Ll_transcript_7819

• Id Trinity: FTRINITY_DN58592_c5_g1_i8
• Name Transcript: Ll_transcript_7819
• Sequence: ATTTAGTACGAGGGTATATCATTTTCAATTTTGAATTATTACATAACATTCTAGTTAGCTTGAAGTAGTGTATTTATAAGAAAAGTGAAAAGGGACGTTA AAGAAGCGGAAGGTGCAGCCAACTGGAAATGAGTTGTTAAAATTGGAAATTCCAAATTCCAAAGTCCAAACTCGTCTCTGTCTCTTCAATTCAATTGTTG CGTGTTCTATTCTACACATACAGGACACACATCGCTGAGAATTGTTAGGGTTTGGATCTGGTATTGAAGAATATGGCATCTCAGCAGAACCTCGAAAAGA TGCAGATCCGCCAGAATTACCGCAATCTCTGGCACACTGATCTCACCAATACAATTCAAGCCGACACTCCTTATTGTTGTTTTGCTCTTTGGTGGTAAGT CTTCTCCATATTTCTATTTTAGTTTTACTAACCCTTTCAATTTTTCAATTATTGGATCAACGTCGTTGACTTGCATTGACAAATCATGATTTACGGAATT TCCACCATCTTTTCGCGTTCTGTGTATATATGGTTCTTGTATTTGATATTTTGAAGTAACGATTGTGGTTCATTTTTTATCATCCTGAATCGAGGGAATT AACACATACACCGAACTTTTAGAATATTAATGCCCAAACATTTATCACCGAGACCAATCTGCCCCGAATTGGAAAAATATTTATACATACCACTGCCGAC GAGTTTAAAGGTGCTTTGTGTCTGTTTCTACTTTCTTCTAGCCAGTTAATGAGGATGGATTCACTTCTAAAACAGTCCATAATGACTTCTTATTCATTAT AAGTAAGGTTTTAAACTGCGGTTGTATTTAGCATTGCATTTACCACAACTATGGGAAAATGCGGCCACTCAATTTTGGTTGTGACATGGTTGTAGAGATT AAGCGCCTTAATTGTGGTTTCGGACCTCACTTTAAGATATTGATTATAAGGATTAAGGAAGGGCAAATCGGGGATATCTTACTCTGCCTTATTATGTTGT TTTCTGTCCTCGTTTTTTCCACAATCATTGGACTTGAGTGGAATGTTGACTCATAGTGTCTTCTATGCCAACATGTGTTGATCCAAGTGGAAGGAGATTG GATCCCTTTACCTTAACCATGTGGTCTTGGGTTCGAGATCAAGATTCATGTGTGTAGGGAAGAAAACATAAACACCATTGAGAGTGGTCTTCACTTAGTC ACATGACTGTAACATGTGAGATTATTCTCTATTCTATCGGGTGGGAGGATGCTCTCGGAAACAAAAAAAAATGTATTTTCAGAAAACTCACGGAAACAAA AAAAGGCCTTTTCAGAAAACTCTCGGAAACAAAAAAAAGGTCTTTTGAGAATACTCTCAGAACGAAAAAGGTCTACCTTGAATCCTGCAGCATAGAGGTT ACCTCATGTGTGTAGTGATCATGGCCTGAATAGAGGTTCTCTATGATCTACTTGTGTCACCCATTTCAGTACTTAATATCATTTGTGTGCTTGTCAATTC AATGACCTGACAATTTGTTGTCATAGTGGATAGAGTTTTTGATGGGCCTGTATTGAAGAGTTAAATGTAATTATTTCATGTTTTTTTCATAGTAATCTTA TAATATCCTATTGTCTAATTCTAGTGCGCCATGTGCATCATACCTGCTCCGCAAACGAGCACTTTACAATGACATGTCAAGATACACTTGCTGTGGTGGT TATATGCCCTGCAGTGGTCGGTGTGGGGAAAGTAAATGTCCTGAATTCTGCCTTTGCACAGAGGTTTTCCTCTGCTTTGGAAATTCAGTGGCCTCAACTC GATTTATGTTGCAAGACGAATTTAACATTCAAACTACCCAATGTGATAATTGCATTATTGGTTTCATGTTTTGCCTTCAACAACTTGCATGCATATTTTC TATTGTTGCCATGATTGTGGGAAGTGAAGAAATTTCAGAGGCTTCTCAGTTACTATCCTGCTTAGCTGACTTTGTATACTGCACGGTCTGTGCTTGCATG CAGGTAAGTTTATAACTTATTACTCACCAATGATTAGTTGTTATATCATGTAAGTGTTTACAATTACATCCAAAATGGCATATGAATTTTATTTGCAGAC TCAGCATAAGGTTGAAATGGACAAGCGTGATGGTTGTGTGCTGCCTCTGTTATCTAGAAAATTTTTGTTCGGACAAAAAACCAGCTGCTGTAAATTGGAT TGAGGGACGAGGGAAATCAGTTTTTTTGTGAAGCAATTATCAAAGAAGAAGTGGTGGAGAAGGTATTGAAGACCAATGTGGCTGCGCTCGTGGAGCTTAA CATGCTCAAGAACCTTGTTGGTTCTGCAGTTGCTGGCGCTCTTGGAGGATATAATGCTCATGCTAGTAACATTGTTTCTGCCATATTCATAGCCACTGGT CAAGATCCAGCTCAAAATGTTGAGAGTTCCCATTGCATAACAATGATGGAAGCCGTCAATGATGGGAGAGACCTTCATATCTCAGTGACTATGCCTTCCA TTGAGGTGGGTACAGTTGGGGGTGGTACTCAACTTGCATCTCAATCTGCATGCTTGAATTTGCTTGGGGTGAAGGGTTCGAGCAAAGACTCGCCAGGGTC GAACTCAAGACTCTTGGCCACCATTGTTGCTGGATCTGTTTTAGCAGGAGAGCTGTCTCTGATGTCTGCTATTGCGGCAGGGCAGTTAGTGAAGAGCCAC ATGAAATACAACAGATCAAGCAAAAATGTATGCCAAATGTAACCTTGTAGATGGTGGGGATGTGGTTGAAGCCACTATTTGTGTGGAGTCTGAAATAAAA ACACTAGGGTCTTTGAGTGCAAAAAATGGAGTTTGGAGAGGAAATGGAAGACGTAAGATTATATATTATATATTGTTGGCATCCACATTTGGCTGTGTAA TGCTATCTGTTAATGTTTTGTACCTTTTTGGTGACAACTCTAGATCCTTCTTTCGCTGTACTCATTTGATAGCACATCCTGCATACCCATTGAATGAGTG TGAACATTCCTTAAACAATACAATTCGGGTGCTGTGTATTATAATTCATTATTTTTTCTGCTATAATATGCTTAATATATGTACTATATAATGTATTATT GGTGTCTCAATATATCTATCATGTGTGGGTAGGGTCAGATAGTTGAGTGGTTTGATGAATTTTGAATTGGACATGCCCTTTCTAGATTCTCCTTTATTGT GTGGATTTTACACAAGATTGTTTTCTTGTCGTATAGATTTGCTGTTTCAACTTTGTGAGGATGTTTGTTTGAGCATAATAATCATAAC
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_78381;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_7819

FPKM

• FPAB: 0.6
• FPNAB: 0.5
• LF1: 0.8
• LF2: 0.2
• LF3: 0.2
• LF4: 0.2
• UF1: 0.4
• UF2: 0.5
• UF3: 0.3
• UF4: 0.6

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_7819

• Blastp: 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase 2 from Hevea with 91.03% of identity
• Blastx: 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase 2 from Hevea with 86.59% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019461234.1)
• Pfam: Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase (PF00368.17)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;