| Id Trinity | FTRINITY_DN58966_c0_g2_i15 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_39802 |
| Sequence | AAAAACATTTTCTTTTTCGGCGGTGGTGTAATTGAATCAAACCCAAACCACTCGATTCTCTGAAAACCCTAACAACAACTTTCCCCATCTTCGTATCACA ACCCATGGAAATTCTATTCCTTTCTTAAACCCTAAATTCGAATCATCATTCCCATTCCTTAAATTCAACGTTTCATTCTATTGGCTGCAATCACAACAGG AATGTCTCTCCCACCAGTACACTATCTATACGTCACAGATGATTCTCTTCGCGAATGGAAGAGTGGAAACCCTAATCTCAAGATCTCAGAACCTGTTCCA TTGCTTCGATTCCTCTACGAGCTTTGCTGGACTATGGTTCGGGGTGAATTGCCGTTACAGAAGTGTAAAGTAGCATTAGACTCTGTGAGATTCTCAGAGA AAGCTTCCACTGTGAAATTGGCTTCAAATTTTGCAGATATAGTAACCCAGATGGCTCAAGATCATACTATGTCAGGAGAGTTCCGCTCCCGTCTCATCAA ACTGGCAAGATGGCTTGTGGAATCTGAATTGGTTCCAGTTAGGCTACTTCAAGAACGCTGTGAGGAGGAGTTTTTGGGGGATGCTGAGTTGATCAAAATA AAGGCTCAGGATTTGAAGGGAAAAGAGGTCAGAGTTAATACACGGCTTCTATATCAGCAAACCAAATTTAACCTTCTCAGAGAAGAGAGTGAGGGCTATG CAAAGCTGGTCACTCTTCTTTGCCGGGATTCTGAAGTTCCAACTCAAAAGGCATCTGCAGCAACAATTGGCATTATTAAGTCGTTAATTGGCCACTTTGA TTTGGATCCAAATCGTGTTTTTGATATTGTTCTTGAGTGCTTTGAACTTCAGCCTGATAACGATTTGTTTTTGGACCTCATTCCTATTTTTCCGAAGTCT 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CTGATACCTTGAAGATCAACATGGAGTTTCTTCAGCGTTGTATCTTTCCACGCTGTACTTTCAGTATGCCTGATGCTGTATATTGTGCTATGTTTGTTCA CACTCTTCATTCCATTGGAACCCCCTTTTTCAATACAGTCAACCACATAGATGTTTTGATTTGTAAGACCCTACAACCAATGATATGTTGTTGCACTGAG TATGAAGCAGGCAGACTCGGCAGGTTTCTGTATGAAACTTTAAAGATTGCTTACTATTGGAAGAGGGATGAGTCTATTTATGAACGTGAGTGTGGAAACA TGCCAGGCTTTGCTGTTTATTACAGATATCCAAACAGCCAGCGAGTTACGTATGGGCAGTTCATCAAGGTACACTGGAAGTGGATTCAAAGAATCACGCG GTTACTGATTCAGTGTTTGGAATCTAGCGAGTACATGGAAATTAGAAATGCTCTCATAATGTTGACAAAAATCTCCAGTGTTTTTCCTGTTACTCGTAAG AGTGGGATAAACCTTGAAAAGCGGGTAGCTAAGATTAAAACAGATGAAAGAGAAGATCTTAAGGTGTTAGCAACTGGTGTTGCAGCGGCATTGGCTGCTA GGAAGCCTTCTTGGGTTAACGATGAAGAATTTGGTATGGGTTTTCTTGAGTTAAAGCCTACACAATCTATAACTAAATCTTTGGCTGGAGCATCTGTACA AAGTGGGATGGGTCTTGGTGTTTCTCAAGCTGAATATTCCAGCGACAAGCATTTGGACTCTGGAAACACAGTCAAAGAGCATATAATAAGACCAAAAACT GGAGACAGCAAGTCAGAAAGGAGTGAAAGCACTGCTGTAACCAAATCTGAATCTGTTCTAGTAAAACTCAAGGGTGGTTCATTGGTGAATGGATTGGATG CTCATTCATCCTTACCCTCATCTTCTGTACAAACTGGAGTTTCAAAATCTACAGAAAACCAAAAGCAAGCGGAAGAACCCATAATTAGAGCATCAGATGA ACATGTGACAAGAGCTGCGGAGTCAAGAAATTCTACAAAACGCTCAGGGCCTGCCGGCTCAGTTTCGAAGCCCTCAAAACAAGATCTTGCAAAAGAGGAT GGTAGATCTGGAAAAGCTGTTGCTAGAACTTCTGGATCGTCGAGCAGTGACAGGGATCTACAAACCCATGTATCCAATGGAAGACAAACTGGAACTACAA GTGTATCTTCTTCAGTCAATGCTAATG BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_81652; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_39802
| Blastp | THO complex subunit 2 from Arabidopsis with 68.51% of identity |
|---|---|
| Blastx | THO complex subunit 2 from Arabidopsis with 73.51% of identity |
| Eggnog | tHO complex(ENOG410XQ2A) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT1G24706) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019437447.1) |
| Pfam | Transcription factor/nuclear export subunit protein 2 (PF11262.7) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |