Id Trinity | FTRINITY_DN58453_c0_g1_i14 |
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Name Transcript | Ll_transcript_30012 |
Sequence | CTGCTATTAAAATTGATCCTTACTTAAACACAGATGCTGGAACAATGTCCCCTTTTGAGCATGGAGAAGTGTTTGTGTTGGATGATGGTGGTGAGGTGGA CCTGGATCTTGGAAACTATGAGCGCTTTATGGATATCAAGTTGACCCGTGATAATAACATAACTACTGGCAAGATTTACCAGGCAAGTTCTTTACCCTTT ATTGTTTACCATACCATGCTGCTTTTTCCATAAAGATACTTTTGGATAACCTTTAGTTGATGTGTTAAAATCATAGTCACATCTTTCCGTTTTACGTATC GCATACAAGATTCGGCATACTGCATATCACATACGGGGTCTTACAAAAAAATCTTGTGTTAATCGAGTATCGCATACTAGAACCGACTACCATGAATCAT GTAACTATGGTTAAAACAACAATAACCAAGCCTTAATCTACTGGAAGGTATGGAACCAAAACATAAGAACAACAATCTTGTTCAGTTCATGTGTTTGTGT GGCAAATGTTATCAAAATTTGCAGAAAAACTGTTCCTTGATGTCATGCTTCGCCTTTCATATTTCGTAATTTCGTGGCAGTTTGTAATTGATAAGGAGAG AAGAGGAGACTACTTAGGAAAAACTGTTCAGGTAAGTCCTGCTTAATCAATCTGATAATGTTTTTGTTATGAACTTCTGATGATAAAGAAAAGGAAAAAA AAACATTATGTTTAGTCTTTAATGTTGTTATGTTTTTTACACTTTTAGGTTGTCCCTCACATCACTGATGCTATTCAAGAGTGGATAGAGAGGGTGGCCC ACATACCAGTAGATGGAAAAACAGGTTCAGCTGATGTGTGTGTAATTGAGTTAGGTGGAACTATAGGAGATATTGAGTCTATGCCATTTATTCAGGCATT AGGACAATTCTCATACAGAGTAGGTGCTGGCAACTTTTGCTTAGTTCATGTTAGCCTTGTTCCGGTTTTAAACGTTGTTGGTGAACAGAAAACAAAACCA ACTCAACATAGTGTTCGTGGGTTACGCGGCCAAGGTCTGACTCCTCATATCTTAGCGTGCCGAAGCACAACGGTGCTGGATGAGAATGCAAAGAGAAAAC TCTCGCAATTTTGCCTGATTCAGGAAGAAAACATTGTTACTCTTTATGATGTTCCCAACATTTGGCACATTCCCTTGCTTTTAAGAGACCAGAAGGCTCA TGAAGCAATATTTAAAGTTCTGAACCTTTATGGTGTAGTTGAGCCTAATTTAGAGGAATGGACTCGTAGGGCTGAAGCTTGCGATTTGCTTCACGAACAG GTACATATCGCCTTGGTGGGGAAATATACAGGCCTTTCCGATGCGTATCTCTCTATTCTAAAGGTACAGTAGCTGTAAATTCATGGCTATATTTACTATT GCCCTTGCTTTCGAACAAGCATTGTTGTCGATGTCTATATCCTTCATGAAGTGCATGTGTCTATGTTGTTTCGGATTTTATCTATGCATGTTTGAACATT GTAGAGCTTAAGCATAATTGCATAAGAATAAGCTTGTTACCTTTGATTTTGAGTTCAGGCCTTAGTGCATGCTTCTGTTGATTGCCACAAGAAACTTTTT GTGGACTGGATCTCTGCTACCAACCTTGAAGATGCAACTGCAAAAGAGGTTACATCAACTTTGATTTATCGTAATTTCTTTTGTTTTCCGTATTCCTCAA CTTCGTCTTTATGATCTTTGTTTAATGTTGCAGAATCCTGATGCTTATAAGACAGCATGGAAGTTATTGAAGGTTTCATTTACAATCTCGAGATGAACCA TTTGTTACTTTAGCTATAAATTTCCCTCTCTTTAGTTCCGAGAACTCTATGATTATTATCTAAGTGGTGTTTGCCTTCAGGGTGCAGATGGTGTTCTTGT TCCCGGAGGGTTTGGGGATAGAGGAGTGCAGGGAAAAATTCTCGCCGCTAAGTATGCCCGTGAAAACAGAATTCCCTACCTTGGCATATGTCTTGGAATG CAAATTGCCGTAATAGAGTTCGCACGATCTGTTCTTGGTGTACATGATGCTAATAGCACTGAATTTGATCCGAATGCCAAAAACCCGGTTATCATATTTA TGCCTGAGGTGTAGATATCTGCCATTATATCCGCACTGAATTATCTCGCTCTAATGCTAAGTATAAGGTTAAAGAAGAAAGTTCGTTTTTCCTATTTGTG ATTTCTTTGAAATATTTTGTGTAGGGATCGAAAACACATATGGGAGGCACCATGCGTCTTGGATCTCGGAGGACCTTTTTCCAGACCAAGGAATGCAAAT CCGCAAAATTGTATGGCTGTAAAGGCTTCATTGAGGAGAGACATCGACATAGATATGAGGTGAACCCTGATTTAGTTGCTTGCCTCGAAAATGCCGGTCT TTCTTTTACAGGGAAGGATGAAACGGGTAAACGCATGGAGATTGTTGAGGTACCTAATCATCCTTATTTTATTGGTGTTCAATTCCATCCTGAATTTAAA TCAAGACCAGGAAAACCCTCTCCATTGTTCTTAGGGTTCATTGCAGCAGCATGTGGAAAACTGGATAATATGTTACAACACCCTTCAAGTGTTGAAAGCA ATGGTCTCTCAAAAGCAGTAGGCACCGGTGTCGTCTCGGCCGTAAAAGCACACAATAAGAAAACTGCAATGAAGCCAGCTTATAGGCCAGAATATGTTTA TGGCAGCTGCAATGGATATCATTACTAAATGTTGCATGTTTTTGTTTATCTTAGAATTTTAAGGTTAATTAGTTAAGTATATGTTGTTGTTTGCTTAAGT TGTCTATGACAACATGTTTGTACAGTGAATTGAAGCTTGGTAGGAATAGAGTTTTCTGAGAATAGAGAAGAGCTTGGTCCTGGTATTTTTAATGGAACAT GCTCATTTAAGTTTATAATGGTGTTAGAGTGGAAAACTCTTGAGCTTTCTTTGTCTAATGTTTCAGTGAAATGGAAAACTCTTTGTTTTGGAAAGATATA ATGCTGTCTATAGAGAAGTTCTGATATATTTCTACTTTTTGGAGGACGTAGAGTCGACTAATCATCTTCTTCTAGCTTGTCCGTTTACATATTCAGTATG GAAAAGTTTCTATTCTTGGTTACATATCCCAACTCTTCTGCCTAATTCTCTTTCAGATTTATTGGTTATGCATGATTCTTTTTATAGAGCTTCAAAAGGT AGAAGTTATTGGAGAATGCTTTGGTTCACAGTGGTGTGGTCGATCTGACTCATGAGAAATGATATAATTTTCTCGGCTAAAGAGGTTAGCTTTACTGAGG TGATGGACTTGATTCAGATTCGGTCTTGGACTTGGTTTTGCTCCATTTGTGGTCCCTCTGTTTATGATTTTGCACATTGGTGCATAGATCCTAGGTCTTG TATTTCTCATAACAACAATATTGACTGATTGTGGTTACTTTTCTTGTATTTCGGTTGTCACTCCTTATGCCTTTTTATTTTTTTTGTTTGCCTATGAAAA AAAATTGATCAATGTATCTAAGAATTAGGATCATTCTTGTTTTCCTAAAAAGTAGAGAACTGTCTTCAATTGTAGTTTGAACAACATTCAATTAGTGAAG GACCAAGCATATGTGGT BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_77209; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_30012
Blastp | CTP synthase 2 from Xenopus with 63.16% of identity |
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Blastx | CTP synthase from Schizosaccharomyces with 52.71% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (444477) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019446965.1) |
Pfam | Glutamine amidotransferase class-I (PF00117.27) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |