Ll_transcript_168472

• Id Trinity: FTRINITY_DN57330_c7_g4_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_168472
• Sequence: GGAACGTGCTTTTTTTTGGGACAGCAGATTAGCGTTTCAATCCATGTTGCCATGTTGTACCTAATCTATCATAAATGCATTTCAAGTTGTAAACATCTTC CTCTGAGACACATAAGTAGACAAATCCCTCCAATCTCAAAACATCATCGTAAGTGGCTCAACCTGTGAACCACAAAGCCACCTTCTACACAAAGAAAAAG GCTTTTGTCCACAAACAAGTGTGTGTTTCCATTCCCACATGGATTCTAATTCTGTTCAAGACCATGTTTCTCAACCTTTGTTAATTCCACCACCTTCAAT AACTCAATCATTCAGCTCAAATCATGAATCAAATGGTGAACTTGAGAGAATACTCTCAGACACAAGTATTCCTCTAATAAAGCGGTTTGGACTTGCTACA TGGATTGAATGCAAGCTTCTATTTTTTCTTGCTGCTCCTGCTGTTATTGTGTACCTTATCAACTATATCATGTCTATGTCTACACAAATATTCTCTGGTC ACCTTGGTAACCTTGAACTTGCTGCTGCTTCTCTTGGTAACACTGGTATTCAAGTCTTTGCTTATGGCCTCATGTTGGGTATGGGAAGTGCTGTTGAGAC ACTATGTGGACAAGCATATGGAGCACACAAGTTGGAAATGTTAGGCATATACTTACAAAGATCTACTATCCTTCTCACATTGGCTGGTGTTATTTTAACT GTGATATATGTCTTCTCCAAACCAATTTTAATCTTTCTAGGAGAGTCTCCAAGAATTGCATCAGCAGCATCACTCTTTGTCTTTGGCCTAATACCTCAAA TATTTGCCTATGCTATAAACTTCCCTATTCAAAAGTTTCTTCAAGCTCAAAGCATAGTGGCTCCAAGTGCATATATATCAACAGCAACATTATTCATCCA CATATTGTTAAGTTGGGTTGCTGTGTATAAAATTGGGCTTGGTTTATTAGGTGCATCATTGGTTTTGAGCTTGTCATGGTGGATCATTGTGATTGCACAG TTTGTGTATATTGTGAAGAGTGAAAAGTGTAAGAGGACATGGAGAGGGTTCACAGTACAAGCCTTTTCAGGGTTACCAGAGTTTTTCAAGTTATCAGCAG CATCAGCAGTTATGCTGTGTTTGGAGACATGGTACTTTCAAATTTTGGTTTTGCTTGCTGGGTTGCTTCCTAACCCTGAGATTGCTCTTGATTCTCTTTC CATTTGTACTACAGTGTCTGGATGGGTGTTCATGATTTCAGTTGGATTTAATGCAGCTGCAAGCGTGAGAGTGAGCAACGAGCTAGGAGCCAAAAATCCA AAATCAGCCTCATTTTCAGTATTGGTTGTGACATTGATTTCTTTCATAATATCAGCTATTATAGCACTTGTGGTGCTTGCATTAAGGGATGTTATCAGCT ATGTCTTCACAGAGGGTGAAGCGGTCGCTGCTGCTGTCTCAGATCTTTGTCCCCTTCTATCTCTTGCAATTCTCCTCAATGGCATTCAGCCTGTCTTATC TGGGGTGGCTGTTGGATGCGGATGGCAAACATTTGTTGCCTATGTTAACGTTGGTTGTTATTATGGAATTGGCATACCATTCGGTTCGGTTCTCGGTTTC TATTTCAATTTTGGTGCTAAGGGAATATGGTTGGGAATGCTAAGTGGCACGGTTTTGCAAACAATTATTTTAATGTGGGTCACATTTCGAACGGATTGGA ATAAAGAGGTTGAAGAATCAGCTAAGAGGTTGACCAAATGGGAAGACAAGACGGAGCCACTTCTCAAGAACTGAACCACTTTGGTCCAATTACTCCACAA AAGTGACACAATATAATGTTATTCCTATTTTTTCCCTCACAATAATATTCTATACTCCTATAATTCTCTATCTATCTTGCTCCAGTAATAGGAAGGTATA AATAGAAGCATGAAAATAGGGTATAAAAATAACGAGTTATATATTTCCAAAATAATATTATTTAGTTTATATTAAAAGCTGAGTTAAAGAATTGGGAAAA AAATGAAAAGAGAAGCAATAAATAAGAGTATAATTGAAAAAATAAGTATAAATATATAAAATATAAAAAAATCAGGAATAACATGAAAAATATTAAAAAA TAAAATATATGGAACGGGGAGTAATTAATGTAAGTTTTGGGGAGGTTAATTAAAAAATCTCACATGATTTTATTTCATTTTTCTTGTTTTTGATTATATG GTGGTGCTAGGTAAAATCTTCAACTAAATCATCCATAGCATCAAAATCATCAATACTCGGATCACCTCGCACATAAAATTCATTCAGGGGACACAATTTA GTGATATACGTTTAAGGTTGTGTGCAGTCTCATAAATTAATGAGTGAAATTTATGCAACTTATATTAAAACTCAAAAGGGGAAACCCAATTTCATTTCCT TTCCTCAGCTTTATATCTGGGCCTTCCAAGATTAGAATTGAGTCTCTGTTTAGCTCAAAAGTACTTTTTAACCGAATGTTAAAATAATTCAAAATTGAAA CTGTTAAAGCCATTTGACAACCAATTATACAAGCTTTGGCCGATTCTTTAGAATGTCAAGTAGTTGAAGTTGCAGCATCAAATTTAATGCTATATAACAG TATAAGAGTCCTTGTACAGTATATAAAGAAAGAGAGTTTTGCAGTTGTAGTTTAACAGTTTATTACATTCTAAGTGTATCATCCCATATTAGTATATTGA CCCCAAGCATTGAACATGAAAAAAAAAAATATGCACTAACAATATATGAATTTTATACAATATCATTACATCTTCACATTTGATATTTGATATTTAATGA TTATTGATTTTTAAGAAAATGTAACTAATCAAAACGCTTGGTATACACATTTATAATGATTGACATCCACACTCAATGTGTTTTTAGAGGGATGTGTGCA CAATTCTAATTTTGGTTTCTGGTGCTGTAAAAATAAAATAAATAAGGCATAAAGTGAATCTCATGTTCCACACTTCACGTGGGGTTCACTGCTTTAATTA TACTTGTATGATTGTATCATGTACACATGCTCATTCAATCATGATCAAGTTTGAATAAGTCTAATTTTTATCGTGTTTAGGGTTGAGTTCAGACTCAAAT ATTAAGTCCTGTCAATATTTAG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_67812;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_168472

FPKM

• FPAB: 29.9
• FPNAB: 2.8
• LF1: 8.4
• LF2: 23.9
• LF3: 27.8
• LF4: 28
• UF1: 7.3
• UF2: 25.7
• UF3: 39.1
• UF4: 37.7

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_168472

• Blastp: Protein DETOXIFICATION 40 from Arabidopsis with 77.21% of identity
• Blastx: Protein DETOXIFICATION 40 from Arabidopsis with 77.21% of identity
• Eggnog: Mate efflux family protein(COG0534)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G21690)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019453774.1)
• Pfam: MatE (PF01554.17)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;