Id Trinity | FTRINITY_DN57881_c0_g1_i4 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_56576 |
Sequence | TCACAAATAGAGGACAAAATTGTCTTCACCGCAATTGTATTGATGAGGTAGTTCGTGTTTCATTTTTATTTATTATATATTATTATTTGTTTTTAATATT AGCCTCTAAGCAACTATTGTTTTGTGATATGTAGATTATAGGTTCAAATACCGGAAACAGTCTCTTCCTCCGGATCCTAACCTATTAGAGATGGAGATTA CTCATACGCTAGTTGATAATCACGGACATTGTGTCAGTTGTTGATGCCAGTAAAAATGGACTTCATATTTGTGCTTTTTCTATTGGGCTGCTTATGTTCT TTTGTGTTGCCTGATTCACAAGGAGATGCACTATTTGCATTGAGGAGTTCATTGAATGCTTCGGCCAACCAACTCACTGACTGGAACCAAAATCAAGTGA ACCCTTGTACTTGGTCTCGTGTTTACTGTGACCAAAACTACAATGTCTTACAAGTCTCACTAGCATTTATGGGATTCACAGGAACCTTGACCCCAAGAAT AGGAGTTCTGAAATATCTTAAAACCCTGTAAGTATATAATATAAAATGTCCATTTTTATCCAAAAACAATGTGAACTATCCAAACAATCTCGGTCATATC CATAATGCAGAATTTTGTTATCCCACTCAATTTTGATGACTTGGAAGTTATGAGATAGGTCCAATTTGTTTGTTGTTAAAAACTATTTGCTTCTGATTTT TTTTTGCAGTCCTCATTTTGTCTTTTTGTTTTATTGGCAAGTCTCATGACTCTCATTATTGAATTGTTGCATTCTAGTGTTTATCTATGAAATTATATAT CTCTCTGTCTCTGTCTCTGCGTATGTGTGTGGGAATAGTATTAATTTGGCCATTTTTTAAAAGTTTGGATGACCTATTTGTTAATTGTGATTTTATTCAT ATTCTCATTACTCATGGGTTCTTTTTTTGTTAATATTGCAAAAGTTCACTTTTTTAATGAACAGGCCTGGGGATTGTGACTTGTGAGGAGTAAATGCTCA ATTAGTGTTACTGTAGTTCATTCTTTAGTTGTGCTATGCTTTTTTCTAGGAATTTTTTCTTAAATATTTACCACTGACAACAGACAAAGAAGAAAGTAAG ATTTGCAAGTTTATCCATTGACGCATGTTAATTGTTAAGCATCTATCATGCAGTTCTTTGCAGGGGAATGGCATCACTGGTGGCATACCCAAAGAAATAG GGAACCTAACAAATTTGAACAGGTTGGATTTGGAAAACAACAGATTAACTGGCGAAATACCATCATCTCTTGGTAATCTTAAAAGGCTACAGTTCTTGTA AGTATGACAATTGATTTTCTGGGTATTAAGGATGTCTGATGACTTAATGAGTCTTAGCATATGTTTTTACTGTGTAATGTTTCTATTTTTGTCCTGAAAC CAGGACATTGAGTCAAAACAATCTCACAGGGACTATTCCGGAATCACTAGCCAGTATCCCAAGCTTGATCAATGTTCTGTTAGATTCAAATTATCTCAGT GGTCAAATTCCAGACCCGCTTTTTGAAGTTTCTAAATACAATTTCACTGGAAATAATTTGAATTGTGGTGTGAATCATCGTCACCCTTGCGCATCTGACA ATGCAGATCAAGGTTCATCACATAAATCGAAAACTGGCCTCGTAATTGGAGTTATTGTAGGGGTAGTCGTTATTCTTTTCCTTTGTGGTTTGCTGTGCTT TTGGTTCAAGGGTAGACACAAGGGCTACAAGCGTGAAATTTTTGTAGATGTTGCAGGTTTGAGTTTCTTGTTTAGTCTGCAGTTTTTTTGGGAGTCTTCT CTTAAATGAGTCAAGGATGTTATTATGTTTTGTAGTTGTAGCATTTGAAGATATTGACTTGGAAACTCTACCCATGCATTCAGTTTCAATATTATAATCC CGCTAGTTAATATGATATAACATTATGGCACATGCACTATTATGCACACTTTATATTGATTTATAACTACAGTGCTATTTCTCACCTCATTGTGTATATT GTATAATCAATGCCCTGGAATTGCACTGGTTAATTATGTGCTGCTAATTTTATTAATTAGTCTTAGTTCCTCTACCATCTTGTGTTTTTGTATGCCAATG TTCTTTGTTCGTGCTTTTCCTTCTTTTGTTGTCCCCACCCTCTGTGCCCCACTTGATCAAGCTAGAGGGAGTCTGGGTAATTCTTTTAATTGTTGTTGTA AGAGTTAGCTAATTTTTTAATTAGCTCTAAGTCTCTAACTATGATTTTCTTCGTATTACTATTTCTTGTCTTATTAGGTGAAGTTGATCGGCGAATTGCA TTTGGTCAACTAAAAAGATTTGCATGGAGAGAACTACAGATAGCTACAGACAATTTCAGTGAGAAAAATGTTTTAGGACAAGGAGGCTTTGGAAAGGTTT ACAAGGGTGTTCTTGCTGATAATACAAAAGTTGCTGTTAAAAGGTTGACTGATTATGAAAGTCCTGGGGGAGATGCAGCTTTTCAGCGTGAAGTTGAGAT GATAAGTGTAGCTGTCCACAGGAACTTGTTAAGGCTGATTGGGTTTTGTACTACTCCAACCGAGCGGCTCTTAGTTTATCCCTTCATGCAGAACTTAAGT GTTGCCTATCGGCTAAGAGGTATTTAGTTATCATTCAAATCAGCATTATAATCTGCCAAGTATTGGATTTGATTTGTTGTAAAGGAGAAATTTTATTTAT TTTTTAATTTGGTTATGGGATTGGAGAGCCATTTAGATTGTTGAATATTGCTTTAGGGCATGGTTTTAAAAAAACTGTTCAATAGAGAACCAGACATGGG GGTGGTTTTTAATACCATTTAGAATAAATTAGATAATAATATATATTCATGTATATGTATACATATATGAAATGACACAGGAAATAGGAAACATAACAGA TTGAAATAAAGTTTAGTAAACATGTATCCTTGTGATAGGACTAGATTTGTATGGTATGGTAGATTGGATGTCCTTGTTTTATTTTGTCTGGTTGTAAAAC TTGGCATCATTTCCAGAGATATTTGACTTTCTGAATACTGATGCAGAAATCAAACCTGGGGAACCTGTTTTGGATTGGCCTACAAGAAAACGAGTGGCTC TGGGAACAGCTCGTGGCCTAGAATATCTTCACGAGCATTGTAATCCTAAGATTATTCATCGGGATGTTAAGGCAGCTAATGTCTTACTTGATGAGGATTT TGAGGCAGTTGTTGGTGACTTTGGTTTGGCGAAGTTAGTGGATGTTCGGAAGACTAATGTGACAACTCAAGTTCGTGGGACAATGGGCCACATAGCTCCT GAATATTTGTCCACTGGAAAGTCATCAGAAAGGACTGATGTTTTTGGTTACGGGGTTATGCTTTTGGAGCTTGTTACTGGACAACGGGCAATTGACTTTT CACGTTTGGAAGAGGAAGATGATGTGCTATTGCTTGACCATGTAAACCTCTTTTTATATCAGTGCCTTATTTCCTCCTGTGTGTCTGTCTGTTTCTTGTT TTTGTAGCATGCTTGGAACTTGTGCATCAATCACACTTGATTCTCGAGTGGTTTGGTGATGTTAACTTCAGCGTTTTTTACATGAATAAGGATCAGCATA TTCTAGCCGCTCGACCTAAAATGAGTATCATAACCCACTTAGGCTAACACATACAGACTAAGAGTAACGATTAATTGATTATGGTGTGCCAGGAGAAGTT CATGCAAGTTGTAACTAACTGCATCTCTACATTCTAATAAAGGTGGAAATTAGTTGGAGAGTGTTTTTTACATCTTGCTTTTGATATTGTAGAAAATACA CAGTTTGCTTCTAATCATCTTATGTCTTGTTAATATTGAAGAAAAGGTTAGGTGCAGTTTCTTTATGAAGAATTCTGCCTTTTGTACATGATGCTTTGTG TTTTGCCATATTAAAAAAAGCAAACCCTGCATCATTACCACTTTGAGTTTATACTTTTTGGCTAATGTTTTTGCTTTATTTTTGTGCTCTACAGGTTAAG AAACTAGAACGGGAGAAAAAACTCGATGCTATTGTTGACCGCAACTTGATTAAACATTACAATATACAAGAGGTTGAGATGATGATAAAAGTTGCATTAC TCTGCACACAAGGAACACCCGAAGACCGTCCGCTGATGTCCGAGGTTGTAAGAATGTTAGAAGGGGAAGGGTTGGCAGAAAGGTGGGAGGAATGGCAGCA TGTGGAGGTCAATCGGAGGGAAGAGTATGAGAGACTGCAAAGAAGATTTGACTGGGGAGAAGATTCAGTTTATAACCAAGATGCCATTGAGTTGTCTGGT GGGAGATGAGAAAATCTATAAACTTTGAACCATCTATGTTTTAATGTCTCTTTTTCCTATAAATAGGTTGGCTTGAATGGGATGAATGTTTTATTGTCTT CCTACTGTAAAAAAGGGGGGAACTGTGTTGCAATTTTGATGTTCCAATGGTGCTGTGGTATGAATGTTTATAGTAAAACATGAATTCATTAGAAAACTAT TTTTCAGCTGGAAAGATCTTGACTTTCAAGTTTGTCTTTAAAAAATCTTGAATATGTATCAAAATAGAATGTTTTGGGATAAAACTTAG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_72399; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_56576
Blastp | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g10290 from Arabidopsis with 81.9% of identity |
---|---|
Blastx | LRR receptor kinase SERK2 from Oryza sativa with 80.56% of identity |
Eggnog | Serine Threonine protein kinase(COG0515) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G10290) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_015957611.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |