Ll_transcript_120843

• Id Trinity: FTRINITY_DN58233_c1_g1_i15
• Name Transcript: Ll_transcript_120843
• Sequence: TGAATTTCCAATGAATTGTAAATCTTTTAAACTTACTTTTGGAGTAACTTCATCATCCATTTGTTTATATGCCAAATAACAATTACATGTTATCTGCTAA TCTTCTTGGATGGATCAAATTATATATATTTTTTGTTATTTATGATTGTAATGTTATGATGGGTTTAATGGCTTATATCAGAAGTTTGGTTAATCTAATT GGGTTTCCATTCATTGAAGCTTCTGTCTTTTATGATCGTTCAATCTTCTAGACATTTTCCTTCATTGTCACTTTTCTTTTGTTTTCAAGGAAAATTTGAT TGCATAAACGTTTCTTCTAAATGTTTAAGGTCATTAAACTCGTCAATGATATTCCATGTGTTCCAACTTCCAACTTCTGAGCAAGGTTATATTTGCCTGA TATAAAATGCTTATTTATAAGCATTATACATTTGTTAAAGGAAACCATCCCATGATATATTTAATATAACATTATTGTCGTCTGATTCAAGTTGATTCGT GAATGAAACATCATTTGGGATAGATGATCTCTCGTATTAGATTGTTTGTATAAGAATTTTGCATTTGTTTATTTACAATTCCACCAACATTTCAAATGAA TAGCTTCATATCATAGGAGTCCACAAGGAACAACACACGATGGGCGATTTCAAATGGAACAGGAATCCATGTTCTCAAAGGACCTTGTCTCCCTATCCTA TCCAATGAAGGAGCAGAAAATAATACTTTACTTTTTTATAATTTTTTCTTTTAATAAAATTATATATTTTAATTAGTTTGGTACACCAATGAGGATAGAG GATCTCCATCGTTTCAAGTGAACTTTCCTCTCCAACTAACTAAACCTTAAATTAAATTACAGTGTGCTGCTATATTTATTGTACACAAGAAAAAAGCTTA AATATTTTCTTATTATTAAATAGCTAAATTATTCTTTATGGTTGTTGCTGAATTTTAAGTAAGTTATTATTTTTTATTTATTTTGAGTAAAATTTTAATT AATTTTAGGCAATCTAATACAGATTGGCTTTCTCTCTGACTAATGATAACTTTTTTTGGTAAGTTGACCAATGGCAATTTAATTACTAATTTTATTCTTG AAACTAATATCATAACACCATAAGTCAATCTTTTTCTTGAAAAGTTATTCTAATTGGTTTACATTTTTTAAAAGAATTTAATATTTATTTACAATCAGCA TAAGATTTTGTTTACTATCAGTGTATCATTTATTATATATGGTACTACTTTTAGTTTATTATTTATGATAATTTATATATAAACGATAAATAATAGCAAT GAAAAATATGTCATTTATACGATTTTAAATTAAGTTGTATAAAAAAGGGTTGAGATAAATTAATACTAACACGATTTGACTTTTGTTGATAAATTAGCCA ATAACAATTTAATTTCCTCCATCATATTATTAATTTTATCCTAAGTGAATTTGGGTTATGACATGATTATTTTTTTTTACTTTAATCACCACCATCAATT TCATCATTAAGATGTTGATAAATTATCAATTTCTTCCCTAAACTTTTGTTAGTCCTTTCCAATTGACTCATGACATTGTCATCAATGTTGTGCTTGCAAA AGCTATAATATTTGGATTATATTTTTTATTGAAAGATTGCCATTTATTTAATAAGAGCGTAATAATTTTATACGATAAATGCATCATACATCATATGAAT TATTTTTTATATTTAGATCAATGGATTTAACACATATAAATGATCAATAAATAATATATAGAGAATATAAAAACTATTATATTTCAATACATAATCTATT TTTTCTCTTTTTCAAGAGGTTAAACATCATTCTAAAGGGACTAGCAGATTTCATTAGAATGAAATACAATAATATTAAGATTATCAAAATAAAAAATGAT ATATTATTTTACAAAATCTTCCTACATCATATACATTATTTTAAACTATGCATTAATAAGTAATTTTGACTGAAATTATTTTCCTTAGATGTAATTCCAA AGTAATTGTTTACACGAATAATTAATCATACATCAATATAACTTTTTAAAACAAGAATTTATAACATCCTAAAAAAATTATAAATGCTAAAAGTTTTTTG ATGATATTACACAAATAATAATTAATTAATAGGTATTTTGTGACAAAGAGGTCCTAAAATTAAAACCAAAGGAAAACAGTGAGAGCTGCCACAGAAGGCC GAGGAAGAAAGCGTTGGATCGGAGAGTGATGTGGGAATCAATTATTTTAACGGTGATTGCCACCGCCGGCAACAACATCGGTAAAGTTCTTCAGAAGAAG GGCACAACCATTCTTCCTCCTCTCTCTTTCAAGCTCAAGGTTATTAGGGCATATGCTCTAAACAAACCCTGGATGATAGGTTTCCTAATGGATATAGTTG GGGCATTATTGATGTTAAGGGCATTAGCTCTGGCTCCTGTGTCTGTCATCCAACCAATTTCGGGTTGTGGACTTGCGATTCTTTCAATCTTTTCTCATTT TTATCTCAAGGAATTAATGAATACTGTTGATTGGGTTGGCATTACACTAGCAGGTTTTGGCACAATAGGAATTGGTGCTGGAGGTGAGCAGCAAGAGGCT GCTGATCTATCTATTTTGCGGATTCCATGGTTGGCATTTGTTATTCTCATCTTGTTTATACTTCTTAATGGGTGGCTTCGAATATGCAAACGTCAACGAA GAGAACAAGAGATGATGGGGTATGATGTTGTCGAGGAAATCATTTATGGCTTGGAATCTGGAATTTTATTTGGGATGTCATCTGTAATATCAAAGATGGG GTTTTTATTCTTGGAGCAAGGTTTCAACAAGCTGTTGGTTCCAATGTGTCTCATCATCAGTTTGTTTTCTAGTGGTACAGGCTTTTACTACCAGACACGC GGTCTAAAGCATGGGAGGGCTATTGTAGTCTCTACATGTGCAGCTGTGGCATCAATTATGACAGGTGTACTTGCAGGAATGCTTGCTTTGGGTGAGCGAC TCCCTTCGGTCCCAAAAGCTCGATTGTTACTTCTTCTTGGATGGCTACTAATTATTGCAGGTGTGATTTTACTGGTTGGTTCAGCAAGGCTAATGAGATT GCTTAAATTTCCTTCACACCGCTTTAGAAGAAGCCGCGCTGATAAGAACTATGGCCACAGGAGATCTGGGAGTTCCCGTATTAGGGAACCAAGCCCAACT GCTGTCATTCATGCAGCCACCCTAAATAATTTACTATCATCTTCCAAAGAAAAAGCTTGAGTTGATACGTGCTAGAAAATGATCCTTCATCAATTCTTAG GATTCAAAACCAAAAAAAATAGTTAGCTTTTAATGTCAGGTTGTTTGTGTACACTGTACAGTTGCTGCTTTATCAGAGGGCATGGAATTTTGGGGAGCAG CCCTTCTGGCTCACATACTTTACATGAGATATTCATCTAACTATCTATGCGAACTTGTATGAACTTTTGCCGAACTTCCAATATTTCTCAATGTTGTATT TAGGATGATGGTATAGCAACATAAGGAATGTTTGGGTAGCATGGAAACAACCTGCAGCAATGGTCTTTATGACAGGTGTGGCTGGCTTCTGTTATGTTAT ATGCCAAAAGGATGGATTCTATCAAAAGTGCTGTTTATGGTCTTTTGGTCCTAATTGGGAGGGGCATAGAAATTTAGTGAGATTATAGTTTTACATGTTT ATAGGAGATGAGTATTGACGTAATGATAAGATTGTTACTTAGTGTCCAAGAGTTAATATGTTCAAATTCTAGAAATAGTTTCATAGCTTGCAGGGTAAGG TTGCATATTCTCTCTAGGCTCCACTAGGTAGGAGCTTTATGCATTGGTCACACTTTTTATAGTTTATATGTTCCATGGTGTGATAATTTATGTGCACCAG TAACAATTTCAGTTTAAAGTATGCAGCTCTTAAGAAAATGCATTCATAACTAAAGAAAACACTGATCATTGAATATGATTCTTGATTTTTGACCATTTAA AGAATTTCTCTT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_75311;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_120843

FPKM

• FPAB: 0.3
• FPNAB: 1.1
• LF1: 0
• LF2: 0.3
• LF3: 0
• LF4: 0.4
• UF1: 0.1
• UF2: 0.4
• UF3: 0.1
• UF4: 0.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_120843

• Blastp: Probable magnesium transporter NIPA9 from Arabidopsis with 70.55% of identity
• Blastx: Probable magnesium transporter NIPA9 from Arabidopsis with 70.55% of identity
• Eggnog: Pfam:DUF803(ENOG41124JW)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G11960)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019415858.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;