Id Trinity | FTRINITY_DN58966_c0_g2_i3 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_39789 |
Sequence | AAAAACATTTTCTTTTTCGGCGGTGGTGTAATTGAATCAAACCCAAACCACTCGATTCTCTGAAAACCCTAACAACAACTTTCCCCATCTTCGTATCACA ACCCATGGAAATTCTATTCCTTTCTTAAACCCTAAATTCGAATCATCATTCCCATTCCTTAAATTCAACGTTTCATTCTATTGGCTGCAATCACAACAGG AATGTCTCTCCCACCAGTACACTATCTATACGTCACAGATGATTCTCTTCGCGAATGGAAGAGTGGAAACCCTAATCTCAAGATCTCAGAACCTGTTCCA TTGCTTCGATTCCTCTACGAGCTTTGCTGGACTATGGTTCGGGGTGAATTGCCGTTACAGAAGTGTAAAGTAGCATTAGACTCTGTGAGATTCTCAGAGA AAGCTTCCACTGTGAAATTGGCTTCAAATTTTGCAGATATAGTAACCCAGATGGCTCAAGATCATACTATGTCAGGAGAGTTCCGCTCCCGTCTCATCAA ACTGGCAAGATGGCTTGTGGAATCTGAATTGGTTCCAGTTAGGCTACTTCAAGAACGCTGTGAGGAGGAGTTTTTGGGGGATGCTGAGTTGATCAAAATA AAGGCTCAGGATTTGAAGGGAAAAGAGGTCAGAGTTAATACACGGCTTCTATATCAGCAAACCAAATTTAACCTTCTCAGAGAAGAGAGTGAGGGCTATG CAAAGCTGGTCACTCTTCTTTGCCGGGATTCTGAAGTTCCAACTCAAAAGGCATCTGCAGCAACAATTGGCATTATTAAGTCGTTAATTGGCCACTTTGA TTTGGATCCAAATCGTGTTTTTGATATTGTTCTTGAGTGCTTTGAACTTCAGCCTGATAACGATTTGTTTTTGGACCTCATTCCTATTTTTCCGAAGTCT CATGCTTCACAGATTCTTGGATTTAAATTCCAATACTATCAGCGCATGGAAGTGAGCAATCCTGTTCCATTTGGGCTCTATAAACTCACAGCCTTGCTGG TGAAGCAAGATTTTATTGATCTTGATAGCATATATGCACATCTACTTCCTGGGGATGATGAAGCTTTTGAGCATTATAACAGTTTCTCTTCCAAACGTCT TGATGAGGCTAACAAAATTGGAAAAATAAACCTTGCTGCTACTGGAAAAGATCTTATGGATGATGAGAAACCGGGCGATGTCACAATAGATCTCTTTGCT GCTTTAGACATGGAAACTGATGCAATTGAAGAACGAACGGCTGAGCTTGAAAACAGTCAAACTTTGGGCTTGCTTACTGGCTTTCTTTCAGTAGATGACT GGAGTCATGCACATACACTATTTGACCGCCTTGCACCACTTAATACAGTGGAACATAACCAAATATGTGGCAGTTTGTTTAGGCTTATTGAGAAGTCAAT TTCACCAGCATATGATGCTATTCGTCAAGCACATCTTCAAAAGTCTGGGCCGTCGATAGGAGGTGGCACTGATTCTATGGATGTAGATAACTCTTCGCGA AGTGGATCTTTCATTGATCTCCCAAAGGAACTTTTTCAGATGCTTGCTTGTGCTGGACCTTATCTCTACCGTGATACTATGTTGTTGCAGAAGGTTTGTA GAGTATTGCGAGGTTATTATCTTTCTGCTCTTGAACTTGTAAGCGGTGGGGATGATGCTTTAAATCCTCATATGCACCTGAAGGACACAAGGCTAAGGGT GGAAGATGCTTTAGGAACATGTCTACTTCCTTCTCTGCAGCTGATTCCTGCCAATCCAGCCGTCGCCCATGAAATTTGGGAACTTATGAGTCTCCTTCCG TACGAGGTGCGATATCGTTTATATGGTGAATGGGAAAGAGATGATGAGCGCTTTCCAATGCTCTTGGCTGCGAGACAAACTGCCAAGTTGGACACTAGAC GTATTTTGAAACGACTGGCAAAAGAAAACTTGAAGCAGCTGGGTCGGATGGTTGCAAAATTAGCTCATGCCAACCCTATGACAGTCCTTCGGACAATTGT TCATCAGATTGAGGCATACAGAGACATGATTACTCCTGTAGTGGATGCTTTTAAGTATTTAACTCAGCTTGAGTATGATATATTGGAATATGTTGTGATC GAGCGATTGGCACTTGGTGGACGTGATAAGTTAAAGGATGACGGTCTTAATTTGTCAGATTGGCTTCAATCGCTAGCTTCATTTTGGGGTCACTTGTATG TGTATTTTTTCCTTCCCATTTACATTATTTTTATAGAATTGGGATACTGGATCTGGTTTATCATCATCTACTTCACAGATAATTTAAATGGCAACATAAT TCATTAAGTCACAAATTGTAATTTGTCCTCCATGTGTTGTTTGGTCAGCTTTTCTGTTTCTGTTTCTTTTGTGATCTGTCTTTTTGTTTTTAAAAATATT TCTGGCAAGCTCTAATTTTACTAGAACTATTTTATTCTGAAGTAATCATTGTTGATAATGGCATTCATTAGTCTTTTTTGTACATTCATACCATCCTATG GAATTTAGATATCCAGGACGCGTTGTATCAAATTCCAGGTTGCAGATCAACCTTAACGAATGCAGGATTGGCTTGCCAGTTGGTGGCATGCACATGCAGC TGTATGATGTGTGGTTACTGTTATTCACTGGCAGATTTTTTGGGATGGATTTTTGCCCTTTGTTGAAAGGGTTGCCACTTCTCTGTTGTCCTTTCAACAT TTGAACTGCTATTAGCGCCATGTCCATATCCTTTTAAAAGGGATATTTAAAAAGTTGAAATCTTCCTGCAATAGCCACTGCAATGTTTACGGAGAATTAT CTGATCTAAATGAAGTTTTGGACCTTCATCCTTCATACGTAGCATGAAAGGCCAGTGCACTTACCAGATACAATTAGTCAATGAGAATGAATGAATGAGT ACATAAGAAGTGCAAGGAAACTGACTGGAAGTCGTTGGGGTTTTATGAGGAATGATCCGTGTTCATACATTTCAATTATTTTTGGTCATTTCGAATGTCA ATAATGAAGTGGCACCTTAATGGCATTTGTGGGGATAGTAGGGATACAGATCCGTGTATACTGTGAGTCTACCATTTTGTCCATGCTTATTTTGTGGTGT ATCTAAAAAAATCGGGGAACAAATTCATATGCTGTTGGTCTTATAAAGAGGGTGGAGCCCTGAACTGTCTATTTTATGTGTTGGCTATGTGATTATTAAT CCTCCTAATTAGGAAGATATGTATTATGCTTGTTGGCATGGGTGCTTAATCCTTGGTATTGGGCTGATGATGCGAAGGTTTTGGGTCTATCTGATGTGAC CGCGGCTGATAGTAGCATTGTTGTAAACGGTCTACTCTATTAGCTATCAGTGTCCTCCTGTGATGCTAATGATGACTGCAATATTCCAAAGAAATCGTTA GCTTTTCCTGAAGCTGTTTGCTGTCTATTTCTACTAACGGACCTAATGCAGTAGTATTGTTAGATAGTATACTCTTTCTTCAGATAAGAGAGCGGCAGCT TTTCGTTTGACTTTATCATCACTAGTTTGTTTGATCAACTATAGTTGAGGATGGGAGGATCATATGATTATATTGTCTGTGACAATGAGTTGCCCACCCT CTGAGGAATGGATTACATAACAAGTTTTTCTAATATTTTACTGATGTGTATACTTCAAAAATGAAGAATGGCGTGCTTGTGCATGCCTTATTTTTTCCGA GCGTACCGGTCAAATCATGAACAACTTGGGGCCAATATTCTGCTAGGAATTTGTTTTTGCTTTGGAGGGATGGGGAATGATATACTTGGAGCAGTTTGGT TTGCTTTTCTTCTCTCTCTCTATTGTATTTCCCCTTTTTATGTATATAATATTGAGTGTGATACTATAAAATGGTTGTGGAGTGGGATGATATAATGTGT TATCTTTCAGACTATTTTTTTAAGAATTCAAGTGTTTGTGTATCTAGTGAATACTATGATTGCAGTTTCTTAACTTTTTGGATGAGTAACTTGTTCGGGT CTTAATACAAGCTACGGTGAATTATACTGGACTTCCCCAAGGTTGTAAATATTTTACGTGGCACTAGTTTCAAAATCTATTGCACTCTTCCTCAAGATGG ACCTTTAGTATATTTAATACTACATTTTGGTGTATGGATGTCATGTGGACATGTCTTCTGTTAATATCTTGGGACATATTTGAGTGTGAGTCAAGAAGAG AACACAGATGCTGCTTATAGTTGGTTTGTTAGGATACTTTCCAAATGACTTTTCTAGATTATAATTGGAGAATTTGAGCTGAAGTCTACTTCAAATAATC TGCATCTATTTTTTTCCCAGTGAGACTTATCTATTTTTTTTATTTTTCATACCATGTTAGGATTTTGTTTGTAGCATCCTTCAAATATTGTGAGCAGAAC TAAAATTTGGTGTCCATAATGTATTGATTGAACGTAACGTAACACATGTTACGTCATTGAACAAATTCTTCATCCATGAATGAGGAGTACTTGGTTTCCT TTCTGCACTGTGATTCGTCATATTCTTCATATATATTGTAGAGTTCTTGCGATGTGCGGCAATTACTATGTAATAATGTTGAGAAGGTTTTCACCTAATT TTCCTTGTTTATATTAAGGCCTGCTTATGTGCAGAATTGAGAAGGATCTATGTGATTACTGGTTAATATAATGTTTTCTTGAACTCAAATCATTTGTCTG TTATAGGTGTAAAAAGTACCCATCAATGGAATTAAGGGGCCTTTTCCAGTATCTTGTAAATCAGTTGAAAAAGGGGCAAGGAATTGAACTTGTTCTACTG CAGGAGCTCATTCAACAAATGGCAAATTTCCAGTACACTGAGAATTTGACCGAGGAACAACTGGACGCTATGGCAGGGAGTGAAACTCTCAGATATCAAG CAACTTCTTTTGGAGTAACTCGAAATAATAAGGCACTGATAAAGTCAACTAGCAGACTTAGAGATTCATTACTGCCAAAAGATGAACCGAAGTTGGCAGT TCCCCTCTTATTGCTTATTGCTCAGCATCGTTCTCTGGTTGTCATCAATGCAGATGCACCCTACATTAAGATGCTCAGTGAGCAGTTTGATAGATGCCAT GGAACTCTTCTTCAATATGTGGATTTTCTTTGCAGTGCTGTTTCACCAGCATCGAATTATGGTGTTCTTATTCCCTCACTCAACGACCTGGTCCATCTTT ACCACATGGACCCAGAGGTTGCTTTCTTGATATATCGCCCTGTGATGAGGCTTTTCAAGTCTCAGAAGGCTCCTGATGTTTTCTGGCCCTTGGATGATAA AAATGCTGAAAGTGATGCTTCTATAAACACTGAGTCTGACCCTGCAGATCATTCTAGCAGTATGGTTCTAGATCTTGGTGCAGCTCAGAATCCTATAAGT TGGTCATATCTTCTTGATACTGTTAAAACCATGTTACCTTCAAAAGCATGGAATAGCCTGTCTCCTGATCTTTATGCAACATTCTGGGGTCTCACATTAT ATGATCTGTATGTTCCAAAAAACCGTTACGAGTCTGAAATTTCCAAGCTGCATGCTAACCTCAAGTCTTTGGAGGAACTCACTGATAATTCTAGCTCAGC AATCACCAAGAGGAAGAAAGAAAAGGAAAGAATTCAGGAATCTCTTGATCGACTGATTAATGAACTTCATAAACACGAAGAGCATGTTTCATCTGTTCGT AGACGCCTTTCCCATGAAAAAGATAAATGGTTAAGTTCCTGCCCTGATACCTTGAAGATCAACATGGAGTTTCTTCAGCGTTGTATCTTTCCACGCTGTA CTTTCAGTATGCCTGATGCTGTATATTGTGCTATGTTTGTTCACACTCTTCATTCCATTGGAACCCCCTTTTTCAATACAGTCAACCACATAGATGTTTT GATTTGTAAGACCCTACAACCAATGATATGTTGTTGCACTGAGTATGAAGCAGGCAGACTCGGCAGGTTTCTGTATGAAACTTTAAAGATTGCTTACTAT TGGAAGAGGGATGAGTCTATTTATGAACGTGAGTGTGGAAACATGCCAGGCTTTGCTGTTTATTACAGATATCCAAACAGCCAGCGAGTTACGTATGGGC AGTTCATCAAGGTACACTGGAAGTGGATTCAAAGAATCACGCGGTTACTGATTCAGTGTTTGGAATCTAGCGAGTACATGGAAATTAGAAATGCTCTCAT AATGTTGACAAAAATCTCCAGTGTTTTTCCTGTTACTCGTAAGAGTGGGATAAACCTTGAAAAGCGGGTAGCTAAGATTAAAACAGATGAAAGAGAAGAT CTTAAGGTGTTAGCAACTGGTGTTGCAGCGGCATTGGCTGCTAGGAAGCCTTCTTGGGTTAACGATGAAGAATTTGGTATGGGTTTTCTTGAGTTAAAGC CTACACAATCTATAACTAAATCTTTGGCTGGAGCATCTGTACAAAGTGGGATGGGTCTTGGTGTTTCTCAAGCTGAATATTCCAGCGACAAGCATTTGGA CTCTGGAAACACAGTCAAAGAGCATATAATAAGACCAAAAACTGGAGACAGCAAGTCAGAAAGGAGTGAAAGCACTGCTGTAACCAAATCTGAATCTGTT CTAGTAAAACTCAAGGGTGGTTCATTGGTGAATGGATTGGATGCTCATTCATCCTTACCCTCATCTTCTGTACAAACTGGAGTTTCAAAATCTACAGAAA ACCAAAAGCAAGCGGAAGAACCCATAATTAGAGCATCAGATGAACATGTGACAAGAGCTGCGGAGGTTGTATTTAATATCTCAGATGTTCTGTTCAATTC AGCTTTTTTCATTTGTATCCTGGCCTACTTGCATGGTTCAATTTGCATCACTCATTTTTTTTAACTGGTTATTGCCTCAGCTTACTACTTGAGTTGATGG TGAAGGAAAACAGCTAACTAAATGTGGTCTGAAGAGTTAAAGAACTTCATATAATTCATAATTCATACTAAGAATAGTAGAGTTCAGTCATAAATGTTGG TTAAGAAAAAGTAGTAGTTAATTATTGTGCTATATTTTTGTTTAGGCAGTAAATTAGAATGGTGCCCTTCATAAGTTAAGTGCCGAACATGTTAGTATTA AATAGATTACCCTCTCTGTTTATCTATTTTCCCTTGAGAATGTAACTTGGTTATTGTTCTTTTTGGGCAGTGCCTTATATTGAGTGTGTGATTCTTGCAT AAGACTTTTCCTACTAGTCCTAGATCATTGTAACTATAGTGAAAGACTGAGGTATGATCTGACATTTTTGTGTCTTTCTCTATCTTCTATACTCGCCCTG GCTACAAGAGCTTTGCATGAGTGTATATTTTTAACTGATTCAGGAAAGCGGGAGGGTTAAGCTTGAATGTGCTAGGGTAGGCTTCTTGAATGGATATTGG GTATATAAATAGTGTTGGTTTGGAATTTTTGAAATAAAACTAGTCGAATTTTATTATTGATGGTCTCTAGGGCAAAAAGCAAGCGCCAATGAGCTTTCTT GACATCTAAAATTTTTATACTGTGGCAAGAAAATCAGGCATGAGAGTTAAAAAATTGAAGGAAAAGAAGTCCAGAAGATAATGTGAACATTAGAAAGGAC CCAAAATCATCTGAATGATATAACCCGAAGTTTTTTTTCACAAAAGAAAGTACAGTTAAAAAGTCCCAAGCCCTAACATATCCCATGGCTTGGGACTGCA TAACTAATGATTGATATTGAAATAATAGAACATCTCTATGCTGAGGGTATATTGTTAATCCATAAAATAATCAAGCCTATGCTAAACCTAATTGTTTTAA TCAATTATAGTCTGTTAAATTATACAGAGTAATACACAATGTCCCAATTTCCTAAGTAGACCAAAATACTAAAATATTCTATTCTCTAGGTGCAGGTGCC TGCACTGCATTACTAGTATTCGAAAAAATTAGAGTTGTACCATTCATCATGGTGGAAACCTCTGCAAGTCATTAGTTACTTCTGGTGCTTCTGTCTTAAG GTTGCATTGGAATGCTGTTTCTCCCCCGCCCCTGCCCATTTGTTTCTTCAGTGTTACTGTTGTTTTTCTTAACTCATAATAATTTGGTTGTCCTTCTTTC AGTCAAGAAATTCTACAAAACGCTCAGGGCCTGCCGGCTCAGTTTCGAAGCCCTCAAAACAAGATCTTGCAAAAGAGGATGGTAGATCTGGAAAAGCTGT TGCTAGAACTTCTGGATCGTCGAGCAGTGACAGGGATCTACAAACCCATGTATCCAATGGAAGACAAACTGGAACTACAAGTGTATCTTCTTCAGTCAAT GCTAATGGTAGTACTGTTGCAGGTTCTACAAAAGGCTCTGCTCCATCAGCAAAGATGGATAGTCCTGGTAGTGAATCAAAGGTAGAGGTTGGAGCAGCCA AGTATTCTGATGTTAGGACTTCTGTGGTTAAGGATGACAGAAATGATGCTGCTGACTTGCCAAGAGGATCCTCTTCTCGTGTTGTTCATTCCCCGAGGCT TGACATGACAGTTCTTACTTCTAAGTCTAGTGATAAAGTTCAGAAGAGAGCTGAATCTGCTGAAGGACCGGATAGACTTGGTAAACGACGGAAAGGAGAA GTAGATCTAAGAGATGTAGAGGGTGAAGTTCGATTCACTGAAAGAGAGAAGCTGGTGGATCCCCGATTGGCTGATGACAGGTCAGGGCCTGATGAATTTG GGGTGTATAGGACAGGTCCATTGGAAAGGCCAAAAGAAAAAGGAAATGACAGATATGAAAGGGAGCACAGGGAAAGATTGGACCGTCCGGATAAGTCTCA TGAAGATGATTTCATTGTGGAAAAATATAGGGATAGGTCAATAGAAAGATATGGAAGAGAAAGGTCTATTGAGAGAATACAAGAGAGGGGTAGTGATAGG AGTTTTAATAGAGTCCCTGAGAAGGCTAAGGATGATAGAAGTAAGTTACGATACAGTGATGCACCTGTAGAAAAACCTCATGCTGACGATCGTTACCATG GGCAAAGCTTGCCTCCGCCACCCCCTTTACCTCCTAACATGGTTCCACATTCTGTTGGTGCGAATAGGCGTGATGAAGACTCTGATAGGCGATATGGAGC TGCAAGGCATTCTCAAAGGCTTTCTCCTAGGCATGAAGAAAAAGAACGGAGGCAGTCTGAAGAAACTGTGGTTTCTCAGGATGATGCCAGGCGCAGAAAG GAAGATGATTTTCGAGATCGGAAACGTGAGGAACGAGATGGATTGTCAATGAAGGTGGAAGAGAGGGACAGGGAGAGAGACAGAGACAAAGCAAACCTTT TAAAGGAAGATTTGGACCTAAATGCTGCATCCAAGAGGCGTAAACTTAAGAGGGAGCATCTACCAGCAATTGAACCTGGGGAGTATTCACCAGTGGCCCC GCCACCTCCTCTCCAGGGTGGTGGTATTTCACAAGCATATGATGGAAGAGACAGGGGAGACAGAAAGGGACTCATAATTCAGCATGCAAGTTACATAGAC GAACCTGGTCTCAGGATTCATGGTAAAGAGGTTGCCAGCAAGCTGAATCGCCGTGATCCCGATCCCTTGAATGACCGAGAATGGGATGATGAGAAGAGAC AAAGGGCTGATCAAAAGAGAAGGCACAGGAAATAGCACATCAAAGTTGAGATTTAACCTTTTGGAAGGTTCACCATTTCTTGAAGCTAATGTTCTGGGTT CACATTCTAGCTGCTACCCTCTCATTTATGTGTTTTATTTAAAACAAAGTTTCAGCTTTTCATATTTATTTTTTCTTTCTGAAGTCAATGAGAAGAAATT GTGAACCGACTTGTACACTTGTATATATTGTGTTGTATAATTTGGGTAACCAGTGATCAAATGTACACTGTGACAATGTTAATTAGTTTGTCTGAATCCT AAGTTAAATGAGTGGTCCAAACGAGGAAACTTGCATGTTAGCAACACTTATTTTTGTCCTAACTATTTTATTATGATTGAAAGATAATAAAAGATTGGTC TTTGAAAAAAAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_81652; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_39789
Blastp | THO complex subunit 2 from Arabidopsis with 71.35% of identity |
---|---|
Blastx | THO complex subunit 2 from Arabidopsis with 73.73% of identity |
Eggnog | tHO complex(ENOG410XQ2A) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G24706) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019446194.1) |
Pfam | Transcription factor/nuclear export subunit protein 2 (PF11262.7) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |