Id Trinity | FTRINITY_DN58718_c0_g1_i7 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_34538 |
Sequence | ACCTAATATAATCTCTTAGCTAAAAATTCAACCACAAATTTTGGGAAATAAAGTTCCTCAGCTTATTTTTGGAATATATTTAAAAAGGCATTGCAACAAT TTTCCGAAAAAAACAAGACAGAAGTGACAAACACAGAAAAAAAACATTTGCGGTTTATTTTAGCTGAGGAGGTCTCAGGAGGTGAGAAGCGTTGTTCTCA TCATCACCATCCCTGAGAACTCACAACCCCCAAGTTTGATTCTTCCATAAATAACATATCTTTCTAAATACCCACTATTCCTTATTCCCAGATTCCTCAT TTTTCATTTTCTTCTCATTTCTCTCTCTCCAACAATGGCCTCTTCCGACCCCTTCACCGACAAGAACATCGTGTTCCGTAAGCTCAAGGCAAAATCTGAA AACAAGATGTGTTTTGATTGCAATGCAAAGAACCCAACTTGGGCTTCTGTTACCTATGGGATCTTCCTATGCATAGATTGTTCCGCTGCTCATCGCAGTC TCGGCGTCCATATCAGCTTTGTTAGGCATGTTATGATTGCTTCCTTACTTAACAGTATAGCTGTTTATATGTTTCGGTTTGGGATTGGCAATGACATGCC TTGTTATGTGCATTTTGATATTGATTAGCATTGAATGTGCATTTTGATGAATGTATATAGTTGTGTTTCATTTGGTAGAAATTCACCAAACTCAATTTTT GTTATGGCTTGACTAGCTGAGAAATCGGGCTAGGTTGCATTAGATCAAACCTGGAGTCTTGAAAACGGGAAAATTATTATGTGATCTATGAAGGGTTCAT AAGGTTGGAAGGTTGTTCTATCATTTGACGAGCTTGTGATTTTTGGTAAGCACAGGCTTACAGGTTTAAATCCTAGATATGTCAGTCTCTTGGGGTTATC CTTGTGAATCTCTTGGGCCTGGCGTAGTTTGTCTACCTTTGACCGGATTGGACTCGTAATCTGACTTGGTCCCTAGCTGACCACAATATAGATAATTACA AAAACATTGATTATTTTATGGAGAGGTGGATCAGTTGTTTGTGAAATTGACTTTTCAATTAAATTCATTATTTTAATGGTTGATTAATCAGTCAAGGTGT TAAATCTCAATGTGGATCTTCCGATCTTATGGTATAAAGACTCAAGTTTGAGAGATCCACCTATTGAAAGACTTGTCATTGCAGAATAAATATATTTGGC TAGTTATTTCTGTGCCATGAAAGTTTTTGGAGGCGATGTGGAAACCGATAGTGGGGATCTGGATAATAACTACATGGCAGTATACAACCATGTGTTTCTG CAACTGGTTGGCATGCCCCATTAATGTCTTGCAGAGGAAATCAGGACAACATTGTGTTTACATGTTTATATTATTTATTTCGGTTTGATATTCATTGCAC GTGCCCTTCATTTGAGGTTAGCTTTTCTAACAGTCTTTTCTGTTGTTGCTTTCCTTGGTATGTTGAATGGATCAGATCTATGGCTGCCTAGGAGTGAAAA GATGATCAATGACATGAAGTTATTATCTTATGTTCCTTGTGTGTTCATGTGGTATGAGAATCTAGATTGGTGAAACTGAATAGATACTTAATTGGAAATA AATGAGCCACTAAATTGCACTGATCTCCCCTTCTAAACTCTCGTTTTAATTGACTTTTATTTTCCCGGGAATGCATATACTGGGAAAATTGAACAGGATG CACTTGTCTGATAAACATGTTCATCCAGGATGATTTGTAATTTTTGAAAGTAGAGGGTCCATTTTTTTATTAGTATTATTGTGCTTTCCTTGATTAGTTT GGATTGGAATGCTTAGCATATGTATTGCCCTAATAAAATTTCTTGCTTGTGGGTTCTGCTCTTTGTAACTTTTTTTGATCAGTTATTCTGTTAAATAAAT TCTATAAAGGAAGGGAGGGAAGAACATAGTAGAATGATGGGAGAAAAGATTGATCCATCTATAATTATATATTTTTTATGTAGATCTACAAATTTAGATT CATGGAGTCCTGAGCAACTAAAAACGATGAGCTTTGGGGGAAACAATCGTGCACAGGTTTTCTTTAAGCAACACGGTTGGACTGATGGTGGTAAAATAGA GGCCAAATATACATCAAGAGCTGCTGAATTATATAAACAAATACTTTCTAAGGAAGTATCTAAAAGTATGGCTGAGGAAGCAGGTTTAGCATCATCTGTT GTTGCTGTCCAGTCTCCACAAGTGGCTAATGGACTTCCTGAAGTTAGGACCAATGAGTTACCAAAAGAAAATAGTCTAGGGAAGCCTGAAACGCCTGAGA GCACTTCTTCACCTAGAGCTTCACATACAACATTTTCCAGTACTGTAAAAAAATCTATTGGTGCCAAAAAAACTGGGAAGACTGGGGGACTTGGTGCTCG GAAGCTTACTAAAAAGCCAAGTGAGTCTCTATATGAACAGAAGCCAGAAGAACCACCTGCTCCAGTCTCTTCCCCAGCAATAAAAAATTTGCCTACTGTA CCACCACAGCCATCTCGGTTTGGGTATGTAGAAAATGTCCAGTCATCTGATTTGAATTCTAGAGCTGGGGATACAGATGTGCATGGTCATGTGTCTGTAC CGAAGTCATCGAGCTTCTTTGCAGACTTTGGAATGGATAGCGGTTTTCCAAAGAAGTCCGTGTCAAATTCCTCAAAAGTGCAAGTAAGCCACATAGCTGC AACATTTTAAAGCTAGCATGATGTAACTTAACTGCATTTGATTAGCCTAGAGAATTAAATTATATTTGATTCTATTCAAAGTTGAGCTTCCTCTCTCTAT TAAGCTACAAGCTTTTAACAAATTATGGCTTGAGATAGCAAAGCATACTGGTCACAACTGTTTGAAACAATGCTATACACTTTTTATCTCTACTACTAAT GAGGAGAAATATCAAGCTGTTTTCCATCTTCAGATTTCGGCACCAAAATTTCAAAATAACTCCTATCCTTTCATCTCTTCATCTCCAAATTAATTTTGAA ATTGAACACAAATATGTCATTTCTGCATTCATTACTGAGTCTTTATTGAAATAATTCTCGAATGATGAAAGTTGTAACATTATCAATTTAATTTCCATCT TGCTCACTGATTTCTTTCACTATTTCATGCATTCTCCACACTTTCCTTATTATTCTCCTACTTCTTCTATAATCTTTTTCCGTTTCTGTTATCATTATTT ACATTCTTTCTTTGTATACACACCATACTGGTGTTTTATTCCTGGTAAAAAAGGAGATGTGCTAGCACACACATGTAGAAACATGTATTAAGCATTCTAT GTTGATTATATAAACAGTGTGATTGACAAGTATGTTCTGATGGTTGTAAGAATGTATTATTATTTATTTTCCATCCATTTAATTTTTCTCAACTTTTATA TTTTATTAAGGTGTTTTCTTCTTGGGGACAGAGAATGGGTTGTGCATCTTATGCATATTGCTTAGGTTGATAGATTGTTGGGATGAAACTATACCTATGG TATGTAATATGCCATACGATGTTGAGCACGTGCTGAGGATTTGGTTGAATAGTGTCAGTTATATATATATATATATATATATTGCAGTGTATTAGTTGCT TTAATTATGGTATTTATTTGTGAATTTTGAATATTTGCTTTAAAATACCTGCTTTTGATGTTGTAATTACACCCTAATGTCATTCCATGTCGAATATATT CTGCTTTTGGTATTGTAATTATTGCATTATCTCAAGGATAGCTTCTCGCCTTCTCCAGTTTGCTGTGTGGCAAATTTATGAAAGTGTAACCTACTTTTAG ATGCAAGATTGCTTCTTCTATTAGACTCTTATTTGCCATTCTTGGCCTTTTGGATTTTTAATTGGCTTGAAATTTGAGTTATTACCTATATCAAACTGAT ATTTTTGAAAAACGCTGATGAGTGATGATAACAAATTGAAGTGGGTCTGTTGATATTAAATGTTCATGGAGGATGGCATGCTTTTACTCTTATGAACATT CAACAATATTTTGTGGACAATATATAGGATATAATTACTCATCTGACTTCACCTGTAAACTATGTACGCAGTGATAGATTTTAATTAATTCTGATCCTTA TTTTGTTTTGGTACCCATCTTTTACTAGATTCAGGAATCTGATGAAGCAAGAAAGAAGTTCTCAAATGCTAAATCTATTTCTTCATCCCAATTTTTTGGA GATCAGAATAAAGCTGGAGATTTGGCTGCTCAGGCTACTTTGTCCAAGTTTTCCGTATGTATCCTTTCTGTTAATAACTTGCTCGATCATTGTCTGAGTA TACACATTTAGGTAGATCTTGGATGTTCAATACTGATTATGGGACTGCATCAGATTGCGTATTTAAGATCTCATAATTTTCTGGCTGTTAGAATTCATTA ATTGATATCTCGTTTCAAATGAAATGCTGAGATTGAGAAGGAACAGTCACACTTTCGAACTAGTAGCCACTCACAAAAAATGCAATCAAATTCTAGACAA GCATTTATGTTGCTGGGATCACAAATTTATTTTTCATTTTATGTTTGTGGCCAGCTGTAATCTGTTTTATGTTCTGTGATAGTAGCCATGGAAAACTGTT ATCTTGATAAGTACAAAACACCCCAAAAATTATTTCTGAAGGCTGAAGCAGACTCTGGAAAAAACTTTTATTGTTCCAATTCCCTACACCATTCTAAAGT CATGTCTCTAAGTGAAAACTCATGTGTCGGTGTCTCGTTAATATGTTTTATTGATAAAAGCTTCTTAAATATGTTTTCAATAATTAGCTTAGCTATTTTT CTTTATCATTATGATAATGTATGTAATTTAACTTATTATAGTTCTAAAAACCCATAATGATGTGGTAAAACAGGTAATTTCCCATTTTAATGAATTGAGA AGGGTGAACTGTTTTCATGCTTTATGCAATAGCATTCTTATGTTTTATTGAAAACAACTTATGACTTGTCACAAGCATGAACAACTTTTTTATTAGAAAT TTTTATAACCCTGTAACGGGGTTGTTTTAAGGTTGATGTTTTGACAGAATTCTTCCTTTTGTTATTTCAAGGGTAAAACTGCCATCTCCAGTGCTGATCT TTTTGGTGATTCAGACTCTTCCATTGATCTTGCTGCTAGTGACCTCATCAATCGGATATCATTCCAGGTATGCCTTTGGATTTAGAATCTTCATTGTTAA TGTCCTCAATCACGTTGCCCATGACCTATGAAGCACAGACACTGCAAAATAGTAGTTGTGTCCCTGTCTCCGTGTCAGACTCATATTCATATATGACACT TCCGTACTATATACTCTACAACTTTCTACGTTTTGTTTTTGAATTTATACTGTTATGGATGGAAACGGCACAATAAATAAAACAATTCTTACATTTTATT ATATTTACAATAACTCATGCCAGCTTTTAAACATTATTCCTCTCGTAGCTGTGTCATGTTTTATAATTTTTAAAAATTTGCCGGATCCTCTTGTCCATGT CGTATTATGTAAGTGTCCGGTGTTGTATCTGTGCTTCCTAGCTCATACCCTCCGGCCTCTGCCGTCTTTTATCTCTTGTTTTTCAGGCACAAGAAGATAT CTCTTCCCTCAGAAACATTGCTGGAGAGACTGGGAAGAGACTCAGCTCCTTGGCTTCCACTTTGATAACAGATCTTCAAGATCGAATACTCTAACATTGT ATGCTTTGTATCAAAGAAAATCCTTGGAGAAACAGCCACTTTTGTTTTTGAATGTAATAGAAGATTGTGCAGCATATGATTCTTTGAGAAACAGATAGAA GGTGCTATTAATTTTGAGACGTGGCTAGTGTTTATATTTTGTATGGCTTGAATTATTATGACGTTGCTAATGTGTCATAAAATGCTGTTTCGCTTAGTCA GGCTTATGCCAGTTTGTAACGAACATAACATTGTCTTGTATCAATTTGAAAATTAGAGACCTTTACGTTTTTCACTTAGCTGGGCCAACTTAAATTAATT TATAAATATAAATATTCTTATTTGCATTGAAAAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_79455; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_34538
Blastp | Probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD8 from Arabidopsis with 60.78% of identity |
---|---|
Blastx | Probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD8 from Arabidopsis with 55.56% of identity |
Eggnog | domain, ankyrin repeat and PH domain(COG5347) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G17890) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019445317.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |