Ll_transcript_179171

• Id Trinity: FTRINITY_DN58663_c0_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_179171
• Sequence: CCTGATTTGCCATTACTACCTCTGTGATTCCACCTCCAAAAACAAAATCCACACAAAAGTGATTCTCCTCAACCACTATTTCACCACACCCCACAATTAT AATCCTACTCCTAATTAAAAAAAATTAAACTTTTATCTAGATTTTAATTCAAACAAAGTTAGCAGCATTTGGTGCGTAACCGTGCTGGTGAAGGGGAAAT TCTGAAGTCGTTGTTCTTTCATTTTCTGATCAACTTCTACGTCTCACTAACTTCGTCGTTGCAACTCGCTTGACTTCTTTTGAAGCAACCTTTTTCCTTT CTTATCCTATCCCCTCCCCATGTTGGACTTTTGTTATAATCAGCTGCTTCAACTTCCATTTGGGTCGTTCAATTTCACTTGAATTTTTGTTATTTGAATG AGAAATGGTGTGTTTGGGTTCTGAAATGGTTGAAAGGTTGGAACTTTGGTTTGTTAAGTGGAGGATTGCATTTGGGTGTTGTGTTTTTCTCTTGTTTCTT AGTCCAGTAATGGGTTTGAGACCTTTGAGGGACAAAACTGGTTCAATGGGCGATGAGGTTTGTCTGTGTTGATTATGGTAGTTGTGGATGCATATTGAGA AGTAGGACATGTTTTCTTCTTGTATTTTTGCTGTATTGTCTGGTTGCAATACCCTTGGCTTTGCTATGAGAACTTTCACTTTATAATTAGGCATTAGCCT TTGGTGTTACTGTTATTTTTCATTGATGAATTGATTTTTTAATGCTTGCGACCAAATTTGACCGATGAATAATTGATTAATTTGCATCTATTGACATTGC TTCTTTCAGTGGCTTTTTTCAAGAAGAGATGAAAGTGACTCAGGTCCATTTTCCGAATGGAACATAACCGGAACATATAGAGGGAGTTGGAAATTTTTAG ATACCACAAATGGCTCTTCCAAATTTCCAGACATCAGAAAAACAAATGGGAATTCTGTAATTGAGTTGGCCAGTACTCCCACAAAGATTACTGGTGTTCA TTATGTGCAGGGGGTAGTTTTGTTCCATGACGTGTTTGACAAAGAATACAATGTTGGTGGGTCCCAAATCAGAATAGAAGGTGTATATATATGGCCTTTT AGGCAGCTTCGAGTGGTAGCCAACAGTGGAAAAGAGGGAGTGTTGAATCCGGGTGATGATTATCTTTTATCTAATCCATACCATCTGCTTGGAATTTTCT CATCTCAAGTATTGCAAGAATCTTCACCAGATAGGATGTGGAGAAGAAAATCTTCTCCATTGCATGATATGGAAAAACATTGTAATGTTGAAATTGCTGC ACAGGTTTCACGCTTGCCATCATCAAAACATGGTACTTGAGTTCTCTCAGCGTATGAATATCTTCTGTTACTTCTTGCAATCCTTCTCTCTTCTTTGTAA TAAAATAACCTTTGGAAAAATGAAGTTATATTGGCCATTTTGCAGTGGCAACAGGAAGCTTCTAGTCACATTTAATAATGAAATTGATTATCCATGAATA TTAATATTAATTGCAGATAGAGGGTGAGCTTGGCACAAATGTAAGGCTATGTACATCTATCCTTCCCAGACTCCACTTAGTCGGAGCCTCATGCACCGGA TTGCCCTTGTTAATATTAATTGCAGATGGATTTTACTAGGAGTTATTGTTTTTTAAAGTTCATTCTTGTTATTGATGAAATTTTATATTTTATTGCTATG TTTTACTCATTTTTTTATATAAATTCTTATAGGAGGGGATTCTTTTCACTTGGAGGGGTTAATGGAGAGCCCGTCCGTGGAGGATGATGGAGAGTGCTTC TCTCCTTTACAGTTAAATGCATCATCTGTTAACGTAGAAGCTTACTACAGTAAAGCAGTGAACTACACATTGATGGTTACTTTTGTCTCTCTCTTGCAAG TTCTTCTATTGATTCGGCAGATGGAACACAGCAACACTCAATCTGGGGCTGCTAAGGTTTCAATTTTAATGGTTGGTCAGCAAGCTATAATGGATGCTTA TCTTTGCCTTTTACATCTCACTGCAGGAATAGTAGTTGAATCGTTGTTTAATGCCTTTGCAACCGCTGCATTCTTTAAATTTGTGGTTTTCTCAATATTT GAGATGAGATATATTCTTGTCGTCTGGAAGGCAAGTAGGCCTTTGAGTAACGGGGAAGGTTGGGAGACAATGAGGCGTGAGCTTTCAGCTTTATACAGGC GCTTATCTGGGATCCTCTTTGCAGGCATTCTGCTCATGTATGAATTCCATTATTATTTGAAACCTATTCTTCTTCTTGTATACTCCTTCTGGATACCTCA GATAATCACCAATGTTGTTCGCGATTCACGCAAGCCATTGCATCCTCATTATATCATAGGCATGACTGTTACTCGGCTAGCAATACCATTATATATTTTC TGTTGCCCTGACAACTTCATGCGGATAGAACCAGACCAGAGGTGGTGTGTCTATCTGACTGTATTTGTTGGACTTCAAGCTGCAATTCTTCTACTTCAGC ACTACCTTGGGTCCCGTTGCTTCATTCCTCACCAGATTCTACCCGAAAAATACAGCTATTATAGGCGGTTTGCTCAAGATACAAGTCATGCTGCAGATTG TGTTATTTGCATGACAACCATTGATCTTAGTCCTCCATCTAATGATTGCATGGTGACTCCATGCGATCATTTCTTCCACTCCGTCTGTTTGCAAAGATGG ATGGATATAAAGATGGAGTGCCCAACTTGTCGGCGCCCGCTTCCACCGGCCTGAAGAGATTTCCACTCTGTTCATACAAATAGGATCAACTGACCCTGCC CAACTTCATAATTTTGGTTGGGATAGAATCAATATTCAGTACAATTCTTCTCATAATTGTATAATGGGGCATTGGTTTGTAGCTGATTATGTTAGTGATA TTTTTTTTCTTCAAAATTTTAGTGGGTAGTACGTGCATTATAGATTATATAACATAATCTAATTTTTTGGCTTCAATTCCATCCTCTATGCATCAATTTA TTTTCTAATTCCACACATAGTAGCCTTTGCCATGATGTGAAAAGTACATTGTGTAACATCCAAATAGCAATTATGAAGTTAAAAGTACTTATAAACACTA TACTTTTTCGAAACATGCATTATCTAAAAC
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_78988;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_179171

FPKM

• FPAB: 0.2
• FPNAB: 0.7
• LF1: 0.5
• LF2: 0.3
• LF3: 0.7
• LF4: 0.3
• UF1: 0.3
• UF2: 0.2
• UF3: 0
• UF4: 0.2

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_179171

• Blastp: Transmembrane E3 ubiquitin-protein ligase 1 from Saccharomyces with 28.98% of identity
• Blastx: Transmembrane E3 ubiquitin-protein ligase 1 from Saccharomyces with 28.98% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (YKL034W)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019464855.1)
• Pfam: Ring finger domain (PF13639.5)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;