| Id Trinity | FTRINITY_DN58103_c0_g1_i15 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_78722 |
| Sequence | TTGATTCAGTCATATAGTCCCAACTCAGTAGACGAAAGAAAACCCTAGCAACTTGAGATTCCTTGGGTCTCTCGATTTGCCCCAATTTCCCAAAAACCCT AATTTATCTCAATCTCCTCAGAATGAGCAGTATTCGTAGGTTGAGTGGCGAAGAATCGCAAGCACTCTACTCTCTCCTGAAAGCAGAACAACGCCCAATT CACGAGATCGTTTCCGAATTCAACTCCAACATCTCTCGCACTCGCCACTTCACTCTCTGTTCCTATCTCCTCATGCTTTTGCAGGACAACAAGATACTCA ACACTACTCAGCGGTTAATTGCGTTTTCTTTGCTACTGGAGGCATATGCATCTCAGAAACCTGCTTCAAATCCATTCATAAGTTTTATCTTAAATGGAGG AAAAGTAACAGTGTTGATCACATGTCAGAACGGGATGCAAATGTTATGTTCTGTGTTTGGTTTAATTTGTGGATATAATAGAAAGAACATGACATGAGAT TAAAATGTTGATCATTTTGGTTCCACCAAGAGAACAAAGGAGGATATCTCATTCCATGTTGATATGTCGGTCAAATGCTACCTAACAGTATAGTTGTAGA GGGGAGGATGAGGTTTCTACATCGCTCAACAAGCCTAGGGAAAAATTTCATAAAAATACATTTTTGCCAGCTTTGGAATCGGTCGGATAAATAAAAAGAT TATGGCCAAAATTTTGTGTGAAGTGGGAAACTGAGATTATTTCTGTGGAGCAATTTTGTAGTTCTACTGATCACCATGTTTACTCAAATTTGGAAATTCT AAAAAAATGTAAGTAAACTGGTTTCATCTAAAGAAAAAGGAATCCAAAAATGTTGTGACATACATTTGTACTTGATTTTGAGGTATATCTAAGAAGCCAC TTCTAAAGTAATCAACACATGAAAATCGAGACATTCAACAGTGAAATTAGCAAATGAAAAACCAAAATAGCAATGGGAAGGGAAGATTCAGAACCTGTAG GTTAATACACGTCTTGTCAAGAAACCGCTGGTGAACCTAGACTGAAGAAAATGCACAATCCTCAAGTTTGAACAGCTGCAGGTCAAAGAGGAAGCAACTC AACAAGCAGTTGCTAAGTTATTTTGCAGCTTAGAAACACACTGGAGAAAGTGGGGTTGAGGGGCTTCAATAGCTCATTGATAAGCTCCAATTATTTAAGG ATATGCACTTGACTCTAAAAACATGAGTTAAACTCACAAATTTGTGCTTAATCCCTCATTCAAGTGTGTGAGTGAGTTTGAACTTTGAATTGAGTTTTAT GCGAGTCTAGTGGAAATTGAGTTTGCCAACAGTTAACATGATTTCACCACTTTGAGGCATAAAATCGTAGTTTTATTTGACAACCATACCACTGTGAAAT TGGAGTAAATAGACGACAGTCCAATCAAAGTGGAGAGCAAAACCTAAGAAATCATTAGGAGGAAGACCTTGCTCTAAATAGTATTTTTGAAATTTGGATT CTGATTGAGTCAAGTGGCACTGATTGATCCCTGTAGGCTGTAGCAACTCACCTACTACATATGTTTTTCTTTTGTCAACCCATTGGAATTTTTAATGGAA ATATTAGCTGAAATTGCTTTGTTTCACATTTCTATACTAATAAGTCAGCCTGTGCTAGTTTTCTTATTTTGTTTACCATTTTTTCTTGAATTTTTATCAT GATTATTTAGCAATGTGATTGTATTATGTGAATGTTGAGATAGGGACAATTTCTTGGTTACAGGCTGCCTGTCATGAAGATTCAGAAAGAGTCGTGAGGG CATTTATTCTGCAGCTATTAGGTGTTGATGGATCCATCAGTGGCAAAGAGTTTCTTAAACAGTCTGCTTCAGATTATGTGAAAGGATTCGACCAATCATT GCATGACTTCCCATCATTAGATCAGTTGCAGCAGCAGTTTCCTGATGATGTTCATCTTGAACCGTATCATCACTTATTTAAAGATGGTTCTGTAAAAAAT GTAGTCCCAGACCCTGATGTTCCCTCCAATTGTGATATAGATTCACCAGAGTTTGATTTGCACCCCGGTTCAAAACCTAAAATTGGATCTGGTGATAAAG AGGAGGCAGTAGTTGGGTTGTTATCAAATTTTTCACTAGAAGGATTACGTCCTCACTGGATCAGGCCTATTCCACCAAGGCTCCCAATACTTGATGAGGA GCTTGTTTGGCTCAACCCCGATGACAATCATGAACTGATGTGGGACTACAGTATGTGCATTGATACAAGCAGAGGAGCTGCAGTAAGGGACTTAATTGCA AATGCTCTGAAGGGAGCCCTTGCACCTGCTCAGCAAGAGGTGACTATTGTTTTTGTTGATAAAACTTCAATAAAGTGTAGAGAAGAAAAAAATAAAAAAA TACTAGTAATATGTAGGATAAGAAATCATGTGCAAAAAAAGGGAAAATAAAACGGCAGCGAAGAGGCAAGATTGGTGGAGCAAAGATGCCCAATCCCTTG GCATATTTAAGGACAACCCTTTGAAAATATGCTTCACATCAAATTGAAGCTGAAATCCTAATCTTTTCCCAAGTCATATGCTGAACCAATTAAGTGCCCT TAAAGTGAGTGTTAGAAGCAATATCCAAATGTAGCAAATAGTAGCATAGATTCTGCATTGCCATAAAAAATAGCTTCTTTACTTCCACCGAAACCACTAA AGCTAGTCAACAAAAATAGGACCATTGAGCTAGTCCATACCCAGCATTCACTATCAAGGATGGACAGTTTATGCCGTAAGAGACAGCTGTAGAACAATTG CGAAACAGATGAGAATTTGATTCTGAACAAACATCAGACCTAATACACGTATCAAGAGAAAGACCTTCTGATTAATTTGTAATAAATATTTCCCCTTTTA GTTATAGTAAAAACAAAAAGATGGGACTTTTGGGTAAAAGTTTAAAACACCTGAGGTAATCTTCTTTTTATAAGAGTACAGATATGTTTTGTTGTACGGA TTCCTTGTTACAAATTGCATCACATTGCAGTATGTCAAGTGAGACCTAGTGCTTATTTTGTCAAATGTTTGATGAAGAATATGATGTTTGTAATTTTTTA CACAGAAAGTCCTTGTGGAGCTGGCTAATGATCCAAAGCTTGTATATCACTGTGGACTGACACCAAGAAAGTTGCCTGTACGTGTTGTGATCTTTTTGAG CCAGTTATGTCTGGATGTTTTGTTCTCATTTCTTTTTCCTATCAGGAACTAGTGGAAAACAATCCCCTAATTGCAATCGACGTTCTTACTAAGTTGATAA ATTCTCCTGAAATAGCAGAGTATGCCTTTTGCCTCTATGTAATCTTTCTTTCTTTAGTATATAAGGACCCAATCACTATTATTTTCTTTATTTCTATTTG CTTATTTATGGAGACAGATACTTTACAGTACTTGTCAATATGGACATGAGTCTACACTCAATGGAAGTTGTGAACAGGCTTACAACAGCAGTTGAACTTC CTTCAGAATTTATTCACATGTATATCACTAATTGTATATCATCCTGTGTGAACATCAAGGTACTTTATTTTGCCTATGTGCTATGAGCTTTTTATTTTCT GTAAAAAATAAAATAATTTTTTTTTCGAAGATTAGGCTTCTGCAGTGTTGTCAAATGGTGGCCATGGTGGCACCATGGTGGAAAGTGGTGGCGGTTCTTC CTGGAAGAAGGCCATACGCCATTTGAAAAAGTCTTTAAACTGCGATGCAAAAATGCATGATTTGAGCACATAAATCTTGGTGTGCATGTAAATCTAATTG TGCCTCACCTAAACCACCAATATATGAATGCTAGAGTAATATAATTTGGTACTTGGAGTTTATATTTATGGTTCTATAGTGCATATTAATTGATTGCTAT AATGGTCCCCGAAGAAGTTGTATATTGCATCATGAGCCTGTTTTAAGTGTTCATTTGACTTTTAAGTTGTCTCTTGATAGTTAATCCTAAATTTTATGCA AGAACCTTTGGTCAAATTGCACTGACCTTTGAAGTTTGTGCCTCATGTTCATGTGGCACTTCAAGAGCTAGAAATGTGTGGAGGGTTAAGTAACCTGGTT AAAGTTGTTCTGTCATTTTACACTTTCTGTTCCAACAGACATTTTTCTATAAACAGAGAAATATTATTAGATAAGAAGAGAGAACATTACAAGTTGATAA GACATCCTCACATTATGTATTAGAAACACATAAAAACTAAGTAAAAGGGCCATGCAATTGAACATGACATTTTTCAGCTTCAGTGATTTATGTTTCTCGT GGTTCTATTTCATTGAAGCAGATGGAAAATGGTATCAGTTGCATTTTGAAATGAGTTATGATTCCCTCATTCTGGGATGTACTTATCCTGCAAGCTCTAA GGTTGATTTCTATGTGTGTGTTTTGCGTGTGTGTATTTATTTAGCATAGCTATTCTGCTTCCATACAAATTCTATGGCCATAGAAAAAATGCAAGTTAAT TATTTCATAGCCATTTGTCTCTCTGCAGTTTGCATCATGTCTATTCTGTTTCTTCTTTCATAATTAGCATCTAAGATTTCAACCTTTATCTCCCAGGATA AATACATGCAGAACAGGCTTGTGAGACTTGTTTGTGTTTTTCTGCAAAGCCTTATTCGGAATAACATTATTAATG BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_74208; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_78722
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | CCR4-NOT transcription complex subunit 11 from Danio with 80% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019432523.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |