Ll_transcript_39828

• Id Trinity: FTRINITY_DN58990_c2_g1_i13
• Name Transcript: Ll_transcript_39828
• Sequence: CTATGACTCTACACGAAGACTACTACTCTGTCCACACGGTTCATACGCTCATTCTCCCACTCCCATCCCTCTTCAATTTTCAATATCCATTCACTCCTTT CTTATGACCCCACATTCATAACTGTCACTCAAATCCTTTATTTCCCATTCTCCATTTATACTCAACCAACACTTTCCCCTCACCAATTCCCCAAACCATG TCTTCTCCTTCTCATTACACTCTCTTCCTCTCTTTCACCCTCTTAATCCTCTGCGCTCACCTCCACGCTCAGGATCTACTCTCAGATGGGGTCCACAACG CTTCTAACCACACGCTTCTCAGACTCCCTTCAAATGACGTGGAACCTTCTTCCACGTGTGAGCAGACGTATGGATTCTTACCGTGCACCACCACCGTATT GGGAAACACGTTCTTGATAATTGTGTATGGGTTTCTCATGTACACTGCTGCTACGTATTTGTCCGCTGGTAGCGAGCTTTTGCTTGAGATCTTGGGACCT GGCATCGTTGGAGGATTGTTTCTTCCTATTCTCGGTGCTCTTCCAGATGCCATGCTTATTCTCGTATCTGGACTTTCCGGTACTGCTGAGACTGCTCAAA GTCAGGTCTCTGTTGGAATGGGTCTGCTAGCTGGGTCAACAGTTATGCTTCTGACTGTAATATGGGGGACCTGTGTAATTGTTGGCAAGTGTGACCTTGA AGGTTCAATTGCAATAGATTCGCGTGATACCAGGGGATTTCATTTAACCAGTATGTCATTTTTTATCATTCTTCATTAATATTATTTTCAATCTTTTGAG AATTAGCCACTAAACTTATCCTTGCCCAGGCATTAAGAAAGTGTTTCCTTTCTTTTGTGATCATCCAAGCAATCAACTTATGGAATTTTTCCACAAAATA TTCACTGTTTTATTATTTCTCGCCGTACTTATGCTGAAATTAGTGATGACTGTTGTCTTGGTTCTAGATAAATTATTTTGGAACTTTGAGGGAAGGGTTC TGGTTGAAACTGTATTATAATTCATCGCTGTCTTATCAGTCCCCCAAGAAACCATGATGCCCTAAATGTGCATCAGATGTGCTGTAATGTTGACCTGTCT CGAATGTATTTCCTTACTCTACTAAAATCTCAATTTGCAGGTTCTGGTGTTAGTACTGATATTTGGACAAGTTATTCTGCTAGGATTATGGTTTTATCTG TCATTCCATTTTTGATCGTTCAGTTACCGCAATTGCTCAGCTCAACTTCAGGAAGGCACTTCGCTATTTTGATTGCTCTTGTTGTCTCCATCTGTTTATT GATTGTGTATTGCCTTTACCAGGTTTTCCAGCCCTGGATACAGAGGAGAAAACTTTCATATGTTAAACACAAACATGTAATCTTAGGACTTTTGAAACAT TTGAAGCAACGTGCATTGGGAAGGCTGCTAACAGAGAATGGTGAACCTAACATAAAAATTATAGAAAAGTAAGGTTATCTCTCCTTTTTGCTTTGACTTC AGAGATGTTACTTACAAAGCATACATTGTGGTCTTTTCATATGTTCATCCATTTGGTTTTCTCTTCCTTCTCAATGGAATATACAGGTTGTTTGATACAA TTGATGAGAATAAGGATGGTGAACTTTCTCACGGTGAATTGAAAGCGCTGGTTGTTGGAATTCAATTTGAGGAGGTTGACCTGGATCATGAAGATGCTGT GACAAAAATAATACAGGACTTTGATGTTTCGGGTAATAATCGTGTTGATAAAAAGGAATTTATTAGTGGCACTTGTAGATGGCTTCAAAAGGCTAAGGGT TCTCGAGTTGCATCTGGTGATGATGGTGCACACACAATGAAGTTTTTAAGTGACTTTCACGATGAAACAAGAAGGGAGCATGATCTTCTGGATGTGGGGG GTCACGATGATGAAGTTGATGAGGGTGTTGGAAATGCTGGATGGACTTCCATCAAAGCAGTGCTTCTGCTTGTGCTGGGTTCTCTTATTGCTGCTGCATT TGCTGATCCTCTGGTTGACGCAGTTAATAACTTTTCTAATGCTACAAGTATTCCTGCTTTTTTCATTTCCTTCATTGCTCTGCCTTTAGCCACCAATTCA AGTGAAGCAGTGTCGGCAATAATTTTTGCTAGTCGTGATAAGAGGCAGACTGCCTCACTAACATTTTCCGAGGTTTGTTTTCTTTCTTCACGCTATGTTT CTTTTACGCACCAGGATGCATGCATGAATTTAACATAAAATATTTGGATTCTAGTAATTTATTATGTTCTGGTTTTTCAAATAACACCATTAGTTCCCAA TTATGTCCTTTTGAATAACCATGATGCTGAATGGATCCCTATCATCTTCTGCAAACACACACATACACATATAATATTAGGGGGCAATGGAGAGAGCAAA TAGTAATAAAAAGTGAAAAACTCATGTTAAAAAGCAACCTTTTGGGTAGTGTATTTGTAATAGCACATTCCTGTTTGTGCCTCGAATTTGTCTGTTTTAG CAATGATTATCATGGCTCTCAATTGGTCTCTTGGATGCTTAACGTGGTTACAGGTAGATCGATAACGATAATGGTAGTTCTGGTTGTTGGCATCATCATC ATTGTAATGTTTGTTCATGGTTGCTAAATTATATATTTCTTACCTTGGGGCTGCATGGTCTGGGATAAATATTTCTCTATGAATTTATCTCATCATCTCT CGGCATAGTGTTTAGGTTGTTTGCCTTGTGACCTGGAGTTCATGAATTCAGTCATGGAGGTTAGTGCTAGGATAAGGCTGTGTACATCTATCTTCCCAGA CTTCACTAAGTCGAAGCCTCGTGTACCAGACTGCCTTTTTATCAACTACATTATATAAACCATGCCAGTTAATGTGGCTCTCTTCTACTTAGATGCAACA TATCAGGCATTTAAAATCAATTATATTTTACCTTTTTTGCAGATATATGGGGCAGTGACAATGAACAATGTGCTTTGCCTATCAGTCTTCTTGGCCCTGG TTTACGCGAGGGGTTTGACATGGGACTTCTCTTCGGAAGTGTTAGTTATTCTCGTCGTCTGCGTCGTCATGGGCGCCTTTGCCAGTTTCAGAACCACCTT CCCTCTATGGACATCCATAGTAGCCATCCTCCTTTATCCTTTCTCCTTGGCATTAGTCTATGTTCTTGATTATGTATTTGGTTGGTCATAGACCATATAA CAATGTTTTCTATGTGTTAGTGCCCTGTATGGCTATTACTCTTGGAGTGTGTGTTTATTATAAGTTGTGTTCTAGAGATTGTGTGGTGTTATTGATTCCA AGTTGGGATTGACATGAAATCGAGAATTTGGGATTTTAATTATGCCCTTTTCATGCATTCTTTATTAGTATAGTTTTTTTTGGTATTATAAATGTATCCC TTCGTCTTTTTAGGTAAGGAACTAATCATTTTGGGGTGTAGTTATTTCTCTAAACAAGTGC
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_81854;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_39828

FPKM

• FPAB: 6.2
• FPNAB: 3.6
• LF1: 2.2
• LF2: 1.3
• LF3: 2.1
• LF4: 1.8
• UF1: 1.6
• UF2: 1.8
• UF3: 1.1
• UF4: 0.6

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_39828

• Blastp: Sodium/calcium exchanger NCL1 from Oryza sativa with 72.32% of identity
• Blastx: Sodium/calcium exchanger NCL1 from Oryza sativa with 60.8% of identity
• Eggnog: Calcium-binding EF hand family protein(ENOG410ZVKW)
• Kegg: Link to kegg annotations (4325568)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019443893.1)
• Pfam: Sodium/calcium exchanger protein (PF01699.23)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;