Ll_transcript_168483

• Id Trinity: FTRINITY_DN57330_c7_g4_i8
• Name Transcript: Ll_transcript_168483
• Sequence: GGAACGTGCTTTTTTTTGGGACAGCAGATTAGCGTTTCAATCCATGTTGCCATGTTGTACCTAATCTATCATAAATGCATTTCAAGTTGTAAACATCTTC CTCTGAGACACATAAGTAGACAAATCCCTCCAATCTCAAAACATCATCGTAAGTGGCTCAACCTGTGAACCACAAAGCCACCTTCTACACAAAGAAAAAG GCTTTTGTCCACAAACAAGTGTGTGTTTCCATTCCCACATGGATTCTAATTCTGTTCAAGACCATGTTTCTCAACCTTTGTTAATTCCACCACCTTCAAT AACTCAATCATTCAGCTCAAATCATGAATCAAATGGTGAACTTGAGAGAATACTCTCAGACACAAGTATTCCTCTAATAAAGCGGTTTGGACTTGCTACA TGGATTGAATGCAAGCTTCTATTTTTTCTTGCTGCTCCTGCTGTTATTGTGTACCTTATCAACTATATCATGTCTATGTCTACACAAATATTCTCTGGTC ACCTTGGTAACCTTGAACTTGCTGCTGCTTCTCTTGGTAACACTGGTATTCAAGTCTTTGCTTATGGCCTCATGTTGGGTATGGGAAGTGCTGTTGAGAC ACTATGTGGACAAGCATATGGAGCACACAAGTTGGAAATGTTAGGCATATACTTACAAAGATCTACTATCCTTCTCACATTGGCTGGTGTTATTTTAACT GTGATATATGTCTTCTCCAAACCAATTTTAATCTTTCTAGGAGAGTCTCCAAGAATTGCATCAGCAGCATCACTCTTTGTCTTTGGCCTAATACCTCAAA TATTTGCCTATGCTATAAACTTCCCTATTCAAAAGTTTCTTCAAGCTCAAAGCATAGTGGCTCCAAGTGCATATATATCAACAGCAACATTATTCATCCA CATATTGTTAAGTTGGGTTGCTGTGTATAAAATTGGGCTTGGTTTATTAGGTGCATCATTGGTTTTGAGCTTGTCATGGTGGATCATTGTGATTGCACAG TTTGTGTATATTGTGAAGAGTGAAAAGTGTAAGAGGACATGGAGAGGGTTCACAGTACAAGCCTTTTCAGGGTTACCAGAGTTTTTCAAGTTATCAGCAG CATCAGCAGTTATGCTGTGTTTGGAGACATGGTACTTTCAAATTTTGGTTTTGCTTGCTGGGTTGCTTCCTAACCCTGAGATTGCTCTTGATTCTCTTTC CATTTGTACTACAGTGTCTGGATGGGTGTTCATGATTTCAGTTGGATTTAATGCAGCTGCAAGCGTGAGAGTGAGCAACGAGCTAGGAGCCAAAAATCCA AAATCAGCCTCATTTTCAGTATTGGTTGTGACATTGATTTCTTTCATAATATCAGCTATTATAGCACTTGTGGTGCTTGCATTAAGGGATGTTATCAGCT ATGTCTTCACAGAGGGTGAAGCGGTCGCTGCTGCTGTCTCAGATCTTTGTCCCCTTCTATCTCTTGCAATTCTCCTCAATGGCATTCAGCCTGTCTTATC TGGTAATTAAGCTAAGTCTTCTATCCACAATTTATTCACTCTATATGCTATGAGGTTTGATTGGTCAAAAAATAATCAATAATTAAACTTTTAATTTAAA TATTTTTTTTTCAACTGATAATAGATTATACCATATAGAATGATACAGTTGTGAGACAAAAAATGTACTTCATATTATACCGACTGTTTGACATCGTTGT TTGTTTCAATTTTGTAAGTTTATTTCGATTTATATGTGTTTATATGACAACCTTATTAAGTATTTATCTCACCGGTAAAGTTAGAAACTAATGCATGCAG TATAATATATTGTATGTAGGGGTGGCTGTTGGATGCGGATGGCAAACATTTGTTGCCTATGTTAACGTTGGTTGTTATTATGGAATTGGCATACCATTCG GTTCGGTTCTCGGTTTCTATTTCAATTTTGGTGCTAAGGGAATATGGTTGGGAATGCTAAGTGGCACGGTTTTGCAAACAATTATTTTAATGTGGGTCAC ATTTCGAACGGATTGGAATAAAGAGGTTGAAGAATCAGCTAAGAGGTTGACCAAATGGGAAGACAAGACGGAGCCACTTCTCAAGAACTGAACCACTTTG GTCCAATTACTCCACAAAAGTGACACAATATAATGTTATTCCTATTTTTTCCCTCACAATAATATTCTATACTCCTATAATTCTCTATCTATCTTGCTCC AGTAATAGGAAGGTATAAATAGAAGCATGAAAATAGGGTATAAAAATAACGAGTTATATATTTCCAAAATAATATTATTTAGTTTATATTAAAAGCTGAG TTAAAGAATTGGGAAAAAAATGAAAAGAGAAGCAATAAATAAGAGTATAATTGAAAAAATAAGTATAAATATATAAAATATAAAAAAATCAGGAATAACA TGAAAAATATTAAAAAATAAAATATATGGAACGGGGAGTAATTAATGTAAGTTTTGGGGAGGTTAATTAAAAAATCTCACATGATTTTATTTCATTTTTC TTGTTTTTGATTATATGGTGGTGCTAGGTAAAATCTTCAACTAAATCATCCATAGCATCAAAATCATCAATACTCGGATCACCTCGCACATAAAATTCAT TCAGGGGACACAATTTAGTGATATACGTTTAAGGTTGTGTGCAGTCTCATAAATTAATGAGTGAAATTTATGCAACTTATATTAAAACTCAAAAGGGGAA ACCCAATTTCATTTCCTTTCCTCAGCTTTATATCTGGGCCTTCCAAGATTAGAATTGAGTCTCTGTTTAGCTCAAAAGTACTTTTTAACCGAATGTTAAA ATAATTCAAAATTGAAACTGTTAAAGCCATTTGACAACCAATTATACAAGCTTTGGCCGATTCTTTAGAATGTCAAGTAGTTGAAGTTGCAGCATCAAAT TTAATGCTATATAACAGTATAAGAGTCCTTGTACAGTATATAAAGAAAGAGAGTTTTGCAGTTGTAGTTTAACAGTTTATTACATTCTAAGTGTATCATC CCATATTAGTATATTGACCCCAAGCATTGAACATGAAAAAAAAAAATATGCACTAACAATATATGAATTTTATACAATATCATTACATCTTCACATTTGA TATTTGATATTTAATGATTATTGATTTTTAAGAAAATGTAACTAATCAAAACGCTTGGTATACACATTTATAATGATTGACATCCACACTCAATGTGTTT TTAGAGGGATGTGTGCACAATTCTAATTTTGGTTTCTGGTGCTGTAAAAATAAAATAAATAAGGCATAAAGTGAATCTCATGTTCCACACTTCACGTGGG GTTCACTGCTTTAATTATACTTGTATGATTGTATCATGTACACATGCTCATTCAATCATGATCAAGTTTGAATAAGTCTAATTTTTATCGTGTTTAGGGT TGAGTTCAGACTCAAATATTAAGTCCTGTCAATATTTAG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_67812;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_168483

FPKM

• FPAB: 8.2
• FPNAB: 0.6
• LF1: 0.8
• LF2: 2.1
• LF3: 4.9
• LF4: 3.7
• UF1: 0.6
• UF2: 1.3
• UF3: 3.1
• UF4: 3.5

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_168483

• Blastp: Protein DETOXIFICATION 40 from Arabidopsis with 77.96% of identity
• Blastx: Protein DETOXIFICATION 40 from Arabidopsis with 77.96% of identity
• Eggnog: Mate efflux family protein(COG0534)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G21690)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019453774.1)
• Pfam: MatE (PF01554.17)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;