Ll_transcript_260187

• Id Trinity: FTRINITY_DN57956_c1_g2_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_260187
• Sequence: TTTTGATGCTGCTGTTGTTCCGTAAGTTCATTGCTAAATATATAATGCTTTTCAAAGCCATATATTCAATATTTAACAACAGAAAAATTCATGTAATTTT TTTTAAAAGTGTCATATATTCAATATTGTGATTTACAAAAGTTTTAATATATAAAAATAGTGATTCTATAATATAGAATGTAAATAAAAAGTTGTAATAA CAATAGAAATTATAGTCACCCGTTGAATGAATTGAAATGAAAGAAATTGTTGTTGAGGAAGTTTTAGTCTTAATGCATGTTAGTTAGGTGCTTTTTGGTT TTTGATGTTGTAAGCACTGTGACCTTGTTTTATGCTGAAGTAATCCTGTTGCTTCAGTCCTAATAAAAATTTCAGTTATAAAAATTTTATTTAAAGTTTT TTTATGTAAGAGTTAATTGTAATTTGAAATAGTTTTTTATGTTCTAGTCTTAATGATATATTGGTGTTGGTGTCAGGTTAAAACATGAAGTTGCCGGAGA AGTTCCAGTTGCATTTGTCGTGAGATCAAATAATGGTTCTAAGATCACGGAAGATGAAATCAAACAATATATTTCACAACAGGTTCTCTCTACCAAAATT ATCAATAGTTTCTTTATTGTATACTGGAGTTTGTGGAGGAGTTTAAGGTCAGAATAAAAACACTTCAGAATTAATCATTTTTCTTTTACCTGAAAAAAAG ACCCCTCAAAGTAACATGTTTAGTTATTATCTATTTATAACAATAGAAGAAATTATTACATAAAGAGTTTATATGTATCACATTATATATTACTTTATCC TGTTGAAGCGTGTATAATAAATAAGTGAATAGTGATAAATTAACGAAAATATAATTTCATAACTTATTTTAGATTACAAATTAATTTGACTAAAAAAGAA GAGTTCTCTGACTAAAGTGTCATATGTATTAATCATATATTGGTATTTATTTATTTTTGATTGTAATGTTTTATTCTGGATGGGTGTGTATGGTTTTGGC AGGTGGTATCTTACAAGAGAATCAATAGAGTTTTCTTCACAGACACTATTCCTAAAGCAGCCTCAGGCAAAATTCTACGAAAGGAATTAAGTGCAAGGCT TAACGAAGGTTTAGTACAAGCCAATTAGGTTCGTGTGACACAAGAAAGTCATCAAGCCTTTGTGTTTTGGTTTTCTTCCTATTTTTGTATGTTATTATAT TATAAATACAATTGAACGACTTTTCTATTTCCATAAATAATTCAATAATTTAAGAATCAACAATAAAGAATCTACTCCTGGTTTGGCATATTCTCGGTTA TGCCTTATGATATTAAAGATAATTTTTTCTGTCACGAATCTCTCTTGAGGATGGGGAAGAAGAGTCATAGTCTATGGATGTGTAGCTAGTTTATTGTTGT TTGGTCTATTTGGTTAACAAGAAATAAAACTATCTTTGAGTTGACGCCTTTTAATTTGGAGGTGGTATTGTTTTCTATCCAACTTCACTCTTGGAATCTT ATAATTGCTCGTTTCCCTTCTTTTTCCTTTTCTCTCTCAGATTAGGTATGAAACCCCTCTACTTGTATTTCTAGTTCTGTTTCTAATCGTGGATATGAGT ATCACTTATTCTCCTAATCTTCTTTTTTATCTAATCTTCATATTGCTGATAAAAAAAAAAAAAAAAATGTAGGAGCCTCCTGCATAAAATTTTATATATT AATTATTTTTT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_73044;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_260187

FPKM

• FPAB: 0.6
• FPNAB: 0.2
• LF1: 0.1
• LF2: 0.3
• LF3: 0.1
• LF4: 0
• UF1: 0.1
• UF2: 0.2
• UF3: 0.1
• UF4: 0.4

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_260187

• Blastp: -
• Blastx: 4-coumarate--CoA ligase 2 from Arabidopsis with 76.92% of identity
• Eggnog: Amp-dependent synthetase and ligase(COG0318)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G21240)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019418409.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;