Id Trinity | FTRINITY_DN57377_c2_g1_i7 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_168329 |
Sequence | AATTAATGTGTTTTATTCGATTTAACTCATTGAATTGTGAATCATGAGTGCTATGGAACACTATTATTATTTTTCGATGAATTTCGTAACTGTTTTTCAG GTCGAAGGTCTTCGTTGTGGTTGAAGTTAGCTTTCGTGACAATTCATGTTGTTTATATAGCTATTCTCTTTTTATTTGATGGAGATTTGGTTGAAAAGAC TAGGAAGGAACCGTGGTATGTTTTATTGCGTGATTTTTTTCGTTATTGATGAAATTCAGTTCACGTTGCTGATTTTGCTGGCTGTGTCGTTGATTTAGTT TAAATTTACGTGTACTTGTGGAATAGTTTAAACTTAATGTTATTGATATGCAATGAATTCTGAGATATCATTAGATTTTTATCTTAGGGATTTTTTAAGG CAGGTCGGTTTTGAGTGATTTGGATTGCGGCTCCGGTGATTGAAAAAATAAATCAATTGACAAATGTTTCTTTCAGTTGCTTAATTGAATGGAATGTCGC GGTGCTATTTAAGTATTAAAAACATTAGATGCAATGTCACTATTCACAATTGGTATATCTAAGAGTTTTTTTGAAATTAAACACATGTTGTGTAGAAATG TTAAGATCGATAACTGTCCTGTTAATTGTTGATCAATCAAGCTTGGTGATCATGTGATAAATTCAGGCAGGCCAATGCTTGGTCATCATTGTCCTATTAT TATTACTATTATTACCACTACTATTTTAACTGGACTTTTGACGTGAATCGAGATATTTTTTGAAGACTGCGTAAACGCTAGGTATACAAGTGAAGATGCT TTGTATAGTTGCCTCTATCAATTGCAAGGAAGCACAAGCACTTCATATGTCGGTTATGTATTTGCATTAGACAGTTTTGAACACTTTTAACTATATTCTT TAACGTTTTATATTTTTTGCCATATTCCTGTGTCATGTCCGTGCTTCCCTGATCAATTGTTTGTCGTGACTCGTGTGCATGGAGAAAATTGGTGGCACTG TTCCTTTTGAGCAGGATAGCTAAGCCTCATTCTTAGTTCAGAGACAGTTTTTGACCAGATGAATGGCACACTATAATATATTAGGGATGGTCATGAATAT CTTCAATGATGGGGTTTGCCCGTTTTCATTTCTTTTAAAAAGTCATTAAGGTGTGGATTAGTCCCTTGTTTCAAAAGTCAACCTTACTGATATATACCAA CACATTCCTTCTGCACTTCCAGGAGATAATATGAGAAGTTTGATGACGCCTGAATAAAATCTATCACTTTTTGATGAATTTATAGAAATTAAGGAAATCT CTGGTTTAACGTGGCCTTGTACACGAGTGTATGATTTAGTGTTTCCAAATAGTTTTATTTGGTTGCTATTATTTTTCCGACTTTCTATTCATTGCTTGCT TTTCTGACAGGTACACTGCTTTATACCTGCTTCTGTGTGCTGTTACTTTAATACAATACTTCGCAACCTCTATTGCCTCTCCAGGCTATGCCCTTAATGC CATGAGGGCTGTTAATGAGAGAAATGCAGTATACAGACAGACATCAGAAACCTCAAATCAATCAGCTTCAAGCAGAAATGGGAGCTTCATTGTTACAGTG GAAGGAAATCTGATCGGAAGAAATGTTTCAGGAAGTAATGCATCAGATTGGTCAAAGTTGGTGGCAGACTTGTATTCGGCATCACCAATCAGAACATGGA CATGCACCTACTGCAATGTGGAGCAGCCTCCGCGAACAAAGCATTGCCATGATTGTGACAAGTGTGTTCTTCAGTTTGATCATCACTGTGTTTGGCTTGG CAACTGCATTGGCCAGGGCAATCATTGTCGATTTTGGTGGTATCTCTGTGAAGAGACAGCACTGTGCCTCTGGACTGGTTTCTTGTATGTTTCATACCTG AAGGCGCACATCACATGGGTTTGGTATGATATCTATTGACCTATTTAGGAGGAATGTTGATACTCATAACCGACTATTAAAATGTTTAGTTTTGTGATCC TTTCCCTTAAGGCAATGGTTAAGAAACCAATAAAGGAAAGTTCTTATAAAGACTAAATACACCATTTCTTAAATTAAGTAAAACACTTCCCAATACAAAA ATTGCTCTTAGTTTCTTTAGCAAAACCGTAAAATGAAATTGATGTAAAATCTTTGTTATCAAATACTCCTTTGGAAAGGAAAAAGTATAAAAAGGGCATC CCAATGCATGAGGCTCATACCATTCTGGGGTCTAAGGAGGGTATATAGAAGATGAGCTTTGGTATACCGGTAATGTTGTTAGCTAGACCTTGTGATCTTT CTATATATAATGGGCAGGCTAGTGCACGAGACTCTCACATAATGAGGTCTGAAAAGGTAGATGTACGCTTACCCTCACAACCATAGAGGCTCAATATCTA ATTTATGTATATGAAAAAATATTTTGCTTATTAATATGTGATTGGAGATTATTTATTTTTCAAAAACACTTTTAGACCTTATAATTATAAGAAGGTCTTC CAAAAAACAAAAGGAAGAAAAGCCAATGCTCATGTTATCTGTGTTTTTCATTTTAATGTGAAATGAATCTTAATTTGATGATGCTGTCAGGTGGCAGGAT GTGATTGTGATACTACTCTTGATCTTTCTGGCAATTTCTCTTATCTTTCTACTTCTCCTAATGCTATTTCATAGGTAACCCTTATAATTTATTTCCTTTT TCTGTATCTTGCTTCAGATTTCATTTATATAGGTCTTTACTCCTGCTCCTTACCTTTGAGGTACTAATACAATGTTTGTAGACTTGATAAATTGTGCTTC TGTTCATTCTGTGGGGGGAAGGGTAAGGAAGGGGTTTTATGGGCTTTTAGAATACCTGTTTTACTGTTATTTGATGTGTGTGTGTGTGTGAAGTATTACT GTCCACAAGGCTCTCACATTCCACTTACTATGTGCTATGCATTTTGGTTTCATGTCTTTCCACATTTTCATTCTATCACCTTGATGCTGCAAAATGTTAT TGTTAAGTGTGAAAGTCCTACATTGGTTGAGTATATAAAGGATGAATCATTTATATACTATCATAACATTGGGCCACCTGCAAATGTCCAGTCTGCCATA CTTCATGCTCCAGATGTCCAGCTCTAGGCGTGAGGAGGCTATCTTATTCTGACAAATCAGACTACATATGAACTTGTAAGGAGAAGACGAATTAATTATC TAAGGTTAGATAAGTTAGTTCCTTGATGTTGTTCTATTATGTTATATTTTTAGTTTTTACCTTAATCATTTAAAAACAAGATTTTGATGGATCACGATTC TCTTTTTTGGTTGTGGTTGTTGGCTTTTTAATGTATCAGCAAGATGTATGTTGATGGGATATGGTTAGGTGACTGAATTATTCTTTGCGAACTTTAATTT GGTATATCACTGTTAAACACATGTCATTGGTCTGCAGGGGGATTCCAGAAAGAGTGCATCCATTCAGTAAAGGAGTTTATAGAAATGTATATAACTTCTG CTGTTTAAGGAGCAGCTTATACAACAGTTTGGATCCCCTACCTTTACCTGAAGAGATAGCCGAGAAGTCAATACCGTACACATGCCTGGATGTTGTAACA TGTCGATGTTGCTGATGGATTTAGGTAGAAGTCTTTTCCTCAATTGCTGATGGTTTGTGGTAGAAGTCTTTTCCTCAATTGCTGATGGTTTGAGGTAAAA GTCTTTTCCTCAACAGTTATATTTTGAGAACAAGGAAGTTTGCCAGCGCGCTCTTTGCTTAGACGGGTAGATGTCGACATAAGGATATTTGTTTTATGAT CTTTCTTCTGCTATCCGTACTTTGCCCCATTTTTTGGAAGGTGGTGTTTCAAGTTTAGTGTATGGTTTCAGTACTAGTGTTTTCTTTTGCTGATGATGGA TTTATACTTGATACTTCATAGATCTGTATAGATGGGTATTATCGAACTGACTCACTACATGGAATTCAAGGGGGCATTAACAGTATTCAGTTGCATGCAG TTGAAGTGCAGTCTCTTGCTTAAATTCATGAAGTATTGAAGTAGTTGAGAAGTTATTTTTCTGAGTAGCAAAAGAAAGAGTTGACGCTCATGAAATGCAT CTATTGAAATATCTGGAATTGCTTTTTCTGTTTCTGTACCTTGAGTGATTACCAACTAATAGAACATGGAAATATTTTATTGTAAAAATTTGGTTTTGTG ATTGGTCTTTCCAAGCCCATCATACTGCTAAATTTAAAAAAAGGTGGAAATAGAGAAAAATAGTTTACTGATCTTGCAGCGTTAAATGTATTTGCTAAAA GTTAAAACTGTTACATACCAGTTTTATTTTACATTCTTTCTATTAGTGTGAAACTACTTAGCTTTCCATTTCTGTATAGAAGCACTCACCTATCAATCTT TCCCTCAACCGATATCTTTCGCTTCTTTGAATGAAATTCTTACCAAAT BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_68185; |
Additional information | - |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_168329
Blastp | - |
---|---|
Blastx | Protein S-acyltransferase 10 from Arabidopsis with 56.11% of identity |
Eggnog | Zinc finger, DHHC-type containing(COG5273) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G51390) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019421300.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |