Ll_transcript_213671

• Id Trinity: FTRINITY_DN57714_c1_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_213671
• Sequence: CGTTGATATTTGCCAAAATCTATATCTTTCAGTTGGGCATCAAAACCTAGTCACATTTAGCTAGTATTATATTATCATATTTGAAGAGGTTTTATAGCCA TTCTAATTTATAAACTTAATTGTGTATTCAGAAGCACAAATGCATTCCCTTAGAAGATCTTGCAGCAGAATTTAAATTACGTACACAGGTATTATTTACC TTTTCTTCTCGTATCTGCATTAGTCTTTCTGTTCCCTTCTTGACCACATCATCTTTTCTTACATTGGTTGTTACTTTTTTATGATAGAACATTATGCCTC CATTCGATCCATGTAGCTGACCCCACAATATGAAATTAAGGCTTGGGTGTTGTTGGTGTGTACTATATATAAGTTTCATGGGAGGAACACTGTAGTACTG GACCGTGCTAATGTTTTATGGAATTTTGAGAAAATCATAAAACATTTATTAGGGAAATATACTTGCGAGATGGCTCTTAGGCCCTTCTTTTTCCCTTCCC TCCCCCCTCGAAATATCAACTCGCAAACAGACCGAAAGAGAGAAAGAGTAAGGGAAAACAAAGGAGATGTGAGGCAGTGGGAGAACATGATATTCTATTA ACTATTAAGAATGTTTCAGTACGTGAGTGGTCCTTTATCTCTATTTCACAAATGCTGCAACTAAACAATGACTTTTACCCTTAAACTTGGTAGTTTAACT TGTATTTTGCTTTCTTTATCATTTTATGGGTGTTAAGCCAACTAGTTAGATCCCTTTGTAATGTTCATAAGTTATTAAGCCCAAGTGATGTTTCGTTTGA CTCCATATTAGTATGCTTAAATGTGAATCAAAATGTTGTAGTGGTGTGATTTATTTTTAAACTACAAAATGTCCATGGACTTCCTTTTTGATAATTCCAT AAACTGCTGCAGGAATGTATCAATCGCATCAGTTCACTTGAAAGTATGGGTAAGTGCCTCTCTTTTTAGTTTCTCACTAACCAGAAGTATATTCTATTCC CTTCTTTTTTAATTTTTGGATTTGTGTCGTCTCGATCACCATGCTCCCCTTTGAATTCACATATAGACAATTTGCCATAGACCATAGTAGATGCCAATAA GATGGCTAATTAAAGAAATGTGACACATGAGGTAATTGAAATCATATTATTCCAAAATGTCAGATGTTATGAGCTATCCCATATTCTCGCTTGCTGCCCA TATATTTGAACCTTCCTGCATTTAATACCTACAAATGATGCTAAACTAGTAATGATGGAAAACATGTGTGTATTGAGCATTATGTTGGTCAACCTATTGC CTAATATGTTTTTGTTTTTAACTAGCAGTAATTTTTCTCTTTGTGCAATCAATGTGCATAGATTATACTGTGACTTACATACTTTCTGTTTAAAAAAGAA AAGAAAAACAAGCTATGTCAAAGTGAAGAGACTGTTTTAGACTTGCTGATAAGTTTTCATCTTTATTTTAAACAAAAAGAGTTTTCATCTTTATTATTGC CAGCCTTAATTGCTTGTCTATTTTACTTAAATTTTGCCATCATTAACTCCCGACTTTGACATACTAAAGAAATATATTGCAGCTGGAAGAAGTTAATTTA CCTTTGTACATCATGTTGATAATTTTTGCTTTGTAATTGTTGGCATTTCCACAATGAATTGAGTTCTACCTTTGTACCCCTTTACAAGTCTGTAGAATTT TGTATTTTACTATAGAGAAGGACAACTTCAAATATGGAAATAATAGAAATCATCTACTTTTTTAATGCTCACTAACCTCTATTCTGAACATGGTAAAATC CTATAAGGAACACTTCAGCTTCTTCTTTTTTTGTTTGTTGCTTAAACTTGTGAAATTATTTATTGCTCAATCTGACAGTGCTGGAGAGATCAATGTTTCC AACTTTCCATGACCATAATGTAAATTAGTTACAACTCAAATAAACTCTTATGCAATTGGACTATTAAAAATGTTGCTGGCCTTTTAAAATGTCTTTCTGT TTTGTTTATTTCTTACTGATGCTTATAAAAGGGAGGTCAAGTACACGAGGCTCCTACATAATAGGATTTGAGTAGATGTATTCTATCTTATTACTTCTGC AAGCAGAGAGACTGCTGACTGATGTTTAATATCATAATGAACTTATTTTATGCAACAGGTCGGCTTTCCGGTGTGATGGATGACAGGGGAAAATACATTT ACATCTCACAAGAAGAAATGAAAGCTGTTGCTGATTATATTAAGCGGCAAGGGAGGGTTAGCATTTCCCACCTGGCTAGTAAATCGAACCAGTTCATTGA TTTAGAGCCAAAAGATCATTACATCGAGGACATAAGTAATGTGGGGGAGATAACTGTCAATTGACGTGGTTTTTTTATTCGGGTGGAGGAAATCATGTAT ATCAGAAAAAGAATGCAATATCTGGTTTTCATAGGAATTAGACTTGAATTTGAAGTTTAAATAACTTGAGTATGTAACTGGAACTAGGGTTTTAGTATGG GACTTGAATTTGAAGTTTAAATAACATTAGTATGTAACTGGAACTAAAATTTTATATTTTTTTTTTTTTGCTAACCTCATACTATTCCGAAAGATTAGTT CCTTGTAAGGATGACAATGGGTTCCGCAGAAAACACCGGCAATGAGTCGGGTCGTTGGACCCATGAATAATTGAGATGTGAAATTTTAAGATTCACTATT AGATGGGTCTGGGTCTGGATAATGAGGTACCTAGACCGACGGGTACCCGGAC
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_71017;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_213671

FPKM

• FPAB: 0.7
• FPNAB: 0.4
• LF1: 0.2
• LF2: 0.1
• LF3: 0.2
• LF4: 0.2
• UF1: 0.2
• UF2: 0.2
• UF3: 0.3
• UF4: 0.2

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_213671

• Blastp: -
• Blastx: DDRGK domain-containing protein 1 from Arabidopsis with 62.5% of identity
• Eggnog: DDRGK domain containing 1(ENOG4111IPW)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G27120)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019443092.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;