Ll_transcript_136942

Id TrinityFTRINITY_DN58089_c0_g1_i24
Name TranscriptLl_transcript_136942
SequenceCTAATTAAAATGTAGATGAATTAAAATGAAAGGAAGACGTAAAGTTAAAGAGTGGATATGAAAAAAGAAGATGAATGAATGCATTTTGATTTGTGTGTTT TAGTTTTATGTGTCTTAGACAGCATAGTGAGAGGGTAGTAATGACTCAAACCCTCTTTCTCTCTCCTCTTCTCTTTCTCTCACCACATTCCCACCAAAAC CCTAGAATTTAATTTCACAAATTCCCCCTTTTTTCTCAATTACTCAAGTCAACTCACGCTCCATTTCAATTTCAATTTCAAATTGTCGATTTAATTTAAC CCTTCCTCTTTCGTCCTCACTTCAACGCACCTATGTCATCCGAAATCGAGGTCGTGGAAGAGCTTCAATCCCGAGATCATCAATTGCCATTGGCTTCTTC CGCTTCATCCTCCGCCGGCGCCGAAGTCGCGGAGGAGAGCCTCCGCAATGATGTTTACACGGCCGCAGCTTACGGTGACTTGGAGAAGCTGCATCGATTG GTTCAGCAAGAGGGTTGCACTGTCACGGAGCCAGATGGTTTAGGTTACTACGCGCTTCAGTGGGCTGCACTTAATAATCGTTCCGCCGCTGCTCAGTACA TCATTGAGCATGGGGGAGATGTAAATGCAACGGATCATACTGGACAGACAGCATTACATTGGAGTGCGGTTCGGGGTGCTATCCAAGTTGCTGAGCTTTT ACTCCAAGAGGGTGCCCGGGTGAATGCTGCTGATATGAACGGGTATCAGACAACACACGTTGCTGCTCAATATGGTCAGACAGCTTTCCTTTACCATGTC GTCTCAAAATGGAATGCCGACCCCGATGTTCCTGACAATGATGGAAGAAGTCCGTTGCATTGGGCTGCTTACAAAGGTTTTGCAGATTCTATACGTCTAC TTTTATTTCTTGGTGCACATAGGGGACGTCAAGATAAAGAGGGTTGCACACCTCTTCATTGGGCTGCTATAAGGGGTAACATGGAGGCATGTACCGTGTT AGTACAGGCTGGCAAGAAGGAAGACCTAATGGTGACTGATAATACTGGCCTCACACCCGCACAGCTTGCATCTGATAAGAATCACAGACAAGCTGCTTTT TTCCTTGGAAATGCCCGAAGACTGCTTGACAAACGCTATGATAGGAACAGCCGCCTTGGAAAGATTTCCAAGTTAGGACTTGCTCCTGTACTGTGGTGTA TAATTTTTGTGCTCTTGATCGTCTATATTCATTCTGTCATCTTGGCAACAAATCTGCCAAAGTTGACAGCTTCTGCTGCTCTTCTTGCATGGCTCGGAGT TTTACTTGCAACTGTGGGATTGGCTATGCTTTACAAGTGTAGCAGGTAAGCAATGTAGTCTTTAAAGTTAAAAGTTTACAGCTTCAGACAAATACTTCCA GGCCATTATATGTCTAAGAACCATTGGTTATTTATATTTTCTAAAAACTTAATGACTTCGATTTATCTTTTCATGATTCCAAAGACATGTTTTACATTTA TGTAATACATCGGTATTTTTTTTGTTTTCTTGTACTGTCGAATCATAATGAAGCAATTAAGAATGACATAACATGGCTTTAAGATTGTTGGATTTTCGGT AGTTTGAACTACATAAGTATTATTATGTAGATCTATGCTAGTTCAGCAATCCAATGCATTACTCATGTGTTTTGGCTGGACTATTCGACTTTTTTATGAG TTGTATAGAGGAGATTGCTTCTCATTGGCTGTGTGCAACAGTGTAAGTGGTTTGGACTAAGTTGGTTTTCATGTGCCTAAGGGAATTCGAGATTCTCCAC CTTTTTGTGGAGGTTAGCACTGTCCATATCTGTCTATTTACCGTCCGTTGATGCTTGCTTCTTGGTCTATATTCTCCAAGCAGCCTACTTGTACATTGTG AACTACTTAAACTTATGCCTGTAATTGTGTGGCACCTGAGGAGGTATTGTTTTGTACAGTGGTCAATATATGAAGGAAATTTAGAGTTGAACTGACCCAC ATAAGACATGCATACCATATTAGTTAATTTTTTGGTTTCTGATTTTGTGACCAGTAGCAACTTGTTTCTAAACGCCTAACTTATTTTTTTTAAGATGCTT TTTTATCAGTTTATTTTGTTTTCATAATCTTTCCTTCCCTTTTTACAGCAAGGATCCAGGTTATGTCAAAATGAATGTGCATGACACTGAGAATATGAAA GATGACGTGAGTTTTGTTCTGTTCTCCCTGGTCTCTACTTTGAAGCTCAGCCGCATCCTTGATCCCTGGATTTTATGACTTCTATTTCCTTTATGGTTTT TTACTTATTGACTATTGAGCACACCAATCTCATGTTGATTTGTTCTAAGTTTATGTCAATTCTATACGTAATTGACTTTAAAAGGTTGATTGATTAATTG CAGGAGCCTCTCTTGAAGATTGAGATAAATAATCCTGCTTTGCTAGCTGGAAACTGGTCCCAGCTTTGTGCAACATGCAAGATTGTCAGACCTCTTCGTG CAAAACACTGTTCTACGTGTGATCGTTGTGTGGAACAATTTGATCATCATTGTCCCTGGGTATCAAATTGCATTGGCAAGAAGAACAAATGGGATTTCTT TGTTTTTCTTGTTCTCGAAGTTTCAGCAATGATGGTCACTGGTGGAGTATCCCTTACAAGTATGTTTGTGCTGAGGACATAAAGACTTACATTGTTCATT TTTTCTATAATTTAAACTGCTTATTGAAACTGATAGTCTGCTTGCAGGAGTATTGACTGATCCATTTGCTCCTTCTTCGTTTGGAGCGTGGATTCAGTAT GTTGGTAAGAATCACGTCGGTGCACTATCATTTTTAATTGCTGATTTTTTCTTATTCTTTGGTGTGTTCGCTTTGACAATTGTTCAGGCTAGTCAGGTAT GTTTTAGAAGCCTCATTTAATTTTTACTTTTGGCTTGGGGTAAAAGATTTTTCTCTCTTGATCTGAAGCAAATGTCCTTTTCTCCTCTCTTTTTCTTTGT TTCCGTAGATATCACGCAATATTACGACAAATGAAATGGCAAATGCTATGCGGTATAGCTACCTCAGAGGTCCAGGTGGTAAATTTAGAAACCCATATGA TCATGGTATCAAGAAAAATTGTTCTGATTTCTTGATCAATGGATACAATGAAGACGTAGAGTGCATCGAAGAAGTAGTTAATTCAGAGAGTATAGGAATG ATGCCCATGGCAAGGAGCTCAAACTTAAATGGAGACTCACATTCTCATTTTAATCGTGCAACAGGCAGTGGAAATAGTCATGTTATTGATGTGAAATCCA ACAGTACCACCAACTCCAGAACACATCATGGTAATATTAATGGCCATGTTCATTCTTCACATTGTAGCCATAATAATCATGCCAAAACTAAAAATGACAG CATTCCAAAGGGCTTAGGTCTTGGTCTTGGCCTTGGGCGGAACACCAAATCTGTTGCACCCTTGTGATATTTACATGTCTGGTTAGTTATGTACCTAATT ATATGTATCATACATAGGCACACGTTTGGGGTAGTTTGCGTTAAATCAATTTATTGTGGCTCTTTTTTACAATACCCATGTTCAATTTTGTGGTATTACT TAAATTTTAGTCTTCTTTGTACTTTCATTTCCCCTCTTTTGTTGTAACTAATTTTAGGGGTAATTTTATTTTCATATCACGAGTACATCGTATTGGATAT GGTGTACCAGGATTTTCTTGTAATGTGACAGAATTAAACAAAAAAGTATAAACACACGTGTATAAAAATATGGTGTTGATATTTAACATTGTTGTATGAA TAATATAACACCTAATTTGGTCACTTTGCTAAGGGAGGTTATTACCTAGTGTAAGCTTATCCATTCAGGTTATGATCATGAAA BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_74069; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_136942

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_136942

BlastpProtein S-acyltransferase 24 from Arabidopsis with 79.59% of identity
BlastxProtein S-acyltransferase 24 from Arabidopsis with 78.11% of identity
EggnogAnkyrin Repeat(COG0666)
KeggLink to kegg annotations (AT5G20350)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019453050.1)
PfamAnkyrin repeats (3 copies) (PF12796.6)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;