Ll_transcript_149996

Id TrinityFTRINITY_DN57632_c1_g1_i4
Name TranscriptLl_transcript_149996
SequenceCCCGCCTGAAGTGGTTGAGAAACTTGTTGGACTGCGAGAAGGCATTCCTCGGAAGAGATCCAGTCTAATTTTACTAGTTTGTTTTTGAAGCTAGCAAAAG GGACAAGACAGAATGGAGAAATATAAAGAATGAATGTGTCAGGAGGATATGTTGTATGCAATCCCCAGATTTACCCGCATTCTTTCGCCATCATCTAATT TCCTTGTTTTTATGCCATATGTGCAACAAATGAGGTGTCATCTTTATTCACAGCTGCCACCACCCCAAAATGCAGATAAATTTGATAATATTGGCAATGA TGTAGCTTTGTTTCATCACATGGCTGATATGCATCCTCGGCCTTCAGTTGTGGAATTCACCAAAATCTTAGGAACAATTGTACAGATGAAATCCTATGCC ACTGCTATTTATCTTCATACCTATATGGAGTCTAAGGGTATCACGCCGTTTATAGTTTCTTTGAACATCTTGATGAACTGCTATTGCATTGTCGGTCAGA TGGGCTTTGCGTTCTCTGTAATTGGTAAGATTCTCAAGTGGGGTTATAAACCGAATGTTGTCACTTTGACGACACTAATGAAGGGGTTGTGTGCTAACGG TAAGATGTTGGATGCAGTAGAGATTCACAACAATTTGAGGGCCAAAGGGTTTCAGTTTGATGAACTTACATATGGAACCTTAATCAATGGGCTGTGTAAA AATGGACAAACAAGTTTTGCCATTCAAATGCTTCAAAAAATAGATGGACCATTGGTTAAGCCCAATCTTGTAATGTACAATATAGTCATTGATGGTTTGT GCAAAGATGGATTCGTAATTGAGGCACATGATTTGTGTTCTGAAATGATTGCTCAAGGAATTTCCCCTGACACTGTCACTTATAGTGCATTGATTTATGG TCTCTATAGCGCAGGCAAATGGAGTGAGGTTAGTTTATTTATGAGTAGGATTGTTGATCAAAACATCAGTATAGATGTTTGTACATTTAACATAATAGTT AATGCATTATGCAAAGAAAGGATGCTCTCAGAGGCACACGCTTTTTGTGATGTGATGATTGAAAGAGGTCTACAACCCGACATTATTACTTACACCATCT TGATGAATGGATATTGTTTAATAGATGAAGTGGATAAGGCAAGAAATTTATTTGATATGATGATCAAAAGGGGTTTAGTGCCTGATGTTTGGAGTTATAA CATCTTGATTAAAGGTTATTGCAAGATTAAAAGAGTGGACGAAGCCAAGAATCTATTTGGAGATATGCTTCTTAGGAATTTAGGTCCAAACATTATATCG TGCAATACTCTAGTTGATGGCTTCTGCAAATCTGGGAGAATCTTAGATGCATGGAACTTTGTTAAGGAAATGCCTTATTACGGGCGACCCCCTGATGCAA CCACTTACAACATCTTGTTAGCAGCTTATTGCAAAATCGAGCATCTTGACCAGACAAATGCATTATTTAAGCACCTTATGGAAAGAGGTTTTGTACCTAA TGTTTGGAGTTACAACATCTTAATTAGTAGTTGTTGCAAGAATAAACGAGTGGATGAAGCCATAAACCTTTTCAAAGATATGTGTTTAATGGGTTTGGTT CCAAATATTGTAACATACAATTCTCTGATTGATGGCTTGTGCAAATGTGGACGAATCTCACGTGCATCGGAGTTTGCCGATAAGATGTGTAATGATGGCC AGCCCCCTGATATAGTCACTCACAATATCTTCTTAAATGCTTTATGCAAAAGACAGCAACTTGACAAGGCAATTGCATTGTTAAATCATATTGTTGATCA AGGGCTTTGTCCAAATTTTTACACATACACTATACTTATTAATGGTTTGTACAAAGGTGGATGGCTAAAGACTGCGCAGAAGATTTTCCAGCATATTTTC ATTAGAGGCCATCCTCCAAATGTCCAAACATATGATATTATAATCAGTGAGATTCGTAAAGGTGGACTGATACCAAAAAGAAAGGCCTTTCTTTTGTAAA TGGAAGACAGTGACCGCTTCCCTAATGCCACAACTGCTGAAAAAATTGTACATCTCTTGAAGAAGAAAAATTGATGATAAGGCGGATAAACTTCTTAGGA AATTATCGCTTGACACCCAGAGAACAATAAGTTTTGTTGTATGTTCAGGGAAACATGGATAAAAGAAGCACTGATGTTCCACCTTCTATATCTAATTGCA TGAGGTAATAGTTTCACCGGTGCAATAGCCGCACGAATCATTTGTTGCTCCTGAAATTGCATTTGCATGGTGGCACCGAAGGAGACCACAAGAACTTTTG TTTGACGTGCCTGCTGAAGAGGATCCTGGAGTATATTGAATTTGACTTGCCTTAACTATATTGAACTTTGTGCCTAGAGCGTTCACATTTTTTCACATTA AGCCAGTATGCAACAAAATAGAATATGTTTAAGGCTGACTTTGATTTGAAGTTTTAAGAGAATGGCTGAAGAGAAAGAAATTATAAATTGTTACAGAATA GAGGAAAGAACAAAGATAAAATAGTCCATCAGATTTTTGTGGGAGTGTAAACAGAAAATTAGCAGCTCTCTGGATAAAAAGATTATGCCCGAAGATACAA TATTTTTCTCTGATATTGAATAAGGTTGAGTACAACTTGGATCAGTGCAAAGGTTGATGAACTTGTATGTCTGTTTTTTGTTTAGGATGGATTAGCTATA AAGTTTGCAGCCCAAAATAGAGGGTTGAATATGTTTATAATTCAACCCTTTTAATTGTAATAGTGTTGATTGGTGGAAATAATATCATCACATATTCACC CAAAAATAAAAAAATAGAATAGCTATTACAGAATAGTTCTTAGTGAGTTTTTTTTTGTGTTGAATACTTACTATGGATTTTATGTCTCAGTTTCAAATTT TAGTTCTTCAGCAGTTTTTCACATTCCTTTCTTCTGAGTGCCCTTCATTGCTATAGTTACTCCTACACCATCTTTTAATTTGTGCCTCTGCTTGTACTAG TTATGAGAGAAGACACTTGTAAGGTTATCCAGCTTGACATGATGATGGAAATAATAATTAAAAGTTAAGGGATAATTAGGAAGAAAAAATGATTCATGAT GACTACTTGCAAAAAGTATAAAGTTTAAGGGGATTTTCTAGACTTTTCATATATTTTTAAACATGCCTTGAACATTAAGATATGATTGACTGCAACTTAT TATTAATAAGTTCCGTGGACTAGTTTCAATTAATCTTACTAGCCCTTGCTACATGCTTAGTATTTAGATTCATTGCACAACTACCACCACCTCTGAAATG CATTGTTTTGTCAATATAAATCTACAATATTTCCTTTTATATCTAATCAAGTACATGGCTATACAACTTATTTGATGTTTTAATAAGAAAATTGATCATT TCCTTGTACATATCAGAATGGAGTGAGGGGCAGGTTACGGAGTACTTGGTTGCGACTTTTGGTGATTATTTTACTGATGTAAAAATGTACATTGAAGAAA GATCTTTTAGGAGATTTGTTGAAGCCTGCCTGGAGGAAACAGTGATTGTTTATGTTGACCATCTCCTAACACAGAAAAACTACATTAAGGAAGAC BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_70333; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_149996

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_149996
BlastpPentatricopeptide repeat-containing protein At1g62670, mitochondrial from Arabidopsis with 34.48% of identity
BlastxPentatricopeptide repeat-containing protein At1g62670, mitochondrial from Arabidopsis with 34.35% of identity
EggnogPentatricopeptide repeat-containing protein(ENOG410Z7Z7)
KeggLink to kegg annotations (AT1G62670)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019459157.1)
PfamPentatricopeptide repeat domain (PF13812.5)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;