Ll_transcript_148027

• Id Trinity: FTRINITY_DN57604_c0_g1_i11
• Name Transcript: Ll_transcript_148027
• Sequence: CTAAACTTCCTAGTTCTTACCTAGTGGCTACTTGTTAGATGCAGACAAGTTGAAATTAATTTTGTTGCATATTATTTACCTATATATCAGTGGTCATGCA TGAATCTTCGAAAAACAAAATCACTTTTTGCTCTCTCTTATTATTTCTACAGATTTCATCCCCTTTAAAGGAATATCTCCCAATATTTCCTCTGCTCTTC TTTCCTTTTTTTTTCCTATTTCCTTTTGTAATCATCGAAACATCACCTTCACGTTTTATTTCCAACCTCTTTATTTACCTTTCCTCATTTTTCTTCTCTG TCTCGGCTTGAATCATTTCATAACCTTTTCAATTTGCCTAGAATTCGAACACAGAGATTGGGTTTTAACTTTTCTCTGTTCGAATTCTTTGGACTTTGTT TTCCTTCTCTTCCTCAAATCATCTATACTACAAAAAAAGCAAAGGTTTCCTGAAATGCCCTTTCTTTTCATGATTTCGGGATTCATTTGTTGATGAGATC AATTGGTGCTTAGAATGGACAGCTCAGAGATATAAATTTGAACTCAAAATTTGATTTTGAAGTTTTAAACTCTTCAATCATCCGAATTTGTGTAATTGTT TATTGTTAGAGAGGGTGGACAAAATGGCTTTTGGTTTAATCTCTGCAGTTTCAAAACTGCAAATGGTATCCACTTCGGATCATGCATCTGTAGTCTCAAT GAACCTGTTTGTTGCACTTCTGTGTGCTTGTATTGTCATTGGTCATCTTCTCGAGGAGAATCGTTGGATGAATGAGTCTATCACTGCCCTTTTGATTGGT CTTTGCACTGGTGTAGTCATTTTGCTGCTTAGTGGTGGTACAAGCTCACACGTTCTTGTTTTCAGTGAAGATCTTTTCTTTATATACCTTCTTCCACCTA TAATATTTAATGCTGGGTTTCAAGTGAAAAAGAAGCAGTTTTTTGTCAACTTTATGACCATCATGTTGTTTGGTGCTATTGGTACATTAATATCTTGTAC CATCATAACCTTGGGTGTTTCTCAAATTTTTAAGAGGATGAATATCGGTCCGCTGGAAATAGGGGATTATCTAGCAATTGGTGCAATATTTGCTGCGACC GATTCTGTGTGCACATTGCAGGTGCTAAATCAGGATGAAACACCTTTACTGTACAGTCTTGTATTTGGGGAGGGTGTTGTGAATGATGCTACATCAGTGG TGCTTTTCAATGCAATCCAGAGCTTTGACCTCGAGCAAATTGACACGTCAATTGCCTCACAATTTATTACCAACTTCTTGTATCTGTTCGTGACAAGCAC ATTGCTCGGGGTTTTGGTAACTATCTCCCTCTAATTCCCTCATGCACACATGACAAAATTATATGAACAATATCTATATCAATAGTGAGCCTGCACATTA ATATTGATATTACATGTGGCTCTGGTCTAATGTATCTCCGTCGCCTTGTAGTCAGGTCTTCTCAGTGCCTACATCATTAAAAAGTTGTATATTGGCAGGT AACTTCTTAACAGTTGTTGTCATTATCATTGTCAGCAGTTACTGAGATAGTGTTCATTATTTTGTATCATATTTATGTAGTTTATTCGTATCAAAACTAA TGTTGTAGATAATTCTTGGATACCAAGAAATTGGAGTTCCTGTTTTTGCCAATCCCTATTAATCTGACAGAAAGTCTTTAGAGTTTAACGAGATTATATA GACCTTGGTTTGGTTGTTTGAATCTATGTTACTGGTTCGTTACTGCTTGCGACCAGAATAATGGGGTTCATTATATTATTATTATTTTAAATGGTGGTTT GTCATTTGACTGGTTCTAAATGTACTGTCTATTATTAATGATGTCATACCACATAGAACTGAACAAGTTTAATTAAATACCCTGATGAATGATGCATCCC TGAATTCTCACTGGGTACAAATTGGTATATTTTTCAATGGAGTCTTGATTTTTTATCAATGTGGCATACATTACGTTATTGCTCATGAATCTCTTAATAA GTTCCTGTTGTCTCTGTCTGTGAACCTGATGTATTTTCTTGGATATATGATTTTATAGACTTGGCTAGGGATGATTTGAAACATTTGTTTACTGAGGTTC AACAATTTTTTCCTTAATTCCAGGCACTCTACCGATCGAGAGGTTGCTCTCATGATGCTAATGGCATACCTCTCCTACATGCTGGCCGAGTTATGCTATC TGAGTGGCATTTTAACTGTATTCTTTTGTGGGATTGTTATGTCTCATTATACTTGGCACAATGTGACTGAGAGCTCAAGAGTCACCACGAAGCATGCTTT TGCAACCTTGTCGTTTGTTGCTGAGATCTTTATCTTCCTTTATGTTGGTATGGATGCTATGGACATTGAAAAATGGAGGTTTGTCAGTGATAGCCCTGGA ACATCCGTAGCAGCAAGTTCAATATTGTTGGGTCTAGTACTTGTTGGAAGAGCAGCGTTTGTTTTCCCGTTATCCTTCCTATCGAACTTATTTAAGAAGT CACAAAGTGAGAAGCTCTCCTTCAGACAGCAGATTATCATTTGGTGGGCTGGTCTTATGCGAGGTGCTGTTTCCATGGCACTTGCTTATAATCAGTTCAC TATGTTGGGTCATACACAACTGCGTACCAATGCAATCATGATCACTAGCACAATCACTGTTGTGCTTGTCAGCACAGTGGTGTTTGGTTTGATGACTAAG CCACTGATAAGGCTTTTGCTTCCTCATGGCCCTCCTAAAGGCACAAGCAGCATGATAAGCACAGATCCATCCACTCCAAAATCATTCACTATCCCACTTC TAGGAAGTGCTCAAGAATCTGAAGCTGATATCGGTGGCCATGAAATTCATCGTCCAAGCAGCATCCGTGCCTTACTAGCCACTCCAACGCACACCGTTCA CCGACTATGGCGCAAGTTTGATAATGCATTCATGCGTCCTGTTTTCGGCGGCAGAGGTTTTGTTCCCGTGGAGCCTGGCTCACCATCTGAACGCAATGGT CATCAATGGCGTTGAGAGAAAAGCCAACAAGTTTGTAAAAATGTATTTTAACTACGTTTATGCATAATGTATGGTAAAGTACGTGCATTTTTTGGAGATC AAGCAATGCATGTATGTATTTAAGAGCCATGCAATGTAATTTTGTTAAGCTTTTTGGGTAGTGATGAGAGTTGGAAAGCTTGTGTGAACCATAAGTCACC ACCTCTCTTTTGAAGCTCTATTATTTGTATTATTAGATTCTTTGATTTATTATCATAAGAGTCATGTTAATTTTCGTGAGTAGTGTTATTTAAACATCAT GCTTTAGATATTGTATTTAATATTATATACATTTATCTTCATCTTTTGTGTATTTTTAATCTTTTCCATGTCATATTATAATATTCAAGTTGACTTGATT AATCC
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_70076;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_148027

FPKM

• FPAB: 48.6
• FPNAB: 14.6
• LF1: 9.9
• LF2: 13.5
• LF3: 23.6
• LF4: 27.4
• UF1: 7.8
• UF2: 11.9
• UF3: 27.6
• UF4: 29.6

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_148027

• Blastp: Sodium/hydrogen exchanger 2 from Arabidopsis with 73.17% of identity
• Blastx: Sodium/hydrogen exchanger 2 from Arabidopsis with 74.07% of identity
• Eggnog: Sodium hydrogen exchanger(COG0025)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G05030)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019427838.1)
• Pfam: Sodium/hydrogen exchanger family (PF00999.20)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;