Ll_transcript_213502

• Id Trinity: FTRINITY_DN57783_c1_g2_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_213502
• Sequence: CTGTAGGCGTTCACTTGATATTGAACGCCCTACCTACACCAACCTCAATCGCCTCGTTTCGCAGGTATATTCATATTTCTATCTTAATTTTTTGAAGTGG ATGTGGCTTGGGATGGTAGATTAGTTGAAATTTCAACTTGATCAATCAACTTTTGGTAAAATTAGTCATCTTCAGGTTATGATTTTACAGAGATTAGTAT GAAATTGAGTATACATATTTACATTTTGATGTAAATTGAAACACTAAATCATATATTAGGATTTTTAATTTGATGAGCTTTTGAATTTATGATTCCAAAA TAGGGTTAATATTTAATTTAATGTGATTTAATGTTGTTGAAAGTCTGTCCATTTTAAAGACCTAATTCCTAAATTGGAATTATTAGTTAATTTAATTCTA TTTGGTCTGGCTTTAATTTATTTAACCGTTGAGGTTGTGTTTGTGGTGAAACCGTAGGTCCTTAAGTGAAATTTCAAGTTGATTTTATTTGACGTGGTTG AAATCCTAATTGAATTTGAATTTATTTTGAAGAGGTTGGAATACTAGAATCTAAAATTTGAATTTATTTTGAAGAGGCTGGAATACTAAAATCTAAAATT TGAATTTAATGTGGCTGAAACTCTAAACCCTAAATTGCATTTTAAACTCATTGTGCAGGTGATTTCGTCCCTGACTGCCTCACTGAGGTTTGATGGAGCT TTGAATGTTGATGTAACTGAGTTCCAAACCAATTTGGTTCCTTACCCGAGGATTCATTTCATGCTTTCCTCATATGCCCCTGTTATCTCTGCTGAGAAGG CATACCATGAGCAACTTTCTGTTGCTGAGATCACCAACAGTGCCTTTGAGCCATCTTCCATGATGGCTAAATGCGACCCTCGTCATGGCAAGTACATGGC TTGTTGTTTGATGTACCGTGGTGATGTTGTGCCAAAGGATGTGAATGCAGCTGTGGCTACCATCAAGACCAAGCGAACCATTCAGTTTGTGGATTGGTGC CCAACTGGGTTCAAGTGTGGTATCAACTACCAGCCACCAACGGTGGTTCCTGGCGGCGACCTTGCCAAGGTTCAGAGGGCTGTTTGCATGATTTCAAACT CAACCAGTGTTGCTGAAGTGTTCTCCAGGATTGATCATAAGTTTGATCTCATGTATGCCAAGCGTGCTTTTGTGCATTGGTATGTTGGTGAGGGAATGGA AGAGGGTGAGTTCTCTGAGGCTCGTGAGGACCTTGCTGCTCTTGAGAAGGATTATGAGGAGGTTGGTGCTGAGTCCGGTGATGGAGAGGATGGTGAAGGA GAGGATGATTATTAGACTCGATTTTTCATGTCACTGTTTCCTGTTATGTAATTCTTCCTTTTATTTGGGACTTCAACTATGTGTCGTTTTATTAATTTGT TGGATGTTGCGTGTGATCAATGTTAGTGCTTTTTATAGCACAAAATGTTGTGTTTCAAATATACTTGTTGATCGTTTATCGCCACTACCATTTTCATTAT CCCGCTTTGACCTTCACTAGTTTCTTCCTTGCTGTATGCATCATACCAAGGTTTTAAGTTTGGTTTTGTGAACGCTACAAACACTCAGAAACCGCAGTTG GAAACGCCCACAACTTGAAACTTGGGTTTTGTTCGGTTCAAGAAATTATATAAACATTTCAATTTCGTCACCATTACCAACGCAACAAATTTCTGTTGTT AATAGTTTAGAAAAACTGTTGATAAGAATGTGCCTGAAATATAGTCACAAACATTCCTGAAATATATTAAATTTATTG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_71599;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_213502

FPKM

• FPAB: 2
• FPNAB: 3.1
• LF1: 2.8
• LF2: 3.1
• LF3: 1.4
• LF4: 1.7
• UF1: 2.2
• UF2: 1.6
• UF3: 1.2
• UF4: 1.8

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_213502

• Blastp: Tubulin alpha chain from Prunus with 97.8% of identity
• Blastx: Tubulin alpha chain from Prunus with 98.53% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_003608582.1)
• Pfam: Tubulin C-terminal domain (PF03953.16)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;