| Id Trinity | FTRINITY_DN57383_c4_g1_i2 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_166758 |
| Sequence | TTGTAAACATTATTTTTTTTCCTTTTTCCAATCCTAAAGGTTAGTTGAGTTATTTTTTTTAATTCTAATCAGACTTTAGACTCAAAGGTAATTACGTTAG GTTAGGGTTCATATTCCAATTGGGAAAACGAAAATCGAGAGAGAATTTGAGGCAAGCGTGCATTGTTTTGAATTGATGATGAGGGAGGTGTTTAGGGTGA GGCCACTTACCTCGTGTTCTTATTCTGTTGCTATTGTTATTGAATTTCAATGCTGAATTCTGCGTTGGTTTCAGAGACTTGGAAGTGTTCGGAGATACGC CAAACAGAGTCTACGTATTGATGGAGTTAAACATACCATAGCCGTCGCCTCCGGTAAAGGTGGTGTTGGAAAATCTACAACCGCCGTCAATTTAGCAGTT TCACTTGCAACTAAATGTAAACTCAAGGTTGGTTTGCTAGATGCTGATGTATATGGACCCAATATTCCTATTATGATGAACATCAATACCAAGCCTTCTG TCAATTTAGATATGAAAATGATTCCGGTTGAAAACTATGGAATCAAGTGTATGTCAATAGGGTTCCTTGTGGAGAAGGATGCCCCAATTGTTTGGAGAGG TCCCATGGTATCAAATGCTCTTGAGAAAATGACAAGGGGGGTCAACTGGGGAAACCTTGACATACTAGTAATGGATATGCCTCCCGGCACTGGTGATGTT CAGATAGCTATGTCTCAGAAGCTGCAATTATCAGGTAGTTAACAATTTAGGAGTTATAGTTAGAGGCTCTTTGCGGGGATCACCTGTGGGTGAGTTCGGA AGCAAATGCTTTGACCAACAGCTCAGGCCTTCACCTTTGTCTTGAATTTTGCAGTTTAGTCTGTGGTTCTTGTCTGCCCTATATATGCAATAAACCTTAC AAAACATTCTCAGTGGAATAATAATTGAATTATAAGCATCAAAACACATGGTTTTAAATTTAAGTCAGACAATGAAACAGAAGTGTCATGATATTTTATA TTGCATACTGTTACGAATAGTTCATCAAATTGACTTGTTTTATCAAGTTTCTGTCACTTGTTTTTTTTATCCATTGTCACGGTTGCTTCTCTGGTAGGTG CACTGATTGTGTCAACTCCTCAAGATGTCGCATTAATGGATGCCAGGAGGGGTGTAAAAATGTTCGATAAAGTTGATGTTCCGGTATGATAATTATTTGA CGTACTTGTGTTTTTGCACAGTGTTGAATTTTCATGAGTCAGAATATGCACGCGTATGCACTTCTGATAGTGTTCAGAACTTCAACATGTAGAGCATATG CATATGCTAAGTTAGACCATGGAACTGCTTCATTGTGATTCACCTCAATATCTTTTTGTGGAAATATATGTACATGATCATGCTAAATGAATGCATTATC TACATGTTTTTTGTGCTATCTAGTGGTACTTCAACTTCTTCCTCGTTGGTTGTCTGGAATTCCCAATTCTGCTGAATCAGTAGAGAAGTGTTTCAGGCAT CAGAGAGCCTTGGTTTTAGAAATTCCAATGGATTGTATAAGTAAATTATTTACAATGCTAAAATTATTTCAAATAATGATGAGAAACATATTTTCTATCA AATGTCTGGTGGAAGCATATACATTTGCGCTTACATGGTATTTTTCATGCATGCTCTTTTCCAGTGTCCAATTTGAGTGCTGAGGATGAAATATTTAATG CCTTGCCTACCATTTATATATTAATTGTCCCTTCTTCTGATATGGTCTTCACACGTCATCTATAAACTACAAATTTGTCATGTGTTCGATGTCCATGCAT AACTCCAACTATTTTTACAGATTTTGGGCATTGTAGAGAACATGAGCTGCTTTAAGTGTCCGCACTGTGGTGAACCTTCATACATATTTGGTAAAGGAGG GACTCGTAGGACAGCCGGTGAAATGGAATTAGAATTTTTGGGTGAGGTATGTTGATTATCCGTGTGTAGGTTACAGTTTATTTTGAAAATTTGCTGATCA TTTAATGGGGAGATTTTGATAAAGGAAGCAATTCTACTGAGACTTTTAGTTACTTTGAGATAAAAAAATGGTGACCCAATACTTGAGGCTCCCACCTAGT GGGATCCAAGGACGGCAGATGTACACAACTTTACCATGGCAAGCGGGAAGGCTGTTTCCAGGATTTGAACTCGTCACTTCTTGGTCACTAAGCAGCAACC TTACTGTTGTCCCGAAGGCTCACTCTCTTTACTTAGTGATAGATGTTATAAATTTTAATGTGACAACTAATTACTTTTTACTTTCCCTTTGATGTTTCTA TGAAAATGTTTTTTTTTACATGAGATGAGTTTTTAACTATATCTAAGCTGTGATCATATGGTAGTTTTAACTATATCTAACTTGCTGGAGTGTATTTTGG CTTATTGCAGTTGCACATTCATCTCTTAAATAATCGGTGTAATATTTTTCTCTAGAATTATTGATAGCAAAGCCACCTCTATTCTCAATCTTCTTATATA ACATTTGCAACATTTATCTACTGAATATTTTGACAAGTTTTTATTTTAATGATTCCAGATACCACTTGAAGTGGGGATTAGAGAATCTTGTGATCAAGGG CACCCCATTGTGTTGTCCGCACCGGATTCAGTAGTTTCCAGAGCATACGGAGATTTAGCTGAAAAAGTTGTTCAGAAACTTAAGGAACAACAGCCTCCAC CAGAGATTAAACTATGAAATTCTGCACTTTGCCATGATAGCTCTGTATGTCTGTGAACAAGTTGTCCTGTTCATGGATATTCAAGAAAGGAGGACGGAGC TGTCTACCTCGATGTTCTGTACCTAAAGAGTGCAGCATTTGATTCCTCTTAAATTGTATTAAAACGACGCGCCTGCCTTATGATTTAAATTTGTTGATTG GAGATTCTCCATCAATCTTTTAAAATAAGCAGTCAATGATGCTGTGACTTGTCAAATTAGCAGTTTGATTTCACTACAATGTTGAGGGTACATGCTGCTG CAGGGATCTCTTGCTAAGTTATATGTTTTCTTTTTGTGGTTTATTCGGATGCATTGTGTTAGAGTTATCTTCAGCAGTATCTTGTGTAAGAGGGTGCGGA TCATATGGTAGTTATGTATGGTGTACTAGGTGCTTCCAAGAATAATATATAAGGTGTGGCAATGGGGAATATATCCTCACTTGGATGAAAAGAATATGAA GTTCGTTAGTTGTAGTCTTCAAACTTTTCCAAGGTTGTTCAACCAAACGTTTGTATTGAAAACAATCTGTATTTTTAGCCACACCTTTTTGAGGTACTTG GAATACATTACTAGCAAATTCTATATGCGCATTTACTCAGAAAAATACTACTTTTCTTACTTGGAATATATATTAAAAGTAAAGTATGACAGATCCCTCG TAACATTAGATACATACTGTCGTATTCAC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_68246; |
| Additional information | - |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_166758
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Iron-sulfur protein NUBPL from Dictyostelium with 55.26% of identity |
| Eggnog | ATP-binding protein(COG0489) |
| Kegg | Link to kegg annotations (DDB_G0291193) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019428626.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |