Ll_transcript_50800

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• Name Transcript: Ll_transcript_50800
• Sequence: CGAAAGAGAGACCCAAGTCCTAAAAAAAGAGTTTCATCGTTCTGCTAGTCAAACAAAACGACCTTTAGTTCTCAAACAAAACGACCAAAACTTGATAACG TTCCCGCTTAACTTGTTGGAGACAAAGCCAAATGCACCCTTCACAGAGATTGGAGTGTACTTGGCTCACTCCATTCAAATTCAAAACTTGCCCTTCACCC ATGAACTCTAACTATGCAACCTTCCCTTTTATCACTATTATCCCTTCATCTAACCCCAAAACATTGTCTTTCCCAAAATACCCTCTTTCGTTCTTCCAAC CAAAGAAAACCCATTTCCCATTGAAAGTGAAGAGAACAAGCTTTGTAATTAGAGCTTCAAATGATGGTAATTCTCAAACAGCATCAAATTGGTCTAAATG GATTCCTACTGGTTCTTTTGCTGCTGATCAAGTTTTCAGATTGATTGCTGGTGCTACTGCTAGTCCCATTGGCCAGTTTGTATCCTCACCCACCACGTTT CTTCACTCTATTGACCCTAGAGTTAAATTGGTATGGCTTTTAGCTCTGGTTGTTCTACCAGCGCGGTCACATATAATAATGCGATTTGGATTAGTAATAT TCTTGACTTTGCTTTCAATTTGGGTTCTACAAAGAGATGTTTGGAAGGATCAATTGGGAAGAGTTTATTTTCTATCAGGATTGGTATTCATAACTTTAGG GCTGGGTGCAGATGGTGTGCCCTCGCTTGTTCAGTTGAGAACTCCACCACCTGCACTGACGGGGCTTCCTAATCTTCCCGTATCTTTATCAGGGTATTCA TATGTAATAGCAAAGTTAGGTCCGTTAATCTTTACAAGGAAAGGCTTATCTGTTGCAAGCACCGCTGCATGTTTGACTTTCACAGTATTTCAAAGTGCAA GTCTCTGTCTAACAACTACAACCCCTGAACAGCTAGCATCTGCATTGCGATGGTTTTTGCTCCCTATGAGATACATAGGTGTCTCTGTGTCAGAAATTGT GCTTACCCTTTTACTGTCACTGAGATTTATCAGTCTAGTTTTTGATGAGGTCCGGAACATTGCTTTGGGGATTGTCTCTCGTAGGGTTAATTGGAAACAT ATGACTTTTATGGAGACAATTGATGTTTTCTTTAACTACTTCAGGCGGATCTTCAAAAATATTTTCAGTCACGCAGAACAAATTTCTCAGGTATGGCTTA AGCATACTTCTATTATGTCTTTCCCCTTCTTTGTCAATGTTGTTTGAAATGCTTCTCCTTTATCATACTTTCAACTCATTCTAGAACTGTTGAATAACAA GATAAGTTCTGTTTTAAATCCATTAACTATCTTGAGGGTTTTACAGATCCATGCTTAGACAAAATGTTACTTTCAATTCTGATATGAGATAGTAAACAGG TAGAAATTGGTCCTTGAGTTCACAATGCTGAGTATCAGATTTTTTTTACTAAATTAGTCTTACATGTTGCAAAAGCGAATTCTGTGGCATAGGCCTATTT TCACTAACTGACCTTTTGGTGCCAAACTACTATTAGCATTGTAGTCATCATATAATATTTATCGGTTTTCGTCTTACAGTTTAACATAAAATACTGCACG CTATGATAGTCGGAGGTTTTAAAGGGGACAGCGACACTCAAAATTTACTTCTTGTCAGAATCATCTTTTAGGATGGCAGATTTTATATTCTTGTTCTTCT TGGCAGTTGTCACAGGAGCTGTTTTCCTGTCTAAGCATTACTTAGTCTAATACTATATGCCACTCTTTCATTGGGAAGAGTAAGAACATTTTGCATTGAT GCATTCATGTTTGCATGTACTTATGTCATTCATTCAAATTCTTTAGTTAGTTATGCAAATTACTCCATAAAGGTATGATACAAGGGAAATGATCTTATGT TTATCATACATTGAGTAGGTTGAAACTCGTGATGACATTCTTCCTTTCCTGATTCAATTCTTTTTTGAGGTTAACTTTGTGTTATTTATGTTGATTCTTA TGGTAGTATTTTTATGCATGTACTTACTGATCTGGTTATACAAAAGCTGCAAGTTTAAGTATGAAGTTAAGTTAATTACTAAATTTGGTCCTTTCAACTA TTTTAATTTTGTCCAATAGCTTTCTTTTTTTCATTTTGGTTCTGCATGACAAGTTTTTGTCACAAATTTTAAAATTTTAATTGTAAGTTGCAATATTTTT ATCATTAAAAGGTGAATTTTAACCTATGAAACTAATGGGAAAATAATTTATAGGTCCAATCTGAAGAAGAAATAACTTAAAGGAATGAAGATAGTAGCTT TGCCTTTATATTAGCTGACATCTATTTACTATATAACAAAAAAAAAAGTTAATGACACATTACCTATGACATGTGTCATCACCACAATGAAAATTTTTCC TCCAAAAATCTCTATATCCCTTATTATGCATCTTCACACATAAGATGATAAAATATCCTATCATTTAATTTGTTTCAATTAAATAATAATTCAATCATAA CTCCATAATTTATTACCTTCCATTATCCTTTCATATATTCGTCTTCTTCTCTGCCATATCTACGATACAATATTCTGTTCATTGAATTTATTTTGTCATC ATCATAAAAACATGTGTAACCATTTTTTTTTATGTATGTTCTTATTTCCTATATTTTTTAATTGACTTTTTTGTTTATTTTATATATGTAGTATGATTGA TTTCATTATTTTTTAGATTTGTTCTTCTGATAATCATCTTCGTTAGTATCTGATTTTCAAAGTTATCTTCATTTGTCACTCCTTTGTTTCATATTTCACC ATTCTTGTCTGTCATATCTACAATCTGATGTTCCATTCATATAATTTACAGTCTCATCATCATCAAAACTTGTGTATCCATTTCTTATTTATAGATATGT TTTTATTTTCTAGATCTTTTAATTGATTTTTTTTTACTTTATAGATTATTCTGACTGATTTTATTATTTTCTAATTTTATTCTTCCATTAATCATCTTCA TTAGTATATGATTTTCAAGGGCTTCATCCTTAACAACGATCAAACTCTAAAAAACGATGGTATGTACTCGATCTCCATTGTTATACATATATATACAATT ATTTATAAGTTACAATATTGTATATGTTTGTTTGTTGGTATTAATCTATTTATCTCCTCACTTTGTCTTGCTCTTATCATTTTATCTATTCATTTGCAGT TTGATTCTCTGCAAAAAGAATGAGGAAGTAAAAAACCCTAACAAATGGAGCCAGAGAGTTTGAAAGTGGATGATCTAATAACAATGGGGTATGAGAGTTT GTAATGTATTGTAAGGAAGATATTTATTTTAATCATATTATTCTTCTACATGAGTTTATGGCTTAATAAAAAATAATATCTTTGATTTGATTTAATTGCG ATAACGAATTCTTTCTTCTGTTTGTAATCTGTTAATATCAATCATAAAATATACATAAATTTTTAGCATTGTAAATTTGTAATATATATGATTTATGTTA A
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_80979;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_50800

FPKM

• FPAB: 0.7
• FPNAB: 0.2
• LF1: 0.6
• LF2: 0.4
• LF3: 0.3
• LF4: 0.3
• UF1: 0.5
• UF2: 0.3
• UF3: 0.5
• UF4: 0.6

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_50800

• Blastp: Protein ABCI12, chloroplastic from Arabidopsis with 62.05% of identity
• Blastx: Protein ABCI12, chloroplastic from Arabidopsis with 62.05% of identity
• Eggnog: Cobalt transport protein(COG0619)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G21580)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019439763.1)
• Pfam: Cobalt transport protein (PF02361.15)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;