Ll_transcript_50228

• Id Trinity: FTRINITY_DN58829_c1_g1_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_50228
• Sequence: TCTAAACCCTATTCCTTCTCTTCCTCCTTCTTGCATTGTATGCAACAGTGTTCAACCTTCTAAGCTTCGCTAATTAGGGTTTTCATTTGGGAATTCAATT TCAATTCCTATATGGATCTTCCCAGTCTCGCTCTCATTCTCCAATCTGCCCTTAGTCCTATTCCCGATGAACGCAAAGCCGCTGAACAAAGCTTGGATCA GATCCAGTATGCGCCTCAGCATCTGGTGAGGTTGTTACAAATCGTTGTCGATAATAACTGTGACATGGCTGTGAGACAAGTTGCTAGCATTCATTTCAAA AACTTCGTCGGGAAGAATTGGTCTCCACATGACCCTGATGCTCAACAACACAAGATATCCCCTGCTGATAAAGACATTGTCAGGGATCACATTCTCATGT TTGTGGCTCAAGTTCCTCCTTTGCTGAGGGTACAACTTGGTGAGTGCCTGAAAACCATTATACATTCTGATTACCCAGAGCAGTGTCCCCGCCTTCTTGA TTGGGTAAAACACAATTTACAGGACCAACAAGTCTATGCGGCCTTATTTGTGTTGCGCATACTTTCTAGAAAATATGAGTTCAAGTCAGATGAGGAGAGG ACACCAGTTTATCACATTGTTGATGAAACATTTCCTCACCTTCTCAATATATTTAACAGTCTTGTCAATGTTCCTAATCCATCAATTGAAGTAGCAGATT TAATCAGGCTTATCTGTAAAATATTCTGGTCCTCCATATATCTGGAGATTCCGAAGCTTTTGTTTGATCAAAATGTCTTCAATGCTTGGATGGTGCTGTT TTTAAATATATTGGAGAGACCTGTTCCATTGGAAGGTCAGCCTGTTGATCCCGAGCTTCGAAAATCATGGGGTTGGTGGAAGGTCAAAAAATGGACAGTT CACATTCTGAATAGGCTCTACACTCGTTTTGGAGACGTGAAGCTGCAAAATCCTGAAAACAGAGTCTTTGCTCAGATGTTTCAGAAGCATTATGCAGCAA AGATCTTGGACTCCCACTTAAATATGTTGAATGTCATTCGAGTTGGTGGCTATTTACCTGACAGGGTTATCAACTTAGTTCTTCAATATCTAAGCAACAG TGTTTCAAAGAATAGCATGTATACTGTGCTGCAACCTCGGCTTGATGTTCTTCTTTTTGAAATAATTTTCCCTCTTATGTGCTTCAATGATAACGATCAG AAGCTTTGGGACGAAGATCCACATGAATATGTGAGGAAAGGCTATGATATTATTGAAGACTTGTATAGTCCTAAGACTGCCTCCATGGATTTTGTGAGTG AGCTGATTCGTAAACGTGGGAAAGATAATCTTCATAAGTTTATTCAATTCATAGTTGAAATTTTCAAAAGGTATGATGAAGCACCTGCAGAATACAAGCC CTATAGACAGAAAGATGGCGCACTTCTTGCTATTGGGACACTTTGTGACAAATTGAAGCAAACAGAGCCATACAAATCTGAACTCGAGCGTATGTTAGTG CAACATGTCTTTCCTGAGTTCAGCAGTCCTGTTGGCCACCTTAGGGCCAAGGCTGCATGGGTTGCAGGACAGTATGTCCACATTAACTTCTCGGATCAGA ACAATTTCCGGAAGGCATTACAGTGTGTTATATCCGGAATGCGAGATCCTGAACTTCCTGTCCGTGTTGATTCTGTTTTTGGTCTGCGCTCTTTTGTTGA AGCTTGCAAAGATTTGAATGAAATTCGTCCTCTGCTCCCTCAACTCCTTGATGAGTTTTTCAAACTTATGAATGAGGTTGAGAACGAGGACCTTGTATTT ACATTGGAGACTATTGTGGACAAATTTGGGGAGGAAATGGCACCTTATGCACTTGGGCTGTGCCAGAATTTGGCAAGTGCATTTTGTAGGTGTATGAACA CCGCTGAAGCTGAAGCTGATGTTGATGATCCTGGTGCTCTGGCTGCAGTTGGTTGTTTGCGTGCTATTAGCACAATACTTGAATCAGTGAGCAGTCTTCC CCAACTCTTTGTTCAAATCGAGCCAACCTTGCTTCCCATAATGCGTCGAATGTTAACCACTGATGGTCAAGAGGTTTTTGAAGAAATTTTGGAGATTATA TCATACATGACTTTTTTCTCCCCGACAATATCACTGGACATGTGGAGTCTTTGGCCGTTGCTGATGGAAGCACTATCAGATTGGGCAATCGATTTCTTTC CAAATATTCTGGTTCCACTGGACAATTTTATTTCAAGAGGAACTGCTCATTTCCTTACTTCCAAAGAGCCTGACTATCAACAGAGTCTATGGAATATGAT TTCATATACCCTAGCGGACAGAAATTTGGAGGACAGTGACATTGACCCAGCTCCGAAGCTTATTGGAGTTGTCTTCCAGAACTGCAGAGGGCAGGTGGAT CACTGGGTTGAGCCATATCTCAGAATAACAATTGAACGCTTGCATCGAACTGAAAGATCATATTTGAAATGTCTTCTCCTGCAAGTGATTGCAGATGCTT TATACTACAATGCTCCACTGACTCTGAGCATATTGCAAAAATTAGGAGTTGCTGAGAATATTTTCAATCTTTGGTTCCATATGCTGCAAGAAGTCAAGAA GAGTGGTGTGCGTGCTAATTTTAAAAGGGAACATGGCAAGAAAGTTTGCTGCCTTGGTTTAACATCGTTATTGGCCCTTCCAGCTGATCAATTGCCAGTA GAGGCTTTAGGCCGGGTGTTCCGGGCCACTCTTGATCTTTTGGTTGCATACAAGGATCAAGTTGCAGAAAATGCAAAAGGGGAAGACGCAGAAGATGATG ATGATATTGATGGTTTTCTAACTGATGATGACGAGGATGACGATGGTTCTGACAAAGAAATGGGAGTCGATGCTGAGGATCATGATGAAGCTGATGCTAG TAAATTTAGAAAGTTGGCTGAACAGGTGTGTGGATATGACTGGGCCTACAAACCATTTACATGCTTATATTAATTGAATATAAGATAATGAATTGATCAT TAATTGAATATAAGATAACGAATTGATCATTTTGCTTGCAATAAAGGAATTTTGTAGTATGTGTGTACGAGCTTTTTAATATACGAAATTCAAGCAGTTC ACAATTAGCTGACTTCATTATCCGGCTCCTAGTTTTATTTGATTATGAAAACCAGGGTATTTAATTAGGCCATTATTGTTTTGGATACTATTCATGTGTA GTGTAAATATTAAACTCTTGAAATATAAAATATTTTGTAACCTTTTAATCGTAACGATTTGAATATAAAATATTAATCTGCATGCCATTTTTAGTGTATT AATTTTTAGACCCAGTGAGATATTTTTGTGATTAGTGTTACATCAGGTGCATATCGCAATTCAGTTTAAGTATGAAATAGAAAAACTTTCATCACTTTAA CCAAAGAAGTATGTCATCTTCATGGTTCCTCTGCTGGCAATGCACAGTGGTCGCATTTGTTTGGCTGTTTTCGGTTCAATTGACATCCATAAGTTGCTTA TCCAATCCGGTAAGCCCATCCAGCTTGGCAGTTTTGTGGTTGAACTGGCGAGTCTAGGTCAATGTTCCCTATTCTCTCTCATTGATTCAGTTTTACATTT TTTAATGAAAGTTTTGTTTTTCGTTCACTTGTAAAAATTTGTGTTAACATTAATACACTTATCATTTATTTATTTGTTTCCTTTATTTAAAACGCCATGA ATCTTAAATTCTAATTGTCCTTTTGCGATGAACCCCATAGGCGAAATCGTTCAGGCCCGCTGATGAGTATGATGACGATGACGATGATGACGACTTCAGT GATGATGAAGAGGTGCAGACTCCCCTTGACGATGTGGATCCTTTTATTTTCTTTGTGGATACTATGCAAGTGTTGCAATCATCGGATCCATTAAGGTTTC AGAACCTCACCTCGACACTTGAGATCTCTTATCAAGCTATTGCTAATGGTGTTGCCCAGCATGCTGTGGTGAGAAGAGGGGAGATTGAAAAGGAAAAACT TGAGAAAGCTTCAGCTGCTGCAAATTCTTAAGCTTTTTGTTGTACATTGTTGGCTATTTTTTTTAATTTTGTTCCTCAAGTTCTTGCCTTTATCCCTTAT TGGCAAGGGAAGCAGAGGGTTGCTTATTTATTTGAGGCATTTGTTGGTTCATTGGTCCTATACAAGGTCTATGAGCTTTGAAGAGTTTACAGTTTTGAAG TACTGAGTTTAGTGGACTCAAGCTCCTACTGATGTTAGAAGATGTTGGGTTCAGGAAACTATGGTCTTGTTCCTTTTTCCAACCATGGTTGTGAATTTGT TTTATTATTTGGTCTACATGTTATGTTTTTGAGTCAAGTTTCATCTTTTCCAATTTATGGAAACCCTTTGATTTGTTCAGAAATGTCTTCAATGGTTGTA TTATTGATGATTATGGTTCTTTGTAACCCTATTTTTGGCTATAATATTTGGGAAGAGAATAGAGTCCGAATTTTGAACAAGAGTTTGGGTTATGCAAGAA AAAGATAAACAATCATTTTTATTCTTTATATGATATAATTTTGTGAGAGGAATAAGCTGAGGCTATTGTGGTCAATGTCATTTTCTTGTAATTTGTTTTT AATGCTTTAGAAGCTTTAATATAGAGCTACTAAATTCTTATATTAAACTTTCTATCTAGAAAATGTGTCATGCCACTTATAAGTCAAT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_80461;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_50228

FPKM

• FPAB: 1.9
• FPNAB: 6.1
• LF1: 5.7
• LF2: 5.3
• LF3: 3.9
• LF4: 6.3
• UF1: 5.9
• UF2: 5.5
• UF3: 6.6
• UF4: 5.8

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_50228

• Blastp: Importin beta-like SAD2 from Arabidopsis with 74.76% of identity
• Blastx: Importin beta-like SAD2 from Arabidopsis with 74.76% of identity
• Eggnog: Importin(COG5656)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G31660)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019441581.1)
• Pfam: Importin-beta N-terminal domain (PF03810.18)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;