Id Trinity | FTRINITY_DN57378_c2_g3_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_169169 |
Sequence | GTTTTCTCTAGTTTTGATCCATATGATTCATGGCCAATATAACTATTAAACCATATCGATATTGGAATCGACTTACCATAATACTCCTATCTCCATTACA GGTATCTTCTTTTTGCAGATAGCCAAGGCTCTATTTTCGGGTGGTGACAACTCTGTTTTGGCGTGTTTCCTTTGTTTCTCGCCACTCTCTCTCAAACTCA TTCACCATCAATGACTCTCTCAATCTCATCCTCTCTCACTCTCCATTCTCACTCATTCTTCAACCATCAACATCAACAACAACGCTCTTTCACCACCTCA AACGCCGTCGTATGCTCCGCTAAATCCGCCTCTCCTCCGAAGCTCAGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTCGAATTGAATCGCTGAGTCAGGTTTCCG GCGTGTTGGGTTGTCAGTGGGGCGATGAAGGAAAAGGTAAACTCGTTGATATCTTAGCACAGCATTTTGAAATCGTTGCTCGCTGTCAGGTATAACATAC TCTTCTTTCTCAAGTTTATTCCTTTTCACCTTTTTATCCATTTTCTGTTTGCTACTAATCATGGGTAGTTTTGCCAACTCAATGAAATTATTTAAAAAAT CACGGGTTAGTGTTTATTTTATCAGCAATTTTTTAGAACGTAAATTTGTTAGTACGTTAGTATTTTCGATGTGGTGAGACTCAAACACACAATCTCCTAC ACTCTGGTGCTTAAGACCACCATCTTCATCATCAAACCACCTTGTGACTCACAATCATAGGTTAGGGTTGAAACTTGAAAAAGAAACTCTATCTTATACC ATTACCAATAAGGATCCTAAGATAGACCAATTAAGGGTTCGATTCCTATTATCGATACTTGTTGGGAGGTACAATCACCTATCCTGAAAATGAATAGTTT CTAAACATTAGTCACAAGTGAGGAGCTCATTTCCTACGAAATAAGGTCTCGGGTTTGAGTCTTGTGAATAATGAAAAAAAAATAGGTATTGAGAGAGCTT TGCTCCTTAAATGGTCTCCCTCACTCAACATTGACTATTCATGTTCAATTTGATTTTGCAGAGCGTTTAGAACTACAAGATCCATTTTTACTGGAGAATA ACTATAACTCACATTTGAGGTTGCTTAACGGGATCTCACCGCCCTCGAGGACTAATGAGTTTGATTCTAAGGAACTAATGTGTCCGGTTCTATATTCTTG CGGCAGGATTCGGGGGGTTTAGTTTCAATTTGTTCACTTGGAGTTCACCTGTGACCTATTGTAGAGAAGATCGTATAATCTCGCCTTAGATGGTTAGAGC ATATGTATGGTACAAGCCCTAGTAAGAAATGGATTATATAGATGGAAGAGAGTGCAATAGTTAGAGGTAGAGGGAAATCAAGAAAAGTTGTAGTTGAAAC CATTAAGACGGATTTTAGATTTAAATAGTTTGTCTATAGATGTGATTTCCGGTAGGATATTATGATGTCATTTGATTGTCAGGGTTTTAAGTTGTGGCCC GATGTGGCCAATGCAGTCTGTAATCATGGTCTGTTGTAGTTCTGCTGGCGGGCACATCATGTAATGTGGTTTGCATTTAAACATTGATCCATGTCTACTT CATGCTCACATACTTCTTTAATTCTTGTTATGTTGGTTTATTTAAGGTGGTTGTTGATTTTACTATGGTCTGTTTAAGACCCCACTTTCTAGCTAAATAG ATATGTATTAGTCAAAGCTTTTATTTAAGATTTTGGAATTATTCGGATTCTCTGTACATTTATTAGTGGGCTAATGATTCTGGAATTATTTTGATTCTCT CTGTGCATTGATTTGTGGGCTAATTAACATTATAATGCATGAGTTGTGATCTTTAGATAATTGCTTTCTATTGGTGTTTGTGAATGAATTTGGTCACTCC CCTCGTCTTTTTGTCTGTATTATTTGCGCTGAAAATTTGTGATCATGTGTATCAGGGTGGAGCTAATGCTGGCCATACCATTTATAATTCGGAAGGGAAA AAGTTTGCCCTTCATCTTGTTCCATCTGGTATCCTTAATGAGGATACGCTGTGTGTTATTGGAAATGGAGTTGTGGTGCATCTGCCTGGGCTCTTTCAAG AAATCGATGGCCTTGAGTCAAATGGGGTTTCTTGCAAGGGAAGGATATTGATATCTGACCGCGCTCACCTGTTGTTTGATTTCCACCAAACAGTGGATGG GCTGAGAGAATCTGAGCTTGCTAAATCTTTCATTGGCACAACTAAAAGAGGCATTGGACCGTGCTACTCCAGCAAGGTTAACCGTAATGGCATTAGAGTA AGTGACTTGAGGCACATGGATACTTTTCCTCAGAAGCTTGATCTTTTGTTATCGGATGCGGCATCAAGGTTCAAAGATTTCAAATATGGTTCAGACGTGC TAAAAAAAGAAGTTGAAAATTACAAGAGATATGCCGAACGATTGGAACCCTTCATTGCTGATACCGTGCATGTCGTGAATGATGCGATAGCACAAAAGAA GAAGATTTTGGTTGAAGGAGGTCAAGCAACCATGCTTGACATTGACTTTGGCACTTATCCCTTTGTTACTTCATCTAGCCCTTCTGCTGGTGGGATTTGC ACTGGTCTCGGTATTGCACCAAGAGCTATCGGTGATTTAATAGGAGTGGTGAAAGCATACACTACAAGAGTTGGTTCTGGTCCTTTCCCGACAGAAATGT TGGGTCCAGGAGGTGATCTCCTTAGATTTGCTGGGCAGGAGTTTGGCACAACCACTGGACGTCCTCGACGCTGTGGTTGGCTTGATATAGTTGCCTTAAG ATTCTCCTGTCAGATCAATGGTTTTTCGTCCCTGAATCTCACCAAGCTGGACGTTTTATCAGATCTCGATGAAATACAGTTAGGTGTTGCTTATAAGCAT GTTGATGGCACCACAGTCAATTCATTCCCTTCAGATCTCCGTCTTCTAGACCAATTGAAGGTTGAATATGAAGTACTTCCTGGATGGAAGTCCGATATTT CTAAAATTAGAAATTATTCCGACCTTCCAAACGCGGCGAGGCAGTACGTGGAAAGGATAGAAGAGCTTGTTGGTACTCCGATCCACTACATTGGTGTTGG GCCGGGACGCGATGCTCTCATATATAAATGAATTCACATATGCCTCTTCAGGCAAGTTTATGTTTTTCACCATAGAAGTATTTTTTTGCCACTAACTTTC ACAGATTTGAGATGATAATGAATTTGTAGTGAATGTTGAAAATTACCTACTTGATGTATTATGTTGTTATCCATCATCAATGCAATTTTTTTGGTTTCTG GGTGAATTTGATGGTGCAATTTCCCCCCTTTAATTTTGCAGTAGTTTCAGAAATGTTGAGTTGTTAGAGTAATTCATGAAGTATATGTATGCTGAAAAAT ATGACCTTACTTGTATCAATGTCGCAGAAATAATGTTGTAATTTTAGTCATGACCTTTCACTCTCAAAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_68198; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_169169
Blastp | Adenylosuccinate synthetase 2, chloroplastic from Ricinus with 89.03% of identity |
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Blastx | Adenylosuccinate synthetase 2, chloroplastic from Ricinus with 89.03% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (8278953) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019456162.1) |
Pfam | Adenylosuccinate synthetase (PF00709.20) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |