Id Trinity | FTRINITY_DN57572_c1_g6_i5 |
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Name Transcript | Ll_transcript_132928 |
Sequence | CTCAAAACCTTGTTTCATTTGTTCCACGCCAAAGCTCATTTTATTATCCTTCACTGAAAAAAATCACTTATTACTTAAACAGCTTCTCAACTCTGACAAC ACTCTTTCACAATAACAATCACCTAAATCTACATCAAACAAAAACACCTTCCATTCTTCAAAGGTCAATTTTATTGAATTTAAATATCAAAGTTCGAGTT TCTTTTCCAACTTTTTTAGCTCCTTTGAGCTATTTCCTTGAACCCCATTAGTTTTCTCTCATCTGGGTATTCTTCTTTGCATGTGTTTTAAGTGAAAGTT TGAAGCTTTATCCTAATCCAAAGTTCCCCAATTTGATGGAACTCTAAATGGGTTCTTCGGAATCTATGATCCCATTAAAGAAAGGGAGCTTGTTTGGTTC TCAACCAAGTAGAAAAGAGAAGCACCCTTTTTCACAGAGGTTCAGATCCAGCTTCTCACGTTTGATGTTCAAGAAACTTGATTACATTCAATGGATTTGC ACTGTGGCAGTGTTCTTGTGTTTGGTTGTTGTTTTCCAAATGTTCTTGCCTATTTCTGTTGTGGAAAAGTCAGGGAATTCATTCAGAGCTGTGAGGGTGC GTTCTGGGAATGTGTCACACTATAAGGACATTAAGAATTATGTGTTGGACATTGAGAATTATGCCTTGGATATTGGGGAGGATGCTATTTTTGTTCCGAA GATTTCAGAGAAATTTCGCAGGAAGGATGTTGGTAGGGACATGAATTTGTTGAACCAGACGGTGCTGCATTTTGGGTATAGGAAGCCTCAGTTGGCAGTG GTATTTGGAGAACTTTTGGTTGATTCACAAGCATTGCTTATGGCAACAATTGCAGCTGCTTTTCTAGAGATTGGCTATGGAATCCGGGTCTTTTCAATTG AAGATGGACCAGGGCATAATGTGTGGACAAATTTAAAAGTTCCGGTCACTGTCATTCAAACTTGCGGCAAGGCAGATGGTGCTGTAGACTGGCTAAACTA CGACGGTATAATTCTGAGCTCTCTTGAAGCCAAGGGTGCCTTTTCTTGGTAAGATACTTATATTATTTCTGAAGAAGAAGATTCTGAATTTGGTTGTTAC CTGAATTATTTAATGACTTCACACTTCTCAATATTTCTTCGAAGGAATGACCTCTGATAGTTGTCTGATATGTTTTCTTTCAACTTTAATGCCATTACAT ATATTTGTTGTTGATCATATATAAAAAATTAATGCTTAAGTTTTTATTTCTACCGCCACAACAGACCTTCCCTATTCTTATGGTTTTTTTCTTCTGTGCC TGGAAATTTTCCATTCAAACACAAACATATTTTGGTATTTTAGATTCAAACTTATGAGCACCTCGTACAGGCATCTTTATCACTGTAATATGGACATGAT TGCTACAACTTTTCGTTCTTGTGGCTGTTTTTATATTTTGACCTGCGTTAACTTATTTGCCAAACGTTATCTCAAAATTGATGTCATAACATACATATGA TGCAATCTACAGTATGAAGAATGGGATTTTTCACTCATTGTGACTTTATCATGTAATTGCAATGTTTTGAAGCTTGGCAAATATTTGTTTTCTGATTGTA TTTGAGGCTTTTGCCATGAATATCCTTAATCAAATAACATGAATGATTTTATTTGTTGCAGTTTTTTGCAGGAACCTTTCAAGTCTATACCTCTTATATG GATCATTCATGAAAATGCTCTTGCTTATCGTTCAAAGCAATATACTGCTAGTGGGAAGACTGGACTTTTGAATGATTGGAGAAGAGCCTTCAATCGTTCA ACAGTTGTTGTCTTTCCAAACTATGCCTTGCCGGTAATATTATGCGGCAAATGATCTTTTATTTATTTGATGCATGGGCATCATACCTAGGGCCTCTACC CAAACCTCACCCACCCAACCGCCTGAGCTAAACTTTAAGCCCAGACATTGGGACAAGTTTATTTTTTTCTACTTACTGGGCAATGACCCCACGTGGTGGG TAACAGCTTGGTTGTTGTTGTAATGGGCAATGACATTTTCATGTAATCACACATTCCATTAGTTCATATAATCTGCTTTGTTGATATTCACGGTTATTTC ACTATTAACCACTTCAGCAAAAGATGTAAATAAGTTTCATATTGGATACTGTCATTATTTTATATTTATGGTGTAAACATTATAGTTATAAACTTATAAT TATAATTATTACTGTAACTATTAATTAGCATCAAGATAATTTGCATTTTGGGACTAATTAGTAATTGACAACTATTGTTTTTTTTATGTAAATCCACAGA TGATTTACTCCACTTTTGATGCTGGAAATTTTTATGTCATTCCTGGTTCCCCTGCTGAATCATTAGAGGCAGATGCATTTATGGCCGTACAAAAACATGA TTTGCGCATCAGAATGGGCTATGGACGAGAAGATTTGGTTGCTGCAATTGTTGGAAGTCAGTTTTTGTACAAGGGCATGTGGTTGGGGCATGCCATGGTT TTGCAGGCTTTATCACCACTTCTGGCAGACTTTCCATCAAGCAAAGATAATTCCAGCGCACAACTACGGATCATTGTTCATAGTGGAGAATTAACAAATA ACTATAGTGTCGCTCTTGAGACCATGTCTCGTAGCTTGAAATATCCAAGAGGTATTATCGAGCACATAGCTGGAGATTTGAATACAGATTCTGTTCTTGG CACAGCGGATGTTGTGATATATGGATCCCTTCTCGAAGAGCAGTCTTTTCCAGATATTTTGACCAAAGCCATGTGCTTAGAGAAACCAATTGTTGCTCCA GATATTCCCATGATCAGAAAATATGTTGATGACAGGGTGAATGGCTACCTTTTCCCGAAGGATAGTAGTAGACTTCTGAGACAAATTGTATTGGAAGTGG TATCAAACGGGAAAGTATCACCACAGGCTCGTCACATTGCCTCAATAGGGAGAAGCACTGCAAAGAACCTTATGGTTTCAGAAGCAATTGAGGAATATGC ATCCTTAATTCAGAATATTCTCCGGTTTTCATCAGAGGTTGTTCCTCCTAAGGCTGTTTCAGAAGTATCCCCCAATGTAAAAGAACAATGGCAGTGGCAT TTGTTTGAAGCAGTTCCAAAATTAACATATGAAAATAGGACAGCAAGAAGTTACACTTTCTTAGATAAATATGAGGACAAGTGGAATCTTTCTCAAAATA ATAGATCCACTATTATTGTTTCATCCAAGGATTCATTTGTATATAGCATATGGGAAGAAGAGAAGTTAATTCAGATGGCTATTACAACAAAAAGGAGAGA GGATGAAGAGTTGAAGGATAGAACAGAGCATTCACATGGAACTTGGGAAGAAGCATATCGAAATGCTAAGAAGGTTGATAGGTTAAAGAATGATTTGCAT GAAAGGGATGACGGAGAGCTTGAGCGAACGGGACAACCACTATGCATGTATGAACCTTACTATGGTGAAGGGTCCTGGCCTTTTCTGCATCAAAGATCTC TTTATCGTGGAGTTAGCCTGTCCACTAAAGGTCGAAGACCAGGGAGAGATGATGTTGATGCACCATCTCGTCTCCCACTGCTTACCAACACTTACTATCG AGATGTACTTGGTGAATATGGAGCCTTCTTTGCAATTGCAAACGTAATTGATCGTTTACACAAAAATGCCTGGGTTGGATTTCAGTCTTGGAGAGCAACA GCAAGGAAGGCATCCTTATCCAGAACTGCTGAAAATGCATTATTAGGCGCTATCCAATCCAAAAAGTTCGGGGATGCACTTTACTTTTGGGTGCGCATGG ATACGGATCCCCGGAACCCTTTGCAGAAGGACTTTTGGTCATTTTGTGATGCCATAAATGCAGGAAATTGCAAGTTTGCTTTCTCAGAAGCTATGAGGAG GATGTATGGGTTAAAAGATGATATGCATTCTTTGCCGCCTATGCCTATAGATGGTGACACCTGGTCTGTCATGCAGAGTTGGACTCTGCCTACAAGATCC TTTTTAGAATTTGTAATGTTCTCCAGAATGTTTGTCGATGCATTGGATATGCAGATGTATGATGAGCACCATTCAACCGGACACTTCCCTTTGAGTTTGT CAAAAGATAAGCATTGCTATTCAAGGCTTCTGGAGCTACTAGTAAATGTGTGGGCATACCACAGTGCAAGGAGGATGGTGTATGTGAACCCCGAAACGGG TGTAATGCAGGAACAACACAAGTTCAAGAGTCGTAGGGGTCGAATGTGGATTAAATGGTTCTCATACAGCACACTCAAGAGCATGGACGAGGACTTGGCG GAGTTATCAGATTCCAGAGATCCTAGCAGGCATTGGTTGTGGCCATTAACAGGTGAAGTATTTTGGCAAGGTTTATATGAGAGAGAGAGAAATTTAAGGC AGAAACAGAGGGAAAAGAGGAAGCAGAATAGTTTAGAAAAACAAGATAGAATAAGGAGACGTCACCGCCAACAAGTAATAGGGAAATACGTTAAGCCCCC GCCTGAAGGGGAAGAAAGCTCGAATTCGACTTTGCTTGCAGTAAAAGCATCAAGATCTACTACAAACACCACTCTTGAGTAGGTCCTGACAATTCTTTTC TTTTGTAATTCTTATCCATTTTTGTGATTTTCATTCAGAAAGAATGCACACTTAATTGGGGGTCTTGTGTGTAAAAATTGCATTCTTCTAGTCATTGGTG CTGATAAATAGCTAATATGTAAAGTAGCCTAATTTGTTTAGTTCTATTTTTTGCTTCCGTATTTCCATTCTTTCAGGATGATAGATTGGTTTAGAGAAAA GAGGTGTGGGAAGTTGTAATCTTAATAGCACTTGTCAATTTGAGTGAAATTAATATTATTCCACGTGCAACTATTCAAAAAGCACTTTTATGCATGTCTA GT BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_69794; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_132928
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019461275.1) |
Pfam | Glycosyl transferases group 1 (PF00534.19) |
Rfam | - |
GO | - |