Id Trinity | FTRINITY_DN58629_c0_g1_i15 |
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Name Transcript | Ll_transcript_179275 |
Sequence | AAGACATTGAAATTTTTTAATATAACTACACTGATGCACTTCAAGTTACATTATAATTTTATCATTAAAATACATTAAGTTACCACAGAGGGAGAGGAGT CTGACTCGTTTTTTTTGTGGACACAAGACAACCCGCGAAAATCCCCGACCAATCAAAGCCCACAAAAACCTTGGAAGCTCATCCTCATTTCGCCACGTGT TCTTATCTCACTGTCTCTTTCAACCTTCAACGCCATGAATGAATGAATACTAACTAGGGTTTCACCTTCTCCTTCTCTCTCTTCACTCCTTCATTCAATG GCTTCCCTTTCTCTCTCCTTACCCGACCTCTATTTTCTCTCTCCTCTCAACCACCGCGTTTCTCTCTCCAAACCCCCCTCACGCAATTCCGTTTCTCGCA ACCCAACACAGTACTGCGGTGTCACACTTCGCACGCGAGTCCGTGCTGTGAAGGAAGAGGGAGCGGTGGTTGAAGAAAGAGTGAATGATGTGAAGTGGAG TGGGAATGGATTTGCTGGTTCAAGTGGTGGAAGTAATGGGTCAGTGAAGAGGAGTAGATTGGTGGTGAAGGAGAGTGAGTTGGTGAAGTATGTGAATGGG AACGGTGTTGCGGCGGCGAAGGGAGTTGAAGTGGAAGGTAATGCTGAAGATGGGAGGAAGAAGAGAGTGGAGGAGATTGGGAAAGAAGATGCGTGGTTCA AACAATCTGGGGAGTCACAAGTTGAGGTAGCAGCTGCACCTGGTGGTCGCTGGAGCAGATTCAAGACTTACTCAACTATCCAGAGAACATTGGAAATTTG GGGATTTGTTGTAACGTTTATCTTTAAGTCGTGGTTGAATAATCAAAAGTTTTCATATAGAGGAGGAATGACTGAGGAAAAGAAAACCTTACGGCGAAAG 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AGACCAAGAAGCTAGATGAACGGGAGCGGTTAATTACAGGAACTGCTTAAGCAACTAGTAGGTGAATGTTGCGTTATTTTTTTAAATGTTCAAAAGTTAA TGTGCTGTTCATGTTAAGATAAAAGTTTTTGGCGTGGAGGTTTTTTCCTCATCATGGGGAGGGTGAGTTTGACGCTGCTTAGTGATTATGTGGTCATATG TTTAAATAATGGAAATAGTCACTCTGCTTGTGGGGGTCAGACTGCATACACATACCCTCCCAAACCCCACTAAGTGGGTACATCGTGCACCCTCTATGGT ACTTGTTTTATGCCTTGTGACCTAGTGGCTATAGATTCTAGTTGTGCTGGCAACCCTTCGATTCACTGGGGTTAAGGTTGTACTGAATATTACCCTTCTC AAACCCCCAGTGGTGGGAACTTGGGCAATTGGTATCCATGTTATCATCTTTGTTTCTAGTCTAGTTCTTGTATTTTAAGGTTTAGGCTACATACATCCTC ATATTGGATGCCAGAATGGTGAGAATCTTATGCATTGGACCTCCTTATATTGTCTGATTCTAAATTTGAAAATTGATTTATGGTTTTTGAGACTAAGCAT TCAACTAAGAAACTTATATGTTAGAAAATGTTACTCGATTGCATTCCTAAGTATTAGAGTAATGTGTTTCAACGCCTTCTCGAGTGGCTAATCGTCACCT CTTAACAACAGAATTAGCCACTTGTGGTAATAGTTCCTTTCCCCCCATGAATATCCACCCACTTTTCCTTGATACTTATCTTCCCTAAAAATAGCAAAAT ACTCTTTTGACTGTCCTATCATTCTTGTACTATGAAGTTTGCATAGCAAATGTGAGAATGAGTTACTTGAAAATGTTACTAGCATGAAGTATTGATTGCA GAGTCTGTTACATAATTTAAAAACAATCAGTTTTATGATTCTTCATCTGTAAATGGCTTGAAACTTCTAATAAATACTTCATAGTTTCCATCAAACATTG TTTTGGGTCCTTTATATGACTCTTATGGCTTTTGTTTGATTTAGCCCATTGCAGATTCAGGCTGG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_78744; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_179275
Blastp | Protein ACTIVITY OF BC1 COMPLEX KINASE 8, chloroplastic from Arabidopsis with 67.84% of identity |
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Blastx | Protein ACTIVITY OF BC1 COMPLEX KINASE 8, chloroplastic from Arabidopsis with 68.22% of identity |
Eggnog | Required, probably indirectly, for the hydroxylation of 2-octaprenylphenol to 2-octaprenyl-6-hydroxy-phenol, the fourth step in ubiquinone biosynthesis (By similarity)(COG0661) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G64940) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019462413.1) |
Pfam | ABC1 family (PF03109.15) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |