| Id Trinity | FTRINITY_DN57330_c7_g4_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_168470 |
| Sequence | GGAACGTGCTTTTTTTTGGGACAGCAGATTAGCGTTTCAATCCATGTTGCCATGTTGTACCTAATCTATCATAAATGCATTTCAAGTTGTAAACATCTTC CTCTGAGACACATAAGTAGACAAATCCCTCCAATCTCAAAACATCATCGTAAGTGGCTCAACCTGTGAACCACAAAGCCACCTTCTACACAAAGAAAAAG GCTTTTGTCCACAAACAAGTGTGTGTTTCCATTCCCACATGGATTCTAATTCTGTTCAAGACCATGTTTCTCAACCTTTGTTAATTCCACCACCTTCAAT AACTCAATCATTCAGCTCAAATCATGAATCAAATGGTGAACTTGAGAGAATACTCTCAGACACAAGTATTCCTCTAATAAAGCGGTTTGGACTTGCTACA TGGATTGAATGCAAGCTTCTATTTTTTCTTGCTGCTCCTGCTGTTATTGTGTACCTTATCAACTATATCATGTCTATGTCTACACAAATATTCTCTGGTC ACCTTGGTAACCTTGAACTTGCTGCTGCTTCTCTTGGTAACACTGGTATTCAAGTCTTTGCTTATGGCCTCATGTTGGGTATGGGAAGTGCTGTTGAGAC ACTATGTGGACAAGCATATGGAGCACACAAGTTGGAAATGTTAGGCATATACTTACAAAGATCTACTATCCTTCTCACATTGGCTGGTGTTATTTTAACT GTGATATATGTCTTCTCCAAACCAATTTTAATCTTTCTAGGAGAGTCTCCAAGAATTGCATCAGCAGCATCACTCTTTGTCTTTGGCCTAATACCTCAAA TATTTGCCTATGCTATAAACTTCCCTATTCAAAAGTTTCTTCAAGCTCAAAGCATAGTGGCTCCAAGTGCATATATATCAACAGCAACATTATTCATCCA CATATTGTTAAGTTGGGTTGCTGTGTATAAAATTGGGCTTGGTTTATTAGGTGCATCATTGGTTTTGAGCTTGTCATGGTGGATCATTGTGATTGCACAG TTTGTGTATATTGTGAAGAGTGAAAAGTGTAAGAGGACATGGAGAGGGTTCACAGTACAAGCCTTTTCAGGGTTACCAGAGTTTTTCAAGTTATCAGCAG CATCAGCAGTTATGCTGTGTTTGGAGACATGGTACTTTCAAATTTTGGTTTTGCTTGCTGGGTTGCTTCCTAACCCTGAGATTGCTCTTGATTCTCTTTC CATTTGTACTACAGTGTCTGGATGGGTGTTCATGATTTCAGTTGGATTTAATGCAGCTGCAAGCGTGAGAGTGAGCAACGAGCTAGGAGCCAAAAATCCA AAATCAGCCTCATTTTCAGTATTGGTTGTGACATTGATTTCTTTCATAATATCAGCTATTATAGCACTTGTGGTGCTTGCATTAAGGGATGTTATCAGCT ATGTCTTCACAGAGGGTGAAGCGGTCGCTGCTGCTGTCTCAGATCTTTGTCCCCTTCTATCTCTTGCAATTCTCCTCAATGGCATTCAGCCTGTCTTATC TGGTAATTAAGCTAAGTCTTCTATCCACAATTTATTCACTCTATATGCTATGAGGTTTGATTGGTCAAAAAATAATCAATAATTAAACTTTTAATTTAAA TATTTTTTTTTCAACTGATAATAGATTATACCATATAGAATGATACAGTTGTGAGACAAAAAATGTACTTCATATTATACCGACTGTTTGACATCGTTGT TTGTTTCAATTTTGTAAGTTTATTTCGATTTATATGTGTTTATATGACAACCTTATTAAGTATTTATCTCACCGGTAAAGTTAGAAACTAATGCATGCAG TATAATATATTGTATGTAGGGGTGGCTGTTGGATGCGGATGGCAAACATTTGTTGCCTATGTTAACGTTGGTTGTTATTATGGAATTGGCATACCATTCG GTTCGGTTCTCGGTTTCTATTTCAATTTTGGTGCTAAGGTATGTTGATAAATGTATATTGGTGAGAGAAAAATATAACACCTTGGAATTTGAATAATTTA ATTTAATAGTATAGTGCTATAATATATATTTGTATGCTTGATTGAGACTTGTGTGTGTAGGGAATATGGTTGGGAATGCTAAGTGGCACGGTTTTGCAAA CAATTATTTTAATGTGGGTCACATTTCGAACGGATTGGAATAAAGAGGTTGAAGAATCAGCTAAGAGGTTGACCAAATGGGAAGACAAGACGGAGCCACT TCTCAAGAACTGAACCACTTTGGTCCAATTACTCCACAAAAGTGACACAATATAATGTTATTCCTATTTTTTCCCTCACAATAATATTCTATACTCCTAT AATTCTCTATCTATCTTGCTCCAGTAATAGGAAGGTATAAATAGAAGCATGAAAATAGGGTATAAAAATAACGAGTTATATATTTCCAAAATAATATTAT TTAGTTTATATTAAAAGCTGAGTTAAAGAATTGGGAAAAAAATGAAAAGAGAAGCAATAAATAAGAGTATAATTGAAAAAATAAGTATAAATATATAAAA TATAAAAAAATCAGGAATAACATGAAAAATATTAAAAAATAAAATATATGGAACGGGGAGTAATTAATGTAAGTTTTGGGGAGGTTAATTAAAAAATCTC ACATGATTTTATTTCATTTTTCTTGTTTTTGATTATATGGTGGTGCTAGGTAAAATCTTCAACTAAATCATCCATAGCATCAAAATCATCAATACTCGGA TCACCTCGCACATAAAATTCATTCAGGGGACACAATTTAGTGATATACGTTTAAGGTTGTGTGCAGTCTCATAAATTAATGAGTGAAATTTATGCAACTT ATATTAAAACTCAAAAGGGGAAACCCAATTTCATTTCCTTTCCTCAGCTTTATATCTGGGCCTTCCAAGATTAGAATTGAGTCTCTGTTTAGCTCAAAAG TACTTTTTAACCGAATGTTAAAATAATTCAAAATTGAAACTGTTAAAGCCATTTGACAACCAATTATACAAGCTTTGGCCGATTCTTTAGAATGTCAAGT AGTTGAAGTTGCAGCATCAAATTTAATGCTATATAACAGTATAAGAGTCCTTGTACAGTATATAAAGAAAGAGAGTTTTGCAGTTGTAGTTTAACAGTTT ATTACATTCTAAGTGTATCATCCCATATTAGTATATTGACCCCAAGCATTGAACATGAAAAAAAAAAATATGCACTAACAATATATGAATTTTATACAAT ATCATTACATCTTCACATTTGATATTTGATATTTAATGATTATTGATTTTTAAGAAAATGTAACTAATCAAAACGCTTGGTATACACATTTATAATGATT GACATCCACACTCAATGTGTTTTTAGAGGGATGTGTGCACAATTCTAATTTTGGTTTCTGGTGCTGTAAAAATAAAATAAATAAGGCATAAAGTGAATCT CATGTTCCACACTTCACGTGGGGTTCACTGCTTTAATTATACTTGTATGATTGTATCATGTACACATGCTCATTCAATCATGATCAAGTTTGAATAAGTC TAATTTTTATCGTGTTTAGGGTTGAGTTCAGACTCAAATATTAAGTCCTGTCAATATTTAG BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_67812; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_168470
| Blastp | Protein DETOXIFICATION 40 from Arabidopsis with 77.96% of identity |
|---|---|
| Blastx | Protein DETOXIFICATION 40 from Arabidopsis with 77.96% of identity |
| Eggnog | Mate efflux family protein(COG0534) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT3G21690) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019453774.1) |
| Pfam | MatE (PF01554.17) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |