Id Trinity | FTRINITY_DN58630_c0_g1_i11 |
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Name Transcript | Ll_transcript_178388 |
Sequence | CATTTATTCAAGAAATAAAAAGAAAAAACTTTGCTTTACCTATGACCCTTTCTCTCTCTTTGCCTAATAGTCCATGCCACAAGCAGAGAGATTGTGAGTG TAATTTCTCTTTCTCTCTCTAAACCACCATTCACCATTACCAGCACCTCTCTCTCTCTCTCAATTTTGAAACTGATTATCATTCAAATTAGGTATTTTTT GTTGGGTTCATCTTACTTTTCCCTTTAGCTTTTTCCATTTTTTCATGCTGGGTCTGCTCCTTAACCTTCCAAGTTTTGTTTTTTTCTTCTGGGTCCCTCT CTTCTCTCCGATCTACTTCAGATTCAACTCATAACCATGCTTCCTTCATCAAAATTCATTTTTTTATTACTTACTCGTGTCTTCTTTTCATTATCTTCAC ATTCCCATAATTGCCCCTGTTTCACTTCAGAATCTGCATTTACTCATGCCCTTGCTCCTATTGGTCCTCCAAGTCCAACTCCTAATTGTTGTTTTGTGAA ATTTATTTATATTTTTTTGATTTTTTTATATTTAAGGGAAAAAAAACTGATTTTTATGTTGCTGGTTACTCAAAGCTATTGAGCTTTACTATTTTTGATT ATGGGTTTTAGGTTCTGTTACTTTTTTTGTTCATGAGTAATAATGTGTGGTTTCACTCTGAAGGAGTCTGAGTTCTTTTTAAAGCTAATTTTCTTATTAT ATATTTTAGTGATGTTAGATGCATATGTTAATTGTTATGTATTACTGGTATGAACTGTTTCGCTGATTACTCGATCTATTTGTTTATTGTTGATTGTGAG CTTATTATTTGATGTATAATTTTATGGATGCTCAAGTTTTTATTCTTTGGTAGATGACTCATGACTCTATCTACAAAAAAGGCGGTCCAGTGCACGAGAC TCTCACTAGTGAGGTATGGGGAGAGTAGATGTACGCAGCCTTATCTCGTAAGCGGAGAGGATATAATAAATGGATGCTCAGCCATGAATTTGGTCAATCT GATTACTATTGAAACTCTTTAGCATATCGGATGGACTCGAAAACTGGTGCTGTAGCTGTCCCAAAACAGCATCCTAACATAGCTGGGATTGAACCCCTTG AGGCAAAAGACATCAGGCCTCCTTCACTGCCGATTTCGAAGGCATGCAAACCTGAGCCATATGTTCATGAAGATATGTCAAAGTCTGTGCAAAATTCATC AAGGCAGAATACTGTGGAAATTCCTGATATGAGGAAGTTAGGAATTTCAGCCCATAAGGGGTCTGCTTCTTCATCCGTCCTCGACAAAGAAGTAGATCAA GCTGTTAATGAGAATGTAGGTTCACAGGATAGCTCTATTGATCATGACAAAAAGACATCGGAATATGGAAGCGTGAAGAACAGTCCTGTTTCTGCTAAAG TTAGTGATGGGGCCTGCAGTATTGCAAAGACGAGTGGAAGTGCCAAGATCAGTGACCGTGCTGATTTTGTCGAGAGTGGTAAGAGCAGTATTTGCAGAGG AAGTACAAGCAGTGATGTGAGTGATGAGAGTACATGTAGTAGCTTTAGTAGCAGCATAAACAAGCCTCACAAGGCAAATGACATGAGTTGGGAAGCTATC CAAGTTCTTCGAACAAGAGATGGAGTATTGGGTTTAAGTCACTTTAGACTGCTCAAGAGGTTGGGTTGTGGTGATATCGGCAGTGTGTATCTCTCTGAGT TGAGTGGAACTAAATGTCACTTTGCGATGAAGGTGATGGACAAAGGGTCCCTTGCAAGTCGTAAAAAGCTCCTTCGTGCCCAGACAGAGAGAGAAATTCT GCAATCACTAGACCACCCCTTTCTCCCAACTTTGTATACTCATTTTGAGACAGAGAAATTTTCATGCTTAGTAATGGAGTTCTGCCCTGGTGGAGACCTT CATACACTCCGGCAGAAGCAGCCAGGGAAGCATTTTCCCGAGCAGGCAGTGAAGTATGTTTAAGTTAAAACTCAAGTTTGGTTCATTCATGCTGATTATA ATACATATTTTATTTCTCTTTGTGATTTTCCTTCATTGCTCATTTAAGTGTTAGTTGCCCCTGCCTTGATTTACATCAACTCCAATTTAATTTGCCCCTT GAAAGTAAGTCATTCTATGATCTAATATTTCTAAGTTTCACATATTGATTAAATGATTATTGACTCGAAATAGAGCACCTGAATAAAAGAGTTACAATAT ACTCTGCATATCCTATATTGGTAATTGAGAAAAACTATGTTCATGTATACTTGGTGGAAGTCTTCGATTTATAGATGTTTGAAAACTTACTTATGTGACT TTCACATTTACTATTTTTTTCAAACTATAAGAACTAATGCAGCTATCCAATTGGAAAACGGTGTTGCATGGGTTCATGGATATTGTGTTACTATGCATGT GAAAACTAAATACTGAATGAAATTTCATATACAATGTTTTAGTGGCTTGCTATGATCTACAAGGAAGGAAACTAGGTTTGAGAATTTTCAGGATATTCTA ATGATCTAATCACAATGAGTGCATTTTTTATAAAAAAAAATCCTTGAATTCTAATATATAGAATTTATGTAGAGTTGTTGAACCATCCTTATGTGTAAGC CTTGCTGCATTTTTTTGGAAGAACTGAATTATATTTCTTGGGTTAATTAATTCAGATCTTGGCTACAATAATGCGGGCAACAAAAACTAGTTACTTAATA ATAATGTCTAATGAACATTGGCTTTTGTTCTCGGGATCTGTCCATGCCATGCATGAAGAGTACATGTGGAGATCATGATGAGTTTCTTTTACGTGTGGGT TTGTATTTGTGCGTGGTTAGCTATTCACTTTTCTATCATGTCTCTGGGTGCTTGTTTGTGTAGAGGTAGGTTAAGTGTAAATCTTAGTTGTGATTAATAT TGAAACAATCTAAAGCATCTGTTTTATTTACTATAATGTAATAGTTTACTCAGTGCACATGACTTTTGATATGCTCAGATTCCTTAAACTCTTCGATTTC TGATTCAGCTGGAGATGAGATGTCTGATACTCCTGAAGCCTGTCATGATTTCTTTTATTGTTTTTCATTTTGGGAATTTTACCTAATATCACCATGTTAA ATAGGTTTGATGATAACAGCTTCTAATAACTTGTTAACTTGCAGATTTTACGTAGCAGAGGTCCTACTCGCTATGGAGTACCTCCACATGCTTGGAATTG TCTACCGTGACTTGAAGCCCGAAAATGTCCTTGTTAGGGATGATGGACATATTATGCTCTCCGACTTTGACCTTTCCCTCCGTTGTGCAGTTAGTCCAAC CCTTGTTAAAAGCACAACTATGGATTCTGAGCTTTTAAGAAAGAATCCAACATATTGCGCTCAGCCTGCATGTATTCAGCCACCTTCCTGCATCCAGCCA TCATGTGTTGCTCCTACCACATGCTTTTCGCCGCGGTTCTTCTCTAGCAAATCAAAGAAGGACCGCAAGCCCAAAAACGAAATTGGCAACCAAGTAACTC CGTTACCTGAGCTTGTTGCTGAGCCTACTGATGCTCGGTCCATGTCATTTGTTGGAACCCATGAATACTTGGCGCCTGAGATTATTAAGGGTGAAGGTCA TGGGAGTGCTGTTGATTGGTGGACTTACGGAATCTTTCTATATGAGTTGTTGTTTGGTAAGACTCCTTTCAAGGGATCCGGCAACCGAGCAACATTGTTT AATGTTGTAGGTCAACCGCTGCGATTTCCCGAAGCGCCTGTTGTGAGTTTTGCAGCAAGGGATCTTATAAGGGGGTTACTTGTAAAGGAACCTCAGCACA GATTGGCATATAAAAGAGGTGCTACTGAGATTAAGCAACATCCCTTTTTCGAAGGTGTGAATTGGGCATTGATCCGTTGTGCTACCCCACCCGAGATTCC GAAGCCCGTAGAGTTTGAGAAGGTACCTTCACCAGCCTCATCAGCTGTCGAAAAACCCGTTAATCACATGTCAATAGCTAATAATCAGAAAGGTTCTGAT AACTATCTGGAGTTTGATTTCTTCTAGTGATAGATAATATTGAATATTGATTGCAATGCAAATGGTTTCTATTAGTGGGGAGGAGCTTTTTTTCAATGTT TCAGGAACAAATATGATGAGGAATTGTATGGTTGTTTTTGTTGGCTTTCAAAATTGTTGTATTGCATAATTAATGCATGGCTTCTCTGTCATCTATCTCA AAGGCATAAAAGAACATTTTTCCAATGCATACTTGGAATTTGAGGTGTGGCTAATGGTGTTTATCATGATCTAAAAGGACTCAATGGTAAGTTTGAAAAT TTGGAAACTTAAGCACATGGGCATGTAGCAAAGTATAGTGCCTTTGGAGTTGATAATCAAGTCAACATTATTTGAATATTTTTTGTTTTCTTTCATGACA TGAGTGTCATCATGGCATGAATAAAGAATACAATTACCTATGTAGGCTTTCTTTGATAACATGCATGACACTAATGCTCATAAAAAAAGTATGTCTAAAA TCAACTGAAAATGGTTTTTGTCTTGCAAAATGGTCAATAATATTTATCTTTTCATGAGCATAGCCCTGAAAAGCTGGTTATTTCTTAACGGTTTGCACGA TTCTTAACATATTGGTGTAAAAGTTCTGTTCTGTTTTTTTTGATGTAATTCAGTGACCAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_78748; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_178388
Blastp | Serine/threonine-protein kinase D6PKL2 from Arabidopsis with 70.96% of identity |
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Blastx | Serine/threonine-protein kinase D6PKL2 from Arabidopsis with 82.21% of identity |
Eggnog | serine threonine-protein kinase(ENOG410XQ0C) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G47750) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019425740.1) |
Pfam | Protein kinase domain (PF00069.24) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |