Ll_transcript_39801

• Id Trinity: FTRINITY_DN58966_c0_g2_i14
• Name Transcript: Ll_transcript_39801
• Sequence: AAAAACATTTTCTTTTTCGGCGGTGGTGTAATTGAATCAAACCCAAACCACTCGATTCTCTGAAAACCCTAACAACAACTTTCCCCATCTTCGTATCACA ACCCATGGAAATTCTATTCCTTTCTTAAACCCTAAATTCGAATCATCATTCCCATTCCTTAAATTCAACGTTTCATTCTATTGGCTGCAATCACAACAGG AATGTCTCTCCCACCAGTACACTATCTATACGTCACAGATGATTCTCTTCGCGAATGGAAGAGTGGAAACCCTAATCTCAAGATCTCAGAACCTGTTCCA TTGCTTCGATTCCTCTACGAGCTTTGCTGGACTATGGTTCGGGGTGAATTGCCGTTACAGAAGTGTAAAGTAGCATTAGACTCTGTGAGATTCTCAGAGA AAGCTTCCACTGTGAAATTGGCTTCAAATTTTGCAGATATAGTAACCCAGATGGCTCAAGATCATACTATGTCAGGAGAGTTCCGCTCCCGTCTCATCAA ACTGGCAAGATGGCTTGTGGAATCTGAATTGGTTCCAGTTAGGCTACTTCAAGAACGCTGTGAGGAGGAGTTTTTGGGGGATGCTGAGTTGATCAAAATA AAGGCTCAGGATTTGAAGGGAAAAGAGGTCAGAGTTAATACACGGCTTCTATATCAGCAAACCAAATTTAACCTTCTCAGAGAAGAGAGTGAGGGCTATG CAAAGCTGGTCACTCTTCTTTGCCGGGATTCTGAAGTTCCAACTCAAAAGGCATCTGCAGCAACAATTGGCATTATTAAGTCGTTAATTGGCCACTTTGA TTTGGATCCAAATCGTGTTTTTGATATTGTTCTTGAGTGCTTTGAACTTCAGCCTGATAACGATTTGTTTTTGGACCTCATTCCTATTTTTCCGAAGTCT CATGCTTCACAGATTCTTGGATTTAAATTCCAATACTATCAGCGCATGGAAGTGAGCAATCCTGTTCCATTTGGGCTCTATAAACTCACAGCCTTGCTGG TGAAGCAAGATTTTATTGATCTTGATAGCATATATGCACATCTACTTCCTGGGGATGATGAAGCTTTTGAGCATTATAACAGTTTCTCTTCCAAACGTCT TGATGAGGCTAACAAAATTGGAAAAATAAACCTTGCTGCTACTGGAAAAGATCTTATGGATGATGAGAAACCGGGCGATGTCACAATAGATCTCTTTGCT GCTTTAGACATGGAAACTGATGCAATTGAAGAACGAACGGCTGAGCTTGAAAACAGTCAAACTTTGGGCTTGCTTACTGGCTTTCTTTCAGTAGATGACT GGAGTCATGCACATACACTATTTGACCGCCTTGCACCACTTAATACAGTGGAACATAACCAAATATGTGGCAGTTTGTTTAGGCTTATTGAGAAGTCAAT TTCACCAGCATATGATGCTATTCGTCAAGCACATCTTCAAAAGTCTGGGCCGTCGATAGGAGGTGGCACTGATTCTATGGATGTAGATAACTCTTCGCGA AGTGGATCTTTCATTGATCTCCCAAAGGAACTTTTTCAGATGCTTGCTTGTGCTGGACCTTATCTCTACCGTGATACTATGTTGTTGCAGAAGGTTTGTA GAGTATTGCGAGGTTATTATCTTTCTGCTCTTGAACTTGTAAGCGGTGGGGATGATGCTTTAAATCCTCATATGCACCTGAAGGACACAAGGCTAAGGGT GGAAGATGCTTTAGGAACATGTCTACTTCCTTCTCTGCAGCTGATTCCTGCCAATCCAGCCGTCGCCCATGAAATTTGGGAACTTATGAGTCTCCTTCCG TACGAGGTGCGATATCGTTTATATGGTGAATGGGAAAGAGATGATGAGCGCTTTCCAATGCTCTTGGCTGCGAGACAAACTGCCAAGTTGGACACTAGAC GTATTTTGAAACGACTGGCAAAAGAAAACTTGAAGCAGCTGGGTCGGATGGTTGCAAAATTAGCTCATGCCAACCCTATGACAGTCCTTCGGACAATTGT TCATCAGATTGAGGCATACAGAGACATGATTACTCCTGTAGTGGATGCTTTTAAGTATTTAACTCAGCTTGAGTATGATATATTGGAATATGTTGTGATC GAGCGATTGGCACTTGGTGGACGTGATAAGTTAAAGGATGACGGTCTTAATTTGTCAGATTGGCTTCAATCGCTAGCTTCATTTTGGGGTCACTTGTATG TGTATTTTTTCCTTCCCATTTACATTATTTTTATAGAATTGGGATACTGGATCTGGTTTATCATCATCTACTTCACAGATAATTTAAATGGCAACATAAT TCATTAAGTCACAAATTGTAATTTGTCCTCCATGTGTTGTTTGGTCAGCTTTTCTGTTTCTGTTTCTTTTGTGATCTGTCTTTTTGTTTTTAAAAATATT TCTGGCAAGCTCTAATTTTACTAGAACTATTTTATTCTGAAGTAATCATTGTTGATAATGGCATTCATTAGTCTTTTTTGTACATTCATACCATCCTATG GAATTTAGATATCCAGGACGCGTTGTATCAAATTCCAGGTTGCAGATCAACCTTAACGAATGCAGGATTGGCTTGCCAGTTGGTGGCATGCACATGCAGC TGTATGATGTGTGGTTACTGTTATTCACTGGCAGATTTTTTGGGATGGATTTTTGCCCTTTGTTGAAAGGGTTGCCACTTCTCTGTTGTCCTTTCAACAT TTGAACTGCTATTAGCGCCATGTCCATATCCTTTTAAAAGGGATATTTAAAAAGTTGAAATCTTCCTGCAATAGCCACTGCAATGTTTACGGAGAATTAT CTGATCTAAATGAAGTTTTGGACCTTCATCCTTCATACGTAGCATGAAAGGCCAGTGCACTTACCAGATACAATTAGTCAATGAGAATGAATGAATGAGT ACATAAGAAGTGCAAGGAAACTGACTGGAAGTCGTTGGGGTTTTATGAGGAATGATCCGTGTTCATACATTTCAATTATTTTTGGTCATTTCGAATGTCA ATAATGAAGTGGCACCTTAATGGCATTTGTGGGGATAGTAGGGATACAGATCCGTGTATACTGTGAGTCTACCATTTTGTCCATGCTTATTTTGTGGTGT ATCTAAAAAAATCGGGGAACAAATTCATATGCTGTTGGTCTTATAAAGAGGGTGGAGCCCTGAACTGTCTATTTTATGTGTTGGCTATGTGATTATTAAT CCTCCTAATTAGGAAGATATGTATTATGCTTGTTGGCATGGGTGCTTAATCCTTGGTATTGGGCTGATGATGCGAAGGTTTTGGGTCTATCTGATGTGAC CGCGGCTGATAGTAGCATTGTTGTAAACGGTCTACTCTATTAGCTATCAGTGTCCTCCTGTGATGCTAATGATGACTGCAATATTCCAAAGAAATCGTTA GCTTTTCCTGAAGCTGTTTGCTGTCTATTTCTACTAACGGACCTAATGCAGTAGTATTGTTAGATAGTATACTCTTTCTTCAGATAAGAGAGCGGCAGCT TTTCGTTTGACTTTATCATCACTAGTTTGTTTGATCAACTATAGTTGAGGATGGGAGGATCATATGATTATATTGTCTGTGACAATGAGTTGCCCACCCT CTGAGGAATGGATTACATAACAAGTTTTTCTAATATTTTACTGATGTGTATACTTCAAAAATGAAGAATGGCGTGCTTGTGCATGCCTTATTTTTTCCGA GCGTACCGGTCAAATCATGAACAACTTGGGGCCAATATTCTGCTAGGAATTTGTTTTTGCTTTGGAGGGATGGGGAATGATATACTTGGAGCAGTTTGGT TTGCTTTTCTTCTCTCTCTCTATTGTATTTCCCCTTTTTATGTATATAATATTGAGTGTGATACTATAAAATGGTTGTGGAGTGGGATGATATAATGTGT TATCTTTCAGACTATTTTTTTAAGAATTCAAGTGTTTGTGTATCTAGTGAATACTATGATTGCAGTTTCTTAACTTTTTGGATGAGTAACTTGTTCGGGT CTTAATACAAGCTACGGTGAATTATACTGGACTTCCCCAAGGTTGTAAATATTTTACGTGGCACTAGTTTCAAAATCTATTGCACTCTTCCTCAAGATGG ACCTTTAGTATATTTAATACTACATTTTGGTGTATGGATGTCATGTGGACATGTCTTCTGTTAATATCTTGGGACATATTTGAGTGTGAGTCAAGAAGAG AACACAGATGCTGCTTATAGTTGGTTTGTTAGGATACTTTCCAAATGACTTTTCTAGATTATAATTGGAGAATTTGAGCTGAAGTCTACTTCAAATAATC TGCATCTATTTTTTTCCCAGTGAGACTTATCTATTTTTTTTATTTTTCATACCATGTTAGGATTTTGTTTGTAGCATCCTTCAAATATTGTGAGCAGAAC TAAAATTTGGTGTCCATAATGTATTGATTGAACGTAACGTAACACATGTTACGTCATTGAACAAATTCTTCATCCATGAATGAGGAGTACTTGGTTTCCT TTCTGCACTGTGATTCGTCATATTCTTCATATATATTGTAGAGTTCTTGCGATGTGCGGCAATTACTATGTAATAATGTTGAGAAGGTTTTCACCTAATT TTCCTTGTTTATATTAAGGCCTGCTTATGTGCAGAATTGAGAAGGATCTATGTGATTACTGGTTAATATAATGTTTTCTTGAACTCAAATCATTTGTCTG TTATAGGTGTAAAAAGTACCCATCAATGGAATTAAGGGGCCTTTTCCAGTATCTTGTAAATCAGTTGAAAAAGGGGCAAGGAATTGAACTTGTTCTACTG CAGGAGCTCATTCAACAAATGGCAAATTTCCAGTACACTGAGAATTTGACCGAGGAACAACTGGACGCTATGGCAGGGAGTGAAACTCTCAGATATCAAG CAACTTCTTTTGGAGTAACTCGAAATAATAAGGCACTGATAAAGTCAACTAGCAGACTTAGAGATTCATTACTGCCAAAAGATGAACCGAAGTTGGCAGT TCCCCTCTTATTGCTTATTGCTCAGCATCGTTCTCTGGTTGTCATCAATGCAGATGCACCCTACATTAAGATGCTCAGTGAGCAGTTTGATAGATGCCAT GGAACTCTTCTTCAATATGTGGATTTTCTTTGCAGTGCTGTTTCACCAGCATCGAATTATGGTGTTCTTATTCCCTCACTCAACGACCTGGTCCATCTTT ACCACATGGACCCAGAGGTTGCTTTCTTGATATATCGCCCTGTGATGAGGCTTTTCAAGTCTCAGAAGGCTCCTGATGTTTTCTGGCCCTTGGATGATAA AAATGCTGAAAGTGATGCTTCTATAAACACTGAGTCTGACCCTGCAGATCATTCTAGCAGTATGGTTCTAGATCTTGGTGCAGCTCAGAATCCTATAAGT TGGTCATATCTTCTTGATACTGTTAAAACCATGTTACCTTCAAAAGCATGGAATAGCCTGTCTCCTGATCTTTATGCAACATTCTGGGGTCTCACATTAT ATGATCTGTATGTTCCAAAAAACCGTTACGAGTCTGAAATTTCCAAGCTGCATGCTAACCTCAAGTCTTTGGAGGAACTCACTGATAATTCTAGCTCAGC AATCACCAAGAGGAAGAAAGAAAAGGAAAGAATTCAGGAATCTCTTGATCGACTGATTAATGAACTTCATAAACACGAAGAGCATGTTTCATCTGTTCGT AGACGCCTTTCCCATGAAAAAGATAAATGGTTAAGTTCCTGCCCTGATACCTTGAAGATCAACATGGAGTTTCTTCAGCGTTGTATCTTTCCACGCTGTA CTTTCAGTATGCCTGATGCTGTATATTGTGCTATGTTTGTTCACACTCTTCATTCCATTGGAACCCCCTTTTTCAATACAGTCAACCACATAGATGTTTT GATTTGTAAGACCCTACAACCAATGATATGTTGTTGCACTGAGTATGAAGCAGGCAGACTCGGCAGGTTTCTGTATGAAACTTTAAAGATTGCTTACTAT TGGAAGAGGGATGAGTCTATTTATGAACGTGAGTGTGGAAACATGCCAGGCTTTGCTGTTTATTACAGATATCCAAACAGCCAGCGAGTTACGTATGGGC AGTTCATCAAGGTACACTGGAAGTGGATTCAAAGAATCACGCGGTTACTGATTCAGTGTTTGGAATCTAGCGAGTACATGGAAATTAGAAATGCTCTCAT AATGTTGACAAAAATCTCCAGTGTTTTTCCTGTTACTCGTAAGAGTGGGATAAACCTTGAAAAGCGGGTAGCTAAGATTAAAACAGATGAAAGAGAAGAT CTTAAGGTGTTAGCAACTGGTGTTGCAGCGGCATTGGCTGCTAGGAAGCCTTCTTGGGTTACCGATGAAGAGTTTGGTATGGGTTATCTCGAGCTGAAGC CTGCACCCTCTATGGCTAAATCTTTAGCTGGAAATTCAGTAGCTTTACAAAGTGGGACAGGTATTGGTGTTTCTCAATCGGAATCTTCCAGTGGAAAACA TTTGGGCTCTGGAAACACTGTCAAGGGCCAGATAATAAGAACAAAAGCTGCAGACAGCAAGTCGGAAAGAAGTGAAAGCACTGCTGTGACAAAATCTGAA TCTGTTGTAGTAAAAACCAAGGGTAGTTCAATGGTGAATGGATTGGATGCTCAATCGTCATTACCATCGTCTACTGCACAAACGGGAGCATCAAAATCTA TGGAAAACCAAAAGCAAGTGGAAGAATCCATAAATAGAGCATCAGATGAACACGTGACAAGAGTTGCTGAGTCAAGAAATTCCACAAAACGCTCAGGGCC TGCTGGCCCAGTTTCGAAGCCCTCAAAACATGATCCTTCAAAAGAGGATGGTAGATCTGGAAAAGCTGTTGCTAGAACTTCTGGATCGTCAATTGACAGG GATCTACAAACGCATGCATCTTCTTCAGTCAATGCTAATGGTAGCACCATTGCAGGTTCTATGAAAGGCTCAGCTCCATCACCGAAGATGGACAGTCCTG GTAATGAATCGAAGGGAGAGGTTGCACCTGCTAAGTCTTCTGATGTTAGGGCTTCGATGGTTAAGGATGACAGAAATGATGCTGCTGACTTGCCAAGAGG ATCCTCTTCTCGTGTTGTTCATTCCCTTGGGCATGATATGCCAGTTGTTACTTATAAGTCTAGTGATAAAGTTCAGAAGAGAGCTGGTTCTGCTGAAGAA CCAGATAGACTGGGTAAACGGCGGAAAGGGGATGTAGATCTAAGAGAAGTAGAGGGTGAAGTTCGATTCGCTGAAAGAGAGAAGCTGGTTGATCCACGAT TGGCTGATGACAGGCCAGGACCTGATGAACTTGGGTTGTACAGGACAGGTGATAAGCCATTGGAAAGGCCAAAAGAAAAAGGAAATGACAGATATGAAAG GGAGCACAGGGAAAGATTGGACCGTCCGGATAAGTCTCATGAAGATGATTTCATTGTGGAAAAATATAGGGATAGGTCAATAGAAAGATATGGAAGAGAA AGGTCTATTGAGAGAATACAAGAGAGGGGTAGTGATAGGAGTTTTAATAGAGTCCCTGAGAAGGCTAAGGATGATAGAAGTAAGTTACGATACAGTGATG CACCTGTAGAAAAACCTCATGCTGACGATCGTTACCATGGGCAAAGCTTGCCTCCGCCACCCCCTTTACCTCCTAACATGGTTCCACATTCTGTTGGTGC GAATAGGCGTGATGAAGACTCTGATAGGCGATATGGAGCTGCAAGGCATTCTCAAAGGCTTTCTCCTAGGCATGAAGAAAAAGAACGGAGGCAGTCTGAA GAAACTGTGGTTTCTCAGGATGATGCCAGGCGCAGAAAGGAAGATGATTTTCGAGATCGGAAACGTGAGGAACGAGATGGATTGTCAATGAAGGTGGAAG AGAGGGACAGGGAGAGAGACAGAGACAAAGCAAACCTTTTAAAGGAAGATTTGGACCTAAATGCTGCATCCAAGAGGCGTAAACTTAAGAGGGAGCATCT ACCAGCAATTGAACCTGGGGAGTATTCACCAGTGGCCCCGCCACCTCCTCTCCAGGGTGGTGGTATTTCACAAGCATATGATGGAAGAGACAGGGGAGAC AGAAAGGGACTCATAATTCAGCATGCAAGTTACATAGACGAACCTGGTCTCAGGATTCATGGTAAAGAGGTTGCCAGCAAGCTGAATCGCCGTGATCCCG ATCCCTTGAATGACCGAGAATGGGATGATGAGAAGAGACAAAGGGCTGATCAAAAGAG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_81652;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_39801

FPKM

• FPAB: 7.9
• FPNAB: 6.6
• LF1: 5
• LF2: 5.3
• LF3: 5.3
• LF4: 3.8
• UF1: 2.8
• UF2: 4.7
• UF3: 4.8
• UF4: 3.3

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_39801

• Blastp: THO complex subunit 2 from Arabidopsis with 60.52% of identity
• Blastx: THO complex subunit 2 from Arabidopsis with 60.23% of identity
• Eggnog: tHO complex(ENOG410XQ2A)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G24706)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019446194.1)
• Pfam: Transcription factor/nuclear export subunit protein 2 (PF11262.7)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;