Id Trinity | FTRINITY_DN57435_c0_g1_i2 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_183951 |
Sequence | CAATTTCAAAATTTATGGCACACCTCTGTTTTGCTTGTTTCTATTATGAGATAATGAACAGAGAAATTTCATCATCAGATTTTGACATGTGTTGCTATCA GATAATTATGTTCTATTTATATTTCTTATGTGTCTGGATGCGTACGTAGGAGATTATTGTCAACTTCTTAAGTTATGTTTGTTTAAGGTTATATGCGAAT GATATGGAATTGCCTGTGAGTGTTTGTATTTGTAGATTTGGATTTGTTACTGGAAACTATCTATGCAGGTGAATATTTGACTGGAAGTTCTATACTTGTT AGTCAAGTTTTATAATAGAAAGAAGCTTCAATGGCCAAGAAACCTGGATCAAGGCTCAATAAATTATCTGTGTACCTTTACATTCCTAATATCATAGGTT GGTATTTAATTCATAATTACGCTGCATGATATTTTGTTTTATTCCTATATGTTCTCTTACGTATTGTAGACACCGTTCTGTTCTACGACATATTTTGTTG ATAAGAATAAGAATTATGGGATACAACTTGGATAAAAGGACAGATTACATTATTAAAATTTTCCTGGGACTACTTTTCCTTATTTGGTTTTTAGGAAACG CCAGTCCTTGACAATGGAATCGTGAAATGCAGGTGTGTATTGGTTATTCGAGTTGTGGATATCCTATTCTCTATCTCTATATTTTTAGAATAGTCAGAAC CCATTAACCCTTAGGACTGTTTATTAGATAGTGCCACATGTTTGCAACTGATGTTTGAAACTAATGGATGCTACCCAAGGGTAATAATATAACATTGATT ATTTTTTGGAATCTTGACAAGATTTCACTCAAATGTAAGGTCTTTCCTCACAATTCTCCATGAGCAAAATGTATTAACCAGTGTGATGATGATGCAGGAT ACATCCGGGTTCTTTTAAACTGTACTGCATTCTACCTATGTTTTACAAACAAAATATTGTTTTCTATTCTCTATTTTTTCAGCTTTGTATGCGATGCTGT GGATGGCTGGGCTGCTCGCAAATTCAATCAAGTGTCAACCTTTGGGGCTGTTCTGGACATGGTAACAGACAGGTCATTCTCTACCCCCCCGGCATGCAAG CCAATGAAATGTGTTGATTGATGCCTGCAATGACTCTTTGTATTTTTCGATTCTTGTGTGCTATGAATTGATGTGGCTTCCTTAATACCAGAATTAGCAC TGCTTGTCTCCTTGTAGTCCTCTCGCAAGTGTACAGGCCTGGCTTGATTTTCTTGTCACTGCTGGCCTTAGATATTGCCAGCCACTGGCTACAAATGTAC AGGTAATGCATTTCAATTTTGTTTTTGCCTCCTCTAACTCTGATTGTATGATTCTAAAGTTACTGGGTTTGGTTTTGAAGAGATTCTTTTGCTCTATTTT TTACTTCAAATGTAGCACTTTCTTGCTGGGAAAGGCTAGCCATAAAGATGTAAAAGACAGCACTAACTGGCTTTTTAAGGCATATTATGGAAATAGGATA TTTATGGCTTACTGTTGCGTTTCATGTGAGGTAATTGTAATTGATCTCTTGTGAAAAAACCGTTAATAAATATAACGTTCTTTGAGAGGAGATCCACTTA TTCCATGAGTAGGTTTAAAAAACTTATCCCCTTCTTGGCCATCAATTTTAAGGAGATCTAATGGTTTAGAGCTACTCACTAGTTCAAACCATTAGATTTC CCTAAAATTAATGGCCAAGATGTGGAGTAATTGGATACCCACCGATATTCTTTTGTTCATATCCTTTATATTATTCTACAGGTTCTTTATTTAATTATGT TTTATCTTGCCGAGAAGCAAACAGATAAATTGGTGGATGTAAGTGGCTAAGTGATCTCTGTATTTCAGCAATTAGATTATCTAATATGTCTAGAAATTTC TTCAGATCAACTTATTTTCTCAGTCGTTTAATTTCAGGTTCTGAAAATTAATTTGCAAAAAATATCAATACATTCTTTCCTCATTGCTACAAGTTTATTT GGATGGGCAATCAAGCAAGTTATAAATATTATTCAGGTTCTTGCACAATTTACTTGGTTAATATATTTTAAGAGTTGAGGTCCGGTATACAAATAACTAT GGAATGCGCTATTAGGAAGTATCTTGTGGCCAATGGTGACATTGGTTTCATTTGCAAAACCTTTGAATTCATATCTAGGATTGATTGTCAGACGATGTAA TTGCCAATTATACGGCCTCATAACAAAATTCTTCAGAAAATTCAGAAACTAGTAAGTTATGTTTTTCCTCAGTCATATCTTGCTTGAGTTTTGTTATTTT ATGAGAAACTAGCAAGTTATGTTTTCCCTTAACATGACTTGAAGATTGATTTAAATAGTTTTGTTCTTCACAGTCCACTTCTAGCCATATAAAGTATTAG AATTGTTTAACTAATTTACTTTGCTGCAATTAGTATGTGTAAATGCTATTCATTGATTTATTGTTTAAGTCTTGAAGTTTGATCTGCCTTAATACCCTTG TCGATTCAGATGAAAACAGCGGCAGATGTGTGTGTTCTTCATGACATTGACAAGAAACACAAGCAGTGATGTTTCTTCCATAACCAAGTTTTTGAGATCT CATTATCAAGTTTTTGAGATCTAACAGTAATACTAACACAAAATCAGTGCTCTGGATGGCAATTGAACTTGAACTTTTCATTTTTCTATCATTTGTGATG AAAGAAATACAACAGTGTAGAATTAAAAATACTAGTTGTCCATGTTGTTACCAAATTCTAATAGCACAACATTCACTGTTTTTTGTTTTTGTTCATTTTG ATTTCTGAATCCCATTTAAATCTATGTTATCTGCTCCAGAGTAATAGGGGTACATTTGTATGTAACCTTGTGGACTTCTGAAACTCGTTTTAGGATAAAC TGAATAAATGTCTATATTTCAGTTTCCTATTACAGTGTGAATAGGGCTACCTTATTATGGGATAAACTGAATAGGGCTGCACCTTATTATGATGTTCCTT TTCTATTTATTTT BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_68644; |
Additional information | - |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_183951
Blastp | - |
---|---|
Blastx | CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase 1 from Arabidopsis with 83.05% of identity |
Eggnog | cdp-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase(COG0558) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G68000) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019451189.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |