Id Trinity | FTRINITY_DN58993_c0_g2_i2 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_38863 |
Sequence | AAGGTTTTTGAATTAAACGAAGGAATGAGAAGGAACATTCCGCGCTCTGACTTAACAAAAAAACATTGATTCATTGATTGATTCATTGATTGATTCACCG ATTCCATAACCTTAGATCCATTTTCTGAAATCGTTGAGAATGTTGATGAGTCCAAGATTAAGAGGATCAACATTAACAGCATCATCAGCGTTATTATCAT CATCATGGGATTCAATGCTCCCTGGTCCACCAACCCGAAACAATTTCGGTTCTTCAGATCTCAATTCTCAAGGCCTTCTCGTTTTCTCTTCTGGAAGTTC CTTATCAATTATCGATACTCATTCTATGCAACTTCTCTCTTCTTTCTCTATCCCTTCTCCTTCTTCTTCTCTATCTCCTTTTGTAACCGCTCTTCGCTGG ACCCCACTCTCTCTCAACCGTCAATTTCTCTCTACTGAACCTTCTTCTTCTCATCTCGTCATCGCCGCCGGTGACCGTCAAGGTCGAATCGTTCTTCTTG ACTTTCGTCTCAAATCTCCGATCCTATGGTTCGATACTGATTCCAATTTCGGTGTTCAAGATCTTTGTTGGGTTCAGGCTCGACCTGATTTATACCTAAT TGCTGCGATTCATGGTTCCTCTACGCTTTCTCTTTACAATGCTTCTACTGGTCGCTGTGTTTGGAAATACGATGCTTCTCCTGAATTCTTCTCTTGCGTT CGTCGCGATCCGTTTGATTCGCGACGCGTGTGTGTAATTGGACTCAAAGGTTTTCTCCTTTCTGTTGTTGTTGTTGGTGAGGAGAGCATTGTGATTAAGG ATCTTCAGATTCGGACTGATAGCAGCGAGTTTATTAAGGTCGAGAGAGATGTTGCTGCCGCTGGTTCTGCTGCATTGCCTGCTTCGGCCGCGTTTCCGCT TTATACAGCGAGGTTTGCTTTTTCGCAGCAGTGGAGGCACATTTTGTTCGTCACGTTTCCGAGGGAATTGATTGTGTTTGATTTGCAGTACGAGAAAGTG ATATTTGCGAGTACATTGCCTCGTGGTTGCAGCAAGTTTCTTGATGTGTTGCCTGATCCCAATAATGAGTGGATTTACTGTGCTCATATTGATGGAAAGC TCAGCACCTGGAGGAGGAAACCGTAAGCATTTATTCCCTTATCTTTTTACGTATTATATACTAATTCATACATACATTTTCGTCTCTCTAATACGACACT AAATAGTAGTTTGTTATGTTTTATTGGTTGCAAGAGTGTACCAGAAATATAGTGCTATACTGTTAAGTTTTGAAGTTGAAGTCACATGTTTATTGACAAT CCATACTTATAATGACATGGGCAATCTTGCTTCAATGGGTTTGCTTTTGGATGAAGTTAGACTTAGATTGTTCTAGGATAAGATTCCTCTTATACTTGAG TATAAATTGAGACAGTGGGGTGTATCTACCTTGATTAATTGAAGTTCAAGATTATCCTAACCCCTTAAATGATTTAAGGCTGGATATGTCCTTACATTCT TACTTTACACCCAATCGCACTTTAGAGGAGCTTTACCCATTATTTTAATATGATATTGCTACAAATTTCACTTAAGACCTGGGCAACCCTTCTTCAATGA GCTAGCTTTTAGATAGAGTTAGATTTGGTTATTTTAATACGGTATTATTGCAAACTTCACTTAGGTCCCACTTATTGTAATATTTAAGGCAACACTGGTG GATACAAAACGAAGAAGGCTAGAAGCATTATTTTAACGTGAAATTATACTGACCTCCCTTAGGTTTGACTTGATTACATGTACCACCCCTCTTGTTTTAA AAAGCTACACTAACCTCCCTTAGAGGGAAGAGAAGGTGGTTGTAATTAAACTGACCTCCCCTAAGGGGAGGTACTATAGCTTTTTGAAACAAGAGGGGTG ATAGATGTATTTTAGCTAAACCTTAAGGGAGGTCAGCGTAATTTCCCCAAATTTTAGTCCTTCATCTTATTATTTCTATTTTTCTTTATCAAATCTTGGT TGTTGTAAATCTCAATTATGCTTGAATTCAATGTATTTGAGACCATTATATCTCACATAGACACAGCCGTGTGAAATATGACGATGCTGGCAAATGAAGT GAGATTGTTCCTATATGACGATGCTGGCAAATGAAGTGAGACATACCCAAATGAAGTAAATCACTTTTAAATTAGGTGGTCAAGTGATCAAGAGATGAAT AAGAAAAATAATCATATTGTCCCATTGTTTCTCTACTTGTAATTTTTTCTCCCTAAGTTTTCCAATAGGTGTTTAGTCATTGATGCAACTATATGCATTG TATAAATCATCAGCATTTGATTGTTTACAATCAAATTCAATTTAAATTTGCATCTGTCTTTATGTACTTATTTCACTCACCTTATTGGGTTTGTTCTCTT TTATATGAGGAGGTTTGTGCTCCACAAATTTATAGTCACTTTTAATGTCATTTGACCTTTCAAGAGCACTGTCGGGTCATGGGTTTGAATAAAGTATTTA ATGCCAAAATATCTATGCATTCATCTGGTATAGGCTACATACGTTTCTGGTCCCTCACCCTCTGTCCCCCTCTTCATTGCTTAATATTTAGTCTTGCTGA TTTATTTGCAAGTGTTTTCCTGTATCTGAGAGATATATTTATCCACATGCAATCACAGTGGCGAACAAGTACACATTATGTGCTCAATGGAAGAGTTAAT GCCTTCAATTGGAACCTCTGTCCCTTCTCCTTCAATACTTTCCTTCCTTTTATGCCAATCCGATTCCACAATCCAGAACATTGACAAGAGTTATTCTGAT GTTCCTAGCTCTCCCTACCTTCGCGAGGATTTTGATAATCCTTTTGATTTTTGTGATGAATCAATAATTGTTTCTAAGATACATTTGATCTCCATTTCCG ATGATGGAAAAATATGGAACTGGCTCTTGACTACTGAAGGGAATGCAGTACACACTCAAAAGGATGATAAAAAGTTGCGGTTAGTCAATGATGACAGTAA AATATCATTTCCCGAGGCTACCTCTAACAGCATAATATCTTCTGCTGGTGGACGGGATCCAAATCTACGAAGGCAGCAGGTGCGTCTCAATGATAGTAAA AGCTGCCTGTCAAGTTCAATCCTCAATCAGGAAGATATGTTAATAAAAGTGGAGGAAATTATCCTGCAGCAGCTGTTCCCCTGGTTGCTTTGGGAACACA GAATGGGACAATAGAGGTTGTTGATGTTTCTGCCAATTCTGTTGCATCAAGTTTATCTGTACATAATGGTATTGTTAGGGGACTTCGATGGCTAGGAAAT TCTAGGCTGGTTTCATTTTCCTATAGCCAGGCTAATGAAAAATCTGGAGGATATATTAACAAGCTAGCTGTGACCTGCCTTCGAAGTGGCGTTAACAAGA TGTTCCGAGTTTTGCAGAAGCCAGAACGTGCACCAATAAGAGCTTTGAGAACATCTTCGTCTGGAAGGTATCTTCTAATTTTGTTTCGTGATGCACCCGT GGAGGTTTGGGCAATGACTAAAAGTCCTATAATGCTTAGATCGTTAGCTCTTCCATTTACGGTATTGGAATGGACTCTTCCAACAGTTCCACGTCCTGCT CAAAATGCAGCTTCTAGAGATTCATCTCTGTTATCTAAGGAGCAAACGTCTAGTGCATCAGATGAAGCGCCTACACCATCAAATATTTCCTCATCCGATT CAAAGGGTTCAAGCACAGAGGGGTCTCAGGACGACACTTCTGAAAGTTTTGCATTTGCTCTGGTGAATGGGGCTCTTGGAGTTTTTGAAGTACAAGGTCG AAGAATTCGAGACTTCAGACCCAAGTGGCCTTCGTCTTCCTTCGTATCATCAGATGGATTGATTACTGCAATGGCCTACCGCTTGCCTCATGTGGTCATG GGAGACAGAATAGGGAACATAAGATGGTGGGATGTGACAACTGGACATTCTTCCTCATTCAACACTCACAGAGAAGGAATTCGGCGAATCAAATTCTCAC CTTTTGTACCAGGGGACCATAGCCGGGGGCGTATTGCTGTTCTGTTTTATGATAATACATTTTCTGTATTTGATTTGGATTCACCAGACCCCTTAGCCAA TTCACTTTTGCAACCGCAATTTCCAGGAACCCTTGTGTTGGAGCTTGATTGGTTGCCCCTGCGAACAGATAAGAATGACCCGCTGGTACTGTGCATTGCT GGAGCAGATAGTAGTTTTCGCCTTGTTGAAATTACCGCAAATGATAAACGATCCGGTCATGTACCCCGTATCAGAAATATAAAGGAGAGATTTCGGTCGA TGCCTATATGCTGTCCCATAATACTTCCTACACCACACGCTCTGGCAGTGCGCATGATCTTGCAATTGGGTGTCAAACCTTCTTGGTTTAATACCTGCAG TACTACCATAAAAAAGAGGCCTCACTTAATTCCAGGAACTCCTTCATCTGTGGGGGATCTTCGCACATACATGATCAACATACCGCCTCTTGGTGACTCT GTGGTGCCAGAGATGCTTTTAAAAGTATTGGAACCATATCGAAAAGAAGGTTGCATACTCGACGATGAGAGAGCCAAGTTGTATGCTAGTATTTTGGACA AAGGTTGTGCTGCAAGGTTTGCCTTTGCAGCTACAATATTTGGTGAATCGTCAGAAGCTCTGTTTTGGTTACAGCTGCGTCGTGCTTTTAAAGATGCGAT GAATAAGCTATGGAGAAAGCCTCCACTGAAAGGGCCATCAGAGGAATCTGTCTCTGAGGTTGACGAGACATCTTTACTGTCTAGGATATCATCAAAAGGG AAACCAACAGAAGAAATGGGAGGATGTGTACTGAGTCAAGGTCAGCTAAGGTTGATGACTTTTGACCAGGAAGAGTTGTGGAAAAGTGCTAGTGAGCGAA TTTCTTGGCATGAAAAACTAGAAGGGGAAGAAGCTATACAGAAACGTGTACACGAGCTTGTCTCAGTTGGAAACCTAGAAGTTGCAGTCAGTTTATTGCT TTCTACTCCTCCAGAGAGCTCTTACTTCTATGTGAATGCTCTTCGCGCATTTGCTTTATCTTCTGCTGTTTCAAGGTCTCTTCATGAACTTGCAGTCAAG GTTGTTGCAGCCAACATGGTGAGGGCTGATAGGTCACTGTCCGGTACTCATCTTCTCTGTGCAGTTGGAAGATATCAAGAAGCATGTTCTCAGCTACAAG ATGCCGGATGCTGGACAGATGCTGCAACCTTAGCTGCTAGTCACTTACAAGGATCAGATTATGCAAGAGTGTTACAAAGGTGGGCTGGATATGTCCTGTA CACAGAACATAATATCTGGAGGGCTTTAATTTTGTATGTTGCCGCTGGTGCACTACAAGAGGCATTGACAGCTCTCCGGAAGGCTCAACTACCTGACACA GCTGCAATGTTTGTCCTTGCATGCCGTGAAATCCATGCAGAAATAGTTTCAAACTTGGGTATTGTTGACGATGATTCAAGTTCATCTGTTACAGAGAAGC TACTAAATTTGCGAGATTTAGATCCAGAGAATGAAGATGTCATTGCAGTTGATGAGTATTTCGGGGAATACCAAAGAAAATTGGTGCATCTATGCATGGA TTCGCAGCCATTCTCTGACTAGTTGCAGGGCTTGATGAAATGGATTCAAAGTTCACATTTATATTCATAAAGCAGTGGATTAACAACTCTGGGCTTGAAA AGAAAGTTGTAGGGTGATTGCTTTGCCAGTACCGCTAAAAGGAGCAGATACTTTCATTACCCAAGTTGTTGCCAAATGTGTACAATAATGGAAGCCATTG GGAAGGGAATAATGACCCAAACCGTCTTGGACAAATAGAGGTGGCAAAATACTGAAGTCTTCTATGTGACACAATCCACTGAACTGCAGTTAATATGGTT TACATTAACTTTCTGAAGTTAAAAAGATTGCATCAGATATGGTAATCACTATTGTAGCTTGTGTATAATTTTTTATTGACAACTAATCATTGAATTGTAT TTATATGTGGGTATTTGATAGGAACTTAAATGACTGCATCTATATACATGTAACGCCCAACCTTCAAATATATACACGTGAAATGTGTGAGCACTTTATT TTTTAGACGTGCCAATTAATAATTCTCCAAAGGGGTATTGTTTGAAGGATTTAATATGTATATACATGGTCATCCACTATTAATTTATTAATCATCATTG ACTCTCAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_81881; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_38863
Blastp | WD repeat-containing protein 11 from Homo with 26.59% of identity |
---|---|
Blastx | WD repeat-containing protein 11 from Homo with 25.86% of identity |
Eggnog | WD repeat domain 11(ENOG410XT4R) |
Kegg | Link to kegg annotations (55717) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019440273.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |