Ll_transcript_166484

• Id Trinity: FTRINITY_DN57350_c0_g2_i9
• Name Transcript: Ll_transcript_166484
• Sequence: CTTGTAAAAGATTCTAAAGCAAGTTGAACTAGATTCATGGATCGAGGGGATCAAATGGCATTATCCGGTTCTGCATCTTACTATATGCAGAGAGGGATGC CTGGTTCTGGAGCGCAACCTGAATTGCATAACTCACCTAATATTCGCCCAATTTCGAATCCCAATTTAGCATTTCAATCAACCATTGGGGGTGGTACTCT AGCATCTACATTGTCAATGGACTCTACAGGAATTCCGTCTCAGTCGGTCAATGTAGGTCCTCCTATGGGGACTCCATCTGGGGACCCTGTCAAAAGGAAG AGAGGAAGGCCTAGGAAATATGGAACTGATGGAACTGTGTCATTGAGATTGACTCCAAGTTCATCACCGGCTAGTCATCCTGGAACCTTGACACAAACAC AAAGCCAAAAACGAGGTCGAGGCCGCCCACCTGGGTCTGGGAAGAAACAGCAGCTGGCTTCTCTTGGTAAATCTCTTCTGCAACTTTTTTGTTGTGTGTT AAATAAAATAATTATAATTGGAAGTTGAGATGTTGTTTGTTTTGTAAGTCCATGTCCTACTAATATCTGATTTTATATTTCCTGCTTTTGAATTAAGGTT TGTTTATTTATTTATTCATACTGGCATGATCATATCATAGTGAATTGAGTTAACAATGACTTTTATATTCCAATGTAATTTGCGATAAATTATGAGTTTC TTTGACTTAATTTTTTTGCTTATTCATGATAGATGGGTTGTTTCCTGAGTTGGTTGAGCTCTATAAAGTTTTGGGTTACTGAGATTAGTGTATTAGTGCA CATTATTTATGGATTTTTCTATGAAAATATCAAGCGTTTCAACCCTCAGTCGTTTCAGTCATTTGATGCTTTGTTTTTTTAGATTATAGTATTTTTTATA ATTTAATATTATTCAACTCACAAACTTGAGCATTGAACCTATCTTTGATAGTTTGAATGTTATTCACACTCACAAACCACTCAGCCGCTTTCAATGTGCA AGTGATTATTTTTTGAAACCACTCGAGTGTTGAAGTCTAACTTCAATCATTTTGATATTATTCACACTCACAATCCACTTGAGCATTGAAAGTTGAAACA CTTGAGTGTTTATTATTTTAATGCATTCTTTACTGTTTTGTATGTGTGTAATAGTTGGCTATTTATAGCTATACACATTTCTCAATATATCAAATATTTT GATCCTGCCGAAGATAGGGATGCATGCTTTTATTCGGTTGTGTGCAGAAGTGGTTGAGCTCTCATCCACATATGATCAAACATTTTGGTTTATTGAGATT AGTGTATATATACAAATTATTTATAACCTTGTTCATTAGATAATACTCCTTCCATTCTGTATATTTTTTGTTCAAGGTTAATGTACACAGATTAAGAAAT CATTAAAAAGTACTATGTTTTGACTAACACGTTTCTCTATTTCCAATGAGAGAAGGAGGAAAAAATAGAATCAATTAATGATAAGTGTAATTGTTGAGTG ATGATAGAATTTGATATAAATTTTATTTAGATTTAGATCGAATAAATTTGCTTTATGAATTGGCTAATGCAAATGATTAGTGGGATAACTTACTCTCAGG GGTTTACCACTGCAGCAAGTTAGCAATATTTGATATTAAGAAACTGAAGAGCTCCAATTCAATGACCTAAAATGCAGTTCAAATTTTGTTTGTTTGATCA ATTGGATTAGTCTATTATGAACTTGTGATTTGAAGGAGTATCACTAAAGTTACTTGGTTGTAATTGATCAGAGAAACTGTCATTTCATTCAACATGTATA TAATATTCTGTAAGTGCCTATGTTTCATATGTCTTATTTTAGCCATGTTTTTCCAAAGTAAGTTTACAACTTATCTAACCTGAAGTGAGTTATAATTCTG ATATTTTTTTTTTGAAGACCTTTATAATCTAGCTATGATTCAGGGCAAAGAAGCTAGTGAACTTCATGTTAAGAACATCTGCTCTATCCGTAAAGGATGA GTAATCCTTTGGAATTAGTTTATCTTAAATTTGGTTTGAATATGTATATTGTTAAGCTTGATGTTTTAAGTGGCTATTGCCAGGTGAATTGATGTCTGGT TCAGCAGGAATGGGTTTCACACCTCATATCGTCACCGTTGGAGTTGGAGAAGACATTGCAACAAAAATTATGGCATTTTCTCAGCAGGGCCCTAGAGCGA TATGCATTTTGTCAGCCACCGGTGCTGTCTCTACGGTGACACTTCGCCAGTCTTCAACTTCAGGCGGCACTGTCACATATGAGGTTGGGAACTTATTCCG TGATAATAACACTCATGCTTGGATACAGTTACTGGTTCATGAAAAGTTTTCTGCATTACACACAATCAAATGCCAATCCTTTATAGAGACACTATGATGG TTACAAACGGCAATCATTTTTAGAGATACAATGATTGATTAATACAACGATTTTGTTTTTTCGGAGAGTGGCTTAGTTTGAGAATTCTATTAATCCGAGG AAGTTAAGTTTTGACATTATATCTGGAAATTAATATTTTTTTGTGTAGTTGAAGTTTGTTTTTACGTCTGGGACCCTGGAGCATATACTGTGGCACTTTT CAAGATGCTCATAATATTGAGACAAAATTTATTGGGCAAATATTATAATTCATAAATGCAGTCCTATCTATGTATCTACATGCATGTACAAATACAACTA CATTGGCCATGTTGCACAAACACAATTAAATCTTGCATTCTACTGTAAAAAAATGTCATTCCATTTTAGTTTCTTGGGTCAGACAGCGATCTTGTACTGA ATTCGAAAAATGACACTGACTGCAACTTCTTTGCTATCATTTTGAGTTGGAAATATCTATAATTGCTAGCCTCCGTAGTTGTAGTTGTTGATGTTTGTTT TCCTGAGTCAGAACATGTTTCTTTTTTTCTTGCTATGGGTGGTTACTGAATTCAAAAGGCGTTGTTCACTGCAAGTTCTTGGCAACTGTAGTTTCCGATT TGAACTAAAAATATTTACAAACTCTGGCCATTCTTGAAGATTTTTTATGTATTTTACTCAGTCTTAGCAATATTGAGTTTCATCCTAGATAGTCCAGAAT TACTTCTGCTTTGTTTATTTTTCCTATCCTTCATAATGGTAAGTTTCTTATGTATAAAGTTATGCATAACTGTTGGTAGCCTTTGGCTTCTATAGGGGTG TTTCGAGATATTATGTCTATCAGGCTCTTACTTGCTTACTGATGGTGGTGGCTCCCGCAACCGAACCGGTGGACTCAGTGTTTCCCTTGCTGGTCCTGGT GGTTGTGTCATTGGTGGAGGAATTGGCGGAGTGCTTATTGCTTCAAGTCAAGTTCAGGTAACGGAAATGTTCTCATTCTCACAACATAACGACTTATGAA ATTTAAAAGTTTTATCTTTATGCATCTACTCTTATCATACTCTATTAGGTGGGAGTCTCGTACACTTAACTACTATTTTATCTTTATGCATCCACGCCAA GATTCCATTTAGATTTGGTCAGTTATGACTGCAGGTGATAATCGGGAGCTTTATGTTGGGTGGATCAAAGGCAAAGAAAATTAAGAAGGATGCTTCAGAA GGCGCAGAAGTTGCCATGGAGTCAGATCACCTGGCTGTTCATAATCCAGTCGCGATAAGTAGCATGTCCTCGAATCAAAATTTTATTCCAACCTCATCTC CAAGCCCCTGGCCTGCATCATGCCCATTGGATATGCGCAATTCGCATATTGACATCGATTTAATGCGCGGTTGACAATTGATTGATACATTTCATATTCA TGGTCACTCATCTAATTTTATTGTAGTAGTAATGACAAAATGGGAAGTACCAATAGTAGAGTAGAGAAGGCAAACTGACTTTTGGAATATGATAAAATGT TACCTATTCACCCATGATTGATTGACTTTGAGGTTTTTGCTTATGTTTTTTTAGCTGTGAGGGATTTTAATGTGAAGATTTCTTGTTCCCAACTATATAT AGTGTTCAATTTTTAATTTTTTTTGTACTACGAAGGGTATCCCTTAGTTTATGATTAAGGAATTAATCACTTTTAACGTTTGTGGCTATTCCTCTTGATA AGTATTGCTAACATGAATTAAACCCTTGACATTTGGGCTAAAAAA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_67987;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_166484

FPKM

• FPAB: 1.5
• FPNAB: 2.1
• LF1: 1.4
• LF2: 0.7
• LF3: 1.1
• LF4: 0.5
• UF1: 0
• UF2: 1.4
• UF3: 0.8
• UF4: 1.7

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_166484

• Blastp: AT-hook motif nuclear-localized protein 9 from Arabidopsis with 46.84% of identity
• Blastx: AT-hook motif nuclear-localized protein 9 from Arabidopsis with 67.16% of identity
• Eggnog: AT hook motif domain containing protein, expressed(ENOG410YDXW)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G45850)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019435157.1)
• Pfam: AT hook motif (PF02178.18)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;