Ll_transcript_120006

• Id Trinity: FTRINITY_DN58280_c0_g1_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_120006
• Sequence: AGGGGATGTTCCTACCACTTATTGTGCCACCAACTATATATCAGGCTGGTCTTTGGTCAATTTGGTTGGCTGTGCTCTGTTCTTTAAAGGTATATGTTAC TAAAAGAGAACATATGAAAATAATTTTGTTGATGTTGGATATATACAAAACCAATGTCAATTAACTGTCTGTCATGCATGTTTTACATATTGCTTAGATG TTTCAAGCTTTAGCCAGAGATCGTTTGGAACGGCTGAATGCATCTCCATCTGCTACACCCTGGACATATCTTCGTGTATATTCAGCGTTGTTATTTGTTT TCTTGGTTGATGTTCTCTGGTACTGCTTACTCTTTTCTAATGCAACATTCATATTATTCTATTACCATCCCAGTTGTTGTTATTACAATACTGGAGATTC CATCTGTATCTTGTTTTTTATGTGGTTTTGTTAGGAATTGTTGGTCAATTTTAGCCATATATTCCATTTAACTGATATGTAAATTAAAAAATAATTTGAT TGCTGAAACAATCACTAGTAATGTTGTTGCTTAAGAATGCTTTTGACACTCCCTTTTTTATGCTCCCAGGATAAGGCTATGTCTAGCGATATATAGAACA CATGGGTCCTCTTTGTTTCTGTTACTATTCTTTGAGCCTTTCTGTATTGCTTTTGAGACCTTACAGGTATTTAGACTGCAAATTTTCAGATTTGAGATAT ACTCATATCATCTAATTAGTTTCCAATGAGGTAGTGGTGCCTGGTTTAATGATAATGTTTTGGGTGTGATATGAATTTTAGGCCATTTTGGTACACGGAT TTCAGTTAGTTGATATATGGTGCAACAGCAGTGATTACAGAAGGCCTAAACTGTTTGACTCAATAACAGCAGGTAGTTTGGATATATACATGTTTTTTAA TCTCTAGTAACTCATTAACACAACTGGGTCAGCATTTGTGTCTTACTCAAGGGTGTCCTAGTGCATGAGGCTCCCAATTAGTGGGGTTTGGGGAGGGTAA ATGTATGCAACCTTACTCCTACAATCAAAGGGGTTGTTTCCATGACTTGAACCCATGACCTCTTGGTTACTAAGTAGCAACCTTACTCTTGTGCCGAGGC TCGCCATCAATTTGTTTTCTACTGTTTTAGATAATTTAGTTGTGTTGTGTCTCTGTTCCCCCCTGGACCCTCTGGTCTTTACATGTTGTTTCACAGTAGT GGTAAGTTGCTATCCTGTAAACCATTACCCTTTATTTTGTTTAATATAAGAGATCACTATTTTACTGGCTTCATTATATAGGAATATACATCGGTGTGTT TCTTAAGATGTGTTGTGTTACATAGAGACCTTGGATGTGTTGTGTTACCACTTACCATTAACAAATTTGCTTCATGATCAGAATAATTAGGTTCTATTTC TAGTTTATTGTCATTAATAACAATGTATATGGTTAATCTTGCCTGCTGACATCATCTGATTACTGTGAACTTGTATTGTTCTCCTAATTTTGTTTTTCCT TTTAATGACCTGTCTGTTGACCTTTCTGCTGTATGCTCGTATGAACTTAATTCTAGTTTTCTAATTAACTGATGTGACTGCAGGTTCATTATTGGAATGT AAAGGAATTCTTATTCGGAACTTGGGATTTTTCCTAGACATGGCAACATTTTTTATGGCACTAGGCCATTACATGTATATATGGCGGCTTCATGGTGTGG CATTCCATCTTGTAGATGCAGTGCTATTTCTAAACACACGTGTAAATATTTGTGTAGATATTTCATTTTTAATTCTGGTTAAATTTGACTACCAATAAAA ATTTAACCAACATTTGCATATTATGCTACTTGTATTCATTGATGTTTTGAGCAGGCATTACTTAGTGCAATTGTAAATCGCATAAAAGGCTTTATTAGGC TA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_75704;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_120006

FPKM

• FPAB: 0.3
• FPNAB: 0.2
• LF1: 0.1
• LF2: 0.2
• LF3: 0.1
• LF4: 0.1
• UF1: 0
• UF2: 0.2
• UF3: 0.1
• UF4: 0.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_120006

• Blastp: -
• Blastx: E3 ubiquitin protein ligase RIN2 from Arabidopsis with 39.47% of identity
• Eggnog: zinc ion binding(COG5243)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G25230)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_003522880.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;