Ll_transcript_32481

• Id Trinity: FTRINITY_DN58402_c3_g2_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_32481
• Sequence: CAGTGTTGCGTGCAAGTACCTGAGGAGTTTTGATTCTTTTAGCATACGATCCATTATTTAATTTGTCTCTCTATTATTATTGTCTGTGCAGCGATTTAGA ATTTCGATTCCTCGGGGCTCTGAAAAGCTGTTTATAGCAACAGCTTAACAATCAAATCATATTTTAAGCGATTAAAAAAATAAGCTGTAAAAAATGGTGA CGGCGAAGAAGGAGATGGTTGTGTACTGCTTCGACACTCTCATCGCTCACTACAACAATGATCAAGTTCCTCCTCCTGCCTTCGATGACGGTCAACAGTA AAATCTCTATCACTTTTTATTAATTATAAAACATTATTTGCATGTTCCTATAACTTGGATGAATTTAAGAGTTGTTGTTTAAATGAATTTTATGATGTTG CTGAAAAAGTAAATTTAATTTTCTTTGTTTTTGTTTTTTATTTCTCTTGCTGTAAATTTCAGTTCAATATTTGACAAAATTTGAACTTGGATCATGGTTT GCTTTTTGTTGTTTGTGTAAATTTCACTCTGTTATCTTCTGCTTGTTAATTTTATTGATCATGCTATAGCTCATCACTGTTAACATATCAAGTGCCAGCG TTCATTTTAAAGAAGTGAAAATGATTGTTTATTTTGGAAAACAATTGTTGTCCCAAAATTGTGTGCTACTGTCTGTGCATATAAACCAATAAAATATAAT TTAAAATTACTTTAAATATTTAAAATTTTAATATTTTTTTGACAAATCAAATATAATGGCATTTTGTTTCCTTGGTTTTTGAGCTGAGTGTTTATGACTA TGGGGAAGCACTGTAATAAATCAAATGTTGAAACTTATCCCTGATTGAAGAAAAAAGTTAAGTACATTTTTCTTCTTTGTGTGTGAATGGAGATAATAAC TTTTGAAAAAAAACCCATTATGAAAATAGATTCTGGTTGGAAGGACTAGTGACTCGTGTACATCTTTCTTTGTTAAATGTCCAAAATATGATTAGTTACT TAATATTGGTTTGGTTTGTCAAAGTCACTATGTTATAAAGATGTGCTGAACCTATCACCTATTCACCTATTCACCTATGAATGTCTTCCATTGTCTGAAT GTGTGAATTTGTGAGACCGTTTTCCTTTGACAATAATGGCAATACAAAATAATTTCTGATTTCCTCTCTATTTTAATTATTTACAAACTAGTTTAGTAAA TCTAAGATAAATTTGAATGAGTTTCAATTGTAACTATCTTGTCCAGAATTTCTTATTGAACCAGTTAAAATAAAATGTTTGGAGGGTCTTAATGAGCCAA ATTTTGAATTTTCAAGCACACTAGAAAGAAACGGGAGAAACAAGAAACTTTTGGTTCAAATGAAAGCTCATTGGGAAGCAACCAAATGATGAGAGATATT TGAATTCGTTTTTTCGTAACAGTTGATTAGGCATAAGCTGGTTTTTGAAAATTTTAATGATTGCTTATGGTTTTTTAACCAGCTGTGCTGTAGGTATGGT TTTTTGAGTTTGACAAATACCCGCTTGGTCATAAGTTTTGTACGACCACTGACCAGAGTATTTTGGGTTTCACATTTGGATGGCAAGGATGTTATTTTAG TTTCATATCAATCTTTTATGTAGATGGCTTGTCCTGTTAGTGCATTACCTATGAATTATGCACATTAAAAAGCAAAACGAAACTGGGTTGCAATTCACTT TTTCAACAATTAACTTGCAATTAAGACAAACACAATATGTTGTTTTTATTTTAGCTTTTGGGTTTTCTATTTTGATCTTCCACTTGATAAATATATGACA TTAGTTTTGTTGTAAATATGCCATTATGTTCTCTGAATGAGCATCTATAGTATTTATTTTATGCTTTTGTCATTATTAAAAGGTTTTGATATGTTTTCGG AACAAAACTAATTTTCCCTCTGATGAAGCCATGATTTATATATTTCACAATATGCTATGATAACCCAGTTTGAAGCAACTGTGCTTTGTTTTAGCCCATT GTTTGTTACATGGAAGAAAGTGGTCAATGGCGGGGAACCTCGTCTTCGTGGATGTATTGGTTCTCTAAAAGCATGTGATTTGATCAGTGGCTTCAGGGGT TATGCGCTGACCAGCGCTCTTAGGGACCGCCGATTTCCACCCATACAGGCTAAAGAGCTTCCTTCTTTGGAGTGTACAGTGTCTATTCTTACTGATTATG AAACTGCTAATGACTACCTTGATTGGGAGGTATGTGCTGATTTACTTGTTTTGCTTTTGGGTTTCCATCTGGCATAAAATGACTGTCCAAATGCTATTTA ACCTTTATAGTTTATAGTGCTCTATTGCATTGTTGTCTGATTTAGGTATGGAGTTAATTATTTGTATTTGTACAATTTTAGAGGATGGGTAGAAGGGCCT CAGTGTAGGCTGAGCCTTTAAAATGGTAGCAAACATAAAAGTAATATAGTCTGCTTTACGTTCTAAGGAGTCCCCTCTGACAAATGTTCTTAACACCTTG TCCTCACATGGCTTGCTTTACTTTATTTATCCATTTTTTCACTAGTTTTAAAATAAATATCACATATTTATTATTATTATTATTATTATCATTCGTGCTA TGTGCAAAATTTCTAAAGCTAGCACTTAAATAAG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_76792;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_32481

FPKM

• FPAB: 3.8
• FPNAB: 2.8
• LF1: 1.5
• LF2: 1.9
• LF3: 3.1
• LF4: 2.1
• UF1: 0.2
• UF2: 1.7
• UF3: 3.5
• UF4: 0.7

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_32481

• Blastp: Uncharacterized protein At2g38710 from Arabidopsis with 79.07% of identity
• Blastx: Uncharacterized protein At2g38710 from Arabidopsis with 85% of identity
• Eggnog: ammecr1 domain-containing protein(COG2078)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G38710)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0002653)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_020966672.1)
• Pfam: AMMECR1 (PF01871.16)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;