Id Trinity | FTRINITY_DN57280_c1_g2_i3 |
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Name Transcript | Ll_transcript_54709 |
Sequence | GTTCCATACATATGATGTATTCTTTTAAAGGAATTTTTTTATTGTTGCTAATTTGTACATTGTTCTTATGTGTTTCAGCTTGTTATTGAAGCTGGAGTGG GTATTGCTGTTTTAGTGCGTTTCTTTATTAACAAGAGAGGAATGGAATATGAGATTATTGATAGACTTGGAAATGGATTCTCACGCCCCCCATTTGCAGC AGTCGTGGTTGTATGCACTACAGTTTCTGTCCTCGCTTGTGTGCCTTTGTGTGAGCTTTTGTTCTTCCACATGATCCTAATCAGGAAGGTCAGTAATTCA GATGCTGGGAATCTGAGGTTGTTTTTCGGTTCTTTTTCTTCCCTGCCCCCATTATACACATGGTTCTGTAGTGCTTGGCTACTGGCTCGTCTTAAATTGA TTAAGGGAACACTCAGACACTCAGTTGAGTTTTAGAAAACTATCTAATAGTATAAGAGCAATTTTCATATCGGTTCGCATTCAGTAATTTGTTGTCACCT AATTAAAATGCCAATTACTTGAAAAAGAAAATAATATTTACTCTGCATAAAAAATATTGTGAAAAAAGTTTCAGACAAGTGCTCTTGGTTGTGTTATTAC TTATTAATGGTCTGCTTGTAGGAACAGAAAACACATTTGGTATTTTCCCTAGGATGAAAGAAGAAAAAGTGTAACTGATTTAGAGAAATTAGAATACAAA GACAACCACCCAGAGATTTATTGATCACTATAAAGCCAGGTTTTATTTTTTAGCTATAATATCAAACTTAGAGCAGGACTCTAATATGCCCTCCTTTCTT CCTATTGGATCAGGGCATCACCACCTATGAGTATGTTGTAGCAATGAGAGCCATGAGTGAAGCACCTGGAGGGGCATCTGTGGATGAGGATTTACCAAAT GTACTTTACTCTCCATCAGGCTCTGCCGCAACTGGATTGAGTGGAGGAAGTTCTTTTGGTTTGCAATATAAAGGGTCATGGTGTACCCCTCCTAGGGTAT TTGTGGATTATCAGGTATTGGTTGAAATTTATTATCATCTTTATATTATTGGTTGAACTAAAAGTAAGTTCTTCTACTATATTAACCACCAAAATTTGTA GTGTTGAAACATAAGTGAAGGACCTCTAGGGCAATATCAAAACACCAGGATCAGGACTTTTTCTTATTTACTTTTATTTTCCTTCATTTCTAATTGGTGC AGAAGTTAAATGTTTTCAGAGGTGATGTTTGGTAATGTAATTGCGAACTTCCATCTTTATATTTTCCTTTGCTTCAAATTGGTACAAAAGTTAAATCTTT TCAAAGGACCTGTTTGGTAATGTGTCCTTGTGCTCCTCTGTCTTGACTTTTTGGTTATAAATCGCCAGTGAAATTTTATCTTTTCTTATCATCCAAATGC TACTTATCTTAAAAAAATGAAGAACAAGAATTAACTTGAATCAGTAGTTTTCTAATGAACAGAAAGAAGTTAAGTGACAAGGTAAACTAGTATAACCTGT TAAGTATTGCAACCATGCCTTTGTTTTGAATTAAAACTCACTTTGGTATTTCCTTCACTCTGTTGAAGATATTGCTTGTTAACTCTTTTCTGTGCATCAG TTTCATTTTCATTGATTTACATGATTCAACATGGAAATCATATGTTAACTACTATTGGTTGCCATGTAATGACTTGCTCAATTCCTTAAAGAAGTTCATT TTGAGCAAAATGTAGTATGTTGAATACAGTTGAGTTGAAGTGGATTGTTGTGTTGAATGTCTTAAGTATATTAGGTTTGACAAAGGGAAGGAAGAGTGAA CAAAAGGAACAAATCTAACCATGTTGACTAAACTTTTACAGGGCTCTTGCATCCAATCCCCCTACAATACCAATCATGATAGAGCAAGCAATCTTTTAGA AATTTAAAAAACATTCTCAATGGTTCACCTTATAAATTATTAGCTATTTTCCATGTCTTTATTTATTGCATTTTTTGCTTTCTAACTTGTGACTTACTGA ACATTTGTCGATGGAAATTATATGATGTTAACATTTTTCTGACTGGTTTTCTTGACAAGAAAAAATGTGCTTTTGTTATAAAAGGAGTAATTTTGACTTG ATTTATGAGACTTCTCTTAAACATTTGTTTTAGGACGAAGTTGTGCCTCACTTGGAGCCTGGAATGCTACCATCGACTGTTGATCCAGATGCAGCTGGAG GACAACAAATGCCAAAAAGACCTGTTCGTATTAGTGCTTGGAAGCTTGCTAAGTTGGATTCAAAGGAGGCAGTGAGAGCAGCCGCAAAAGCTAGGGCATC TTCTTCAGTTTTGCGACCTGTAGATAATCATCGTCTACAAGATCCAGAATTAAGCTCTAGTGGCAACATGAGCATCAGAAGTAGTTTGAGCGCAGAGACT GGAACTAATAAAGAAACAAAACATGAATTTAGATTGCCTGCAGTGAGAGATTCTATTGCTCCTGGTCAAGGAAGTCGTGGTGAGTATGAAACTGGAAGTC AAAGTATGAGCAGTTTCAGCAGTCCAAGTCATGTTCATGAGGCAGTTACACTTAGCCCTCTCCCACAGGGTCACGGTTTGGGTGGCTTCAGGGAAGCTAC CCCAATTCCTAGTTTGGTGCCGGAACATCCTTCAAGTTCTAAAGCAACTTTGTCAAACTTCAGGAACCCAAAATCCAATAATTCTCTTGGACTTGATGGA AGAATGATGCCGAAGGGAATCAGTAATGATCCGCTGTTGCTTTCAGCTTCTAGCACTAATATTCTAAGAGACATGAGGCGGACATCTGTTGTTTGGGATC AAGAAGCTGGCAGATATGTATCGGTTCCTTTGTTGCCCTCGGAAGCTCGAAATAGGTTATCTACACGAGTAGAGTTGCCAAATTTAAATGCTGAAACAAG TAGCACTGCAAGAAAATCAGTGATTCCCCAGCATGAGTTATCATCATCATCTGCACCCAAGACTACTGCACAGCATGCACAGAATCTGATGTATACAGGA AATTCTATCTTTTTTGGTGGTCCACTTCTGAGTGCCCCTGTTAAGGATGGTTTGGAAAATAACAGGCATTTAGCATCAGCAGGTGCACAAGATAGCATAG CAGTAAACATACCCCAAGAGTCAAGATATAAAAGGGATGCCTTATCAAATCAGCTTCCAGTGTTTGTCCCTGGAGGTTTTGATAATACTCTTTTACCAGG GTGCAACACTAATTAGCTGAACAAATTTCAGGTTCTGATGAGTCGAACATAACTTTCGTCTGAACCAAGACAGTGGTGAATATCAAGGTTTTGAAATTAA AAGTTTCCGGTACAACCAAGAGAGTGGTGAAGAGCAAGGTTTTGAAATTAAAAGGTTCTGGTAAGCACAAGCTTAGCCTTTTTTGCTGGCTATACCAGTT AAAACTATGGTGGACAACATTTGACTCTAACATATATGCCAGCATAATACTCTTTTTCACTCTCTTCAACATGTTTTCTATTATCAAGTGTATTTCATGT GAAACTCACTAAATTGTATCAGTCCACTATTTATTGAGTGAGTCTCACATGAATTACAACAATAATAAATGGTGTTGAAGAAGTGTATAAGAGAATGTGT TGCTAACATTCCTCTTCTGTCTAAGCTTCTAGGTTTAATGTCTGTGTGTAAAGTATAAACAGCCTGTTTGCTTGATACTCTTCTCAACGCCACTGCGCGA TTGAAAGAAGGAGCTTCTTTGTTCCTTTTGTATACCGGGCCTCGGAAAAATGTGAATCTTCCTTTTGCAGTAGATGAGACCTTAAACATAGATGCAGTTA CTCATTAGCACTTCATTAGACTTTTGTCCCACTAGATACTAAAATTGTCCATAGGTTGCTAATAGAAAACTGTTGGATTTGTAGAATGATCTGCATGCTG TTTTTTCTTCAGTGCAATTGGATCTGGATATGTATCCTTTGCTACATTTTCTTCAGTGCTATATTTTTCTTCTTCATAATTCAAGAAAGTTGTGTGATAC AAGTTAAAATTTGCATATTAAAAATGAAAATGAGTTAAACACTAAGCCGAAAAATGTGTAATTTAGCCTAATTTAATGTTGCCCTTGCTTGAGGTTGACA AGTTGCAGATATTTTCTTCTTAGGGCATGATATAAGATTGACCAAGGAATGCAATAGTAGACTATTCTTTTAGGCTGCTGTATGGAAACTAGAAATATCT GCATTGTGAATTTATGTCAGCTGCCAATAGCCCAAGACCGGGAACCACTCTTAGGGTTGGCAATAAAATGAATAAACTCGAC BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_67362; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_54709
Blastp | Probable protein S-acyltransferase 19 from Arabidopsis with 51.14% of identity |
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Blastx | Probable protein S-acyltransferase 19 from Arabidopsis with 51.66% of identity |
Eggnog | Zinc finger, DHHC-type containing(COG5273) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G15080) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019454293.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |