Ll_transcript_32489

• Id Trinity: FTRINITY_DN58402_c3_g2_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_32489
• Sequence: GTATAAATGAAATGAAAATATATAAAGTGTGTATATCAATAGCTCATGTATAAATATTAAATGAGTATAATAAATGTTTTACCCTAAGGTCACCAAATCC ATTCCGAAGAACAGGGACAAAGTAAAAACTCTGGAAAGCGAAAGGGACAAAATGCGATTTAGAATTTCGATTCCTCGGGGCTCTGAAAAGCTGTTTATAG CAACAGCTTAACAATCAAATCATATTTTAAGCGATTAAAAAAATAAGCTGTAAAAAATGGTGACGGCGAAGAAGGAGATGGTTGTGTACTGCTTCGACAC TCTCATCGCTCACTACAACAATGATCAAGTTCCTCCTCCTGCCTTCGATGACGGTCAACAGTAAAATCTCTATCACTTTTTATTAATTATAAAACATTAT TTGCATGTTCCTATAACTTGGATGAATTTAAGAGTTGTTGTTTAAATGAATTTTATGATGTTGCTGAAAAAGTAAATTTAATTTTCTTTGTTTTTGTTTT TTATTTCTCTTGCTGTAAATTTCAGTTCAATATTTGACAAAATTTGAACTTGGATCATGGTTTGCTTTTTGTTGTTTGTGTAAATTTCACTCTGTTATCT TCTGCTTGTTAATTTTATTGATCATGCTATAGCTCATCACTGTTAACATATCAAGTGCCAGCGTTCATTTTAAAGAAGTGAAAATGATTGTTTATTTTGG AAAACAATTGTTGTCCCAAAATTGTGTGCTACTGTCTGTGCATATAAACCAATAAAATATAATTTAAAATTACTTTAAATATTTAAAATTTTAATATTTT TTTGACAAATCAAATATAATGGCATTTTGTTTCCTTGGTTTTTGAGCTGAGTGTTTATGACTATGGGGAAGCACTGTAATAAATCAAATGTTGAAACTTA TCCCTGATTGAAGAAAAAAGTTAAGTACATTTTTCTTCTTTGTGTGTGAATGGAGATAATAACTTTTGAAAAAAAACCCATTATGAAAATAGATTCTGGT TGGAAGGACTAGTGACTCGTGTACATCTTTCTTTGTTAAATGTCCAAAATATGATTAGTTACTTAATATTGGTTTGGTTTGTCAAAGTCACTATGTTATA AAGATGTGCTGAACCTATCACCTATTCACCTATTCACCTATGAATGTCTTCCATTGTCTGAATGTGTGAATTTGTGAGACCGTTTTCCTTTGACAATAAT GGCAATACAAAATAATTTCTGATTTCCTCTCTATTTTAATTATTTACAAACTAGTTTAGTAAATCTAAGATAAATTTGAATGAGTTTCAATTGTAACTAT CTTGTCCAGAATTTCTTATTGAACCAGTTAAAATAAAATGTTTGGAGGGTCTTAATGAGCCAAATTTTGAATTTTCAAGCACACTAGAAAGAAACGGGAG AAACAAGAAACTTTTGGTTCAAATGAAAGCTCATTGGGAAGCAACCAAATGATGAGAGATATTTGAATTCGTTTTTTCGTAACAGTTGATTAGGCATAAG CTGGTTTTTGAAAATTTTAATGATTGCTTATGGTTTTTTAACCAGCTGTGCTGTAGGTATGGTTTTTTGAGTTTGACAAATACCCGCTTGGTCATAAGTT TTGTACGACCACTGACCAGAGTATTTTGGGTTTCACATTTGGATGGCAAGGATGTTATTTTAGTTTCATATCAATCTTTTATGTAGATGGCTTGTCCTGT TAGTGCATTACCTATGAATTATGCACATTAAAAAGCAAAACGAAACTGGGTTGCAATTCACTTTTTCAACAATTAACTTGCAATTAAGACAAACACAATA TGTTGTTTTTATTTTAGCTTTTGGGTTTTCTATTTTGATCTTCCACTTGATAAATATATGACATTAGTTTTGTTGTAAATATGCCATTATGTTCTCTGAA TGAGCATCTATAGTATTTATTTTATGCTTTTGTCATTATTAAAAGGTTTTGATATGTTTTCGGAACAAAACTAATTTTCCCTCTGATGAAGCCATGATTT ATATATTTCACAATATGCTATGATAACCCAGTTTGAAGCAACTGTGCTTTGTTTTAGCCCATTGTTTGTTACATGGAAGAAAGTGGTCAATGGCGGGGAA CCTCGTCTTCGTGGATGTATTGGTTCTCTAAAAGCATGTGATTTGATCAGTGGCTTCAGGGGTTATGCGCTGACCAGCGCTCTTAGGGACCGCCGATTTC CACCCATACAGGCTAAAGAGCTTCCTTCTTTGGAGTGTACAGTGTCTATTCTTACTGATTATGAAACTGCTAATGACTACCTTGATTGGGAGGTATGTGC TGATTTACTTGTTTTGCTTTTGGGTTTCCATCTGGCATAAAATGACTGTCCAAATGCTATTTAACCTTTATAGTTTATAGTGCTCTATTGCATTGTTGTC TGATTTAGGTATGGAGTTAATTATTTGTATTTGTACAATTTTAGAGGATGGGTAGAAGGGCCTCAGTGTAGGCTGAGCCTTTAAAATGGTAGCAAACATA AAAGTAATATAGTCTGCTTTACGTTCTAAGGAGTCCCCTCTGACAAATGTTCTTAACACCTTGTCCTCACATGGCTTGCTTTACTTTATTTATCCATTTT TTCACTAGTTTTAAAATAAATATCACATATTTATTATTATTATTATTATTATCATTCGTGCTATGTGCAAAATTTCTAAAGCTAGCACTTAAATAAG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_76792;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_32489

FPKM

• FPAB: 1.6
• FPNAB: 0.4
• LF1: 0.3
• LF2: 0.7
• LF3: 0.2
• LF4: 1
• UF1: 1.1
• UF2: 0
• UF3: 0.2
• UF4: 1.8

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_32489

• Blastp: Uncharacterized protein At2g38710 from Arabidopsis with 79.07% of identity
• Blastx: Uncharacterized protein At2g38710 from Arabidopsis with 85% of identity
• Eggnog: ammecr1 domain-containing protein(COG2078)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G38710)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0002653)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_020966672.1)
• Pfam: AMMECR1 (PF01871.16)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;