Ll_transcript_214406

Id TrinityFTRINITY_DN57735_c0_g3_i5
Name TranscriptLl_transcript_214406
SequenceCCAATTATGTCTTTTGATCAAAATGAAGATGCTATTGTGGGCTCTCTCAAGCATAGCTTGAGGCAACTAGAAACTCTGGGAGCTGAAAGGGCTGGTCTTG AAGACATGCTTAAAGAGATGAAAAGAAAGGTATACCTGATAAACATGATTCACATTATTTTATGTTTAGCTCTTCCTGTAGAAACTAATTCTTTCCTTTC TTTATATCCGATGATTTAAAATATGCTTGGCTTTCATGTGAAATATTTGTATCATCTATATTCAAAATGCTGGTTTTTAGTGACTTACGGGTGTGTTTGA GTCACCTGTGGAAATTAAATTAGTAAATGTAACCAATAATTGATTGTTTTTTGTTTTTTGTTGAAAACAATTTAAGATAATCTATCTTATTTGTATGTAA CCAATAATCTGTTGTTGGTTGTGTTTTATATGGAAAGCTGATGATAGACCCCGTTAAATATTTATGGTAGATTTTTTGTAAGATGCTAGTATTTTATGCT ATTTGCCTGTTGTGAATGCAATTGATTTTCTGGGATCAGTGCTGAGGTCATTCTTGGGCTAGCATAGGATTGTGGCAAAAACAGTACATACTGATTTTTT GTGTGAGAGAAATTTTTAATAATTTTGAGCTTATGTCTCTGAAGGGTAAAAGACTATTTATAACCCCGTTTACTCCTTCCTACAGGATTCACCATCCTTA AAGTCCTTTTTTTGTTCATATATTTAGCAATTCAATCCTGGAGTCCCACTCTGTATTATTGGTGTTCTATCATTTGAATACAATATTCTCTACAATTAGT GTATAAAAAGCTATACTATATTTAAGAGTGAGGAAAAAAAGCATATGCTTGTTTTCTATTTGGTATATGCATTTCTTTGGCTCAAGTATAAATTAGTGGT TCAAGTTTTGGTTTGTTCATTTTGAGGTTTCTTGGTTGAAGAATGGATGTGCCTTTGTTTCATGCCAAGTAGTTTGCCATTCGTGAACCTGTTATGCACA AGATTTATCTTTGCTTATAAATGTGTATAATTTCCCCAGGATGATATACTGCCCAAGTTGATGACATTCTCTGGTTCTCATGAGGATCTTTTCAAAAAGG AGATATCGAAATATGATCATATTTGTGAAGAAATAGGTCAAAATATTGAGGCACAAGAGCAGTTGTTAGTGCACATCCAGGTACCTCTCACTCTTTGTGC TCCCATCTAAATTGAACTAATGCATATACAACAACTTGGTTCCACTAGCTATTGACTTTGTTCTTTACTGTTGAGGTTCTTTTCCCTTATGGAAGCAAGG GTGTGTTGGGCATCCCTTTTCTAGTTTTGTGGTGGCATAGTTTCTTTCTAAGTGATCACTTCTGATAGATGATACATGAAACAATAAATTAATTTATTGT GATAATTGTTTGCTATTGTTCACAGGTTCAAAATCATGATTTCTCTGTTATCTTCAATCTTGACGATTACAAAGGTTGGTTTTGTTGGGTTGTTATCCTC TAGTTCTTCAATGCCTCAAATTCATTTTAATGCGCATTAATGATCTGGACCATTAATGAAAATAAGTATAATAAAAAAGAGTTGAATGGGTCAGATCAAA GATAGAATTTTAGTACACCTTTCTTGTATGGATAGTTGATCCTTCTATTATTTCCTTGTAACTATCCAGTTTCACGTGAAAAATCATACAAGCAGATTGA AGCTGCTATCACAATGTTTCGAGAAATAAAGGACAACATCAACGAAGGGTTAAAATTCTATCGTACTCTGCAGGTAAGAACTTTTTAAAATATGTCCGGC TTGGATTGTATATCCAAGAACCTAACTCTATTTATTAATTGATTTGTTCTACTCTATGCAACTTGCTAAGTTATCACCATTATTAATTTAAATCATTACC AGCTATTTTTAAATTTGTTTGGATGATCCTCTTAATTTTGTGTGTGTAACAATATGCATTTTCATCGTTCAACAGGACGCAATCATAAATGTAAAGCAGC AGACCAATGACTTTGTAATGACAAGGAACATCCAGTG BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_71195; 
Additional information-

Expression of Ll_transcript_214406

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_214406

Blastp-
BlastxVacuolar-sorting protein BRO1 from Arabidopsis with 75.51% of identity
EggnogRhophilin, Rho GTPase binding protein(ENOG410XQX6)
KeggLink to kegg annotations (AT1G15130)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019428016.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;