Ll_transcript_177439

• Id Trinity: FTRINITY_DN58626_c0_g1_i10
• Name Transcript: Ll_transcript_177439
• Sequence: AAGTTGGCAAAGATCACTTTGTCTTCAACCTGGAATTTAGAGGACTTCAAATCAACCTTATCAAAAGACATCAGCTCTCCACCTGTATCTGAGTTCAACT TAAAAGTGGGTATATCTGCATATATATATATATATATATATGTCTTTTACTTCTATGATTTCCAATATTGAGTTTCTTTACATATCTGTGTACTAATTGA TATATGCTAGTTTGTTTCTTGCAATTTTTGGTGTCTCAAGCTTTTCTGATGTAACTTGTTTCATGGCAGTTATACTAGAATTTCTGGATTTCCTTCCTTG CTTATTTTGGGCATTCTATATGAAATAATGGTTATAACCAGTATGATGATCTTACCCCTTTATACCAATATCGTGTCTACTTACTAAAGACAGAAACACC CTTTACTTAGGGAGCATGAAAGATATCGTTACTTAGCTCGAAGTTAGAAACCTCAGTGGTTATAACGATGCCAGTGGCTGATTCAAGGTTTTGAAAATAA CTGGTTGAGGGGATGATTCAACTGTGGTTGAACTATGCTCGAACTTACTGGAGTTTACACTTTACACACACCTACACAGTGATCAAATATATAATATTTT CAAAGATAAAACTGAAGATATCATTGTCTATTGATGATTATGGGGACACTGAAAGTTTGAATCCAAATCTTACATTGATGAAAAGAAGTTCAATTGAATT CAAATTTTACATTTCGATAAGATCATTTTTTTATTTCCTGAAGGTTTGATATCTACCTCCCATGAACCATATAACCAAGAGAAGCCATGGACTGGAATAG AAGGGTTAGCCACATCATTGAGTAAATATTTCGTACCAGCATCATTATACTCTATGTCTCTACATCGTTCTTGGTATGCAGATAGTAAATAGGAGCACGG ATTAAAGTATTATATAGGTACGAAGATAGTTATTAAATCGTTTAGGGTATATTCCTCCTAGAGTGCCTGCTAATAGCCTAATAAGAACAATAGAAACTCA AGTTTGGATTTGATATTAGTTACAATCTGAACAACCAGTATGCCTTAGATTTGATATTAGTTATTTGATTCTTCAATACTAGAAACCTCTCCGGTTCTGG GATACTGCTACATATATATGTACCCTCCCTAGACCTCATTAGGTGGGAACCATGTACACTGGTCACTAGGCAACACTTTTTATTTGATTCTTCAATAATT ACAACTCCCATATTGGGCTGGTAGTAAAGCAAGGGAAGTATTACCGTTATGCTGCTTAGTGCTTACTAGTCTTATTGCCTTGTGCAGTTGTGCTACTTAA TGCACAAATTACAAGTCCCATATCAGACAGTAAGTGAACATCCAATCATATAACAACAACAACGAAACCTTAATCCATTAGGTAGGGATCGTCTACATGG ATTGAACGACGATGCCATAATGCTCTATCATGTATAATATTTTTGTTTGCTATTGGGTCATCCCAGCACGTACCTATCGCAAGTCCCAATCTTTTGTTAT ATGTGTGCCTTTCTTTTTTGCTTTTTGGTCTCTAGCTCAACAATTTTTTTGGCTGGCTGGGCTTAAAAAGTTTTAATACAAAATTGACCGTCCTAATTTT GTCAACCAGTTTCACTAGTTTGAGTTTTCTTTGGTGGCTAGCTACTAGTCTAACCTATTCAACCTGCTGGTACAATATCGCCTTTTGAACTATGGTTCCA ATGGTCTAATTTTTTTCCCACTTGATAAAGGACATTGCTTAGTGTGAAGCTTCCTTTTGATATTTTGATACACCAATAATCTTCTTACCTGCTCGCTTTA TTGTTGAAGCTGAACCCTAAAAATAGTTATTAGTTGTTAGGCAAACAAGAGACAAATCAGCCATATAAGCACAGGGCTTGCTTTCACTCCAGCAATTTGT GCTTACAATTGTGGATTAATTCAGTTTAGCACATTTATGTTCCTATTGAACATTGAACATGGTAGATGCTACCCTACCTTATTCTGATGGGAGGTTGATT TGATTTATATTTTAAGCTTTACACAAGCAAATGTCTATACTCTATATCATAATTTATTGGCATTCACCACCCGCTCTTGCATCTTTGTTAATAGTATGAA ATGCTAGTAGATTCTATAAAATGCTTTAACGAATTGGTAATAGACTGTATAAAATGCTTAGACTATTCACTTGGTATCAAACTGCTTTCTCTTGGTCTTT GATGAATTTAGCTGAAATGAATATGTTGTCCAATTGATATGGCAAAGTTTGACTTTTATTGCTATACTTTGTTCACCATGGTCAGTGTCCCTCAGTTTTC TTTTGATTCATCTTGGTGATAAATGATGAAAGTATCATATTTGTTGATAAGATTGAGTTTTAGTATTAATTCTAATTGTTCTTCATTACGAATATGTGGC TCCGTATCTGGGCGATGCTGTGATATCCTGCAGCTAGTGTTTGATGAGCTACTGGAACGGGCAAAGGAGAAGGAGGAAAAAGAGGCTAAGAAGCGTAAAC GGCTTGCAGATGATTTCTTTCATCTACTAAGTTCTATTAAGGTGCAGTTTTGTGGGCTGATAATTAGTGATGCATAAGGAATATTGCTTATGGTTTTGTT TTGTGTACTTTGTTGCAGGACATTACTGCATCTTCAAAG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_78719;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_177439

FPKM

• FPAB: 0.6
• FPNAB: 0.7
• LF1: 0.4
• LF2: 0.3
• LF3: 0.5
• LF4: 0.3
• UF1: 0.2
• UF2: 0.3
• UF3: 0.5
• UF4: 0.3

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_177439

• Blastp: -
• Blastx: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2 B, chloroplastic from Lemna with 62.71% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (YP_009161329.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;