTGATCACATGTGTGCAGTTTGGTAGGCTTTTTCACCACAGGCTCTCTTTATCCCGGAAACATCATCATT TTGTTTTGTAAATTTGTATTGTTGAAAGGTGGAAACTTATGGCCAAGGAATATTGATTGGGGAGCATTGTTGACATTGATGCTTGTAGGTTCCTTATGAT CATTAATTGTCGTTACTTGTTAATTAATGCAACATGTGCTTTCTTCTGTTGTATATGTTTGGTTCTCTACTCTTCTTGATGGAACACTCTTTATGAAATG TTGTGTTGGGTTAAAGTGTGAAGTTCCACATTGGATATGAGGAGATGCATGAAAGGATTTGTAAGTAGAAATGGTGTCTCATTTGTGACTCTTCACTCTT CTTATGTCTAGGTAACAATGTAACTCCCTAGTGGTTGGTGGCTCTTCCTGGTTGCGGTCAAGTCCAATAAGTGCAATTAGAGTCGATAGTTCGGCTAGGA CATGATAAACTTAAAGGAGAGCAAACTTATAAGTGTGCGGTACCTACACTTGAGGGGATCACTTGTAGAACTATTGTCTTAATGTTTTGGTTCAAGATAT GATTACTTGTGTCTATTGTCTTAATATTTTCGAAAAGACTCATAGAACTATTGTCTTAATATTTTGGTTTAAGATATGATCAGTGTGTCTCTCCACTACT ATGTAACAATTGAACTCCCTAATAGTTGGAGCCTCCTAGGTTGCAATCTGGTCAAACATGTTGCTTGCTCCAAGTGCAAAGATCAAAAAATTATGTCATC TTATTTGTACAAATATACATAATTAATTAACAAATTTCATCTTATCCGTACAAAG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_67242;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_55080

FPKM

• FPAB: 0.6
• FPNAB: 0.1
• LF1: 0.2
• LF2: 0.2
• LF3: 0
• LF4: 0.3
• UF1: 0.1
• UF2: 0
• UF3: 0
• UF4: 0

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_55080

• Blastp: -
• Blastx: Ras-related protein RABA2a from Arabidopsis with 78.05% of identity
• Eggnog: GTP-binding Protein(COG1100)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G09630)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019425775.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;