Ll_transcript_78786

• Id Trinity: FTRINITY_DN58181_c3_g1_i17
• Name Transcript: Ll_transcript_78786
• Sequence: GTTGGACACTACAAAGAGGCGGTATGATTGTTTAAATTTTACTTTTAGGGTTTAATAATGGTCTACATTTTTCATGGTACAACTTGGCACAGGTTAAAGA TTATGATGCTGCATTGGATTTGGAATTGGACTCAGTGGACAAGTTTGTACTCCAATGCCTTGCCTTTTATCAGAAAGAGATTGCTCTATACACAGCCTCA AAGAATAACAGTGATTTTTGCTGGTTTGATATTGATGGGGATATTAATGCACTTTTTAAGGAGTACTGGTGCAAGAAATTGCATCCAAAGAAAGTATGTG AAAAGGTTTTCAGGCAACCTCCTTTGCGTGAATCGTCAAGAAGGGGAAAGTTTAGAAAGCTGGAGTTTATTATTACAAAGCAGAAAGCTGCTCTTTTACA GGCTGCAGACTCCATTGGCAAGAAAATCCAGTATGATTGTCCTGGTTTCCTACCTAACAGGCGCCAGCATCGCATGGCAGGACTTGCTGCTATTGAAATT GCACAAAAGGTCTCAAAGGCCTGGCGCTCCGAATGGAAACATTCTAATAAAAGCAACTCAAAAAATGGAAAAAGGACCAGGAGAAGGGAAAGAATTAAAA TGCCCAGTCAAAACAGGGGAGGTGCTGGTTGTAGTACAAGCAGTGCCTTCGAAACATGTTCACGTGGCACTTTAGATGATAGACCATCTGGCCGTACCAT GTCTTGGAAAGATGTTTACTCATCAGCTGTTAGATGGAGACAGATTGCTGAGCCTTGTGATCCTGTTGTGTGGGTTAACAAGCTAAGTCCTAGTGTTGGG GATGCCAACACCTAGTCCTAGAGGCATGATATAGCTATCAAGTTCGTGGTCTACTAAGCTTGCAGAAATTCTAGATATATTTGAAGTCCCTCCTCTATTT TTCAGTTAGTGGTGGTTACAGGAATGTTTGTAAGGTCATATTCAATATTCCATTTGGCTTCCATCAATTTGAGGTAGCATCCTTATATTATTATGTCCAA AAAAGTAGTTGAGTAGCAAGATTGCATGTTCATAAAATAAATTAATAACAAATGCTAGTTAAAAAGGCCCTGAAACATATAACTGGGGGTTGAAGATGAG GCAATATACACTTGAGGGAACATTTCCAAATTAATTTCAGATGAGTTGACAAACTTTAATTGTATGCTAAGGTTCTCATTTGAACTATGTTATTATTAGA AAAATATCTGATTTCCTCGATATTTTACCTTTTATCATCTCATTTATGTTTTTTTAGTCTAAATTTAGTAAAACTGGTAGTGTGCAGCTTCTCTTGTTTT CAGGATAGGTTAACCAAGAGCTCTTTGTTACAAAGTAATGACAAATTAATTAACAATTCCCGTAAATAAATTTGGTTGTTCATAATTTCTTCTAATTAAA TTCATTGTTTACCTTGTTATGATAAAATTCATCTGGATCCCTTAGTTGTAATTGTTACTATTTATTCCAAAAAAATAAATTTGTCTACGGGTTGTCCTTC TCTTTTGATTGTTATTACAGTGCATTTGCATTATTGTTCATACTTAATGCATTAACTTTGTCCTTTTACAAATGCTTTTAGTTTTTGTTTGTTTGTGGGG TTTTAGATCTCTATGTTGATCTCTTTTGTTCAGACTTCAGAACATCTGCATCCTATTTATCATTCAAGTTATGTGATTTTTGAAAGATTATTTTCTTTTA TTCTAAAGTATATACTGCTCTTTATTTGTGAAATTAGGCTTGTGATTTTTTGGTATGGGTTTGATAAGTTTTTTATTTTGCTTGCAAGCCTCTTAGTAAT ATTGGTTAATGTCCCTAGTTTATCCTCGGACTGTTGAGTTGAATCAATTTCAGATCTTGTGTTGGATTTTGAATTGGTTTTTGTTTACACTGCAGTGAAG ACTTCAATTCTGGATTCGGCTCTCATACATCTATGATTCTTGGCCAAGCTAAGGTTGTCCGTTACTTTCCTAATTACAAAAGGACATTGGATATTGCAAA AACTGTCATGAAAGAGAGGTCATATGTACACAGCAGAACAGATGAGATCATTAATCTTTCCAAAGATGGGAAATTAGAAGAGATTATGCATGCAAAATCA TGCTCTGATCTTTATAAAGTTGTTGGTGAGGACTTCTGGTTAACTACTTGGTGCAACAGTACTGCATTTGAAGGGAAGCAGCTTGAAGGGACAAGGATAA CACTTGTAAAAATGGGGGAACATGGTTTTGACTTTGCAATTAGAACACCGTGTAAACCTGCTAGATGGGAAGATTTTGATGCAGAAATGACAATGGCATG GGAAGCTATTTGCGATGCTTACTGTGGTAAAAACTATGGATCTACTGATTTCAACAAACTTGAAATCGTGAGAGATGCCATTTTAAGGATGACATATTAC TGGTATAACTTTATGCCATTGTCTAGAGGATCTGCTGTGGTTGGATTTGTGGTTATGCTGAGTTTGTTACTTGCTGCCAATATGGAATTCACAGGAAGCA TCCCACAGGGTTTACAAGTTGATTGGGAAGCCATTTTAAGCTTAGATCCAAACTCCTTTGTGGATTCAGTTAAAACGTGGCTATACCCAACTCTGAAGGT GACAGCCTCGTTGAAAGACTACCCTGATATTGCATCAACTTTTGAAACAACAGGGTCAGTTATTGCTGCTCTCAGTTGTTTTGATGATTGAATGAATTCC TTTATAAATGGCAACCTCATATTTAGTCTAATTTTAAAAGGGCATGTTACATTGTAACATTTATGGATCATACAATAATGTAACTTATGTTTGTTATTCG TGTCTGTTAAGATCAAAGTTATGTGCAACAGTCATTTCCCAAATTTTCAAATCACTTTACATGCAGTTCTTTTTTTGGTACTACCAATGGTAACCTTTCA CCCTT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_74863;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_78786

FPKM

• FPAB: 0.3
• FPNAB: 0
• LF1: 0
• LF2: 0.2
• LF3: 0
• LF4: 0.3
• UF1: 0
• UF2: 0.3
• UF3: 0.1
• UF4: 0

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_78786

• Blastp: Suppressor of RPS4-RLD 1 from Arabidopsis with 66.4% of identity
• Blastx: Suppressor of RPS4-RLD 1 from Arabidopsis with 67.29% of identity
• Eggnog: repeat-containing protein(COG0457)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G37460)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019446848.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;