| Id Trinity | FTRINITY_DN58829_c1_g1_i22 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_50245 |
| Sequence | GTTAAAATGAAATTGAAAAGCACGATCGTTAAAATCTATAAACGGAAACCCTAGTCTTATAAATACCCTCCAAACTCTTCTTCTTACTTCTCAATTCTCA TTTATCTATCACTCTCTCTCAAAACGCATCGTTTCGGGTTTTGATTTCTCATACCTTGATCAGAGATGGATCTTCCGAATCTCTCTCTTATACTCCAAGC TGCTCTTAGTCCAAATCCCGATCAACGCAAGGCAGCTGAACTTAGCTTGAATCAGTTCCAGTATGCACCTCAGCATCTGGTGAGGCTGTTGCAAATCATT GTAGATAATAACTGTGACATGGGGTTGCGACAAGTAGCTAGTATCCATTTCAAGAACTTCATTGCAAAATATTGGTCTCCATATGAGTTTGATCCCCAGC AGAAGATCTCTCAGAGTGATAAAGACGTGGTGAGGGATCACATTCTTGTGTTTGTAACTCAAGTTCCTCCTTTGTTGAGGGTACAACTTGGCGAGTCCCT AAAAACAATTATACATTCTGATTACCCTGAGCAGTGGCCTCATCTTCTTGACTGGGTGAAGCATAACTTACAGGATCAACAAGTCTTTGGTGCATTATTC GTGCTTCGGATTCTTTCGAGAAAATATGAGTTCAAGTCAGACGAGGAGAGGACACCGGTTTATCACATTGTTGAGGAGACATTCCCTCACCTTCTCAACA TATTTAACAAGCTTGTCAAGATTGTTACTCCATCACTTGAAGTAGCAGATTTAATCAAGATTATCTGTAAAATATTCTGGTCCTCTATATATCTGGAGAT TCCGAAGCAGCTGTTAGATCAAAATATTTTCAATGCATGGATGATGCTATTTTTTAATGAATTGGAGAGGTCTATCCCCTTGGAAGGTCAGCCTGTTGAT CCCGAGCTTAGAAAATCATGGGGTTGGTGGAAGGTCAAGAAATGGACTATTCACATTCTAAATAGGCTCTACACTCGTTTTGGAGACTTGAAGCTGCAAA ACCCTGAAAACAGAGTTTTTGCTCAAATGTTTCAGAAGCATTATGCTGGGAAGATTTTGGAGTGCCACTTACATTTGTTAAATGTTATTCGTGTTGGTGG CTATTTACCTGACAGGGTTATCAACCTGATTCTTCAATATCTAAGTAACAGTATTTCAAGGAATAGCATGTATGCTCTGCTGCAACCTCGACTTGATTTC CTTCTTTTTGAAATAGTTTTCCCCCTCATGTGCTTCAATGATAATGATCAAAAGCTTTGGGATGAAGATCCACATGAATATGTAAGGAAAGGATATGACA TTATTGAAGATTTGTATAGCCCTAGGACTGCTGCCATGGATTTTGTGAGTGAGCTGGTTCGAAAACGCGGGAAGGAAAATCTTCAAAAGTTTATTCAATT CATAGTTGAAATTTTCAGAAGGTATGATGAAGCTTCTTTGGAACACAAACCCTATAGGCAGAAAGATGGTGCCCTTCTTGCTATTGGGGCACTTTGTGAC AAATTGAAGCAAACTGAGCCATATAAATCTGAACTTGAGCCTATGTTAGTGCAACATGTCTTTCCCGAGTTCAACAGCCATGTTGGCCACCTTAGGTCTA AGGCGGCATGGGTTGCAGGACAGTATGCCCACATCAACTTCTCAGATCAGAACAACTTCATGAAGGCATTGCACTGTGTTGTATCCAGAATCCAAGATTC TGAACTTCCTGTTCGTGTTGATTCTGTTTTTGCTTTGCGTTCTTTCATTGAAGCTTCCAAAGACTTGAATGATATCCGTCCTATCCTTCCTCAACTCCTT GATGAGCTTTTCAAGCTTATGAATGAGGTTGAGAATGAGGACCTTGTATTTACTCTGGAGACTATCGTGGACAAGTTTGGGGAAGAGATGGCACCTTATG CAATTGGGCTGTGCCAAAATTTGGCAGCTGCATTTTGGAGGTGTATGAATACTACAGAAGCTGATGATGAAGCTGATGATCCGGGTGCTCTGGCTGCAGT TGGTTGTTTACGTGCTATTAGCACAATCCTTGAATCAGTGAGCAGGCTTCCTCACCTTTTTATTGAAATTGAGCCAACTTTGCTTCCCATAATGCGGAAA ATGCTAACAACTGATGGTCAAGAGGTTTTTGAAGAAGTGCTGGAGATTGTCTCATATATGACTTTTTTCTCTCCAACAATATCGTTGGATATGTGGAGTC TTTGGCCATTAGTGATGGAAGCTCTGGCAGATTGGGCAATCGATTTCTTTCCAAATATTTTGGTTCCTTTGGACAACTATATTTCTAGGGGAACTGCTAA TTTTCTTACTTGCAAAGAGCCTGATTATCAACAGAGTCTATGGAATATGATTTCATCTATTATGGCTGATAAAAATATGGGGGACAATGATATTATTCCA GCACCAAAGCTTATTGAAGTTGTCTTCCAGAATTGCAGAGGACAGGTGGATCACTGGGTTGAGCCATATCTCAGAATAACAATTGAACGCTTGCATCGAA CTGAAAGATCATATTTGAAATGTCTTCTCCTGCAAGTGATTGCAGATGCTTTATACTACAATGCTCCACTGACTCTGAGCATATTGCAAAAATTAGGAGT TGCTGAGAATATTTTCAATCTTTGGTTCCATATGCTGCAAGAAGTCAAGAAGAGTGGTGTGCGTGCTAATTTTAAAAGGGAACATGGCAAGAAAGTTTGC TGCCTTGGTTTAACATCGTTATTGGCCCTTCCAGCTGATCAATTGCCAGTAGAGGCTTTAGGCCGGGTGTTCCGGGCCACTCTTGATCTTTTGGTTGCAT ACAAGGATCAAGTTGCAGAAAATGCAAAAGGGGAAGACGCAGAAGATGATGATGATATTGATGGTTTTCTAACTGATGATGACGAGGATGACGATGGTTC TGACAAAGAAATGGGAGTCGATGCTGAGGATCATGATGAAGCTGATGCTAGTAAATTTAGAAAGTTGGCTGAACAGGTGTGTGGATATGACTGGGCCTAC AAACCATTTACATGCTTATATTAATTGAATATAAGATAATGAATTGATCATTAATTGAATATAAGATAACGAATTGATCATTTTGCTTGCAATAAAGGAA TTTTGTAGTATGTGTGTACGAGCTTTTTAATATACGAAATTCAAGCAGTTCACAATTAGCTGACTTCATTATCCGGCTCCTAGTTTTATTTGATTATGAA AACCAGGGTATTTAATTAGGCCATTATTGTTTTGGATACTATTCATGTGTAGTGTAAATATTAAACTCTTGAAATATAAAATATTTTGTAACCTTTTAAT CGTAACGATTTGAATATAAAATATTAATCTGCATGCCATTTTTAGTGTATTAATTTTTAGACCCAGTGAGATATTTTTGTGATTAGTGTTACATCAGGTG CATATCGCAATTCAGTTTAAGTATGAAATAGAAAAACTTTCATCACTTTAACCAAAGAAGTATGTCATCTTCATGGTTCCTCTGCTGGCAATGCACAGTG GTCGCATTTGTTTGGCTGTTTTCGGTTCAATTGACATCCATAAGTTGCTTATCCAATCCGGTAAGCCCATCCAGCTTGGCAGTTTTGTGGTTGAACTGGC GAGTCTAGGTCAATGTTCCCTATTCTCTCTCATTGATTCAGTTTTACATTTTTTAATGAAAGTTTTGTTTTTCGTTCACTTGTAAAAATTTGTGTTAACA TTAATACACTTATCATTTATTTATTTGTTTCCTTTATTTAAAACGCCATGAATCTTAAATTCTAATTGTCCTTTTGCGATGAACCCCATAGGCGAAATCG TTCAGGCCCGCTGATGAGTATGATGACGATGACGATGATGACGACTTCAGTGATGATGAAGAGGTGCAGACTCCCCTTGACGATGTGGATCCTTTTATTT TCTTTGTGGATACTATGCAAGTGTTGCAATCATCGGATCCATTAAGGTTTCAGAACCTCACCTCGACACTTGAGATCTCTTATCAAGCTATTGCTAATGG TGTTGCCCAGCATGCTGTGGTGAGAAGAGGGGAGATTGAAAAGGAAAAACTTGAGAAAGCTTCAGCTGCTGCAAATTCTTAAGCTTTTTGTTGTACATTG TTGGCTATTTTTTTTAATTTTGTTCCTCAAGTTCTTGCCTTTATCCCTTATTGGCAAGGGAAGCAGAGGGTTGCTTATTTATTTGAGGCATTTGTTGGTT CATTGGTCCTATACAAGGTCTATGAGCTTTGAAGAGTTTACAGTTTTGAAGTACTGAGTTTAGTGGACTCAAGCTCCTACTGATGTTAGAAGATGTTGGG TTCAGGAAACTATGGTCTTGTTCCTTTTTCCAACCATGGTTGTGAATTTGTTTTATTATTTGGTCTACATGTTATGTTTTTGAGTCAAGTTTCATCTTTT CCAATTTATGGAAACCCTTTGATTTGTTCAGAAATGTCTTCAATGGTTGTATTATTGATGATTATGGTTCTTTGTAACCCTATTTTTGGCTATAATATTT GGGAAGAGAATAGAGTCCGAATTTTGAACAAGAGTTTGGGTTATGCAAGAAAAAGATAAACAATCATTTTTATTCTTTATATGATATAATTTTGTGAGAG GAATAAGCTGAGGCTATTGTGGTCAATGTCATTTTCTTGTAATTTGTTTTTAATGCTTTAGAAGCTTTAATATAGAGCTACTAAATTCTTATATTAAACT TTCTATCTAGAAAATGTGTCATGCCACTTATAAGTCAAT BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_80461; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_50245
| Blastp | Importin beta-like SAD2 from Arabidopsis with 74.34% of identity |
|---|---|
| Blastx | Importin beta-like SAD2 from Arabidopsis with 74.34% of identity |
| Eggnog | Importin(COG5656) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT2G31660) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019419652.1) |
| Pfam | Importin-beta N-terminal domain (PF03810.18) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |