| Id Trinity | FTRINITY_DN57604_c0_g1_i22 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_148039 |
| Sequence | CTAAACTTCCTAGTTCTTACCTAGTGGCTACTTGTTAGATGCAGACAAGTTGAAATTAATTTTGTTGCATATTATTTACCTATATATCAGTGGTCATGCA TGAATCTTCGAAAAACAAAATCACTTTTTGCTCTCTCTTATTATTTCTACAGATTTCATCCCCTTTAAAGGAATATCTCCCAATATTTCCTCTGCTCTTC TTTCCTTTTTTTTTCCTATTTCCTTTTGTAATCATCGAAACATCACCTTCACGTTTTATTTCCAACCTCTTTATTTACCTTTCCTCATTTTTCTTCTCTG TCTCGGCTTGAATCATTTCATAACCTTTTCAATTTGCCTAGAATTCGAACACAGAGATTGGGTTTTAACTTTTCTCTGTTCGAATTCTTTGGACTTTGTT TTCCTTCTCTTCCTCAAATCATCTATACTACAAAAAAAGCAAAGGTTTCCTGAAATGCCCTTTCTTTTCATGATTTCGGGATTCATTTGTTGATGAGATC AATTGGTGCTTAGAATGGACAGCTCAGAGATATAAATTTGAACTCAAAATTTGATTTTGAAGTTTTAAACTCTTCAATCATCCGAATTTGTGTAATTGTT TATTGTTAGAGAGGGTGGACAAAATGGCTTTTGGTTTAATCTCTGCAGTTTCAAAACTGCAAATGGTATCCACTTCGGATCATGCATCTGTAGTCTCAAT GAACCTGTTTGTTGCACTTCTGTGTGCTTGTATTGTCATTGGTCATCTTCTCGAGGAGAATCGTTGGATGAATGAGTCTATCACTGCCCTTTTGATTGGT CTTTGCACTGGTGTAGTCATTTTGCTGCTTAGTGGTGGTACAAGCTCACACGTTCTTGTTTTCAGTGAAGATCTTTTCTTTATATACCTTCTTCCACCTA TAATATTTAATGCTGGGTTTCAAGTGAAAAAGAAGCAGTTTTTTGTCAACTTTATGACCATCATGTTGTTTGGTGCTATTGGTACATTAATATCTTGTAC CATCATAACCTTGGGTGTTTCTCAAATTTTTAAGAGGATGAATATCGGTCCGCTGGAAATAGGGGATTATCTAGCAATTGGTGCAATATTTGCTGCGACC GATTCTGTGTGCACATTGCAGGTGCTAAATCAGGATGAAACACCTTTACTGTACAGTCTTGTATTTGGGGAGGGTGTTGTGAATGATGCTACATCAGTGG TGCTTTTCAATGCAATCCAGAGCTTTGACCTCGAGCAAATTGACACGTCAATTGCCTCACAATTTATTACCAACTTCTTGTATCTGTTCGTGACAAGCAC ATTGCTCGGGGTTTTGGTAACTATCTCCCTCTAATTCCCTCATGCACACATGACAAAATTATATGAACAATATCTATATCAATAGTGAGCCTGCACATTA ATATTGATATTACATGTGGCTCTGGTCTAATGTATCTCCGTCGCCTTGTAGTCAGGTCTTCTCAGTGCCTACATCATTAAAAAGTTGTATATTGGCAGGT AACTTCTTAACAGTTGTTGTCATTATCATTGTCAGCAGTTACTGAGATAGTGTTCATTATTTTGTATCATATTTATGTAGTTTATTCGTATCAAAACTAA TGTTGTAGATAATTCTTGGATACCAAGAAATTGGAGTTCCTGTTTTTGCCAATCCCTATTAATCTGACAGAAAGTCTTTAGAGTTTAACGAGATTATATA GACCTTGGTTTGGTTGTTTGAATCTATGTTACTGGTTCGTTACTGCTTGCGACCAGAATAATGGGGTTCATTATATTATTATTATTTTAAATGGTGGTTT GTCATTTGACTGGTTCTAAATGTACTGTCTATTATTAATGATGTCATACCACATAGAACTGAACAAGTTTAATTAAATACCCTGATGAATGATGCATCCC TGAATTCTCACTGGGTACAAATTGGTATATTTTTCAATGGAGTCTTGATTTTTTATCAATGTGGCATACATTACGTTATTGCTCATGAATCTCTTAATAA GTTCCTGTTGTCTCTGTCTGTGAACCTGATGTATTTTCTTGGATATATGATTTTATAGACTTGGCTAGGGATGATTTGAAACATTTGTTTACTGAGGTTC AACAATTTTTTCCTTAATTCCAGGCACTCTACCGATCGAGAGGTTGCTCTCATGATGCTAATGGCATACCTCTCCTACATGCTGGCCGAGTTATGCTATC TGAGTGGCATTTTAACTGTATTCTTTTGTGGGATTGTTATGTCTCATTATACTTGGCACAATGTGACTGAGAGCTCAAGAGTCACCACGAAGCATGCTTT TGCAACCTTGTCGTTTGTTGCTGAGATCTTTATCTTCCTTTATGTTGGTATGGATGCTATGGACATTGAAAAATGGAGGTTTGTCAGTGATAGGTAAGCC TATGTTCTTTCACTCCTCTGAGAGACTTGTAAATAGTCATCGAGACCCCAACTTTTCTTCACCGGTGAAAAATTGTTGAATGTCATCCTTCTCATGTTGT ATGATATAAGCTTATTTACTTAATCAGTCCTTATATTACTTGATAATTGATATGACTGGAAAGTTCTTCTGTATTCTCTGTTTTGTCATTTGGGCTTTTA TCTTTGGAAAGTTTATCCTTCACTCCTCAATCTTTACCCTCAAAACTTCCTTTATTATAATAGAAAAACAATTCATGTGCCACATTCTTCTGCAGCCCTG GAACATCCGTAGCAGCAAGTTCAATATTGTTGGGTCTAGTACTTGTTGGAAGAGCAGCGTTTGTTTTCCCGTTATCCTTCCTATCGAACTTATTTAAGAA GTCACAAAGTGAGAAGCTCTCCTTCAGACAGCAGATTATCATTTGGTGGGCTGGTCTTATGCGAGGTGCTGTTTCCATGGCACTTGCTTATAATCAGTTC ACTATGTTGGGTCATACACAACTGCGTACCAATGCAATCATGATCACTAGCACAATCACTGTTGTGCTTGTCAGCACAGTGGTGTTTGGTTTGATGACTA AGCCACTGATAAGGCTTTTGCTTCCTCATGGCCCTCCTAAAGGCACAAGCAGCATGATAAGCACAGATCCATCCACTCCAAAATCATTCACTATCCCACT TCTAGGAAGTGCTCAAGAATCTGAAGCTGATATCGGTGGCCATGAAATTCATCGTCCAAGCAGCATCCGTGCCTTACTAGCCACTCCAACGCACACCGTT CACCGACTATGGCGCAAGTTTGATAATGCATTCATGCGTCCTGTTTTCGGCGGCAGAGGTTTTGTTCCCGTGGAGCCTGGCTCACCATCTGAACGCAATG GTCATCAATGGCGTTGAGAGAAAAGCCAACAAGTTTGTAAAAATGTATTTTAACTACGTTTATGCATAATGTATGGTAAAGTACGTGCATTTTTTGGAGA TCAAGCAATGCATGTATGTATTTAAGAGCCATGCAATGTAATTTTGTTAAGCTTTTTGGGTAGTGATGAGAGTTGGAAAGCTTGTGTGAACCATAAGTCA CCACCTCTCTTTTGAAGCTCTATTATTTGTATTATTAGATTCTTTGATTTATTATCATAAGAGTCATGTTAATTTTCGTGAGTAGTGTTATTTAAACATC ATGCTTTAGATATTGTATTTAATATTATATACATTTATCTTCATCTTTTGTGTATTTTTAATCTTTTCCATGTCATATTATAATATTCAAGTTGACTTGA TTAATCCâBLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_70076; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_148039
| Blastp | Sodium/hydrogen exchanger 3 from Arabidopsis with 77.83% of identity |
|---|---|
| Blastx | Sodium/hydrogen exchanger 3 from Arabidopsis with 65.75% of identity |
| Eggnog | Sodium hydrogen exchanger(COG0025) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT3G06370) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019427838.1) |
| Pfam | Sodium/hydrogen exchanger family (PF00999.20) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |