| Id Trinity | FTRINITY_DN58382_c2_g2_i12 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_212639 |
| Sequence | CTCCTAGAATTTGAGGTTTCGTTAGAGAGAGAGAGAAAAAAAGAAAAAAAAAAGAAAATGAAAATGAAAATGAAAATCCCTTGTTGTTCGGTGTGTCAAA CGCGTTATAACGAGAACGAACAAGTTCCGCTTCTTCTTCAATGCGGTCACGGTTTCTGCAAAGATTGTCTTTCTAGAATGTTCTCTTCTTCTTCTGACGC AACTCTCACTTGTCCGAGATGTCGCCACGTGTCCACAGTCGGGAACTCTGTCCAGGCGTTGCGCAAGAATTTCGCCGTCCTCGCGCTCGTCCACTCGGCC GCGAACGCGGCGAGTTTGGACTGTGACTACACTGATGACGAGGAGGAAGCTGGCGGGGAGGAGGAGGATGAGGATGAGGATGAGGAGAGGCGCCGGCTGC GCGGCTCGCAGACGTCGAGTTCGGGAGGGGGTGAGGTTGTGATTGAGGTTGGGGCGCAGCAGGAGCTGAAATTGATGCAGAGGATCGGGGAAGGGAGGAG GGCGGGGATGGAGATGTGGACGGCGGTGTTGGGCGGCTGAGGCATGAAGTGGCGGTGAAGAAGGTGGCTGTAGTCGAAGGGATGGATTTGGAATGGGTGC AGGGGAAGTTGGAGAGTTTGCGGAGGGCTTCGATGTGGTGTAGGAATGTGTGCACTTTTCATGGAGCAATGAAAGTGGAAGAGAGTTTGTGCCTTGTGAT GGATAGGTGCTATGGATCAGTTCAGTCTGAGATGCAGCGCAATGAAGGGAGGCTCACTTTGGAGCAAGTCCTAAGATATGGGGCAGACATTGCACGTGGG GTTGTTGAGCTTCATGCTGCAGGTGTTGTTTGCATGAATTTAAAACCTTCCAATCTTCTTCTCAATGCAAATGGTCATGCAGTGGTTTCTGATTATGGAC TTGCAACAATTTTGAAGAAGCCTTCCTGTTGGAAGGCTCGACCGGAGTGTGACAACTCAAAGATCCATTCCTGTATGGAATGTATTATGCTTAGTCCACA TTATACAGCACCCGAGGCTTGGGAGCCAGTGAAGAAGTCTTTAAATTTGTTCTGGGATGATGCAATAGGTATATCTTCAGAGTTGGATGCCTGGAGTTTT GGTTGTACATTGGTGGAGATGTGCACGGGTTCCATTCCGTATGTGGAGCAACTCTTTTCTCAAATCTTATGTTTCCCACTCTTCTTTTTTATTTATTTAT AATTTCTTAGTCCAAAATCTATATTTCTGCAGTTGGGCTGGTTTAAGTGCGGAAGAAATTTATCGAGCAGTTGTTAAGGCGAAGAAACTACCTCCACAGT ATGCTAGTGTGGTTGGTGGTGGAATTCCTAGGGAATTGTGGAAGATGATCGGAGAGTGCTTGCAATTCAAGCCATCTAAAAGGCCTACTTTTAATGCAAT GCTAGCAATATTTCTCCGCCATTTGCAGGAAATACCACACAGTCCTCCTGCAAGCCCTGATAATGACTCTGTTAAAGTCTCTGTGTCAAATGTGACCGAA CCTTCCCAAGTACCTGAATTAGAAGTTCCTCAGGAAAATCCAAACCATCTTCTTCATCGACTTGTGTCTGAAGGGGATGCCAGTGGTGTTAGAGATCTTC TTGCAAATGTGGCATCAGAAAATGGCAACAACTACATATCTTCTCTATTGGAAGCCCAAAATGCTGATGGGCAAACGGCTCTCCACTTAGCTTGTAGGCG TGGCAGTGCAGAACTTGTTGAGGCAATTTTGGAGTATGAAGAGGCAAATGTTGATGTCTTGGACAAAGACGGAGACCCCCCTCTTGTTTTTGCACTGGCA GCTGGGTCCCCAGAATGTGTTCGTAGCCTCATCACAAGAAATGCTAATGTGAGGTCACGATTGAGAGACGGCTTGGGCCCATCTGTGGCTCATGTTTGTG CCTATCATGGCCAACCAGATTGTATGCGAGAATTACTATTAGCTGGAGCTGATCCTAATGCAGTGGATGACGAAGGTGAATCTGTACTGCATAGGGCAAT TTCCAAGAAGTACACAGACTGTGCTCTCATGATATTGGAGAATGGGGGCTGTAGATCAATGGCCATCTTGAATTCAAAGAATCTGACACCACTGCACTTG TGTGTGGCAACATGGAATGTCGCTGTTGTGAAGAGATGGGTGGAAGTTGCAACTTCTGATGAGATTGCCAAAGCAATTGACATACCTAGCTCCGTTGGCA CTGCCTTGTGCATGGCAGCTGCTTCCAAGAAAGATCATGAAACTGAGGGTAGAGAACTGGTACGGATATTGCTTGCAGCAGGAGCAGATCCTTCTGCTCA AGATTCACAGAATGGGAGGACAGTTTTGCATACAGCTGCTATGACTAATGATGTGGACTTGGTTAAGGTTATTCTTGCTGCTTGTGTTGATGTCAACATT TGCAATGTGCACAACAGTATACCTCTTCACTTAGCCTTAGCTAGGGGCGCGAAGGAATGTGTTGGACTGCTTTTAGCTGCAGGGGCAGATTGTAATTTGC AGGATGATGATGGTGACAATGCTTTCCATATAGCAGCACAGACAGCAAAAATGATACGCGAAAATCTTGATTGGCTTATCGTGATGCTAAGGAATCCCAA TGCTGGTATTGAAGTCAGAAACCACAGTGGCAAGACGCCACGTGATATCTTGGAGGCCCTTCCCCGAGAATGGATATCTGAAGATCTGATGGAGGCACTC ATGAACAGAGGAGTTTGTTTGTCTCCTACGATATTTGAAGTGGGAGATTGGGTGAAGTTTAGAAGAACTGTCGTAACTCCAATACATGGGTGGCAAGGTG CTAGGAAGAAGAGTGTTGGCTTTGTGCAAAGTTTTCTGGACAGAGATAATCTCATTGTTTCATTTTGTTCTGGAGAGGTTCATGTTCTGGCAAATGAAGT TGTAAAAGTCATTCCATTGGACAGGGGACAACATGTACAGCTAAAAAAAGATGTAAAAGAGCCCAGGAGACCTTTAACAAGGTGAGGAGGAGAGTGGAGA AGAGAATGAGAAAGGATTGGAGCGCATTTTCGGGGTTTAAATTTGGACACTCACAGTTCACCCTCTCACAAATAACCAACTGAGTTGACTCAAGAGGCAC TAGGTCTACATTTCAAGTTGTTAACAAAGCTTGCCATTTCCTTTGCATGTTTACAAAAGAAACACCATTAAAAGCCCATGTGCAGAGCACCAAAGGGAAG CCAAAAAAGTTGACCTATCCCAAACAAAATCAATAGATGAAAAACAGTCATTGAGATTCCAATTGTTCCTTTCCAACCAAATACACCAAAGGATAGAAAA AAGAGCACTGCCACAGAATTTTGACATCTTTGTGTGTGGCAAAACCTCTTTACTTAATTAGGAGGAAATTGCGCAAGTGCAAAGGGTATATCCATGGCTC ATCAATCCCATGCAATCTATTCCAAAGCACGTCTGCCGCAGAGCAATGTAAAAAGAGATGAGTCTCGCTTTCAGCATCTAAATGACACATTAGGAGACAA AGCGATTAGAGGTTTGTGCTTTTGCTTTTGGAGCATGTCTTTGGTGTTAATTCAGTGAAGAATAGTGGAGTAGACAAAAGCTTTAACCCTTGACGGAGCT TTGGACTTCCAAATGGGGTTTTCCAAAGTAAAACTGATTGGGCTGTGAGGAAGTGTCAAGAACTGAAAAAAGGATCTGCATGTGAACATTCTCAAGGGGT CAAAGTTCCAAATTCTAGCTAATCACTTGTGTGGAGTTTCTTTAGTGTTTAGTAAACTATGTAAAACAATTTCAGAGATCCGTGTTCTGTTGTGGGCAAG ACAATTAGGAAAGATTTAAAGATTAATGCTTTGCTAATGGATAGGATTTATAATAGATGATTATGGTGTCATTCGAACCATGTAGCCGATCCCACCTAGT GGGACTAAGGCTTAGTTGATGTTGTTGTTGTGTTATGTTGTGGGGATTTTCCCCTTGCTATTCCAAATGCAGGGGTTAGTTAAAGAAGTACATAACAGTT GTGAAATTAAACCAATATAGCTCCCATATCCCTTTTAATGACGACCACGATAATATATTTAAAGAAACCATTTGCTTGGCATGAAATTGAGACCATAGAG GCATGCTTAAGCTGAAACGATAAAACTTTCTGGTTTCATTTAGTGTTCAGCTGCTACCTAATACATTGATCCCTGCTAGCAAATTACATTTTCCCTAGGT TATTGGTTTCTTCTACTGATATCTGGTTGAAAATGACCATTAATGTCTAGATATTGTTAAAAGCATTGGTGTTATTTCTTCTGTTTTGCTGAATCCTATT ATTCTTTTATGCAAAATATTTTCTAGATAGTTTATTGCAAGGCTGCTAAGCTAGCCAATAATAATAGAAGAAAAGGTAACTGCTAGTATCTCAGCTTCTA AAAGAATGTACAAATGTCTAGGAGTAGAGATTTATTTGGATTTTGAACTAGTAAGGGATCATTTGTGTTAATCACAAAGGTGATGCAATGGCAACTTACC TTCCTTATAAAGGCTGAGTAGTGAAATCTGCTTCAAAGGAGACTGAATATGATTCTGGAATAAACATGTTTAAAAGAAAAGCCAAAAGGACTCTAGTGAT CAAGTTCTATTATCTACCGCCAGTGCTTGTTCCATATAGACATAATTACATTTCCTTTGGTAAACCCATGGATTTTTGGAGGATGTCCAATGTGACCAAA TAGCCCAAATAGTTGCAAGCATCTTTGTACTTTTCTACGGAAAAAAATATTTTTTGTTCTGTGGATATCTTGTACCTGTTATATCTTCTCTTCATGGGTT TTTAGTTAAATCACAATATATGTCCAATTTGACGGGTTGGCATGCATTGTTGCTTCATTCTGTTACTTGATTTTAATTTTTATGTCACTTTTTGGAGGAT GCTTTATCTTCTTCCTTTGTACTTCTCTCTTCACATCTAATAATATTACTTTTATCATAAAAATAACAATATAGTATACAATCTATGCTTCATTGTTAAA TTGTGTTAATTAGTTCTATGGTGTGCTTGAAATCCTTAATGATTTGACATTTGATTTTGATGACCATTTATCTGTTAGGTTTGGTTGGCGTGACCAGTCA CGGGACAGCATTGGGACAGTATTATGTGTTGACGATGATGGTATCCTCCGTGTTGGGTTTCCTGGAGCATCCAGAGGATGGAAAGCTGACCCAGCTGAGA TGGAACGGGTTGAGGAATTCAATGTTGGAGACTGGGTTCGTATCCGTCCTACTCTAACATCTGCAAAGCATGGTTTAGGTTCTGTGACACCAGGAAGCAT TGGAATTGTATATTGTATCAGACCAGACAGTAGTCTGTTAATAGAACTGAGCTATCTTCCAAACCCATGGCTTTGTGAACCAGAGGAGGTTGAGCATGTT GCTCCTTTTAGGATTGGGGATCGGGTATGTGTGAAGCGGTCTGTTGCAGAACCTAGATATGCTTGGGGTGGTGAGACACATCATAGTGTTGGAAGAATAA GCGAGATTGAGAATGATGGTCTCTTAATAATAGATATACCAAACCGACCCATTCCATGGCAGGCTGATCCATCTGATATGGAGAAGGTGGAGGATTTCAA GGTTGGTGATTGGGTCAGAGTGAAAGCTTCAGTGTCGTCTCCAAAATATGGATGGGAGGATATTACAAGGAACAGTATTGGGATAATTCATAGTTTGGAG GAGGATGGTGATGTGGGTGTTGCCTTTTGCTTCAGAAGTAAGCCTTTTTCTTGCTCACTAACTGATGTGGAGAAAGCTCCTCCCTTTGAGCTGGGACAAG AAATTCATGTGATGGCATCTGTTACTCAGCCACGACTTGGGTGGTCAAATGAATCACCAGCTACTGTTGGAAAAATAGTGAGAATCGACATGGATGGTGC TCTCAATGTGAGGGTCACTGGTAGGCACAGCTTCTGGAAAGTTTCTCCTGGTGATGCAGAACGACTTCCAGGATTTGAAGTTGGTGATTGGGTTCGCTCA AAATCAAGCCTGGGAACCAGACCAAGTTATGACTGGAGTGGTGTTGGGAGAGAAAGTTTAGCTGTTGTGCATAGTGTACAGGATTCTGGATACCTGGAGT TAGCTGGCTGTTTCCGTAAAGTGAAGTGGATCACCCACTACACTGATGTTGAAAAGGTTCCTAGCTTTAAAGTCGGGCAATATGTTAGGTTCCGAACTGG TTTGGTTGAACCAAGGTGGGGTTGGAGAGGAGCTCAGCCTGAATCACAAGGGGTTATAACTAGCATTCATGCTGATGGAGAAGTCAGGGTCGCATTCTTT GGTTTACCAGGATTGTGGAGAGGAGATCCTTCAGACCTGCAGATTGAACAAATCTTTGAAGTTGGAGAGTGGGTGAGGTTGAAAGATAATGCAAATAATT GGAAATCGGTCGGGCCAGGTAGTGTTGGTGTAGTACAAGGAATAGGGTATGAAGGAGATGAATTGGACAGAAGCACTTATGTTGATTTCTGTGGGGAGCA AGAAAAGTGGGTAGGACCAAGTTCTCATCTTGAAAGAGTTGACAAGCTTTTTGTTGGACAGAAGGTTAGAGTTAAAGAATATGTAAAGCAACCAAGATTC GGGTGGTCAGGGCACACACATGCAAGTATTGGAACTATACAAGGAATTGACGCGGATGGAAAGCTTCGAATATATACACCAGCAGGATCAAAAGCATGGA TGTTGGACCCATCAGAAGTGGAGATAGTAGAAGAGAAGGAGCTTTGCATTGGCGACTGGGTAAGGGTTAGAGCATCGGTTTCAACCCCAACCCATCAGTG GGGGGAAGTGAGTCATTCAAGCATTGGGGTGGTGCATCAGATGGAACATGAGGATCTGCGGGTGGCATTCTGTTTCATGGAGAAACTATGGCTATGCAAG GCATGGGAAATGGAGCGTGTTAGGCCGTTTAAAGTGGGGGACAAGGTAAAGATCAGAGATGGACTGGTGACCCCACGGTGGGGATGGGGAATGGAGACAC ATGCCAGCAAGGGACAAGTAGTAGGCGTTGATGCAAACGGCAAACTAAGAATAAAGTTTCGGTGGAGGGAAGGAAGGCCGTGGATAGGAGACCCTGCTGA TATTGCCCTTGATGAGAACTGATGTCCAGCTTTAGCATGTATTATAACTAGATTTTCTCATTCAGCTTTTCGGGGTATGCTTATCCGGGCCTGAGCTCAT GCTATGATGCAAAAAGTGAAAAAGCTTTATGCTCCCTGCAATCAAATGGCCTCGGAAAGTTTACGATGATTGAAATGCAACTTGACCAGATTTATTCATG TTAATAAACGAGTGAAAGGATAACAGTTGTGGGGAAGAGAAAGTAAGCTTGCTAAGGCCAAAGATAGAGTTTTAAATGCAGCTAAAGCAAATATTGGCAA TTGGGTCATTTATATTCGTCACTGACTTGTAAGTTTGTAGACCCAGATTTTGAGCTGTATATTTATGTTTGTTTAATATTTTTGTACAAATTGTATTCAG CAATCAACTTAATGCATTTTTTGACAACCCCACCATATACAGTTGCATAATTTTTGAATGGAATGGGTTCATTATAATTGTCTGCAATATTGTTATCCTT ATTTTCTAATTTTACAACTTAAGGAAGCAATAAAATATCTGTTTTATTGAAAACTTGGACACACAAATCTCCTGCATTGGATTCAACACTTCCAGTTAAG GCTTCATTCGGGAGTATGATTTTGGAAGGGAAGAGAGAGATCCTTGTATGAGAATTGAATGAAGGATAGGGGAATGATTTGGAGGGTCCTTTAAAACCCT ATATATGTTTATTTTTGTAGTTCCTCTAGTTTGGGGTTTTCTAGATACCTAAATATTTATATAAAATTATATAATTATATATTTTGTCCATTTCACAATA TTAATTATATTTAAAAAAAAAATAAAAATATTATGAGATTATCATTGGCTTATCCTCCCTTATCAAAATTTCATATTTTCACACAAGGGAAAATATTACC TTTTTCATTTCCTTCCTTCCCTTTTTTAGCACTTTGATCTATTTCCTTCCCTTTTTCTCATAACTCTCAAATAAAGTTTGAGGAGAAATGTTTTGTAAGT CTTGTATGGGGAACTGATTTTCCTTAAAAGTGACGAATGCATTAGAAGAGAAGAGTTGCTATAGGATATTTTTGGAATTATGAAGCACTCTTATATATGA AGCATCAGCATGGATAATACTTAGGTAGGACAAAATTGCCTCAACTCAATTTGAAGATTATTGTACCACATGATAGCTATGTTACTTAAATTCCTATATA TTCATAATGAGTGATATATAGAAAATGTATTACTGAGAATAATAGGCCAAAATTGGAATAATGAGAGTGAGAGAAATTATTATTAACTATTAGATTAAAA TAAATGGCTAAAATTGCATTACTAATTTTGAGTCTCACATTCTTCTCTCCACAAATCTATATAATGAAACAATCATCTCCTCTGTCAAGTCCAAAATGCA CAATCAACTAAAAATGTCTCAATCCATGTTCTTCTCTCACTTCACTTTTTCTGTTTCTTGCACTACCTAGAAGCTTGTGTTCCGATTGATCTTCCAATGT ATTTTTAAGTTTTTCAATCTAAGGTATTTTTTGGATTTTTCAATTCCAACTTTTATGCTTGTTTTTGTTGTTGTTTAGTGTTTTTGGTTGAGTTTTCCTA TATGATAATGATAAGAGTTAAATTGTAATATCTAGTAGTTATATGTCAATTACATTAGGCTAGAGTTGGTTCCTAGTTTTATAAATAGGGACATGTAGAG TAAGCCACTCAACTTGATTCATTGTTGTAACTTTTCTTTTTTATAATTTTTCCTATTCTCTCAATAATTCTCTATCTCAAAACTCTTTCTATTCATAGAG TTTCCTGCAATTCATTAATTTCTTCGAGTTCTTTCTTGAATTTCGAGAAAAACCATATCAATTGGTATGAAGAGTTTCTTCTTTTCTGGGAAGAGAAATG ACAGGACCTATGCAAAGAACGCTAAAGGAAGTAGAAGAGCGTCTGGAACGTAGAACGGTGGAGAAAGTTGAGAAGTGCATGGTGGAAATTGCGGGTGAAA TTCAAAAGGCATTAGCAGAATCATTAGATAATATAATGGAAGAACTTATGAACAGGAACGTGCAAGATTCAGAAAGATCACCCAAGAATAGAAGCTTTAG TTCTAATGAACAAGATTGCACACAAGGTGTTCGATACTTTATTTCAGATGATAAAAATCTCATTTCCTCACACTTAGCTTCTGAAACTACAGTGTCTAGA GTTGATTTTCCTAGATTGAGTAGGAAAAATATCAAGTCTTAGATAAATCAATATAAAACCTATTTTTGTATAATGGATCACTTGAGAAGTTTAAAGTAGA ATTAGCAAATGCCCATTTGGAAGGAAAAACATTACAATGATATGATATTGTTAAATTTAATTGGAATAATTATTGGCTTAAATGGGATGAATATGTTAAA TTTCTGGTTGAAC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_76599; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_212639
| Blastp | E3 ubiquitin-protein ligase KEG from Arabidopsis with 74.22% of identity |
|---|---|
| Blastx | E3 ubiquitin-protein ligase KEG from Arabidopsis with 77.84% of identity |
| Eggnog | Ankyrin Repeat(COG0666) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT5G13530) |
| CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0001786) |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019437104.1) |
| Pfam | Ankyrin repeats (3 copies) (PF12796.6) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |