| Id Trinity | FTRINITY_DN57601_c0_g1_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_149882 |
| Sequence | CAACAACAAAATTGTATGCCTAATGCATTTGTTTCGGGGCCGGACAAAAATGAGTGTTCACACATTTTGCTCTGAGTCTCCATTGATAGTTGTGTCGTGA TTGGAAAAAATATCTTCACCAATTAATGGTGGGATGTGTTTTGAATCACCTTTTTAAAATTAAATGTGTGGTGGAGAGAGTTTGTCCACTGGCACACAGC TTGGAGCACTGCCCAAGGCATTAATTGAAGGAAATAATTGAGTGGATTGATTTAAATCAGGAGAGAGAATAGGACTAGACAGTCTAGATTGATCCATTAA TTTAAAGAGTGGTGAGTGTGTTAGGCGGGTTCCATGAGGCAGTGTACCTTGCGAGTGAAGTGGGGAGTTAAAACACTTTTACTCCCAATTAATTCATTTT CATTATTTTCTCTGAGGGAAACCACATACTCCTTCTTTTTCTCTTCCTTCATCTTTCCCAACTCTTCCACTATCTTCTCTTTTTTAACACACTTCTCTTC ATCTCTAGCCATTTCAATCGGTGAAGGAGTATCTTCATCAGTCACCATTGTATTTTCAGAACCTGTGATAAGAGGATGAGCCTCCTCATGTCCAACCATA TGGTTCTCGGTTGCTGTCCTTGTTCCATTTTCGTTTTTAGAACCTGTGATAAGAAAATGAGCCTCCTCATGTACAATCATCCGCTTCTCGGGTTCTGTCC TTGGTCCATTTCCCCCCCCCCCCCCTTCTTCAACAGTGTTCTGGGAGGAGCCATTTAAATCAGTTGGAGCCATGTCAAAACCTGGTGGTAACTCCATGGC GGTCTCAGGCGCTGGGTCGTGGAAACATCTCTAAGCTGAAATGTGGAAAACAGGGTGAACCCGTGACTGAGTTGGTAAGGTCAGTTCACACACAACTTGT CCTATCCGTTTCACAACCTTGAATGGACCGAAGTATCAGCATGAAAGCTTCTTGGATGGCCTTCGGAAAACTGATTGTTGGTGATATGGTTGTAACCGTA ACAAGACTCAGTCTCCTGGAGTAAAGGTAATATCATTTCTCTTTGTATTGGCTTGTGATTTCATTCTCATTTGTGCATGTGTCAAATGTTTTTTAAGATT TGCTAAAAACTCAGCTCTTTGATGCAAGGTGTCACTAATCACCGTGTTAGTTGTTGTGTCGGGAATGTAATATTGGAGTTTGGGAGGAGCTCAATCGTAC AAGGCCTCAAACGAAGATAGTTGAATGGTCGAATGGTAGCTGGTGTTGTACCAGAACTCAGCTAACGGTAGACAAGTGAACCACGTTTCGGGGCGAGAAC TTGTGAGGCATCGAAGGTAAGTCTGTAACCCTCTATTTATTACTTCTATTTGACCATCTGATTGAGGATGATATGATGTACTGTAGCAAAGTGTAGTCCC TAACAATGTAAACAATTCCTTCCAAAACGCACTTAGGAATATTTTATCACGGTCTGAGACAATTGTCTTGAGAACCCCATGAAGCCGACAGATTTCGTTG AGAAATCAATGAGCTAGGCTCTCGGCTGTAAACTTAGTTGGAAGGTCAATGAAGTGGACATATTTAGTGAGTCTATCCACAATGACCCAGATCACAGTAT GCCCATGAGACATTGTCAGATGTGTCACAAAATTCATAGATAGATCCTCCCATACCTTTTCTGGAATTTGTAGTGGTTGTAACATGCCTTGGTATTTCTT GGGAAGGTACTTGTTGGATTGACAGACACAACATTAGTGGACAAAAAGCTTAACTTGCTTAGTGATGCCTGACCAAGAGAAAGCAACCGAGAGTCTGACT AGGGTGGCCTTCCAACCCGAGTGACCTGCTATTGGAGTATCATGATATTCATGGATCAAGGAGATACGCAGGTTGTCGAGGTCAGGTATAAAAATTCGTC CCTTGTAGAACAATAAACCTTGTGAAAAATGGTATGACCTATGCTCACTGTTTTCTGATTCTTGTTTCTTGATGATGGCATGCCCTTCCGGTGAGGAAAA GAAATGCCTCAAGCGGTCAATAAGTTAAGGAAATGGGGAGAACAAGGATACCATGATGGGAATGTCTTCACTACTACAACGAGATAAGGCATTTGCAACC CGATTTGAAGTACATGTCCTATACTTGATAATATACTAAAATCCTATTAACTGTGTTGCCCATTCCTGCTGCTCTAGTGTTTGAAACCCTTGAGTCATCA AGTGTCTAAAACTTTGTTGATCAGTATATATTGTAAATTGTTTGCCTAATAAGTATTGTCTTCATTTCTTAACATATTCTGTCACAACAAACATTTCACG GACATAAGCAGAGGAATGTTGCATCCTGGTGAACATCTTCTTGTTGAAATAAGCTAGAGGATACCCATGTTAAGAGAGCACTGCCCCAATTGCCACAGCA GACGCATTGGTTTCAATGACAAAGGGTGACAAGAAATCAGGAAATTGCAACACTGGTGTTATTGTCATAGATTTTTTGAGATTTGCAAAGGCGGATTGTG CCTCGTTTGTCCATGTAAACTGTTGTAATCTTAACAAATCAGTGAGTGGAGCAGTGATAAAGGTATAATGCCGAACAGACTTTCGATAGAACCCTGTGAG GCCCAGGAAGCCCCTGAGAGTCGTGAGAGAACGAGGTGGTGGCTAATCCACCATTGCTTGTATCTTATCTGGGTATGGTTGCACCTTGCCTGATGTGATA ATGTGTTTGTGATAAGTAACAGACGCAACACCAAAAGAGCACTTAGAAAATTTGGCATAAAATTGATTAGCAACCAATAGGTCCAATACAACATGCAAAT GAGCTAAATGATCATCTAAACAAGTGTTGTACATAAGTATATTATCAAAGAATACCAATATGAATCGCCGCAGATGTGGCCTTAAAAGGTTATTCATAGC CGCCTGAAATGTAGACGGCATATTAGTTAGCCCAAATGACATAATTAGGAACTCATAATGTCCATCAAAGGTACGAAATGTCATCTCGTGTGTATCCCCT GAATGCACACAGATTTGGTGGTATCCCGAGCGGAGATTAATTTTAGAGAATATAGTGGCAACACCAAGTTCACCCAGTAACTCCTCAATTGTCGGAATAG GAAAATGGTCCCGAACTGTCAGGGCATTCAGTGCCCGATAATCCACACAGAATCTCCATGTCCCATCTTTCTTTTTAACCAGTAAAACAGGGAAAGAGAA AGGGCTGGTACTTGGGGTTATTATGCCCTCGTTGGTATTGAGGGTATCTATAGGGCTTCAGTGATAACGGGGTAGAATTTGGAAGAAGAGTAATATGATG GTCATGTGGTCTAGGTGGAGGTTGGCCTTATGGGTTTTGTAATAATGGTTGTAAGGTGGAGAGTAGGTTAGTTATAGCTGGATGGACATTGGAATTGTTA GGTATATCAGGTGAGGTTTTAGTTGTCATGGGTAAGGAAGGTAATTGTGTGTAAGGAAGCTATTGTGTCAGTGTGGAATAGGCGGTTGAGATGGTTTAAA GTAGAGGGTGAGTAGGATTGTGAGGAGTCCCCTTGGAGAGTGATAGTGTTGTCGCCCACCTTAAATGACATTGAAGGAATAGCAAAATCTGATGTTACCA GCCCAAGTGTCCCTAGCCACTCAATTCCTAGGATGACATCTACTCCCTTTATATGAAGTAAATATAGAGGAATGTGAAATAACTGATTTTGCATCATAAT TGGGGTGTTGGAGCACAACCCCGAGCAATAAATATGCGCCCCATTTCTCACCATGACTGGAAATTGTGGGGTAGGGGAAATCTTTAGTTGCTAGTAGTTC GCCAACCTTGGTTGTATAACATTATGTGAGCTTCCAGTATACACTAAAATTGTGACCGGTTGTCCTGCAATAGAGCCCTGAAACCGAAGTGTTTTGGGAG AGGGTTGTCCCTCTAGGGCTTGTTCAGAAAGTTGAAAATGTATAAATTCATCTTGGTTGTCTTGGTGTTCAACTTCTGTATTCTCAAGACTGGACATAAA AGTGTCTGTCGGTGGTGGTGAATCATCCACCATAACCAGTAAGAAACGCTGGCATTTAAGTCCAGCGTGAAATTTCTCATCACAATTGTAGCAAAGTCTT TGTGCCCGTCGCTCCTACATTTGTGCAGTTGTGAGGCGATGTATGGGTATAGTTGGTTGTTTTGTTTGAGTGGGTGGAACTTGGTTTGGAAGTGTGTTTG GTTTTGTGTATTGGAATGGCTGAGTAGTGTTTAGGTAATGAGGTTGTTTAGTGAAGGGTGTTTTAGAGTCCTTGATCTTTGATTCAACCAACTTAGCTAG GCCCAATTAATCAGTAATATTAGTGGGACAAAAGATAGGAAGTTCCCTTTGAATTTCAACATTAAGACCAAATAAAAAATAATTAAGAATTACCTCTAGT GGTTAACCCCAAATTAATTTACAATTTTTCTCAAAGTGTTGTTGATAGTTTGCAACAGATCCTATTTGGCGGAGCTTAAAGAGTTATGTCTGATGATTTT CATAGCATGATGGTCCAAAACGTGTCTCTAGTGAGCGAGTGAAACTCTCCCAATCAGTAAAGTTGTAGTTGTGAAAAGCCCACTTAAACCAACTAAGTGC CCCTCCCTTCATATAGAATGAAATAAGATGTAGGCGTTGGTCTGGAGGAATTTGACATGGCTGAAAAGTTGTTCAGCTTGAAAAAGTCAGTCTAGAGGTT TGGAGCCATCAAATGGAATTAGTTGAAGCTTCAGAGGTCTTGGTTGAGGTGGAGGGTTGGTCGTAGGAGTGTAGATTGGACGGACATAGGGGTTATGTGT GAAAAAAAGGGGAAACATGGAGTTGGTATAGTTGGGAAAGAAGTTATGTGTGAAAAAAAGGGGAAACATGGAGTTGGTATAGTTGGGAAAGAAGTTA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_70042; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_149882
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Transposon Tf2-6 polyprotein from Schizosaccharomyces with 29.98% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019450597.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |