| Id Trinity | FTRINITY_DN58172_c1_g2_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_80863 |
| Sequence | CGGGGAATTATGAATGTGTTTTCTCAAATTTTTAATTGAATAATTGTGTGATTACATCACATTACTGTAATGTACCTTATAGTTACTAGGCATACATGTT ATCTTTGTTGTGATTTTACCTTCTTAGAAAATTGTGGATGCTGGAAAGTGTAGTGTGAGGAGTTTGCAGTTATGTTTAGTGTGTTTGTTATTTATCTTTG TGGGATTATAAGATATATCCCCCCTCTTGAAGTGTCTGGAAATAATAGAGATGTTAGCCTATTAAGTTGGATAATTGCATTTTATTTATTCATGGGGTGT GATGAATTTATGTGTTGTGGCATGTGTTTTTTCCATTTGAAAATGGTTTGAAGTCAGACTTCTCTCTCGCCTATGTGAATGTCTTCCCTACCATTTCAAT ATGTTAATGTATTGTGTATGATATAAAATATGTTAATATATTGTTGGCTATATATGTTATGTTAATGCATACTTTTTTGAATAGGTAAACTCATACGATT CATGACTCAAGCTTACCCGACCTCCACGAGTTTAGTGAAATCGCGAGTTCGACAACTATTATTCTTTTGTTGAATTTCTATCATATGCTTTGAGAAATAA TGTGAACTTTTAAAACTATGAAGTCGATTAACTGAAGAAATGGCTGCAAAGCTTAATAAAATCACTAATGGCAATGAGATAAAAGTTAACAGATTAGAAC TCTACCAAGTTGTTTGGAACTCTTCAGTCTTCACTTTTGAAATCCTTGAAATTTAAGATTTTAGCATGTACTTGTTTCCCTGTTTCTTCTACTTAAGATG TTTTCATTGTGCTGGTTTGTGACTCTTGTTTTTCTAATGTGGTGTTATTGTAACACAAATAAAGGTCTAATTTGTTGTAGACACAAAATATAGATATATT TTTTTTAAATATATAAAACCAAATCTAGATTTTTACCCACCTATAACTCAGCAACTGCATCATTAGAAGAGTTAGTTCCCACCTTTGTGGTTTTAACCTC ACCTTTCGTGTGCTAGAGAGCAGAGGTCCTGTTTGAGGTCTTGTGTGGAACAAAGTGACATCTACAATCTACATTTCAATTTTCATGTCCTGGTTACTTG TCCATTGTGATACATTCAATTCTAGGAACACCGAACACTGGATCCTTTATTTGCCTTTTGTAGTTTATGTTGGATTTTCAAATTGAAGTATTGTTGGTAT TATACTTGACAGCTCATCATTGTGATTAATCATACATTGCATAGAAGATACCTGATTTCCCATTTTGCCTGGTTATGGTGTAATTTGCAATGGTATTTAG TATAAAATTAAAATGTGAGTCAGTCGATGTCGAGTTTGATGGTCCTAACCTAGGTCTATTGCAGTTGAGATGCTTCACTTCAGAGAAAATTCCTAATTTT TATAGGTCCATACTACTAAGTCCTAACGTCTTCCATCTCAGCCTGAACTTTTGGTTAGAAACCATAGCATTGGTCTTAAGGTACAGATGGCTTCATGAAT CGATTCACAAGGATGGAATAGCAAGATTTATGTAACAGGCCTCACTTAGTCTGAGACTCTGAGTTAGGCTGGGTTTGTTGTATGGGTTTTAGCTTTGTCT ACATACGTATGCTTGAATGAGGATTTTATCACAGTTAAAGTAATTTGAAATTTTTAATGAAATATTTTTGGGGTTTTCACTTTATGAACTTGATAGCTAT TGGTTTGACATTATTCTCGATGCAGCTTACTGCTGATGCCTTCTTTTTGGTATTTCTTGATGACCATTTACAACTTTGATTTTCTTTATACTTCAATATT AATAGTAATAATTGTGTTAGCATCAACAAATCTTTATTGTATGATAGTCAACCATTACAAGAAAAATTAAGTTGCAATCTAAAGTTTCCCTGTGTAAAAA AATAGAAGTAACATCTTATCTTTAGCCCATTTTATGTCTTGTTTCCATTCATATAAAATGTTTATGGAAGGCCATTATTAAATGTATCCCTTTAAATTTG TGCGTTTACATTATATTGATTTGCAAAAATGATGATGGATTTTACTTATTTAATATGCATATGATGGATTGCAGAGTGGAAACCATGGGGTGTCCCAGAT GATTATGAATGTGAGGTGATCGAGAATGATGCGCCAGTTCCCAAGCATGTTCCGCTTCATCGTCCTCCTCCTCTCCCTACAGAGTTTCACAAAACACTAG AGTCACTTCAATCAGGAAAAGATACTGCTGCTATCAGTTCTGGTGAATCTAAGGCATGATCTGAAGGTTTCTATATTTGAATGTGCTTTTCCTTTTCTTT GCATTAAATTGTTTGTCTTAGATAGTTTCAGACTAAACAAACTTTGTGGGAGAAAATATTGGCTCCTTAATAACTTGAACAGGAAAAGATACTCTTGCTG TCTGCTCTGGATTCAAAGGCATGCTCTGAAGCCACATAAGAGCATTGGTTTATATATTTGAATGTAATTTTCCTTTTCTTTGCATTACATTGTTTGTGTT AGATAGTTTCAGACTGAACAGACTTTGTCTGAGAAAATATTTGCTCCTTAATAACTTCAACAGTATGAAATAACAAGACAAGAGTTTCTTGTACTTGTGC TTTGTTATATCCTCTAAACTTTTTGGAACCGTCTGTTCCGTAGCATTTTGGATGTGATAAAATATTTAGTATTAGTATTGAGAATTTAATCAATTCATAA TAATTATTTATCAAAAAA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_74794; |
| Additional information | - |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_80863
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5, mitochondrial from Arabidopsis with 67.8% of identity |
| Eggnog | NADH dehydrogenase (Ubiquinone) 1 alpha subcomplex(ENOG4111V89) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT5G52840) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019449713.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |