Id Trinity | FTRINITY_DN57601_c0_g1_i5 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_149884 |
Sequence | CAACAACAAAATTGTATGCCTAATGCATTTGTTTCGGGGCCGGACAAAAATGAGTGTTCACACATTTTGCTCTGAGTCTCCATTGATAGTTGTGTCGTGA TTGGAAAAAATATCTTCACCAATTAATGGTGGGATGTGTTTTGAATCACCTTTTTAAAATTAAATGTGTGGTGGAGAGAGTTTGTCCACTGGCACACAGC TTGGAGCACTGCCCAAGGCATTAATTGAAGGAAATAATTGAGTGGATTGATTTAAATCAGGAGAGAGAATAGGACTAGACAGTCTAGATTGATCCATTAA TTTAAAGAGTGGTGAGTGTGTTAGGCGGGTTCCATGAGGCAGTGTACCTTGCGAGTGAAGTGGGGAGTTAAAACACTTTTACTCCCAATTAATTCATTTT CATTATTTTCTCTGAGGGAAACCACATACTCCTTCTTTTTCTCTTCCTTCATCTTTCCCAACTCTTCCACTATCTTCTCTTTTTTAACACACTTCTCTTC ATCTCTAGCCATTTCAATCGGTGAAGGAGTATCTTCATCAGTCACCATTGTATTTTCAGAACCTGTGATAAGAGGATGAGCCTCCTCATGTCCAACCATA TGGTTCTCGGTTGCTGTCCTTGTTCCATTTTCGTTTTTAGAACCTGTGATAAGAAAATGAGCCTCCTCATGTACAATCATCCGCTTCTCGGGTTCTGTCC TTGGTCCATTTCCCCCCCCCCCCCCTTCTTCAACAGTGTTCTGGGAGGAGCCATTTAAATCAGTTGGAGCCATGTCAAAACCTGGTGGTAACTCCATGGC GGTCTCAGGCGCTGGGTCGTGGAAACATCTCTAAGCTGAAATGTGGAAAACAGGGTGAACCCGTGACTGAGTTGGTAAGGTCAGTTCACACACAACTTGT CCTATCCGTTTCACAACCTTGAATGGACCGAAGTATCAGCATGAAAGCTTCTTGGATGGCCTTCGGAAAACTGATTGTTGGTGATATGGTTGTAACCGTA ACAAGACTCAGTCTCCTGGAGTAAAGGTAATATCATTTCTCTTTGTATTGGCTTGTGATTTCATTCTCATTTGTGCATGTGTCAAATGTTTTTTAAGATT TGCTAAAAACTCAGCTCTTTGATGCAAGGTGTCACTAATCACCGTGTTAGTTGTTGTGTCGGGAATGTAATATTGGAGTTTGGGAGGAGCTCAATCGTAC AAGGCCTCAAACGAAGATAGTTGAATGGTCGAATGGTAGCTGGTGTTGTACCAGAACTCAGCTAACGGTAGACAAGTGAACCACGTTTCGGGGCGAGAAC TTGTGAGGCATCGAAGGTAAGTCTGTAACCCTCTATTTATTACTTCTATTTGACCATCTGATTGAGGATGATATGATGTACTGTAGCAAAGTGTAGTCCC TAACAATGTAAACAATTCCTTCCAAAACGCACTTAGGAATATTTTATCACGGTCTGAGACAATTGTCTTGAGAACCCCATGAAGCCGACAGATTTCGTTG AGAAATCAATGAGCTAGGCTCTCGGCTGTAAACTTAGTTGGAAGGTCAATGAAGTGGACATATTTAGTGAGTCTATCCACAATGACCCAGATCACAGTAT GCCCATGAGACATTGTCAGATGTGTCACAAAATTCATAGATAGATCCTCCCATACCTTTTCTGGAATTTGTAGTGGTTGTAACATGCCTTGGTATTTCTT GGGAAGGTACTTGTTGGATTGACAGACACAACATTAGTGGACAAAAAGCTTAACTTGCTTAGTGATGCCTGACCAAGAGAAAGCAACCGAGAGTCTGACT AGGGTGGCCTTCCAACCCGAGTGACCTGCTATTGGAGTATCATGATATTCATGGATCAAGGAGATACGCAGGTTGTCGAGGTCAGAAATGCCTCAAGCGG TCAATAAGTTAAGGAAATGGGGAGAACAAGGATACCATGATGGGAATGTCTTCACTACTACAACGAGATAAGGCATTTGCAACCCGATTTGAAGTACATG TCCTATACTTGATAATATACTAAAATCCTATTAACTGTGTTGCCCATTCCTGCTGCTCTAGTGTTTGAAACCCTTGAGTCATCAAGTGTCTAAAACTTTG TTGATCAGTATATATTGTAAATTGTTTGCCTAATAAGTATTGTCTTCATTTCTTAACATATTCTGTCACAACAAACATTTCACGGACATAAGCAGAGGAA TGTTGCATCCTGGTGAACATCTTCTTGTTGAAATAAGCTAGAGGATACCCATGTTAAGAGAGCACTGCCCCAATTGCCACAGCAGACGCATTGGTTTCAA TGACAAAGGGTGACAAGAAATCAGGAAATTGCAACACTGGTGTTATTGTCATAGATTTTTTGAGATTTGCAAAGGCGGATTGTGCCTCGTTTGTCCATGT AAACTGTTGTAATCTTAACAAATCAGTGAGTGGAGCAGTGATAAAGGTATAATGCCGAACAGACTTTCGATAGAACCCTGTGAGGCCCAGGAAGCCCCTG AGAGTCGTGAGAGAACGAGGTGGTGGCTAATCCACCATTGCTTGTATCTTATCTGGGTATGGTTGCACCTTGCCTGATGTGATAATGTGTTTGTGATAAG TAACAGACGCAACACCAAAAGAGCACTTAGAAAATTTGGCATAAAATTGATTAGCAACCAATAGGTCCAATACAACATGCAAATGAGCTAAATGATCATC TAAACAAGTGTTGTACATAAGTATATTATCAAAGAATACCAATATGAATCGCCGCAGATGTGGCCTTAAAAGGTTATTCATAGCCGCCTGAAATGTAGAC GGCATATTAGTTAGCCCAAATGACATAATTAGGAACTCATAATGTCCATCAAAGGTACGAAATGTCATCTCGTGTGTATCCCCTGAATGCACACAGATTT GGTGGTATCCCGAGCGGAGATTAATTTTAGAGAATATAGTGGCAACACCAAGTTCACCCAGTAACTCCTCAATTGTCGGAATAGGAAAATGGTCCCGAAC TGTCAGGGCATTCAGTGCCCGATAATCCACACAGAATCTCCATGTCCCATCTTTCTTTTTAACCAGTAAAACAGGGAAAGAGAAAGGGCTGGTACTTGGG GTTATTATGCCCTCGTTGGTATTGAGGGTATCTATAGGGCTTCAGTGATAACGGGGTAGAATTTGGAAGAAGAGTAATATGATGGTCATGTGGTCTAGGT GGAGGTTGGCCTTATGGGTTTTGTAATAATGGTTGTAAGGTGGAGAGTAGGTTAGTTATAGCTGGATGGACATTGGAATTGTTAGGTATATCAGGTGAGG TTTTAGTTGTCATGGGTAAGGAAGGTAATTGTGTGTAAGGAAGCTATTGTGTCAGTGTGGAATAGGCGGTTGAGATGGTTTAAAGTAGAGGGTGAGTAGG ATTGTGAGGAGTCCCCTTGGAGAGTGATAGTGTTGTCGCCCACCTTAAATGACATTGAAGGAATAGCAAAATCTGATGTTACCAGCCCAAGTGTCCCTAG CCACTCAATTCCTAGGATGACATCTACTCCCTTTATATGAAGTAAATATAGAGGAATGTGAAATAACTGATTTTGCATCATAATTGGGGTGTTGGAGCAC AACCCCGAGCAATAAATATGCGCCCCATTTCTCACCATGACTGGAAATTGTGGGGTAGGGGAAATCTTTAGTTGCTAGTAGTTCGCCAACCTTGGTTGTA TAACATTATGTGAGCTTCCAGTATACACTAAAATTGTGACCGGTTGTCCTGCAATAGAGCCCTGAAACCGAAGTGTTTTGGGAGAGGGTTGTCCCTCTAG GGCTTGTTCAGAAAGTTGAAAATGTATAAATTCATCTTGGTTGTCTTGGTGTTCAACTTCTGTATTCTCAAGACTGGACATAAAAGTGTCTGTCGGTGGT GGTGAATCATCCACCATAACCAGTAAGAAACGCTGGCATTTAAGTCCAGCGTGAAATTTCTCATCACAATTGTAGCAAAGTCTTTGTGCCCGTCGCTCCT ACATTTGTGCAGTTGTGAGGCGATGTATGGGTATAGTTGGTTGTTTTGTTTGAGTGGGTGGAACTTGGTTTGGAAGTGTGTTTGGTTTTGTGTATTGGAA TGGCTGAGTAGTGTTTAGGTAATGAGGTTGTTTAGTGAAGGGTGTTTTAGAGTCCTTGATCTTTGATTCAACCAACTTAGCTAGGCCCAATTAATCAGTA ATATTAGTGGGACAAAAGATAGGAAGTTCCCTTTGAATTTCAACATTAAGACCAAATAAAAAATAATTAAGAATTACCTCTAGTGGTTAACCCCAAATTA ATTTACAATTTTTCTCAAAGTGTTGTTGATAGTTTGCAACAGATCCTATTTGGCGGAGCTTAAAGAGTTATGTCTGATGATTTTCATAGCATGATGGTCC AAAACGTGTCTCTAGTGAGCGAGTGAAACTCTCCCAATCAGTAAAGTTGTAGTTGTGAAAAGCCCACTTAAACCAACTAAGTGCCCCTCCCTTCATATAG AATGAAATAAGATGTAGGCGTTGGTCTGGAGGAATTTGACATGGCTGAAAAGTTGTTCAGCTTGAAAAAGTCAGTCTAGAGGTTTGGAGCCATCAAATGG AATTAGTTGAAGCTTCAGAGGTCTTGGTTGAGGTGGAGGGTTGGTCGTAGGAGTGTAGATTGGACGGACATAGGGGTTATGTGTGAAAAAAAGGGGAAAC ATGGAGTTGGTATAGTTGGGAAAGAAGTTAGGTGTTGTTTGTGGTTGTGGAAAGGGTGGAACAACATTTGTGGGGTTGGGAGGAGATGTAGTGGATGAAC TAGTTGTGCAGAAGGTGGAGGAGTTGGATCTGGGGTTGAGGAGGGGGGAATGGTTATTGTGGCTAATTTATCAGTGGTTCTATGGAGGGCCTCCGCAATT GCTTCATGCCTAAAATCCTATTGATCTTGATGCTCCTTAAGTTCTCTGTAAAAAGTTGTAACAATGTATCATCCATCTCCTTGCTAACAGCTTTGGGAGG CATGATACAAGAATGAAAGCACCAGAATGTTACAGAATTTCTAGTGAGAAGAGATTAAGAACCTAGAATTATTGAAATAACTATCTAACCAAGGATAGAA AATACTGAATAATACTTCATTGATTGTTTTTCTGCAGCAACAACCACATACATATATACTTTCAAGCAGTTTTTAGGGTTTACATCCTAATTGGGCTTAC GTATTGGCCCAATATTTTAATTGAAATAACAACTGAAAATATATTAAAATTCATTTAATATAATCTACAAGTCATTTACCTCTTTGTCTATTTCTTTTGG GTCTAGTTGGGTCATCTGCTCTTGGACTATTATCAGTCTTTTGTCTTAAACTTATTAACAAGGTGGCCTTTAACCTGTTCAATCTTCATAGTGTTGTTTC CGGCTAGCACTAGATCATCTACATATACTAAAAGAGCTGTAAAATCCTTCCTGTAAGCTTTAGTGAATGAGGAATGATCATGATGAGATTGATTGTACTC AAAGGAAAGCAAGAAGTTGGATAACTTGTTGTACCATTGTTTGCCTGAGTCCATAAAGGGACTTATGCAGTTTGCAGACCCTTCTGCAGTCTACTAAAGT GGGCGCTTTGTTAACATTGACATAGAATAAGTGAACCCTAAGTTTTCATTGAACAAAACAGTCAGCACTACGGTGGACACAAGACCGACACTAATTAAGT CCTCAACATCAGTTTATTTCTTTCTAATTTTGTGTTGCCTAGCAAAAGCCAACGCTAATAGCCAATTTTCTTGTAAATTTCTTGTAGGTTGAAATTGTCA TAGTAGAGAGCACCGAGTCTCATTAAAGTTATGAGTGTAATATTTATGCACTAATAATATAAAGATTTATATATAGTCAATATATTATCCACTTTTATTT TAATTAAATGTATGGTGAATGATATATTGACAGTGTTAACATATCTTACAGGGTTATCATATGCATATTTTCCTCTAAAAGTTATACTAAAAGTTCTATG GATTATTTGCTGTTTTCTGGCCCCATAAAAAGAATATCCATCAATTTGTCTCACGAATTCCAATATATGACAAGATAACCGAATAGTCACCCATTCGAAT TAAGATTTCTAATGTCTTTCATCAAATTTCGAAGATGATTTTTTTTCAAGTTTAGCAAATAGTTAGCTTCTTCAACCTCTATTCATAGCGTGAATTGCGG CATGTGTCTTGGTATCACCTATCATATTGGTTGTTCCCAATATAGCTTAATAAAGAAG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_70042; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_149884
Blastp | - |
---|---|
Blastx | Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 from Sophophora with 37.03% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019450597.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |