Id Trinity | FTRINITY_DN57530_c4_g1_i4 |
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Name Transcript | Ll_transcript_131804 |
Sequence | AACTGTACGAGTTTTGCAGCAGTTCAAGCATGCTGAAGACGTTAGAGAGGTACCAGAAATGTAACTATGGAGCACCTGAGGCTAATGTTTCTACAAGGGA AGCTTTGGTAATGGAGTTGAGTAGTCAACAGGAATACTTGAAGCTGAAGGCACGTTATGAAGCCCTCCAAAGATCCCAAAGGAACCTTATGGGAGAGGAT CTTGGTCCTCTGAGCAGCAAAGAGCTCGAGTCACTTGAAAGACAGCTAGATTCTTCATTGAAGCAAATCAGATCAACAAGGGTAAGAATGTTTCTAATGC TAACCGATAACACCTGAAATTATGAAGGAACATATAATCCTAACACATTTTCAGATAATAACTTTAGTTAACACTGAACAGTAATTATACAACTGAAGCA GAGAAAAATAAGATAATTAGAATTATATCATTTTTATGCAAGGGTTAAATAGTAATGAGGAAAAAAATAATATGCTTGCCAATTGGTTTTCTTATTTTAT TAGTTAAAAGAGAAGAGATTCAGGTATATAATTATAGACATACATTTTTCATTCTTATAGTATAATCTCTAACTAATATTACTGTTAATTTTCCATATCT AAGAAATGCATTGACTAACATCTTCATATATCTAGAGAATCTAGATTATTATATGTTATGCCTTTCTAATCATATGCCATTTTATAGATAATTTTTGGAA ATGTGAAGAATTTTATATTTTAATTCTCATCCTTGATACACCTTTTTGTAACTCCAAGAACCCATCATAGTTGTTTGAACTTTAGACTATGTAATGTCTT TATGAATATATCTCTGCAATTTTTCTTTGGCCTTGCATTTTTATCTCCATGATCACTATATATTTTATTTTGTTGTAAAGGATTGGACTCTTCCCCATTG CTATTACCAAATTGTCACAATAGATTATACTTGGCTCCATTTATTGATCTTCAATATTACCATGTATTCTTCTAATTATATAGTTTGATTTGTCATATTA TTGATTGTACAATAATTGCTCGTTTCTTAGATGCTTGAGAGAATACTCTTGAACTGACCTAGTTATTAACGGTGCAGTCTTGCAACCTTGAGTTATTGTT TGTCATATATCATATATCAAACTCTTTTTCCTTGCAAGTATCTTATAATTCTCTTGTCGGCTTCCAAGTGAATTTGATTTAGGATTTGCATGATCCCTAA TAGAAAACTTATATCATACATGATATCTGATAGTATGACAGTGAGTTATAGAAGACTCCAAACTTCTACACAATGATACATTTTCCTTATAAGACTGATT ATCCTTATACAACTTCTCATTATTCATTAGTGGAGTAGCAACATGTATTCATTCAAGCATCTTGAACTTCTTGAATAGTTCTTCCGAGTACTTTCATCCA TGAGACATTGTTTCTTCTTTTCTTTGATTTGCCACAATGTCAACGAAGTAGTGCATTACACCAAGGTCTGACATCACGATGGTCTTCATAATGTCTTTTT TGAAACTCCGTTATCATTTTCATATTATTTCATGTAGATACGATCATCTACATATAAGGAGATAATAAGAGTTTTGTACTGACCTTGAATCTTAGGGTTA GTTCGAGAGTTAAATTTTGGAGGGGAAAGAAAGAAAATGGAAGGTTCGAGAGTCATCTTAAAAATATATTTCATGGCTCTCAAGCCTTCAATTTCACTTC TTCTCCCTCCAAAAATCAACTCCCAAACAGACCCTTAAGATATACCATAAACTCAATTTCACAAGCCTGAAACTTGTAGTTATTATGGTAAGATCGGGTT ATTCTGTCAACATTTCCTTCATCCTAATTCTGAGTAGCACTTTAATCAACTTAAATATCTCGATTAATCTATCTTTGAATATTATAAATCTAACAGCTAT TTGGTTATGTGCTATATTCTAAGAAGATATTTTGATAAAAAATTGTGATAAGAATACATGATAGTTAAATAGTTCTTACCAGATTTAAACAAATACATAG AAAAGCTTTAGACTAGATAACAAAATTTTGAGGTTGTTGAAAATTAGTTTAAGTGATGGTTTTTGCAAGGTGTGAGATAGAACTTAACTCTAACATTTTA TCTTTAGATTATTCCATTAACATAATATATTAACATCTTTGATAAATTCTAGATAATATAAATTATTCTATGTTATGCCTTTGTAATGCTATGCAACTTT GTAGATGATTGTAGAAATATGCAGCATTAGATATTTTAACACAGTTTCCTCTACAGACCCAGTTCATGCTGGATCAGCTATCTGATCTTCAACGCAAGGT ATAATATAACAATTTTGCTTTCCTTTGCCACCATTTGTTGTGTACCTTCTTTTAGTACTCATCAATTTTATGTCACCTGGATAGGAACACTTGCTAAGTG AGGCTAACAGATCTTTGAGACAAAGGGTAAGAAACATCTCACCAAATTAAACTATATATGTAAAATAAATCGGCAGCATAGTGCATGAGACTTCCTCTTA ATGGGATTTGAGGAGGATAGATCGTCACATCACACAAGCCTTTCTCTACGAATAGAGACTATTTATAAGATTTAAACTATTGATTTTATGGTCACTTAAA GGATCAGTCTTGACATATCTAAGGCTCTATCCAAGTAAAACAATATAGGTCCTAAATTTATTAAAAAAATTATATACAATTTTCTATGGGACTAGGAAAA TTGTGGCTATAAGTTCATGTCAAAGTTTTAGTAACAAAATTGATTTTTTAGACATTATGTAAAACTTAACATCAAATGTTGAACAAAATATAGATTTATA AGTTTCAAATTACACGAGTCTTAAAATTTTAATAATCTTATCTCTATTATCATATTTATTGAATGAATTTAAATTAGAACTATGAAATGTATTAAAATTA TTATATGATTTATAAAAATAAACATATTAATAAAGAAAAAAGAAAATATTTAATTAAAATTATTGAGAAAATGATGCATATACTAACATTGTAAGAAATT TTACACTATCATTATATCATCTACCATTTATTTTTAATTATCATTGATTTTTAAATAAAAGTAGTGCAAATAAAAGATGGATAATATATTGACCGTGTAT AAACCTTTATATCGGTGCATACATATTACACTCAAAATTATTATTTTTAAATTGGCTTCTTTTCATTGTGATGGGCGTCGCACCTGCCGAGGTTTGTCGT AATCACTAATCAATAACTTTACCCTTTCGCCGGCTTATAACCCTATTTTGATATTGAAAATTGAATGGCATAAGTGAAAGTGTTTGTTGTTTAATTAGCA GTTGGAAGGGTATCAAATAAATCAACTCCAAATGAACCCTAGTGTTGAAGATATGGGATATGGAAGACACCCATGTCACCAAGATCAAGGTGATCACCTC TTTCATCAAATGGAGTGTGAGCCAACATTACAAATTGGATATCAGCATGATCCAGTATCAGTGGTGACAGCAGGCCCAAGCATGAGTAATTATATGGCAG GATGGTTACCTTAGTTCAAAGCCCTTATAATAAGATCCACTCAGCACCAAATTTGTGGTTTCAATTTTATTGAGAGGAAAAAACAAAGTTAATATCTTTG GCATGTAATAGACTTATTTTAATTTATATAAATGTCTACTTTGTATTAGGAACAATATAATTAGTGCTGTTCTATGTGTGCTTTCATAAAACTGCACTTT CTTTGAATCCGTACATCTTTTATTCACTTTATTATAATAATAGAATAATTATTGTTATTTG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_69453; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_131804
Blastp | MADS-box transcription factor 1 from Pisum with 86.73% of identity |
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Blastx | MADS-box transcription factor 1 from Pisum with 86.73% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_014522694.1) |
Pfam | K-box region (PF01486.16) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |