Id Trinity | FTRINITY_DN58311_c1_g1_i13 |
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Name Transcript | Ll_transcript_210311 |
Sequence | CTATCCTCAGTTTACTTGTCCATGGATATCTGAATCATAATCAGTGCCTTCCTCGCAAAAATATTGATTATCTTTCTGGTTTGTGGCCGTCAACTTTGGC ATATTTAAAGCCACCCCTTTTCTTTCATTTCTTTAAAAATCCAATCTTTATTCTCATTCCCTCTTTCTTCTCATTCTCACTTTTCTCTCTTCAAATAGTG CTTGATGACGCCCAAGGAACATGACACTAATAACGAGGACAAAGATCCGGAGATTGTTCCTGATTCAGAACATATGAAGAGGTACGCCAATGGTCAAATT TGGGATTTTGAGGATGAGATCATGGCTGTCTCAGATGATGTCTTGTTGGGTTTGGATGGTGGAACAACTTCCACTGTCTGCATTTGTATGCCATGTATTC CCTTCTCTCATTCTCAGCTTCATTCTCTTCCTATACTTGCTAAGGCTGTTGCTGGTTGCTCCAATCATAATAGTGTTGGAGAAATTGCTGCAAGGGAAAC GTTAGAGCAAGTTATGGCAGATGCCCTTTCAAAGTGTGGTTCAAAACGATCTTCAGTCCGAGCTATTTGTTTGGCTGTTTCTGGTGTTAACCATCCAACA GATCAGCAACGAATTCTCGGTTGGCTTAGGTTGCTATGTATAAGAATATCTTGCTCTCTTTTTCGATAAAAAAACATACCTTTCTACTTTTACTCTTTAG CTGTTTGAAGAAATTTATCTGTTAGTTTTTGGCGTGTGATGTTATTTTTCAATATCTCAGTGAGATTGATGGTCTCTTATTGACTTCTTAAAACTTATAG GAGAAGAAATATCTTTTTCGACAGTGCCCTATCTCCTCTGCTACATTGAATTGGTGGATTCAATGTCACAGCTGAGTCTAAGTTTTTTATAATGGTATTT TCTCTCTATTCATTAGGAAAACGAGGTTTCTTAAATAAAAAATAGACAATAAACATAGTTAATCCTATCATTAATAATAGCTTATTGCAGTACTCGAGGT TTATAAAGGAGAATGGTAGTGTAAACTTTGCTGTTTCTAGTTTTTGTGTTTTATTGTCTTACAATTTTAGATAGACTGAACGTTACTGTATTTTTCCTTT TTTGATTAGCTGACATGTTAGTGTAGATAATCGAAGTAAGGACCACAACGGTATTAGACAACTTATCAGTAAATAATTGAAATTTTAGTTAAATTGTAGC TTGTCCGATTTGCTGGTTCACTTCTTCAGAGATATTGTGTTACTTGATTTCCACAATAGTTTGTTTGCTACTGTAGAGACTGAAGTTTATGGTGTGACCT TAACAGGGATATATTCCCAGGCCATGTAAGGCTATATGTTCGGAATGATGCTGTAGCTGCTCTGTCAAGTGGAACAATTGGTAAACTTCACGGATGTGTA TTAATTGCTGGCACAGGAACAATTGCATATGGATTTACAGAAGATGGCAAAGAAGCAAGAGCTGCAGGTGCCGGACCTGTCTTAGGTGACTGGGGCAGGT AGTAATCCATCACAACTGTTTCCTTTCCTTTCATAATCTCTCTCTGTACTTCCCTCCGCTATGCCCCATCTATACTATTTGTTACACGTGCAATCTGAGT CATTGAAACAGTCTAGGGTGAAGCGATGTTTGGTAGGCAGACCAAGAAAATTCAAATAACCAGAGAAGGCTCTATGTTTCTAGATTGATCTGACCTTACT TTTCTCGAAAGCTCCTTGACTATCATAGATCCTGACATACACATAATGTGGCTAGGAAATGTATAAAGGTCTTTCTTTTGACCTCCAACTTGATTCCATG TATTATTTGCTTGAAAGGTTTTCTTTTTATTTGTAGTGGATACGGAATAGCTGCGCAGGCATTATCTGCTGTAATAAAAGCACATGATGGCCGTGGTCCA AATACAATGCTTACAAGTAGTATTTTACAAAAGCTTGGTCTTTCTTCTGCAGAAGAATTAATCGGGTATATATGTTATCTTTACAATTGTTCATTACAAT GCTATGTGACTGTGCTAGTTGCTTCTCTATCCATGAAATTTTAAGGTCAAAGTAGTTTTCTCAGTGTTTTTTATTTCATTAAAATTGTCATGCTATTAAT CTATTATGCTGACATTCAGCTTTCGCTATTTTCTGATTGATATTGCATGAATGCATATGGTTTGTTTTATGTTTTATGTTTTTTTGGAATGGATAGCCAA AATATATGATTGTATTTTGTTTATTGAATGTTCTATTCTATTGATGAAATATTAAGGGGTTATATGCACGTGTTTAAAAATCCTTTTCAAAGAAGTTTTA CGTTACCAGGATCCTGAATTCCTGATAGACACGTGAATATGAAAGTGAGAAGAAAATAATTTCCCGACGATTGAGCTGGATGTAGGATCACAATCATTGG TTTGTCTCATTGAAAATCAGGTGGACCTATGCAGATCCCTCTTGGGCTCGAATTGCTGCACTGGTTCCAGTTGTAGTGTCCTGTGCTGAGGATGGGGATG AGGTGGCAAATAAGATTTTGCTAGAATCAGTACAAGAGCTGGCTTCAAGTGTCAAAGCCGTTGTAGAGAGACTTGGATTATGTGGTCAAGATGGAAAGGA TGGTTTTCCCCTTGTCATGGTTGGTGGTGTTTTGGAAGCAAATAGGAGATGGGATATAGGTACAAAAGTCATAAACTGCCTCTCCAAGGACTTTCCTAGA GTACTTCCTATTAGACCAAAGGTGGAGCCTGCTGTGGGGGCTGCTTGGTTAGCTTGGAATTTTTTCATGAAAGAAGAGTATCACAAGGAAGCATAACATA GCTGACAATTGATGGAATAGGATAAGAGCATAAAAAAGTCTTTGTTCATTGAAGTTGTAGATTACACATTACACAATACTGTAACTTTGAAGCTATCTTG TAAACTTGCAATGCCCTTACAATACTGTAACTTAGCACATGCATATATTAATTTCTTGTGAACTTGAGATCATACATATGCTTGTGTAAATAATTTAATG GTTTTGACAGTGTAACTGTTTTAACTGTCACGTGAATTATTATCATGTGTTTCTTG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_75978; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_210311
Blastp | - |
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Blastx | N-acetyl-D-glucosamine kinase from Dictyostelium with 33.05% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019462387.1) |
Pfam | BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family (PF01869.19) |
Rfam | - |
GO | - |